Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae F38: MCCPF38_00745
Help
Entry
MCCPF38_00745 CDS
T03703
Symbol
dnaE
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K02337
DNA polymerase III subunit alpha [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mcap
Mycoplasma capricolum subsp. capripneumoniae F38
Pathway
mcap03030
DNA replication
mcap03430
Mismatch repair
mcap03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mcap00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MCCPF38_00745 (dnaE)
03430 Mismatch repair
MCCPF38_00745 (dnaE)
03440 Homologous recombination
MCCPF38_00745 (dnaE)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mcap03032
]
MCCPF38_00745 (dnaE)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mcap03400
]
MCCPF38_00745 (dnaE)
Enzymes [BR:
mcap01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MCCPF38_00745 (dnaE)
DNA replication proteins [BR:
mcap03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MCCPF38_00745 (dnaE)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mcap03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MCCPF38_00745 (dnaE)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
DNA_pol3_finger
HHH_6
PHP
tRNA_anti-codon
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEA12102
UniProt:
A0A9P1P876
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(770281..773241)
Genome browser
AA seq
986 aa
AA seq
DB search
MNYLPLLTIKSEYNFLESLITIDSYIKFIKKNNFSYAFYNETHTMYGVAEFFKKAIDNNI
KPIIGLTLELEENKLCIYAKNRQGYQILNYLSSFLNDGFSHHDYEIKEYFLNLVNNNVVV
IGLISNLDFKISLKNQLNNDFYDVKELNLYFNQISYLDINDQRIFNILNAIKTNKTIDQI
QNINNYFYPDIDYLSKNYSLENIKKVISEINSKVDFNLFDSNEKHLVKYKNINNLSSFEY
LRQVCLLSLKKYQQKIKPNLDLKLYINRLNYELEIIKQMRFSDYFLIVSDYVNFAKKNDI
LVGPGRGSAAGSLISYLLRITDIDPLEYDLLFERFLNPDRSSLPDIDLDFQDNRREEVLE
YLFEKYGKNHVGMITTYQTIGYKMAWRDVCRVFNIDLLIVNKISKVLDQYTNFDFLEFIK
ENKLLNDYFQNDLFKEIFITMHKIVGLPRQTSTHAAGIVLTDCDLRELVPIKIGFNGINQ
TQFDMNYLDALGLIKMDILGLRNLTTIQEIKHLIYLNQNLKINLNKIDLNDKKAFELLKN
KQTSGIFQLESKGMTDLISKMQVDSIEQISIASALYRPGPQEMIPIYLENKKTNKFKIID
KSVYEILKPTYGIIVYQEQVMQMLNKVANFSYAKADIIRRAMSKKNNKVMQSMKLEFINS
AIKNNFSYNKANLIWNWIEKFSNYGFNKSHSISYSYISYWLAYFKAHFTTEFYTSLLDQN
IGNEIKTQQYIKELYDYKIKVNKPSVINSNFNYQIINKQIYMPLTCIKSIGYEVVKKINL
AKSENENMYLDIHNFILAIIKQKINVNVLQTLIKAGALDIFNYNKKTMIENLDLLISQAN
AYKQVNNILDDEKINLIIYDEYEDKILASFEKELYGFFIDQNPILKLKTNNFNLNLIDIS
KLEYNKVQVILGYILKIKEIKDKNNNKMAFVTVFDNTSELELTIFSSDYKDIYDQLIENK
AYVFKVLKTKTNNKTSIKFISLIKAI
NT seq
2961 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattatttaccattattaactattaaaagtgaatataattttttagaatctttaatt
actattgatagttatattaaatttattaaaaaaaataattttagttatgctttttataat
gaaactcacactatgtatggagtagctgaattttttaaaaaagctattgataataatata
aaaccaataattggcttaacattagaacttgaagaaaataagttgtgcatttatgcaaaa
aatagacaaggttatcaaatacttaattatctttctagttttttaaatgatggatttagt
