Lucilia sericata (common green bottle fly): 119602510
Help
Entry
119602510 CDS
T08270
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: collagen alpha-1(IV) chain
KO
K06237
collagen type IV alpha
Organism
lsq
Lucilia sericata (common green bottle fly)
Pathway
lsq04512
ECM-receptor interaction
lsq04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
lsq00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
119602510
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
119602510
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
04147 Exosome [BR:
lsq04147
]
119602510
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lsq00536
]
119602510
Exosome [BR:
lsq04147
]
Exosomal proteins
Exosomal proteins of other cancer cells
119602510
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
lsq00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
119602510
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119602510
NCBI-ProteinID:
XP_037810005
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1780 aa
AA seq
DB search
MEPLWKRLLFAAVLAGALVGINAQFWKTADTGAIYNSAKHYRPEVETPRNPIDDSYAVID
SATTTRTGQVPSNCTSGTVGCIPKCFAEKGNRGLQGAIGAPGPKGMPGYPGPEGPPGDKG
QKGDPGPEGPRGLKGERGTAGIPGMAGVPGIQGIAGNPGAPGIPGKDGCDGEKGLPGVTG
LSGMTGPRGYPGQPGAKGEKGEPAKENGDYAKGEKGEPGFAGRSGNPGPEGPIGPKGDRG
DTGAYGPPGQRGDRGQKGEKGAPCFARPQPGKKGEKGQKGEPARKHKLTGQETYSGERGE
KGDKGDTGPAGIKGEVGFQGEPGRDGMKGEKGLPGPSGDRGRQGSYGPPGPAGQKGDRGD
TGLNGLPGKPGQKGEPGRPGQPGERGLVGPPGPPGGGRGSPGAPGPKGPRGYTGAPGPKG
LDGFDGPPGPQGLPGAKGGPGVPGHNGVEGPPGEKGEKGNPGREGSMGPQGPTGHTGPPG
PEGQKGEAGLPGYGERGFKGDDGIPGMPGAKGQKGERGFPGNVGAPGDSKLGRPGTPGRI
GAPGQKGDAGRPGTPGQKGDMGPKGDIGGKCSSCPYGQKGDKGERGVDGAPGQPGLRGPP
GERGYPGERGADGIAGPPGAPGEKGKDGLPGAPGPYGPPGKDALIDLNQIEAEKGDKGER
GYPGPAGLKGERGERGEPGRNGEKGEMGAKGDKGFMGPPGSDGTPGTPGRDGLDGIPGQS
IKGDTGRAGFDGAKGDKGFSGPQGEKGEPGSCAVDMLXVPAKGNKGDRGLQGXPGPQGVQ
GIKGDAGRPGEKGERGPQGPVGPTGARGLTGPRGEKGNQGPIGAPGNPGKDGFNGPPGRT
GAPGQKGEMGIAGIGPRGPQGRPGLTRXEGERGPTGNYGPPGKDGPPGYPGDKGDAGYPG
APGMPGVDGAKGDMGPIGPPGPQGPPGIPGVDGVQGRDGAKGEPGNPGLVGMPGLKGERG
APGNDGPKGSPGVTGQPGKRGPPGPAGIPGAKGDRGERGLTGRDGLTGPRGPPGPPGLMG
VKGDLGPVGPPGADGIPGLDGEKGDRGFTGEMGPRGEPGDASEKGQKGEPGAPGLRGEDG
LPGAPGMQGEKGVAGIAMHGRPGLPGEKGDRGRDGMNGRDGAQGXEGDQGLPGLMGAKGA
KGEMGLPGVPGAPGMDGKPGEVGAPGPVGYMGLKGDKGERGYSGINGAKGERGEPGLPGF
AGAPGPKGERGLTGPAGLDAKPFTIRGDKGEMGEAGLIGLPGPMGLKGNQGAPGFNGPKG
DRGMTGPPGAPGLNGLPGMKGDMGPRGDVGAPGLTIKGEKGLPGRTGXNGREGAPGPAGL
KGDKGLPGLPGTPGAXGPPGVPGPQGPKGDRGLVGQPGRDGHDGMPGVQGIKGDMGYPGP
KGEMGPPGFQGQKGXKGDLGFTGAPGLPGRAGMKGDMGMSGLDGLPGPVGAPGEKGYPGP
AGINGRDGKPGTKGDKGEPGMVPPPGPKGEPGYPGRDGQKGERGAPGPRGLIGLQGERGE
KGDQGLIGLTGPTGRPGMKGDQGLPGPMGREGLPGALGPKGEPGAPCTAAQDYLTGILLV
KHSQSEEVPRCEPGHIELWTGYSLMYVDGNDYAHNQDLGSPGSCVRRFSTLPVLSCGANN
ICNYASRNDKSFWLTTSAPLPMMPVPAQDVSNYISRCTVCEAPSNVISIHSQSLDIPSCP
NGWEGLWIGYSFMMHTAAGNGGGGQDMSSPGSCLQDFRTTPFIECNGGKGHCHFYETMSS
