Lottia gigantea (owl limpet): LOTGIDRAFT_231078
Help
Entry
LOTGIDRAFT_231078 CDS
T03273
Name
(RefSeq) hypothetical protein
KO
K24333
multiple epidermal growth factor-like domains protein 6
Organism
lgi
Lottia gigantea (owl limpet)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgi00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04990 Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
lgi04990
]
LOTGIDRAFT_231078
Domain-containing proteins not elsewhere classified [BR:
lgi04990
]
Laminin domain-containing proteins
Laminin EGF-like domain-containing proteins
LOTGIDRAFT_231078
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_EGF
FXa_inhibition
cEGF
hEGF
EGF_CA
EGF_2
EGF_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
20248462
NCBI-ProteinID:
XP_009049938
JGI:
231078
UniProt:
V4B093
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1639 aa
AA seq
DB search
MPTVLTKEGDHNDRYSYNSQPLSGGYLDQYKPDRYYFGRHRNKLLTAGIGYHDNYNRIPL
NHQNSIIDANQPRYPYNQPRYPYNQPNYYNQPNYQVDYGMKTQYIPTNNRVQYGASNTRF
GTDVDLTRQRGQNPTSDRSRILYGRHPAPRPLQTAAPTRAPTPPTSAPYNKVQSVDNGQY
KFQNGGYPTPSPRVITPKPTPVSDNGNPLYGSELEGPEIKDVERTTSAPTGNHLNVLRPP
FRISSKPRLAILDMKVKATGGCSVRNGGCEHVCVDGYSGRFHCRCRSGFTLGRDGKSCET
TNPCNGNIGCQHKCVNDRGRAICQCFKGYRLSRDRRTCEDVDECQRDNGQCSQACVNTKG
SFVCTCTPEYQLGEDGKSCYRIEMEVIDNCAFNKGGCAHKCRNGVNGPVCSCRKGYLLQA
DERSCEDIDECEGGDHCCDQYCNNNPGGYTCSCSRGFLLNRDGCGCEDIDECLNDNGGCE
QICVNSEGSYSCACTAGYTVSPDGRRCIADEPIDKGPERGDLPRIRYETTPLPILSITED
PYDSLLSQELQEQAAKFNCQPGTFGVNCLLNCNNCLNGAICNEEQTGCECTAGWQGIICN
ETCSQNFYGKDCNSICNCPNGNVCDSVTGECKDECPQGYYGAQCNRRCPHHCASGHCHKV
FGYCKCRPGRFGPSCNQPCPSFTWGSNCATQCDCNVDNSNGCQPETGECVCKPGYFGEKC
LDRCPADRFGEMCTRICDCPADSKCNHITGYCLKECPAGKTGQRCEESCPNGKYGPNCLK
KCHCSGSSCHPESGKCVCKAGKTGRRCRKSCPLGSWGMDCANKCTCKNGAKCDSITGECV
CKDGWYGPYCGEACPSGRFGPQCMEVCMCENNATCDQITGDCTCSPGWTGQLCDRGFPPG
RWGRWGSDCQSKCQCLNSADCDSITGECICVPGWRGAGCDKKCLNGTYGAGCLKKCKCQN
GATCDHVGGACTCSDGWRGRFCEKACPQGFYGLDCQNICNCGNGATCDHVTGDCHCESGW
YGDSCEQRCPAGKFGDDCGERCQCVNGDCDTVSGNCICSAGWRGAKCDEVCPPGFYGNSC
LYRCFCLNQGKCNHIDGSCNCTAGWEGTACESACPSGKHGKNCDLDCDCVNGKTCDRVTG
ACVCNPGFIGPRCNKTCPRGFYGAECNSMCPCKNGAKCNSESGECTCTTGWRGKNCDKPC
LPGLYGDDCNQKCSCDKDEPCNHLNGECRCPPGFSGPSCGQHCPHGTFGPECRGQCSCNE
NYDCHHVTGECVCKPGQRGRMCTQARKGGKLRKGRKGRKGKGKWRKKPKDKNGFKKLQAG
CKEGEFGPNCDQLCKCENGGECDMMTGSCMCPPGFIGPTCSERCPGNTYGEDCTGVCKCR
NGGKCSRRSGRCKCLPGFKGKHCDEVCEEGKFGMECKENCNCKNGRCDPVSGLCDCNLGW
MGGACDLPCPPNRYGPGCNHTCMCQNGGECESVTGCCTCPDGYYGHVCEMVCPQGTHGPY
CQETCDCVNGATCDARMGQCRCPPGYKGDTCQKRCPSGYFGVNCLQRCDCENSDCHHVTG
KCICPPGYSGRRCDQKCSEGRYGPSCAFFCDCDNSGICDPVSGSCSCEKGWIGATCQVVQ
IPSGPRRGDVPWAVNYSRK
