KEGG   Lotus japonicus: Lj6g3v1559380.1
Entry
Lj6g3v1559380.1   CDS       T04348                                 
Symbol
Lj6g3v1559380.1
Name
(Kazusa) -
  KO
K11797  PH-interacting protein
Organism
lja  Lotus japonicus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:lja00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   04121 Ubiquitin system [BR:lja04121]
    Lj6g3v1559380.1 (Lj6g3v1559380.1)
Ubiquitin system [BR:lja04121]
 Ubiquitin ligases (E3)
  Multi subunit Ring-finger type E3
   Cul4 complex
    Target recognizing subunit (DCAF)
     Lj6g3v1559380.1 (Lj6g3v1559380.1)
SSDB
Motif
Pfam: WD40 Bromodomain NBCH_WD40 Auxin_resp
LinkDB
AA seq 1727 aa
MDKKMALQKYVPSGDAPTVNMKRLSFSTKGAEKTQLNVANQNHNMNVDVDLREVYFLILH
FLSAGPCHKTCLQFWNELLEHELLPRRYHSWYSRSGACSGNADDDGLSFPLSYDKLVERY
PHIEKDHLVKLLKQLLNTASPSLGMSTRNAPNAADVPTLLGRGSFSLLSYDRDKMNEEAK
RPAAYMRWPHMKANQVHGLNLREIGGGFPRHHRAPSIRAACYAIAKPSTMVQKMQNIKRT
RGHRNAVYCAILDRSGRYVITGSDDRLVKIWSMETAYCLASCRGHDGDITDLAVSSNNAL
VASSSNDCVIRVWRLPDGLPISILRGHTGAVTAIAFSPRPNAVYQLLSSSDDGTCRIWDA
RHTQSVPRLYVPRPPDSLGKSSGPSSSTFPQSHQIFCCAFNANGTVFVTGSSDNLARVWN
ACKFSVDDADQPNHELDMQSGNENDVNYVQFSGCAVASRFSAAETLKEENIPKFKNSWLN
HENIVTCSRDGRAIIWIPKSRRAHGKSGRWTRAYHLRVPPPPMPPQPQRGGPRQRILPTP
RGVNMIVWSLDNRFVLAAIMDCRICVWNASDGSLVHSLTGHTESTYVLDVQPFNPRSAMS
AGYDGRTIVWDIWEGKPIRIYEISHFKLVDGKFSPDGTSIILSDDVGQLYILSTGQGESQ
KDAKYDQFFLGDYRPLIQDTHGNVLDQETQIVPYRRNLQDLLCDSALIPYPEPYQTEFQQ
RRLGALGLEWRPSSLRLAVGPDFSLDPDFHMLPLADLDVLTEPLPEFIDAMDWEPEIEVF
SDDADSEYNFTEDCSSRGEKGCSSSSDSGDPECSTDNSEEEDIHMDSIRRSKRKKQKNET
EIMTSSGRRVKRRNLDECDGNTFSSNRNRKGKSVKKTSRSKYSNTKSSRPQRAAARNALH
LFSKITGAPTDGEEDSLLGDFSDSESTLQESNIDSDESGRASQNDQLNCSKGKEVLLSES
QDTKSHELTETHVNAVNRRRLVLKFPIRDSSQPMHEFDKQDGLVGSSSKTADLSRNRPSS
QDPEYYFGNGSNETIERNHQLNLGQEADDVDLLGKIRWGVVRPRSSKLLRVREAVPSEAN
ANSVKCPNQLDEKENGGTGLEKENKDFSTSTLALEIQNDDDKVDNLTDNSGNCVSTSSQL
FNPAENGEVLTASSNCRDKDESLVNASMIPQDTIPAFVTHEADQLPEPNIGFPSVSTKLR
SKRGSRDGESPSKHETKSSVLKNSACSTNADNNLNNEHHIVVVEDGNNNRVTSNQGENGS
PEDAQVKQISTSHDSLEPRPNRDKMYKAVYRRSRSHKAVNNLADGSVLGESTSNGSNSNS
NVAVGLSNGTNEALHTSGSLELETATCDANNERNNFKVQQGHESCMVRSPQNASTSRGQL
TEEERGRSSKLTVGLRSTRSRRSSYNIRETSPVNIKKPTQSASKGSWLLLSTHEEGCRYI
PQQGDEVVYLRQGHQEYIDYLRKRESGPWILLKGHIRAVEYCRVQSLEYSHVPGSGDSCC
KMTLQFVDPDSSVVGKSFKLTLPEVTGFPDFLVERTRFDAAMQRNWTRRDKCRVWWKNED
NSSGSWWDGRILWDKAKSPEFPDSPWERYNVRYKSDLSETHLHSPWELFDADTQWEQPHI
DDNSRNKLLSSLTKLQQSGNTAQDRYGLRELKKISTKSKFINRFPVPLSLELILSRLENN
YYRSLEAMKHDVSVLVSNATSFLEKDADMSAKIKRLSEWFTRTLSSS
NT seq 5184 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggataagaaaatggctttgcagaagtatgttccttctggtgatgcacctactgttaac
atgaaacgtttgagtttttccactaagggggctgagaaaactcagcttaatgtggcaaac
