Latilactobacillus graminis: LG542_06580
Help
Entry
LG542_06580 CDS
T06857
Name
(GenBank) LPXTG cell wall anchor domain-containing protein
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
lgm
Latilactobacillus graminis
Pathway
lgm02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lgm00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
LG542_06580
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
pAdhesive_17
DUF3712
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFP79932
UniProt:
A0A5J6Z1W9
LinkDB
All DBs
Position
complement(1337784..1343069)
Genome browser
AA seq
1761 aa
AA seq
DB search
MKKKRRMNQKHLLRRSLYVCSGVLLLLNSGVGVASALVINQNRVQASEISPSVGLADISI
LQNASLTSDTGTQMTPNAQGNYDLALKYSGTGLATVGVADKKVLVYALPAELQGKVVGGA
TVDIHANLLPITPGEIPGVSLLFGALGTAIDGLNAVVKIPAVKAAFDRLSTVQSLGAYQE
TVPATVSPDGKTISVDFTQGFGKYVHQAYVALFDTLRDAIAAIDAGGILVKPLVEALQAA
SAKLFDILDAIAAGTSDILDNALNANLLGSMSGTLHTTVSDPNVASTTVKAGAINNALIS
ADVLTAIEQEGEAVTLNFPTTAVNPIENYDVAAPVITQPVAGQTQLAGQVTLAQPIPDGT
TFEAVVTLPDGSTKNVPLAADGTFVVETGSLVDGQTVSAKVVATNGAYTKDSPITTATVT
AAPIENPIADYDVATPTVNPLTTGDSEITGQVTLNQPIPLGTTFEAVATLPDGSKLTGIV
ENDGTFKIAGVDQLAAEQTVTVKVVATNGTYTKDSASVQLNVAAAPVEDPLANYQMATPT
IDQARDGDTNIAGQVTLSQPIPAGTTFEAIAVLPGGRQVIGTVNADGSFAVATGDPLVAG
TQVAVHIKAVNGTFAKESAPATMTVADALSTNPIENYDVPAPLVTPAVAGDKSVKGHVNL
VTPIPTNTTFKALVTYEDGTTAEVKVPETGDFEVPTRTLVADEKVSIKVIAQNGMNQKES
PATEITINKAVATDPLDGYTVPKPSVDPVTSTDTSVAGQITLNNPPVGTTFIANVKMADG
SINKANVMPDGTFTVATGALEANAVLEVTITAQNSGYEKVSEPTTVTVSKADPLENYVVA
KPSVDLIKEGDQAVTGNVTLNKPVPDGTTFEAVVTLPNGDQIKAPVNDQGQFTVPVAGIK
ADDKLTIEVVAHNDGFDKNSDPVNVTVDKVTPTNPLEGYGVAQPVVDPAKASDTTVTGKV
ALEEPIPAGTTFEAEVTLPDGSTKTGALNPDGTFTVDTGTLVAGDELIVHVIAHNGANQK
ESNPVHVLVAADTTTNPIENYTVNAPVVNPMTDGQTQVTGQVNLGIPIPNGTTFTAVVTL
ADGTTTSAPVAADGQFTVATNMLVADTTVGVKIVATNGTFTKDSSIVYQTVSPQLDTNPL
ANYTVNQPTVEPVTVDQTSVKGQVTLATPIPDGTTFEATVTLPNGTQKTAAVDANGNFEV
VTGRLTADSDLSVKITAKNSTYTKDSENVSVTVGAAIIENPLENYDVAEPVVDPVKEGDK
QVTGGVEFTKPVPDGTNFEAVVTLPNGDKVTADVDDQGHFTIPVDGIKEGDELTVEVIAH
NGDHEKASDPISVTVDKAAVTNPIEDYDVATPTLNPVKAGETVVSGTVELGDFPEGTTFE
AIMVMPNGRVRIVRLDSSNVAADGTFTIQTAALTAGQKIQVKIIATNGAFTKEGGIAEMT
VEAANPTNPLENYNVAEPVVDPVKEGDKNVTGSVEFTKPVPDGTNFEAVVTLPNGDKVTA
DVDDQGHFTIPVDGIKEGDELTVEVIAHNGDNEKASDPISVTVDKAVVTNPLEDYVVAKP
TVDPVKAGDKAVTGSVTFTKPIPEGTNFTAVVTLPNGIQVRVPVDENGQFAARVDGLKAG
DRIIVQILAENDGYQKASVPVDILVSAGDLGNPGGNSNNGNGSGNNGTGDGTGTGNNGSG
LGNGQLGGSGNGQLGGHEPGTLKPLTISSKTLNQTNSRQGTNGQYLPQTGEKATSVWSWL
GMLFLTAALFIKRLVPIKRDK
NT seq
5286 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaaaaacgtaggatgaatcaaaagcatttgttacgccgtagtctatatgtgtgt
agtggggtattgttattactcaacagtggtgtaggggttgcgagtgcgctagttattaat
caaaaccgagttcaagcgagtgaaatttcaccaagtgttgggctagctgatatctcgatt
