Lacinutrix sp. 5H-3-7-4: Lacal_1830
Help
Entry
Lacal_1830 CDS
T01533
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
lan
Lacinutrix sp. 5H-3-7-4
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CshA_repeat
Big_9
Cadherin_5
Cadherin_4
Big_6
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEH01676
UniProt:
F6GE69
LinkDB
All DBs
Position
2068228..2074653
Genome browser
AA seq
2141 aa
AA seq
DB search
MTKITYRLLLASFHKIKIPTVLKDLSCASFTTGLFRYTKFQKSFQSNYIHSNMKNSTLSS
NNWLNSILLFIAFLLITPNVFADGTKQVMPNQNNGTALYIVTDTNFGGSLVGPYLGTSES
QRVYFTIADASTENLYFGLQARMRNSFAGGNNPLGTNFYYQIFNEAGVAQTSPILFGNTS
GENGFIETYNEAVAGPNIGGATPTGYTPLSFNPTANGNYYIALYSSYDGGTTVATGGNTL
NGLDQLMFLPYFDFTVSTAANVQSEGRIWSRKWSFITYLVEDADNDVNTPDVPNPTEAAS
FEGNFFAYTDDQVILEVDFAEGFRPFGYQLAMNRFGVVDDDSDPSNSFIASRTSKTYGLA
APANLDNGYQVFIASPDQNVFIPSPEPSPVVANGIVGCPGSYFIPVTLQLAQDTAVLLEF
NGTPGYQSGTTDVLLESFENEPGEVFIPWDGNDGLGTPVTSSTISVSVNSFIGRTNVPMI
DAELNLNGLSVTGVAPNTNSRLLRWDDRDIIVTGTVCDGSNQLNNLTTVDGTFHRSGLLD
GIVGPAHAWSSSNPDDSVPAISQGGNDSDNLLCNDFGNTRVINTWTYGATVETEPVTLDL
PNCDGDTDDDGIDDITDLDDDNDGILDTDELNCSPGFVDLGQTFNDNTSDPVIVNNAYVY
NSTNVDMTFEIEGSAVWAGGVSNQTAAGVSGSYVNTQPSNTNFVNGDVGVYTFTFSQTVY
NIKFKFGGLDNEDRADFIASESGFNVPVQLTDINLAGNGTFSGQSVVSSANSGNAPNNSV
QLEIAAANQIIIRVAKDNGNTGNVTLQFYELEYCLPINSDTDGAPNHLDNDSDADGCPDA
LEGSGLYEASTLEGDGSLGDNVDANGIPETSGSISLQQTDVSSTDSNVSSAECVPVALDD
TGSSTAPVSDANTVSVNVVSNDTDSNGTIDVSTVDLDPSTAGIQDTFTNVDGTYTVDANG
VVTFDPNAGLTTDPTPITYTVNDNDGNTSNEASITITYGEGPVALGDSATTGSDEDVVID
ITLNDTDGDGTIDDGTVDLDPNTPGQQGTFTVPGEGTYTDNGDGTVTFDPEPDFDGVSTI
NYTVNDNDGNVSNTAPITVTVEDAPVALDDTGSSTAPVSDANTVSVNVVSNDTDSDGTID
VSTVDLDPSTAGIQDTFTNVDGTYTVDANGVVTFDPNAGLTTDPTPITYTVNDNDGNTSN
EASITITYGEGPVAVDDNASTTPDTNVTFPITDNDSDPSAGGSIDVTSVDLDPNTPGQQG
TFTVPGEGTYTDNGDGTVTFDPEPGFTGVATPIDYTVNDNDGNPSNIATITVTVASCPSP
IDSDGDGLTDCEETTGIDDPSTVNVPVGVTDPSDACDPIEGSDLTDSDGDGLTDCEETTG
NDNPNTAGVPVGITDPNNPCDPFTDGSGCTPIAVDDNASTTPDTNVTFPITDNDSDPSAG
GSIDVTSVDLDPNTPGQQGTFTVPGEGTYTDNGDGTVTFDPDPGFTGVSTPIDYTVNDND
GNPSNIATITVTVASCPSPIDSDGDGLTDCEETTGIDDPSTVNVPVGVTDPSDACDPIEG
SDLTDSDGDGLTDCEETTGNDNPNTAGVPVGITDPNNPCDPFTDGSGCTPIAVDDNASTI
EDAPVALDDTGSSTAPVSDANTVSVNVVSNDTDSDGTIDVSTVDLDPSTAGIQDTFTNVD
GTYTVDANGVVTFDPNAGLTTDPTPITYTVNDNDGNTSNEASITITYGEGPVALGDSATT
GSDEDVVIDITLNDTDGDGTIDDGTVDLDPNTPGQQGTFTVPGEGTYTDNGDGTVTFDPE
PDFDGVSTINYTVNDNDGNVSNTAPITVTVEDAPVALDDTGSSTAPVSDANTVSVNVVSN
