Methylovorus glucosetrophus: Msip34_1243
Help
Entry
Msip34_1243 CDS
T00943
Name
(GenBank) Hemolysin-type calcium-binding region
Organism
mei
Methylovorus glucosetrophus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HemolysinCabind
PD40
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACT50489
UniProt:
C6XD64
LinkDB
All DBs
Position
1329023..1334425
Genome browser
AA seq
1800 aa
AA seq
DB search
MANFSYSSLSAFNFADINQQLDNGSTELDNAFALLESSGDLQNVEYSNTRITGNYGEWNV
VIRGNNFNNQNPVITSYLVSNAAGTVLKLSGRVDPDTGGVLTSISVATANISVNYAGSFR
INADGDIVSGRVTTYQISTSTYKIVVSGNMYIDVDSGDLTSGVITRLSIEGSDGEYFFAN
NISILAANFDPLTDADRDLQSLFDAMSKAGNDVIVGGGGNDSIAGGAGNDTLRGGAGDDT
LDGGVGADSLAGGAGGDLYIVDSIKDKVVEGKDAGQDTIESSVSYTLSANVETLQLTGSL
DINAAGNTLANTLIGNSGANILNGGIGADTLQGGDGNDTYVVDNAGDVVTESEDEGTDTI
RIAIATKGGSYSLGDHIENGILANSVAFSLIGNDLNNSLTGNAAANTLDGGIGNDSLLGG
AGNDRLLGGTGDDTLDGGVGNDTMDGGEGSDVYVVNAAGDVIADSGTGVSDIDVVQSTVS
YILNEDIENLILSGKGKLSGTGNAQNNLITGNTGANRLDGGAGDDTLYGGLGADTLIGGL
GADQLEGGAGNDTYEVDDIGDTITELANEGTDLVKSSIDYTLGDYLENLILTGTDHINAT
GNSLSNTLIGNDGNNVLMGGAGVDVLKGGKGDDTYQVNLISSGTGSKMVAKLEDSVSEAA
AVSGGDDTLTLQGTVSGLSKATVLTLATGLEHLDASGTGDTWLNLTGNAANNALTGNDAN
NILRGLAGNDSLSGGAGADTLYGGLGNDALSGGDGADVFVFDSKLSAANVDTIDDFEVGV
DRLQLDEAIFGKLVAKGLTSDNLLVVNGNPQAQDANDYLIFDEEDGSLYYDKDGSGVGAA
IKIGILQNLNGTLSANDFSSSVALASSVTYSLSPSQLNLTLTGSSNINGTGNAFGNVING
NSGTNALSGGAGNDTLYGNEGNDSLDGGAGADSLLGGAGDDTYIIDNLSDTIVEFSDQGI
DTVKSSLVSYQLAYNLENLTLLNTAYSGSGNAANNYITGTSGFNVLSGNDGDDTLDGVSG
GDSLLGGDGDDVYIINNAGYRVVEFEDEGQDTIISRISYSLEDTDGTGVNGGNVENLILA
GSADINGTGNELDNQITGNTGKNLLSGGLGNDTLDGVAGADTLKGGAGDDVYFVDNIDDV
IIEESTSYSSQFTQGHYSNDTPSISADGRYVMFDSYNEFSFGSRTLAVDVFLKDMQTGEL
SKVSDYSQAFAGEISSDGRYAMYISQGSMDGDTNYELDVYIKDLLTGETIIASSNEQNVL
GDESVVGDAKFSSDNTYVVFSSYSDGLVAGNSYPGSDVYVKNLSTGELTRVSTDSSGNPG
NNTSIWSSISSDGRYVVFHSLASNLSSSDTNNELDVYWKDTQTNQTYLVSSSASGVVGNA
KSWYGSISPDGKWVVFESQASNLVENDTNNSTDIFLKNIQTGEIQRISTNGSSEQANFHS
GDASFSADGRYVIFTSGASNLVEGDTNGRADIFIKDLLTGGIQLVSTNSLGQLANGSSSI
ASISDNGRYVVFISEANNLVDGDLNYNSDVFVKDLQTGEVKIASVEHIAVQGGTDTVNSS
VSYTLGAHIENLNLIGSLAINGSGNELNNTLVGNAAANSLYGNAGDDSVVGGGGIDQLFG
GAGNDTLIGAGSLYGNDGDDHLVGAGINNDLLMGGQGNDYLNGDGGVINTLMGNEGNDTL
VGSNGADFMWGGTDADVFLIGAITGGADVIGDFNTAELDRIGLSKDAMNGLGNMGTLDTS
VFESGDGLVAANTEDGRIIYNTSAGHIYYDQDGVGGENPVLIAILTDKPQLDSSVFFIEQ
NT seq
5403 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaacttttcttatagctcgctttccgcatttaactttgctgacattaatcagcag
ttggataatgggtcgactgagctggataatgcattcgccctattggagtcatcgggagat
ttgcaaaacgttgagtattcaaatactcgtattacgggtaactatggcgaatggaatgtc
gttatacgaggtaataacttcaacaatcaaaatcctgttattacaagctatcttgtgagc
aatgcagcgggcactgtgttaaagctctctggacgtgttgatccagatacgggtggcgta
