Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_167437
Help
Entry
LOTGIDRAFT_167437 CDS
T03273
Name
(RefSeq) hypothetical protein
Organism
lgi
Lottia gigantea (owl limpet)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
F-box-like
MBD
F-box
PHD_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20240614
NCBI-ProteinID:
XP_009063163
JGI:
167437
UniProt:
V3ZUE6
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1126 aa
AA seq
DB search
MDHSYAGPESSDVKNSVDGPPDTDHNYFGAKVKLEKDADEMSEDSEIFSDNLTAKQKVVD
QNQNSAVQSDQEMETDETKTLESSDVKDGDEAKDDSGDETGLIMDVDDNSCDKTNSGAVA
EDEGGGKSSQAESSQIDSSQAESSQIDSSQNTNNNNSSVHGDEEDGLESLMSNISEYTKD
LDMNLLLRPFKEGWKREVVQRNVFEKYSASGRKKSKPVDIYYFTPEGRKLRSMIQINDYL
NKSSSVKLPATCFCFMRKPIYREPFEIVRSAGKSRRSYDSPASVSPIKRGRPGKGNKMSP
KPTLKPNKTKSSIPEPEVVIERDEDEFSMTPYLNMAIEAAASRKRSLDDVTTPAPPVKKK
ATARKSTTPRPPSLQPKTAVTLPAHLERSEGQLCTINCPGLEGQPPELTCSQCMCLFHPK
CVNAESDVTSANFKCHRCRLLPNGTCNSIPVASNKTTSYTMVFPKPPTPKLSQTMNSTLR
TYLDSKSPQMTQSTGNSILPLEIPPLPPLKMATSSMIPRSTLPLLKPSPGISLVPPKLIA
APGTIPMRTIAPHGVISPPKPQLGLTPQTPVIVQKPSKETPVNAQLLTLPTAVTKRLNLN
QPLALKINNVHIVVPPNCVINSKEGLKVVLPPNTFGLPTDPQTKLNVTVSNNSGGVEGFK
PVSDTSSSDSASVSVNGSANSVNGSANSVNTVTSVSGDNKNSVNDISSEVSVNKMKLSNK
RKCVEGINPASCYIKSLYGGYDCMLLIFRYLSTRDLLRVGQVCKTWHNISQHLSLWRVIR
LKDIKIPDWKIACKFIRKVGVQRLSLKGLHHYDDRNRTWHQLMANLYNLVALQEITFGLV
PATVLHSVCEKLQSLQVFSAEFISDSNTEQMWNTPTKIDIGKLSKLEYLQELRLRGLGGL
VLPNTSISGSLSNLTQLKQLKILSLTSLRSFEDSDFTFLSELKNLTTLEIGDCSPWKKAY
ESLGQLVSLKRLRLECGGDFDNTTLADSLSKLQSLEELELVMFIVPNNLAERMHHLQKLY
RFVIWPYIEGRDEDSSLAQLNTNTLNSISKLCKLLYLEWGIVLTNDSSSPSKIVDSLKFQ
PGRFDSNSVSIQELTETLCSIMPDTEKIRVFRTQPLNHTKCKNKDS
NT seq
3381 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatcacagttatgctggtccagaaagttcagatgtgaaaaattcggtagacggtcca
ccagatacagatcataattattttggtgcaaaagttaaattagaaaaagacgcagatgag
atgtcggaagacagtgaaattttcagcgataacctgacagccaaacagaaagttgtggat
cagaatcaaaactctgctgtccaaagcgaccaagaaatggaaactgatgaaaccaagaca
cttgagtcaagtgacgtcaaagatggtgatgaagctaaagatgattctggggatgaaaca
gggttaattatggatgttgatgataatagttgtgataaaactaatagtggtgctgtagct
gaggatgaagggggtggaaaatcatctcaggcagaaagctctcagattgacagctcacaa
gctgaaagttctcagattgacagttcccagaataccaacaataataactctagtgtccat
ggtgatgaagaagatggtctagaatctcttatgagtaacatttctgaatacacaaaagat
cttgatatgaacttgttactccgcccctttaaagaaggttggaaaagagaagttgtgcaa
agaaatgtatttgagaaatattcagctagtggtagaaagaagagtaaaccagttgatatt
tattattttacaccagagggaagaaaattgaggtcaatgatacagataaatgattattta
aataaatcttcatcagtcaagttgccagctacatgtttctgtttcatgagaaaacctatt
tatagagaaccattcgagatagtgagatcagctggaaagtcacgaagaagttatgacagt
ccagctagtgtcagtccaataaagagaggacgtcctggcaaaggaaataaaatgagtcca