cagaatcataacatgaatgtggatgttgaccttagggaagtttattttctcattctgcac
ttcctttctgctgggccatgtcataaaacttgtttacaattttggaatgagcttcttgag
catgaacttttgcctagaaggtatcattcttggtattcaaggagtggggcatgtagtgga
aatgcagatgatgatggtttatcattccctttaagttatgataagttggtggagaggtat
cctcacattgaaaaggaccacttagtaaagcttttgaaacagttattaaatacagcctct
ccatcgctgggcatgagcaccagaaatgctccaaatgcagccgatgtacctactcttctt
ggaaggggctcattttcacttctgagctatgacagggataaaatgaatgaagaagccaaa
cgaccggctgcttatatgcgctggcctcatatgaaagccaatcaggttcatgggctcaat
ttgagggaaattgggggtggtttccccagacaccaccgtgcaccttctatacgtgctgca
tgctatgccatagcaaaaccttctaccatggtacagaagatgcaaaatatcaagaggaca
agaggacaccgcaatgctgtgtattgtgctatattagatcgatcaggaagatatgtaatt
actggttcagatgatcgacttgtaaaaatttggtcaatggaaactgcatattgtttggcc
agttgccgtggacacgacggtgacatcacagacttggctgtgagttccaacaatgctttg
gttgcatcctcatcaaatgactgtgtcattcgagtttggcggttgccagatggattgcca
atatcaattttacggggacatactggagctgttacagccatagcatttagtcccagacct
aatgctgtttaccagcttttatcttcatctgatgacggcacttgtaggatatgggatgca
aggcacactcaatcagttccaagattatatgttccaaggcctcctgattctcttgggaag
agcagtggcccatcttcaagtacttttccgcagagccatcagattttttgctgtgcattt
aatgctaatggaactgtctttgtcactggtagttctgacaatcttgctcgggtctggaat
gcttgtaaatttagtgtggatgatgctgaccaaccaaatcacgagttagatatgcaatca
gggaatgaaaatgatgtgaattatgtgcaattcagtggatgtgcagtagcatctagattt
tccgcagcagaaactttgaaggaggaaaatatacccaaatttaagaattcatggttgaat
cacgaaaacatagttacctgctctcgtgatgggagggctattatatggattccaaaatca
cgcagggcacatggaaaaagtggtcgctggactcgggcatatcatttgagagttccacct
ccacctatgcctcctcaacctcagagaggtggtcctcgtcagagaattctaccaactcca
cgtggtgtaaatatgattgtttggagcctagacaaccgcttcgtccttgcagctattatg
gattgcagaatttgtgtttggaatgcttctgatggcagcttagtacactcgttgactgga
cataccgagtctacatatgttctagatgttcagccttttaatccgcggagcgctatgagt
gctggatatgatggaagaactattgtgtgggatatatgggaaggcaagcctatccgaata
tatgagatatcgcatttcaagttagtggatgggaagttttctccggatgggacatcaatt
atactttcagatgatgttggtcaactttatatattaagcacaggtcaaggtgagtcccag
aaagatgccaaatatgatcagttctttcttggtgattatcgacctctcattcaagatacc
catggtaatgtacttgaccaggaaactcaaattgttccatatcgacggaatctgcaagat
ttgctctgtgattcagcactgataccatacccagaaccttatcagactgaatttcagcaa
agacgattgggagctttaggtctcgagtggcgcccgtcatcactaaggcttgctgttggt
cctgacttcagtttggatcccgattttcatatgcttccattggcagacttggatgtgctt
acagaaccattaccagagtttatagatgctatggattgggagcctgaaattgaagtcttt
agtgatgatgctgattcagaatataatttcactgaagattgctcttctcggggtgagaaa
ggatgttcaagctccagtgactctggtgatccagagtgcagcacagataacagtgaagag
gaggacattcacatggatagcattcgtagatcgaagagaaaaaaacagaagaatgaaact
gagattatgacttcttctgggagacgtgtgaaaaggaggaatttggatgagtgtgatggc
aatactttcagcagtaaccgaaataggaagggaaaaagtgtcaaaaaaacatcaaggagc