ttgacatccataagtgttgccacagccaatatttcagtgaattacgctggttctttccgg
atcaatgctgatggcgatattgtcagtggtcgagtgactacatatcaaataagcacaagt
acatacaagatcgtggtaagcggaaatatgtacattgatgtagatagtggagacttaacc
agcggtgtaataaccagactatcgatagaaggaagtgatggagagtatttttttgccaat
aatatttccatactcgcagcgaatttcgatcccctgacagatgcggaccgcgatcttcag
tcactttttgatgcgatgagtaaagcgggtaatgacgttattgttggaggcggcggcaat
gacagtatcgcaggtggtgctggcaacgacaccttacgtggcggtgcgggtgacgacacg
ctggatggaggggttggtgcagacagtctggcggggggtgcaggtggtgatctttacatt
gttgattccatcaaagataaagtggtggaaggcaaagatgctggacaagacacgatagag
tcttcggtgagctacaccctgagtgccaatgtagaaaccctgcaactgacgggtagcctg
gatatcaatgcggcgggcaacactttagcgaatacccttattggcaatagcggtgccaat
atcctgaatggcggaattggtgcggacaccctgcaagggggcgatggcaatgatacctat
gtagtggacaatgccggggatgtggtcaccgagtctgaggatgaaggcacggatactatc
cgtattgcgattgctaccaaaggcggaagctacagcctgggtgaccacatcgagaatggg
atactggccaacagcgttgccttcagcctgatcggtaacgatctcaataacagcctgacc
ggcaatgccgcggccaacacactggacggtggaatcggcaatgacagcttgctgggcgga
gctggtaatgacaggctgctgggcggtactggcgatgacacgctggatggcggggttggt
aatgacactatggacggtggtgaaggcagcgacgtctacgttgtgaatgccgcaggcgat
gtgattgccgacagtggaacgggtgtatcggatattgatgttgtgcaaagcacggtcagt
tacattctcaatgaggatatcgagaatctgatattaagcggcaaggggaaactctctggt
acgggcaatgcccagaacaacctcatcaccggcaacaccggtgccaaccgtctggatggt
ggagcgggcgatgacaccctgtatggtggccttggtgcagacaccctgatcggtggtctg
ggcgcagatcagttggaaggtggcgcgggcaacgacacctacgaagtagatgatattggc
gatacgatcaccgagttggcgaacgaaggcactgatctggtcaagtcctccatcgattac
acgctgggcgactatcttgaaaacctgatcttgaccggtactgaccacatcaatgcgact
ggcaacagtctgagtaacaccctgattggcaacgatggcaacaatgtattaatgggtggc
gctggtgtggatgtactaaagggcggcaaaggggatgacacctatcaggttaacctgatc
tccagtggcactggcagcaaaatggtggccaagctggaagatagcgttagcgaagccgcc
gcggtcagtggcggggatgacacgctaacgttacaaggcacggtaagcgggctcagcaaa
gccacggtactgacccttgccacgggtcttgagcatctggatgcgagtgggacgggagat
acctggctgaacctgacgggcaatgccgccaataatgcactcacgggtaatgatgccaat
aatatcctgcgaggcctggcaggcaatgacagcctgagtggaggagctggtgcagacacg
ctgtatggtgggctggggaatgatgcgcttagcggcggagatggtgctgatgtgtttgtg
tttgacagcaagctgagtgcagccaatgtggatacgattgatgacttcgaggtcggggta
gacaggctgcaactcgatgaagccatcttcggaaaactggtcgcaaaaggattaacttct
gacaacttactggtcgttaatggaaatccgcaggcgcaggatgcaaacgactacctcatt
tttgatgaggaagacggtagcctttattatgataaagatggtagtggcgtcggtgcggca
atcaaaatcggaatattacaaaacctaaacggcaccctctctgccaacgactttagctct
tcagtagctttagcctcttcagtgacatactcactttcgccatcccaacttaaccttacg
ctcaccggatcttcaaatattaatggcacaggcaatgcgtttggaaatgtcattaacgga
aactcaggcacaaatgctttaagtggaggggccggtaatgacaccttatatggtaatgaa
ggtaatgacagccttgatggtggagctggtgcggatagcttgttaggcggggctggcgat
gatacctatattatcgataatctgtcagatactattgttgagttcagcgaccaagggata