aaaccaacacttaaacctaataagactaaatcatctataccagaaccagaagtggttatt
gaaagagatgaggatgagtttagtatgacgccatatttgaatatggctattgaagcagca
gctagtagaaagcgttctctcgatgacgttactaccccagctccacctgttaaaaagaag
gcgacagctagaaagagtaccactccacgaccaccaagtcttcaaccaaaaacagctgtt
acattacctgcccatctagaaagatctgaaggtcaactatgtactattaactgtcctgga
ctagagggtcagcccccagagttgacctgtagtcaatgtatgtgtttatttcatcctaaa
tgtgtcaatgctgaaagtgatgtgacatcagctaattttaaatgtcatagatgcagattg
cttcccaatggtacctgcaacagtataccagttgcttccaataaaacaacatcatatacc
atggtatttccgaaaccgcccactcctaaacttagtcaaactatgaattccacattacgc
acctatttagatagtaaatcaccccaaatgactcaaagtaccggtaattctattttaccg
ttagaaattcccccccttccaccattaaaaatggccacttcttccatgatacctagaagt
acattaccattgttaaaaccttctcctggcatatctttggtgcctcctaagttaatagca
gctccaggaactattcctatgagaacaatagcgccgcacggtgttatttctcctccaaag
cctcaactaggcctcaccccacaaactccagtcattgtgcagaaaccatcaaaggagacg
ccagtgaatgctcagttattaacgttacccacagcagtgaccaaacgcttgaatctcaac
caacctttagctttaaagatcaacaatgtacatatagtagtgcctcccaactgtgtgata
aattcaaaggaaggacttaaagttgtgttgcccccaaatacatttggtctacctacagac
cctcaaacgaaattgaacgtgactgtttcgaacaatagtggaggtgtggaagggtttaag
ccagtttcagacacttcttcaagtgatagtgcaagtgttagcgttaatggtagtgcaaat
agtgtgaatggtagtgcaaatagtgttaatactgtgacaagtgtttctggtgataataaa
aatagtgttaatgatatatctagtgaagtcagtgttaataaaatgaaactaagtaataaa
aggaagtgtgtggaagggattaatcctgctagttgttatattaagagtttatatggtggt
tatgattgtatgttattaatatttagatatctttctactcgcgatttattacgtgttggt
caagtttgtaaaacctggcacaatatatcacagcatttatctttgtggcgagttatacga
ctaaaagatatcaagatcccagactggaaaatagcttgtaaatttatacgtaaagttggt
gtacaaagactgagtttaaaaggtttacatcattatgatgacagaaacagaacctggcat
caattgatggctaatttatataatcttgttgctctacaagaaataacttttggtctggtg
ccagccacagttttacattctgtttgtgagaagttacagagtttacaagttttctcagct
gaattcatctctgatagtaatacagaacaaatgtggaacacgccaacaaagatagatatt
ggtaagctgagtaaattagaatatttacaggaattacgattacgtggtttaggtggactt
gttttaccaaatacttccattagtggttctttatcaaatttaacacagttaaaacaactt
aaaatattgtctctaacctctttaaggtcatttgaagatagcgattttacctttcttagt
gagttaaagaaccttactacattagaaataggtgattgttcaccatggaaaaaggcatat
gaatcattaggtcaattggtcagtttaaaaagattaagattagaatgtggtggagatttt
gataatacaacattagctgattcattatctaaattacagagtttagaagaactagaacta
gtcatgtttatagtacctaataaccttgctgaaagaatgcatcatcttcaaaaattatac
cgatttgttatctggccttatattgagggaagagatgaagactctagtttagcacaactt
aataccaacactttaaacagtatatctaaattatgtaaactgttgtatttagaatggggt
atagtccttactaatgattcaagttcaccatccaaaatagtggacagtttaaaatttcaa
ccaggacgattcgacagcaatagcgtctccattcaggaattgactgaaacactttgttct
attatgcctgatactgaaaagattcgcgtctttagaacccagcctctgaatcatacaaaa
tgtaagaataaagattcctga
DBGET
integrated database retrieval system