aaatattctaacacaaaatcttcaagacctcaaagagccgcggcacgcaatgctctgcat
ttattttccaaaattacgggtgcaccaacagatggagaagaagatagtttgcttggtgat
ttttcagatagtgagtcaacgttgcaagagtctaatattgacagtgatgaatctggtaga
gcttcacagaatgaccaactgaattgttccaagggaaaagaagtattattgtctgaatca
caggacacaaaatctcatgagttaactgagactcatgtgaatgcagtgaaccggaggaga
ttggttctcaagtttccaattcgtgattcatctcaacccatgcatgagtttgacaagcag
gatggattggttggttcatcatcaaaaactgctgatttaagtaggaacagaccaagttct
caggatcctgagtattattttggcaatggaagcaatgaaacaattgaaagaaatcatcaa
ctaaacctaggccaggaagcagacgacgtggacttactaggaaaaattagatggggagtg
gttaggcctcgttcatctaaacttcttagagtgagagaagctgtgccatcagaggcaaat
gccaactctgtaaaatgtcctaatcaactcgatgaaaaagaaaatggtggtactgggctc
gagaaggagaacaaggactttagtacatcaacccttgctttagaaattcagaatgatgat
gataaggtagataacttgaccgataacagcggaaattgtgtcagcacttcttcacagctt
tttaatcctgctgagaatggagaagtgctcactgcttccagcaattgcagggataaagat
gaatcactagttaatgcaagcatgattcctcaggatactattcctgctttcgtcacccat
gaggctgaccaactacctgaaccaaatattggttttccttctgtttcaacaaagctaagg
tctaaaaggggttcacgggatggtgaaagtccatccaagcatgagacaaaatcttcagtg
ctaaagaatagtgcatgtagcactaatgctgataataatttgaacaacgaacaccatatc
gttgtggttgaggatggcaacaataatagagtaacatctaatcagggagaaaatggttct
ccagaagatgctcaggttaaacaaattagtacttcccatgattcactagagccacgtcca
aatagagataaaatgtataaagctgtttatagaagatcaagatcacataaggctgtgaat
aatttagctgatggaagtgtcttgggagaatccacttcaaatggtagcaacagtaattcc
aatgtggctgtgggcttaagtaatggcacaaatgaagctctgcataccagtggttcctta
gagttggaaacagctacttgtgacgcaaataatgagcggaataatttcaaagtgcagcaa
ggacatgaatcttgtatggttagaagcccacagaatgcttctacaagcagaggacaactc
acagaagaagaaaggggacgtagttcaaaattgactgttggtttgaggtccaccaggagt
cggaggtctagttataatattcgggagactagtcctgtaaatattaaaaaaccgacacaa
tcagcttccaaagggtcatggttgctgttatcgacgcatgaggaaggatgcagatatatt
ccacaacagggagatgaagttgtatatttgagacagggacaccaggagtatatagattat
ctccgtaaaagagaatcggggccttggatattgctcaagggacatataagagctgtagaa
tattgtagagttcaaagccttgagtattctcatgttccagggtctggtgatagctgctgc
aaaatgacccttcagtttgtagatcctgattcaagtgttgttggcaaatcttttaaatta
accctacctgaagtgaccggtttcccagattttcttgttgagagaactaggtttgatgct
gccatgcaaagaaactggacccggagggataaatgcagggtttggtggaagaatgaggac
aattcctccggtagttggtgggatggtcgaattctgtgggacaaagccaagtctcctgaa
tttccagacagtccatgggagaggtataatgttcggtacaagagtgacctctctgaaaca
catttgcacagtccttgggagctttttgatgctgatactcaatgggaacagcctcacatt
gatgataacagtcgaaataaactgctatcttctctgaccaaattacagcagtcaggcaac
actgcgcaggatcgttatgggttgcgtgaattgaagaaaatttcaaccaagtcaaaattt
ataaacaggtttcctgttcctctgtctcttgaattgatactgtcaaggttggaaaacaat
tactaccgtagtttggaggcaatgaagcacgatgtctccgttctagtgtcaaatgcgacc
tcttttcttgaaaaggacgcagacatgtccgcgaaaatcaaacgcctatcagaatggttc
acccggaccttatcatcttcatag

DBGET integrated database retrieval system