NT seq
4920 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaacagttttaaccaaagagggtgatcataatgatcgatatagctataatagtcag
cctctttctgggggttaccttgatcagtataaaccagaccgctattattttggtagacac
aggaacaagttattgactgcaggaataggataccatgacaattataatcgtattccttta
aatcatcaaaattccatcattgatgctaatcaacctagatatccatacaatcaacctaga
tatccatacaatcaacctaattattataatcaacctaattatcaagttgattatggcatg
aaaacacaatatattccaactaacaatcgagttcaatatggagcatcaaatacccgattt
ggtacagatgttgatttgaccagacaaagaggtcaaaatcctacatcagatagaagtaga
attttatatggcagacatccagctccaagaccactgcaaactgcagcaccaaccagagct
cctacacctcctaccagtgctccttataataaggttcaatctgttgataatgggcagtat
aaatttcaaaatgggggttacccaactccttcccccagggttattactccaaaacctact
cctgtttctgacaatggaaatcctttatatggttctgaacttgaaggaccagaaatcaaa
gatgtagagagaactacttcagcaccaactggaaatcatctcaatgtgctgcgtccacca
ttccgcatatcaagtaaaccacgtttggctatccttgatatgaaagtaaaggctactggt
ggttgtagtgtaagaaatggtggatgtgagcatgtttgtgttgatggttatagtggaaga
tttcattgtcgatgtcggtctggctttactttgggtcgtgatggaaaatcatgtgaaacg
actaatccatgtaatggtaatattggttgtcaacataaatgtgtaaatgatagaggaaga
gctatatgtcaatgttttaaaggctatagattatctcgtgatagaagaacttgtgaagat
gtagatgaatgtcaacgtgataatggacaatgtagtcaggcttgtgttaatactaaaggt
agttttgtttgtacctgtacacctgaatatcaacttggtgaagatggtaaatcttgttac
agaattgaaatggaagtgattgataactgtgcctttaataaaggtggttgtgctcacaaa
tgtcgaaatggagtcaacggtcctgtttgctcatgtaggaagggttatttattacaggct
gatgaaagatcttgtgaagatatcgatgaatgtgaaggaggagatcattgctgtgatcag
tattgtaataacaatcctggaggttatacctgttcatgtagccgtggattcctcctcaat
agagatggctgtggttgtgaggatattgatgaatgcttaaatgataatggtggttgtgaa
cagatctgtgtaaactctgaaggttcctatagttgtgcttgtactgctggttatactgtc
tcaccagatggtagaaggtgtatagctgatgaaccaattgataaaggtcctgagagaggt
gatttaccacgaatacgatatgaaacaacaccattacctatattatcaataacagaagat
ccctatgatagtctcttgtctcaagaattgcaggaacaagctgctaaatttaattgtcaa
cctggtacatttggtgtgaactgtttgttaaattgtaacaactgtttaaatggtgctatt
tgtaatgaagaacagacaggctgtgaatgtactgctggttggcagggtattatttgtaat
gaaacttgctcacagaatttctatggtaaagattgtaatagtatatgtaattgtcccaat
ggaaatgtgtgtgattctgtaactggtgaatgtaaagatgaatgtccacaaggttactat
ggtgctcaatgtaatagaagatgtccacatcattgtgccagtggacattgccataaagta
tttggttattgtaaatgccgacctggaaggtttggaccatcttgtaaccaaccatgtcca
tcttttacatggggatcaaattgtgctacacaatgtgactgtaatgttgataattctaat
ggttgtcaaccagagacaggagaatgtgtatgtaaaccaggttattttggagaaaaatgt
ttagatagatgtccggctgatagatttggtgaaatgtgtacccgaatttgtgactgtcca
gccgatagtaaatgtaaccatattacgggttattgtttaaaagaatgtcctgctggtaaa
acaggacagagatgtgaagaatcatgtccaaatggaaaatatggtcctaattgtcttaag
aaatgtcattgctctggcagctcatgccacccagaaagtggaaaatgtgtttgtaaggca
ggaaaaactggcagacggtgtcgaaaatcttgtccactgggaagttggggaatggattgt