ttacagaatgcgagtttaacttcagatactggcacgcaaatgacgcctaatgcacaggga
aattatgatttagctttaaaatattctgggactggattagcaacggttggtgtcgcagac
aagaaagtattagtttatgcgttaccagctgaattacaaggaaaagtggttggtggggca
accgtcgatattcatgctaatctgctaccgattacaccaggggagattcctggtgttagt
ttactttttggtgccctaggaacggcaattgatggcttgaatgcagttgtgaaaattccg
gccgtaaaagcagcttttgatcgtttaagtaccgtacaaagtttgggggcttatcaagaa
acagtgccagcgaccgtttcaccagatggtaagacaatctcggttgatttcacgcaaggc
tttggtaaatacgttcaccaagcttatgttgccttatttgatacactacgggatgcgatt
gcagcgattgatgcgggtggaattttagttaaaccattagtggaagcactgcaggcagct
agcgcaaaattatttgacattcttgatgcaattgcagccgggacatctgatattttggac
aatgctttaaatgctaatttgttgggttcgatgagtggtactttgcacacgaccgttagt
gatccaaacgttgccagtacaactgttaaagccggtgccatcaataatgcattgatttcg
gctgatgttttaacggcgattgagcaagaaggcgaagctgtcacacttaatttcccaacg
acggcggttaatcccattgaaaactatgatgttgctgccccagtcattacgcaaccagtg
gccgggcaaacacagcttgccggtcaagttaccttggcgcaaccaattccggatgggaca
acatttgaagcggtagtcacgttaccagatggcagcaccaaaaacgtaccgcttgcagct
gacggaacctttgttgtggagactggtagtttagtcgacggccaaactgtttcagcaaaa
gtggttgcgactaacggagcttacacgaaagacagtccaatcacaaccgcaacggtgaca
gctgcaccaattgaaaatccaattgctgattatgacgtcgcgacaccaaccgttaatccg
ttaacaacaggtgattcggaaatcactggtcaagtcacactgaaccaaccgattccgctc
ggaacgacatttgaggctgtggcaactttaccagatggctcaaaattaacgggaatcgtc
gaaaatgatgggacattcaaaattgctggtgttgatcagttagctgccgagcaaacggta
acggttaaagtcgtcgcaactaacggcacgtatactaaagacagtgccagcgtacaactc
aacgttgcagcggcaccagttgaagatccgttggctaattatcaaatggcaacgccaacg
attgatcaagcacgtgatggtgatacgaacatcgcgggtcaagtcacactcagtcagcca
attccagccggcaccacatttgaagctattgcagtcttacctggtggtcgtcaagtcata
ggaactgttaatgcagacggtagtttcgcagttgcgaccggcgatccattagttgctgga
acacaagtggcagttcatatcaaagcggtcaacggtacctttgctaaagaaagtgcaccg
gcaacgatgacagtggcggatgccttatcaaccaacccaattgaaaactatgatgtgcca
gcaccacttgtcacaccagcagtggcaggcgacaagagcgttaagggtcacgtgaacttg
gtgacgccaattccgaccaacacaacgttcaaggcattggttacttatgaagatgggaca
actgctgaagtaaaggttcctgaaaccggtgattttgaagtgccaactcggactttggtg
gctgatgaaaaagtttcaataaaagtcattgcccaaaatgggatgaatcaaaaagaaagt
ccagcgactgaaatcacaatcaacaaggcagttgcaaccgatccactagatggttatacc
gtaccaaaaccaagtgttgatccagtaacaagtacggatacaagtgtggctgggcaaatt
acgcttaataacccaccagtcgggacaacttttatcgcgaacgttaaaatggcggatggc
tcgattaacaaggcaaatgtcatgccagatggcacctttacagtcgcaactggcgcacta
gaagctaatgcggtattagaagttaccataaccgcacaaaatagtggttatgaaaaagtg
agtgagccaacaactgttacggtcagcaaggccgatccacttgaaaattatgttgttgct
aagccgagtgttgatctaattaaagaaggtgatcaagctgtcactggtaatgtgactctc
aataagccagtaccagatggcaccacttttgaagcggtggtcactttgccaaatggtgat
caaattaaagcgccggttaacgatcagggacaattcacagtgccagtggctgggattaaa
gcagacgacaagttaacgatcgaagtcgttgcccataacgatggttttgataagaatagt
