Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 8530: LRHK_2019
Help
Entry
LRHK_2019 CDS
T01961
Name
(GenBank) alpha amylase, catalytic domain protein
Organism
lra
Lacticaseibacillus rhamnosus ATCC 8530
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AER64770
LinkDB
All DBs
Position
complement(1966914..1968692)
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MFQFDSFTDRQPFGAVRKATTIHFTAKADGAVTQASLIIMPDGRGDQTETLPMTKSPNGY
TVSFAPQTAGLWFYHFELQTDEGRQRFGAVDGGFGGIGQVYPENADVNSYQLTVVNEFDP
VPEWYRHARFYHIFVDRFNNGNADGHVNAPKANSFIYGRQSDRPMYIRGTNGEVLRWDFY
GGNLTGIQQKLPLLAARGINALYLSPIFQARSNHRYDTGDYYAIDEVLGTLHDFKQFLAA
AHQLGMHVILDGVFNHVGADSRYFNAVNEYDDVGAANSLDSPYASWFSFKRFPDDYNSWW
GVKDLPAINKDNQDFHNFIAAKKDSVISYWTDLGVDGWRLDVADELTDDFIHQIRTTLDQ
FPDRVLIGEVWEDASNKQAYGKRRQYFEGGELNAVMNYPLRSMLIDFVNGQLSAAGFVRQ
LMTLKENYPPNAFAFNFNNIGTHDTARILTVLNGDRRKLQLIVSLLYWLPGVPCLYYGDE
AGLTGGKDPDNRAFYPWGHEDQAILDMYQIALQTRIDQPALAADAAFFPFTFEDSLGFVR
QNEAQTLVVLANPTCSPQVLQDPNAKLVPANLRSLLPMGTMVPPGSVIWQAI
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttcaatttgattcattcaccgatcggcagccttttggggcagttcggaaggcaaca
acgattcatttcacggctaaagctgacggtgcggtgacgcaagcctcactgattatcatg
ccggatgggcgcggggatcaaaccgagacattgccaatgaccaaaagcccgaatggttat
acggtgagttttgccccgcagacggctggtttatggttttaccattttgaactgcaaacc
gatgaaggccgccaacgctttggtgcggttgatggcggttttggcgggatcgggcaagtt
tatccggaaaatgccgatgtgaacagttatcagctgaccgtggtcaatgagtttgaccca
gtgccggaatggtatcggcatgcgcggttttaccatattttcgtggaccggtttaataac
gggaatgcggatggccacgtcaacgcaccgaaagccaattcttttatctatgggcgccag
tcggatcggccaatgtatattcgcggtaccaatggcgaagtgttgcgctgggatttttat
ggtggtaacttaaccggcattcagcaaaaattgccgctgttagctgcacgggggattaat
gcgctttatctgagcccgatttttcaggcgcgcagcaatcaccgctatgataccggtgat
tattatgcgattgatgaagtgttaggtacattgcatgatttcaagcagtttctggcggcg
gctcatcagctggggatgcatgtgattctggatggtgtgttcaatcatgtcggtgccgac
agccggtatttcaatgccgtgaacgaatatgacgatgttggtgcggcgaacagtctggat
tcaccatacgcatcgtggttttcgtttaaaagatttcctgatgactataacagctggtgg
ggggttaaagacctcccggcgattaataaagacaatcaggattttcacaattttattgcc
gctaaaaaagattcggtgatcagttattggaccgatctgggcgtggatggctggcgtttg
gatgtcgccgatgagctgactgacgactttattcatcaaattcggacgacattggatcag
tttcctgaccgggttttgatcggtgaggtttgggaagatgcatcgaataagcaggcttat
ggcaaacgccgccagtattttgaaggtggcgagctgaacgccgtgatgaattacccgttg
cggtcgatgttgattgattttgtcaacggtcaactcagcgcggccggttttgtccgccag
ttaatgacgctcaaggaaaactatccgcccaatgcgtttgcgtttaattttaataacatt
ggcacgcatgatacggcgcgaatcttgaccgtgttgaatggtgatcggcgtaagttacaa
ttgattgtgtcacttctttattggctgccgggggtaccttgtctttattatggcgacgag
gcaggattaaccggcggcaaggatccggacaaccgcgccttttatccatgggggcacgaa
gatcaagccattttggatatgtatcagattgcgttacagacgcggatcgatcaaccagct
ttagcagccgatgcggcatttttcccgttcacgtttgaagacagcctcggttttgtccgg
caaaacgaggcccagacgttggtcgtcttggccaaccccacctgctcgcctcaggtttta
caagacccgaatgccaagcttgttccggctaatctgcggtcacttttgccaatgggaacc
atggtgccgcctggaagcgtgatttggcaagctatctaa
DBGET
integrated database retrieval system