DTDSDGTIDVSTVDLDPSTAGIQDTFTNVDGTYTVDANGVVTFDPNAGLTTDPTPITYTV
NDNDGNTSNEASITITYGEGPVALGDSATTGSDEDVVIDITLNDTDGDGTIDDGTVDLDP
NTPGQQGTFTVPGEGTYTDNGDGTVTFDPEPDFDGVSTINYTVNDNDGNVSNTAPITVTV
EDAPVALDDTGSSTAPVSDTNTVSVNVVSNDTDSDGTIDVSTVDLDPSTAGIQDTFTNVD
GTYTVDANGVVTFDPNAGLTTDPTPITYTVNDNDGQMETEQ
NT seq
6426 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaaattacttatcgattattattagcttcatttcataaaattaaaattcctaca
gttttgaaggatctatcatgcgccagttttacaactggcttatttcgttatacaaaattc
caaaaaagttttcaatcaaattatattcattctaatatgaaaaattctactctatcaagt
aataattggttaaatagcatattgctttttattgcttttctattaattacacctaacgtg
tttgctgatggaacaaagcaagtaatgccaaatcaaaacaatggtacagcattatatatt
gtaacagatactaattttggaggatctctagttggaccatatttagggacttcggaatct
caacgtgtttattttacaattgcagacgcttcaacagaaaatttatattttggtttgcaa
gcccgaatgcgaaatagttttgcaggaggaaataatccattagggactaatttttactac
cagatttttaatgaagcaggtgttgctcaaacatcaccaatattatttggtaatactagt
ggagaaaacgggtttattgagacttataatgaagctgtagcaggaccaaatattggtggt
gcgactcctactggttatactcctttaagttttaatccaactgcaaatggaaattactat
atagcactttatagtagttatgatggaggtacaactgtagctacaggaggaaatacttta
aatggtttagatcaattaatgtttttaccttattttgattttacagtttctacagctgct
aatgtacaatctgaaggacgtatatggtctagaaaatggagttttattacttatttagtg
gaagatgcagataatgatgttaatacaccagatgtacctaatcctactgaagcggcctct
tttgaaggaaacttttttgcttatacagatgatcaagtaattttagaagtagattttgct
gaaggttttaggccttttggttatcaattagctatgaatagatttggtgtggttgatgat
gattcagacccttcaaatagctttatagcttctagaacatctaaaacttatggtttagca
gctccagctaatttagataatggatatcaagtttttatagcatctccagatcaaaatgtt
tttattcctagtcctgaaccaagtcctgttgttgctaacggaattgttggttgtccagga
agttactttattccggttactttacaattagctcaggatactgcagttttattagaattt
aatggaactccaggttatcagtctggtactacagatgttcttttagaatcttttgaaaac
gaaccaggagaagtttttataccatgggatggtaatgatggtttaggtacgcctgtaacg
tcaagtacaatttctgtttctgtaaattcatttataggtagaacaaatgtaccgatgatt
gatgccgaattgaatttaaatggtttaagtgtaacaggagttgctcctaatacaaatagc
agacttttacgttgggatgatagagatataattgttacaggtacagtttgtgatggttca
aatcaattaaacaatttaacaactgttgatggcacgtttcaccgttctggccttttagat
ggaatagtaggtcctgctcacgcgtggagttcaagtaatccagatgattctgttccagca
atcagtcagggtggaaatgatagtgataacttattatgtaatgattttggtaatacacgt
gtaattaatacttggacttatggagctactgtagaaacagaaccagttactttagattta
cctaattgtgatggagatactgatgatgatggaattgatgatattaccgatttggatgat
gataatgatggtatattagatacagatgaattaaattgctctcctggttttgttgattta