gatccagtgaatgtaaccgttgacaaggttacgccaacgaatcctttagaagggtacggt
gttgcacaaccagttgttgacccagcgaaggcgagcgatacaacggtcactgggaaagtt
gctttagaagaaccaattcctgctgggacaacatttgaagcagaagtgactttaccagat
ggctcgacgaagactggcgcgcttaacccagatggtacctttaccgttgatactgggaca
ttggtagccggggatgaattaattgtccacgtgattgcccataatggtgcaaatcaaaaa
gaaagtaatcctgtccatgtgcttgttgcagccgatacaactacgaatccaattgaaaac
tatacggtgaatgcaccggttgttaatccaatgaccgacggccaaacccaagtgactggt
caagtgaatcttgggattccaattccaaacgggacaacctttaccgcagttgtcacatta
gctgatgggacaacaacgtccgcaccagttgcagctgacggtcaatttacagtcgcaacc
aacatgttagtcgctgatacgacagtcggtgtgaagattgttgcaacgaacggcacattt
accaaagatagttcgattgtttatcaaacggttagtccacaacttgatacgaatccgttg
gcaaattacacggtcaatcaaccaaccgttgaaccagtgacggtcgatcaaacgagcgtg
aaaggccaagtcactttagcaacgccaattccagacgggacaacgtttgaagcaaccgtt
accttaccaaatggaacgcaaaaaacggcggcagttgatgcaaatgggaatttcgaagtg
gtgactgggcgcttaaccgcagatagtgacttaagtgttaaaataacagccaagaatagc
acctacacgaaggatagcgaaaacgtatcagtcacagttggggcagcaattattgagaat
ccgcttgaaaactatgatgtcgcagaacccgttgtcgatcccgttaaggaaggcgataaa
caagtcaccggtggtgtagagttcacaaaaccggtgccagacggaactaattttgaagca
gtcgtgacattaccaaacggtgataaagtcacagctgacgttgacgatcaagggcacttc
acaattccagtcgatgggattaaagaaggcgatgagctaaccgtcgaagttatcgcccat
aatggtgatcatgaaaaagcaagtgatccaattagcgtgacggtcgataaagccgcagtg
acgaacccaattgaagattatgacgtggcaacaccaacattgaaccctgtaaaagcgggt
gaaacagtggttagtgggactgttgaattaggggacttcccagaaggcacaacctttgaa
gctatcatggtcatgccaaacggacgggtccgaattgttcgtctcgatagtagcaatgtt
gcagctgatgggacctttacaattcaaaccgccgcattaacggccggtcaaaagattcaa
gtcaagattatcgcaacgaacggcgcctttactaaagaaggtggcatcgctgaaatgaca
gttgaagctgccaatccaacgaatccacttgaaaactacaacgtcgcggaaccagtcgtc
gatccagtcaaagaaggcgataaaaacgtcaccggtagtgtagagttcacaaaaccagtg
ccagatggaactaattttgaagcagtcgtgacattaccaaacggtgataaagtcacagct
gacgttgacgatcaagggcacttcacaattccagtcgatgggattaaagaaggcgatgag
ctaaccgtcgaagttatcgcccacaatggtgacaatgaaaaggcgagtgacccaattagc
gtgacggtcgataaagccgtagtcaccaacccacttgaagattatgtggttgccaaacca
actgttgatcctgtcaaggcaggcgataaagctgtgacgggtagtgtgacatttacgaaa
ccaattccggaggggactaactttacagcagtggtgacattgccaaacgggatccaagtg
agggtaccagttgatgaaaatggtcaattcgcagcccgcgttgacggccttaaagctggt
gatcgaatcattgttcaaattcttgcggagaatgatggttaccaaaaagcgagtgttcca
gttgatattctggtttctgccggcgatctcggtaatcctggaggcaatagcaataatggt
aatggctcaggtaacaatggtaccggtgatggcacaggtactggtaataacggttcaggt
ttaggcaatggccaacttggcggatcaggtaatggtcagcttggtggtcacgaacctggc
acgttaaaaccattgactatcagctcaaaaactttgaatcaaactaatagtcgtcaaggt
actaacggtcaatatttaccacaaactggtgagaaagcaaccagcgtttggagttggcta
ggtatgttattcctgactgccgcactattcatcaaacgtttagtcccaatcaaacgcgat
aaataa
DBGET
integrated database retrieval system