gctaataagtgtacctgtaagaatggagctaaatgtgactctattactggagagtgtgtt
tgtaaagatggctggtatggaccttactgtggtgaagcctgtccaagtggaagatttggt
cctcaatgtatggaagtatgcatgtgtgaaaacaatgctacttgtgaccaaattactgga
gattgtacatgttctcctggatggactggtcaactgtgtgaccgaggatttccaccagga
agatggggaagatggggtagtgattgtcaatctaagtgtcaatgtttgaacagtgctgat
tgtgactctataacaggagagtgtatatgtgtaccaggatggagaggtgcaggttgtgat
aaaaaatgtctgaatgggacttatggagctggttgtttgaagaaatgtaaatgtcagaat
ggtgctacttgtgatcatgttggtggagcctgtacatgttctgatggatggagaggaaga
ttctgtgagaaggcctgtccacaaggtttctatggattagactgtcagaatatttgtaat
tgtggtaatggagctacatgtgatcatgtaactggtgattgtcattgtgaatcaggatgg
tatggtgattcatgtgaacagagatgtcctgctggaaagtttggtgatgattgtggagag
agatgtcagtgtgttaatggtgactgtgatacagttagtggcaactgtatttgttctgca
ggttggagaggagctaaatgtgatgaagtctgtccacctggtttctatggaaacagctgt
ttatataggtgtttctgtctaaatcaagggaaatgtaatcatatagatggatcttgcaat
tgtacagcaggatgggaaggaacagcttgtgaaagtgcctgtcctagtggtaaacatggt
aagaattgtgatttagattgtgattgtgttaatggtaaaacctgtgatcgggttacagga
gcttgtgtttgtaatcctggttttatcggtcctagatgtaataaaacatgtccaagagga
ttctatggtgcagaatgtaattctatgtgtccatgtaaaaatggtgccaaatgtaacagt
gaaagtggtgaatgtacttgtacaactggctggagaggcaaaaattgtgataaaccctgt
ttacctggattgtatggtgatgattgtaaccagaaatgttcttgtgataaagatgaacca
tgcaatcatttaaatggtgaatgtagatgtccaccaggtttcagtggtccttcatgtggc
caacattgtcctcatggtacatttggaccagaatgtcgtggtcaatgttcgtgtaatgaa
aattatgattgtcatcatgtgacaggagaatgtgtatgtaaaccaggacagagaggtcga
atgtgtactcaagccaggaaaggcggtaagctaagaaagggtcgtaaaggtagaaaagga
aaaggaaaatggagaaagaaacctaaagataaaaatggcttcaaaaaacttcaagcagga
tgcaaggaaggtgaattcggacctaattgtgatcaattatgtaaatgtgaaaatggagga
gaatgtgatatgatgacaggatcttgtatgtgtccaccaggttttattggacctacttgt
agtgaaagatgtcctggtaatacatatggtgaagattgtactggtgtctgcaagtgtaga
aatggtgggaaatgtagcagaagatctggcagatgtaaatgtttaccaggatttaaggga
aagcattgtgatgaagtatgtgaagaaggaaaatttggtatggaatgtaaagagaattgt
aattgtaaaaatggtcgatgtgatcctgtatctgggttatgtgattgtaatctaggatgg
atggggggagcatgtgatttaccatgtccacccaatagatatggtcctggttgtaatcat
acttgtatgtgtcagaatggtggagaatgcgaatctgttactggttgttgtacttgtcct
gatgggtattatggacatgtttgtgaaatggtttgtccacaaggaacacatggtccatac
tgtcaggaaacctgtgattgtgttaatggagctacatgtgatgctagaatgggacaatgt
cgctgtcctcctggctataaaggagatacttgtcaaaaacgttgtcctagtggttatttc
ggagtaaattgtttacagcgctgtgattgtgagaactcagattgccatcatgttacagga
aaatgtatttgtcccccaggatattcagggagacggtgtgatcaaaaatgttctgaagga
agatatggtccgagctgtgcatttttctgtgattgtgataatagtggtatttgtgatcca
gtatcgggatcatgtagttgtgagaagggatggattggagctacatgccaagtggtacaa
attccatctggtccaagaagaggtgatgtaccatgggcagtgaattatagtcgcaagtga
DBGET
integrated database retrieval system