ggtcaaacttttaatgataatacttcagatccagtaattgttaacaatgcgtatgtttat
aacagtacaaatgttgacatgacttttgaaattgaaggaagtgcggtttgggcaggagga
gtaagtaaccaaacagcagcaggtgtgtcaggctcttatgtaaacacccagccttctaat
acaaattttgttaatggagatgttggagtatacacatttacattttcacaaacagtttat
aatataaaatttaaatttggaggtttagataatgaagatagagcggattttatagcatcg
gaatcaggatttaatgttccagtacaattaacagatattaatttagcaggaaatggaact
ttcagtggtcaatctgtagtaagtagtgctaattcaggaaatgctccaaataatagcgtg
caattagaaatagcagctgcaaatcaaataataattagggttgctaaagacaatggaaat
acgggtaatgtaactttacaattttatgaattagaatattgtttgccaatcaactcagat
acagatggagctcctaaccatttagataatgatagtgatgcagatggttgtcctgatgct
ttagagggtagtggactatatgaagcaagtacattagagggagatggtagtttaggagat
aatgtagatgcaaacggaatccctgaaacatcaggttcaatttctttacaacaaacagat
gttagttctacagattctaatgtgtcaagtgcagaatgtgttccagtagctttagatgat
acgggatcaagtacagcaccagtaagtgatgctaatacagtatcagtaaatgttgtatca
aacgataccgatagtaatggaacaatcgatgtaagtacagtagatttagatccatcaaca
gcaggaatccaagacacctttaccaatgtagacggcacgtatacagtagatgctaacggc
gttgtgacttttgatccaaacgcaggattaacaacagacccaacaccaattacttatacc
gtaaatgataatgatggtaacacatcaaatgaagctagtatcactataacttatggagaa
ggtccagtagcattaggagatagtgcaacaacgggatcagatgaagatgttgtaatcgat
atcacgttaaatgatacagatggagacggaacaattgatgatggaacagtagatttagat
ccaaacacaccaggtcaacaaggcactttcaccgtaccaggagaaggaacgtatacggat
aatggcgatggaacagtaacatttgatccagaaccagattttgatggagtaagcacaatt
aattataccgtaaatgataacgatggcaatgtttctaacacagcaccaattacagtaaca
gtagaagatgcaccagtagctttagatgatacgggatcaagtacagcaccagtaagtgat
gctaatacagtatcagtaaatgttgtgtccaacgatacggatagtgacggaacaatcgat
gtaagtacagtagatttagatccatcaacagcaggaattcaagacacctttaccaatgta
gacggcacgtatacagtagatgctaacggcgttgtgacctttgatccaaatgcaggatta
acaacagacccaacaccaattacttataccgtaaatgataatgatggtaacacatcaaat
gaagctagtatcactataacttatggagaaggtccagtagcagtagatgataatgcaagt
acaacaccagatacgaatgttactttcccaattacagataatgattcagatccaagtgca
ggcggaagtatagatgttacaagtgtagatttagatccaaacacaccgggtcaacaagga
acctttaccgtaccaggcgaaggaacgtatacggataatggtgatggaacagtaacattt
gatccagaaccaggctttacaggcgtagcaacaccaatcgattacactgtaaacgataat
gacggtaacccatcaaacatagcaactataacagtaacagtagcttcatgtccatcacca
atagatagtgacggcgatgggttgacagactgtgaggaaacgacaggaatagatgatcca
agtacagtaaatgtaccagtaggcgtaacggatccatcagacgcatgtgatccaatagaa
ggtagtgatttaacagatagtgatggcgatggattaacagattgtgaggaaacaacagga
aacgataatccaaatacagctggagtaccagtagggataaccgatccaaacaatccatgt