catcatgattatgaaattaaagaatattttttaaacttagttaataataatgttgttgta
attggtttaattagtaatttagattttaaaattagtttaaaaaatcaattaaataatgat
ttttatgatgttaaagaattaaatttgtattttaatcaaataagttatttagatataaat
gatcaaagaatttttaatattttaaatgctattaagactaataaaacaatagatcaaatc
caaaatattaataattatttttatccagatattgattatttatcaaaaaattattcatta
gaaaatattaaaaaagttattagtgaaattaattcaaaagttgattttaacttgtttgac
agtaatgaaaaacacttagtaaaatacaaaaatataaataacttatcttcttttgaatat
ttgcgtcaagtttgcttattatcattaaaaaaatatcaacaaaaaattaagcctaattta
gatttaaaactatatattaatagattaaattatgaattagaaattattaaacaaatgaga
tttagtgattattttttaatagttagtgattatgtgaattttgcaaaaaaaaatgatatt
ttagtaggtcctggtagaggaagtgctgctggtagtttaattagctatttattaagaatt
acagatattgatccattagaatatgatttattatttgaaaggtttttaaatccagatcgt
tctagtttaccagatattgatttagattttcaagataatagaagagaagaagttttagaa
tatttatttgaaaaatacggcaaaaatcatgttggtatgattacaacttatcaaactatt
ggttataaaatggcttgaagagatgtatgtagagtttttaatattgatttattaatcgtt
aataaaatttctaaagttttagatcaatacacaaattttgattttttagaatttattaaa
gaaaataaattattaaatgattattttcaaaatgatttgtttaaagaaatatttataaca
atgcataaaattgtaggcttaccacgtcaaacatcaacacatgcagctggaattgtatta
actgattgtgatttaagagaacttgttcctattaaaattgggtttaatggaattaatcaa
actcaatttgatatgaattatttagatgctttaggtttaattaaaatggatattttagga
ttaagaaatttaactactattcaagaaattaaacacttaatatatttaaatcaaaactta
aaaattaacttaaataaaattgatttaaatgataaaaaagcttttgaacttttaaaaaat
aaacaaacttcaggaatttttcaacttgaatcaaaaggaatgactgatctaatttcaaaa
atgcaagttgatagtattgaacaaatttcaatagcttcagctttatatcgtccaggtcct
caagaaatgattcctatttatttagaaaataaaaaaactaataagtttaaaatcattgat
aaaagtgtttatgaaattttaaaaccaacttatggaattattgtttatcaagaacaagtg
atgcaaatgcttaataaagtagctaatttttcttatgcaaaagcagatattattagaaga
gctatgagtaaaaaaaataataaagtaatgcaatcaatgaaattagaatttattaatagt
gcaattaagaataatttttcttataataaagctaatttaatttgaaattgaattgaaaag
ttttcaaattatggatttaataaatcacattctatttcttattcttatataagttattga
ttagcttattttaaagctcattttacaactgaattttatactagtttattagatcaaaat
attggtaatgaaattaaaactcaacaatatattaaagagttgtatgattataaaattaaa
gttaataaaccaagtgtaattaattctaattttaattatcaaattataaataaacaaatt
tatatgcctttaacttgtattaaatcaattggttatgaagtagttaaaaagattaattta
gctaaaagtgaaaatgaaaatatgtatttagatattcataatttcatactagctataatc
aaacaaaaaattaatgttaatgtattacaaactttaataaaagctggagctttagatatt
tttaattataataaaaaaacaatgatagaaaatctagatctattaattagtcaagctaat
gcttataaacaagttaataatattttagatgatgaaaaaattaatttaattatttatgat
gaatatgaagataagattctagcaagctttgaaaaagaattatatggtttttttattgac
caaaatcctattttaaaacttaaaactaataattttaatttaaatcttatagatatttct
aaacttgaatataataaagtgcaagtgattttaggttatattttaaaaattaaagaaatt
aaagataaaaataacaataaaatggcatttgtaacagtttttgataatactagtgaactt
gaactaacaatttttagtagtgattataaagatatttatgatcaattaatagaaaataaa
gcttatgtttttaaagtactaaagactaagacgaataataaaacttcaataaagtttatt
agtttaattaaagctatttag
DBGET
integrated database retrieval system