gataccgttaaatcttcattagtcagctatcagttagcttataacctggaaaaccttaca
ctgttgaatacggcatacagtggtagcggaaatgctgcgaataactacataacaggtaca
tctggttttaatgtgttaagtgggaatgatggggacgatactctcgatggtgtctctggc
ggcgactctcttttgggaggtgatggagatgatgtttatatcatcaataatgctgggtat
agggttgtagaatttgaagatgaaggtcaggacacgattattagtcggatcagctacagc
cttgaagacactgatggaaccggagttaatggtggaaatgttgaaaacctcatattggca
ggcagtgcggatatcaatggcacgggcaatgagctggacaaccaaattacgggaaataca
ggtaaaaaccttctttcaggaggccttggtaatgacacgcttgatggtgttgcaggtgcg
gatactttaaagggcggggccggagacgatgtttactttgtggataacatagacgacgtc
attatagaggaatcaacgtcatactcctctcagtttacccaaggacattattcaaatgac
acgccttcgatttcagccgatgggcgctacgttatgtttgactcatataacgaattctcc
ttcggtagtcggactcttgcagtcgatgtgtttttaaaggacatgcaaacaggagagttg
tcaaaagtatctgattactcacaagcttttgcaggtgagatatcttcagatgggcgctat
gccatgtatatcagtcaagggtccatggatggcgataccaattatgaactcgatgtttat
attaaagacttgctcactggggaaacaattattgcgtcctctaacgagcagaatgttctg
ggagatgaatccgttgtaggtgacgctaaattctcgtcggacaatacatatgtggttttc
tctagctactcggatggtcttgtcgccggcaatagctaccctggatctgatgtgtatgtc
aagaatctgtcgacaggtgaattaacccgtgtttccaccgactcatctgggaatccgggc
aacaacaccagcatatggagcagcatttcttctgacggcagatacgtggtttttcattcc
ctagcttccaacttgtcctcgagtgatactaataatgagttggacgtatattggaaagat
acacaaaccaaccagacttatcttgtttcgagcagtgcgagtggtgtcgttggtaatgct
aaaagctggtatggctccatatctcctgatgggaagtgggtcgtatttgaaagtcaggcg
agcaatctggttgagaacgacaccaacaatagtacagatattttcttgaagaatatccaa
actggtgaaatacaacgcatctctactaatggatcttccgagcaagccaacttccatagt
ggagatgcctctttttctgccgatggccgatatgtgattttcacaagcggtgccagtaac
cttgttgagggggacacaaacggccgggctgatatctttattaaagatttgctcacgggc
ggcattcaattggtgtcaaccaactcgctagggcagcttgcgaatggcagctcatcgatt
gccagtatttccgataacgggcgatatgttgtgttcatcagtgaagcaaataacctggtt
gacggtgacttaaactataactctgatgtgtttgtaaaagacctgcagactggagaggta
aagattgcttcggttgaacatattgcagttcaaggcggaacagatactgttaactcctcg
gtttcttatacgctaggggcacatatcgaaaatttgaatctgattggtagccttgcaatt
aatggaagtggtaatgagctgaataacactctcgtaggcaatgcagccgccaatagcctt
tacggcaacgcaggtgatgattctgttgttggcggaggtggaatagatcagttatttggt
ggtgctggcaacgatactttgataggtgcaggttccctgtatggcaatgacggtgatgat
caccttgttggtgcgggcatcaataatgacttgttaatgggtggccagggaaacgactat
ttgaatggtgatggtggtgtaatcaacacacttatgggaaacgaaggaaacgatactttg
gtcggcagcaatggggctgacttcatgtggggaggtacggatgccgatgttttcttaatt
ggagcaattacgggcggcgcagatgttattggcgactttaatacggcagaacttgatcga
atcggattgagcaaagatgcgatgaacggtttgggtaatatgggaactctagatacttcg
gtttttgaaagcggggatggccttgtcgccgctaataccgaagatggacggattatctat
aataccagcgctgggcatatttactatgaccaggatggggtcggtggtgaaaatccagta
cttattgcgatacttaccgataagcctcagcttgactcaagtgttttttttattgagcaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system