gatccatttacagacggatcaggatgtacaccaatagcagtagatgataatgcaagtaca
acaccagatacgaatgttactttcccaattacagataatgattcagatccaagtgcaggc
ggaagtatagatgttacaagtgtagatttagatccaaacacaccaggtcaacaaggaacc
tttaccgtaccaggcgaaggaacgtatacggataatggcgatggaacagtaacatttgat
ccagacccaggctttacaggcgtatcaacaccaatcgattacactgtaaacgataatgac
ggtaacccatcaaacatagcaactataacagtaacagtagcttcatgtccatcaccaata
gatagtgacggcgatgggttgacagactgtgaggaaacgacaggaatagatgatccaagt
acagtaaatgtaccagtaggcgtaacggatccatcagacgcatgtgatccaatagaaggc
agtgatttaacagatagtgatggcgatggattaacagattgtgaggaaacaacaggaaac
gataatccaaatacagctggagtaccagtagggataaccgatccaaacaatccatgtgat
ccatttacagacggatcaggatgtacaccaatagcagtagatgataatgcaagtacaata
gaagatgcaccagtagctttagatgatacgggatcaagtacagcaccagtaagtgatgct
aatacagtatcagtaaatgttgtgtccaacgatacggatagtgacggaacaatcgatgta
agtacagtagatttagatccatcaacagcaggaatccaagacacctttaccaatgtagac
ggcacgtatacagtagatgctaacggcgttgtgacttttgatccaaacgcaggattaaca
acagacccaacaccaattacttataccgtaaatgataatgatggtaacacatcaaatgaa
gctagtatcactataacttatggagaaggtccagtagcattaggagatagtgcaacaacg
ggatcagatgaagatgttgtaatcgatatcacgttaaatgatacagatggagacggaaca
atagacgatggaacagtagatttagatccaaacacaccaggtcaacaaggaacctttacc
gtaccaggagaaggaacgtatacggataatggcgatggaacagtaacatttgatccagaa
ccagattttgatggagtaagcacaattaattataccgtaaatgataacgatggcaatgtt
tctaatacagcaccaattacagtaacagtagaagatgcaccagtagctttagatgatacg
ggatcaagtacagcaccagtaagtgatgctaatacagtatcagtaaacgttgtatcaaac
gatacggatagtgacggaacaatcgatgtaagtacagtagatttagatccatcaacagca
ggaatccaagacacctttaccaatgtagacggcacgtatacagtagatgctaacggcgtt
gtgacctttgatccaaatgcaggattaacaacagacccaacaccaattacttataccgta
aatgataatgatggtaacacatcaaatgaagctagtatcaccataacttatggagaaggc
ccagtagcattaggagatagtgcaacaacgggatcagatgaagatgttgtaatcgatatc
acgttaaatgatacagatggagacggaacaatagacgatggaacagtagatttagatcca
aacacacctggtcaacaaggcactttcaccgtaccaggagaaggaacgtatacggataat
ggcgatggaacagtaacatttgatccagaaccagattttgatggagtaagcacaattaat
tataccgtaaatgataacgatggcaatgtttctaacacagcaccaattacagtaacagta
gaagatgcaccagtagctttagatgatacgggatcaagtacagcaccagtaagtgatact
aatacagtatcagtaaatgttgtgtccaacgatactgatagtgacggaacaatcgatgta
agtacagtagatttagatccatcaacagcaggaatccaagacacctttaccaatgtagac
ggcacgtatacagtagatgctaatggcgttgtgacctttgatccaaatgcaggattaaca
acagacccaacaccaattacttataccgtaaatgataatgatggtcagatggagacggaa
caatag
DBGET
integrated database retrieval system