FWMVTMEEYQQFQRPAMETLKAGNLLQKVSRCQVCIKNSS
NT seq
5343 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagcccctctggaagcggctactttttgccgctgtattagctggagcgttagtggga
attaatgctcaattttggaaaactgccgatactggagctatctataactccgccaaacat
tatagacctgaagtcgaaactcccagaaatcccattgatgatagttatgctgtaattgat
agcgctacaaccacccgtaccggtcaagtaccctcaaattgtactagcggtacagtcggt
tgcataccaaaatgttttgctgaaaaaggtaaccgtggtcttcaaggtgccatcggtgct
cccggtcccaagggtatgcctggttatcccggtcccgaaggtcctccaggtgacaagggt
caaaagggtgatcccggtccagaaggtcctcgtggtcttaagggtgaacgtggtacagct
ggtattcccggtatggctggtgtgcccggtattcagggtattgctggtaatcccggtgcc
cctggtattcctggtaaagacggttgtgatggtgaaaaaggtttacctggtgttaccggt
ctcagcggtatgactggtcctcgtggttatcctggtcaacccggtgctaagggtgaaaaa
ggtgaacctgctaaggaaaatggtgattatgctaagggtgagaagggtgaacctggtttt
gctggtcgttctggtaatcctggtcccgagggtcctattggtcccaagggtgatcgtggt
gatactggtgcatatggtcctcctggtcaacgtggtgaccgtggtcaaaagggtgaaaag
ggtgctccctgctttgctcgtcctcaacccggtaagaaaggtgaaaagggtcaaaagggt
gaacctgctcgcaaacataaattgactggacaagaaacgtacagcggcgaacgtggtgaa
aagggtgacaaaggtgatactggcccagctggcataaagggcgaagtcggtttccaaggt
gaacctggtcgtgatggtatgaaaggtgaaaaaggtcttcctggtccttccggtgataga
ggtcgtcaaggtagctatggtcctcctggtcctgccggtcaaaagggtgatcgtggtgat
actggtttgaatggcttgcctggtaaacccggtcaaaagggtgaacctggtcgtcccggt
caacctggtgaacgtggtcttgttggtcctcctggtccccccggtggtggccgtggttcc
cctggcgctcctggtcctaaaggtcctcgtggttacactggtgctcccggtcctaaaggt
ttggatggttttgatggtcctcctggtccccaaggtttgcctggtgctaaaggtggtccc
ggtgttcctggtcacaatggtgttgaaggtcctcccggtgaaaagggtgagaaaggtaat
ccaggtcgtgaaggttcaatgggtcctcaaggccctactggtcacactggtccaccaggt
cctgaaggtcaaaagggtgaggctggtcttcctggctatggcgaaagaggctttaagggt
gatgatggtattcctggtatgccaggcgcaaagggtcaaaagggtgaacgcggtttccct
ggtaatgtcggtgctcctggtgactccaaattaggtcgtcctggtactcctggtcgtatt
ggtgcccctggtcaaaagggtgatgccggtcgtcctggtacccccggtcaaaaaggtgac
atgggtcctaaaggtgatattggtggtaaatgctcaagctgtccttatggtcaaaagggt
gacaaaggtgaacgcggtgttgatggcgctcctggtcaacctggtcttcgtggtcctcct
ggtgaacgtggttatcctggtgaacgcggtgctgatggtattgccggtcctcccggtgct
cctggtgaaaagggtaaagatggtcttcctggtgcccctggtccatatggtccccctggt
aaagatgctcttattgacttgaaccaaatcgaagctgagaaaggtgacaagggtgaacgt
ggttatcctggtcccgctggtcttaagggtgaacgtggtgaaagaggtgaacccggcaga
aacggagaaaaaggtgaaatgggagccaagggtgacaaaggttttatgggtcctcccggc
tctgacggtactcctggtactcccggtagagatggtcttgatggtattcctggtcaaagc
attaagggtgacactggtcgtgccggttttgatggtgccaagggtgacaaaggtttctct
ggaccccaaggtgaaaagggcgaacctggctcctgtgctgttgatatgcttncagtaccc
gctaaaggcaacaagggtgatcgcggtcttcaagganatcctggcccacaaggtgttcaa
ggtataaagggtgatgctggcagacctggcgagaaaggtgaacgcggtccacaaggtcca
gtaggtccaactggtgctcgtggtttgactggtcctcgtggtgaaaagggtaaccaaggt
ccaattggtgctcctggtaaccccggtaaagatggtttcaatggtcctcccggtagaact
ggtgctcctggtcaaaagggtgaaatgggtattgctggtattggtcctcgtggtcctcaa
ggtcgtcctggtttaacccggtgagaaggtgaacgtggtcccactggtaattatggtccc
cccggtaaagacggtcctcctggttatcctggtgacaagggtgatgctggttatcctggt
gcccctggtatgcctggtgttgatggtgccaagggtgatatgggtccaattggtcccccc
ggtccacaaggtcctcccggtattcctggtgttgatggtgtacaaggtcgtgatggtgca
aagggtgaacctggtaatcccggtttggtcggtatgcctggtttgaagggtgaacgcggt
gctcctggtaatgatggtcccaaaggttcccccggtgttaccggtcaacctggtaaacgt
ggtcctcctggtccagctggtattcccggtgccaagggtgacagaggtgaacgtggttta
actggtagggatggtttgactggtcctagaggtcctcctggccctcctggtttgatgggt
gttaagggtgatttaggtccagttggtccccccggtgctgacggtattcccggtcttgat
ggtgaaaagggtgatcgtggtttcactggtgaaatgggtcctcgtggtgaacctggtgat
gcttctgaaaagggtcaaaagggtgaacctggcgcacctggtctacgcggtgaagatggt
cttcctggcgctcctggtatgcaaggtgaaaagggtgttgctggtattgctatgcacgga
cgtcccggtcttcctggtgagaagggtgatcgtggtcgtgatggtatgaatggacgtgat
ggtgcccaaggtnatgagggtgaccaaggtttgcctggtcttatgggagccaagggtgct
aagggtgaaatgggtcttcctggtgttcccggagctcctggtatggatggtaaacccggt
gaagtcggcgctcctggtccagttggttacatgggtcttaagggtgacaagggtgaacgt
ggttattccggtatcaatggtgccaagggtgaaagaggtgaaccaggtttacctggtttc
gctggcgctcctggtcctaagggtgaacgtggtttgactggtcccgctggtttagatgct
aaacctttcaccatcaggggtgacaagggtgaaatgggtgaagctggtttaattggtttg
cctggtcctatgggtcttaagggtaatcaaggtgcacctggtttcaatggtcctaaaggt
gatcgcggtatgactggtccacctggcgctcctggtttgaatggtctccccggcatgaag
ggtgatatgggtcccagaggtgatgttggtgctcctggtttgacaattaagggtgaaaag
ggtttgcctggccgtactggtnaaaatggacgtgaaggtgctcctggtcctgctggtctt
aagggtgacaagggtttgcctggtcttccaggtactcctggtgccnatggtcctcctggt
gttcctggtccccaaggtcctaaaggtgatcgcggtttagtaggtcaacctggtagagat
ggtcatgacggtatgcccggtgttcaaggtattaagggtgatatgggttatcccggtcct
aagggtgaaatgggtcctcctggcttccaaggacaaaagggtngaaagggtgatttaggt
ttcactggtgcccctggtctacctggtcgtgctggtatgaagggtgatatgggtatgagt
ggtctcgatggcttgcctggtcctgttggcgctcccggtgaaaagggttatcctggtcct
gctggtattaacggtcgcgatggtaaacctggtactaagggtgataaaggtgaacctggt
atggtacctcctcccggtcctaaaggtgaacctggttatcctggtagagacggtcaaaag
ggtgaacgtggtgctcctggtcctcgtggtttgattggcttgcaaggtgaacgcggtgaa
aagggtgatcaaggtttaattggtcttactggtcccactggacgtcccggtatgaagggt
gatcaaggtcttcctggtcccatgggtcgcgaaggtcttcccggtgctctcggtcctaag
ggtgaacctggtgccccttgcactgctgcccaagattatcttaccggcattttattggtc
aaacacagtcaatccgaagaagtaccacgttgcgaacctggccacattgaattgtggact
ggttattctctcatgtacgtcgatggtaacgattatgcccacaaccaagatttgggttcc
cccggttcttgtgtacgtcgcttctctactctgcccgtactctcttgcggtgccaacaat
atttgcaactatgcctccagaaacgataaatcattctggttgaccacatcggcacctttg
ccaatgatgccagttccagctcaagatgtcagcaactacatttctcgttgtaccgtatgc
gaggctccatcaaatgtcatttccattcacagtcaatctttagacattccaagctgtcca
aatggttgggaaggtctctggatcggttacagtttcatgatgcacactgccgcaggtaat
ggaggtggtggtcaagatatgtcctcacctggttcctgcttacaagatttccgcaccaca
cccttcattgagtgtaacggcggcaaaggtcactgccacttctacgagaccatgtccagt
ttctggatggtcactatggaagaataccaacaattccaaagacccgctatggagaccctt
aaggctggcaatctgctacaaaaggtctcaagatgtcaagtttgtattaagaactcatca
tag
DBGET
integrated database retrieval system
