Manihot esculenta (cassava): 110601325
Help
Entry
110601325 CDS
T05761
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
Pathway
mesc03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mesc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
110601325
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mesc03019
]
110601325
Messenger RNA biogenesis [BR:
mesc03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
110601325
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110601325
NCBI-ProteinID:
XP_021594113
LinkDB
All DBs
Position
15:complement(3405815..3414419)
Genome browser
AA seq
465 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLQDYFSQYGDVLQAVVMRDKTTGRPRGFGFVVFADPSTL
DRVLQEKHTIDGRTVEAKKALSREEQQTSARAGNVNPSRNTGNGGNIRTKKIFVGGLPPT
MTEDGFRQYFEDYGHVTDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDSEDAVDRVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGGGSRSMSGGANGGAGGYQGYGASGGNANSYDGRMDSNRYMQPQSTGG
GFPPYGSSGFNAPGYGYGPANNGVGYGGYGSYGGASAGYGGPAGAAYGNPNVPSAGYASG
PPGAPRSSWSSQAPSGYGAMGYGHAPSWGTPNAGAGSTGPGPTPAGQSPGGTAGYGNQGY
GYGSYVGNDGSYGNPAGYGAVGGRSGGTPNSNIGGSPPELQGSGSGYMGGGYGDANGNPG
YGNAGWRSESQLSGNYGTQGNGLHGGQLGYGGGYSGSQNRQGQQQ
NT seq
1398 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggaaagctatttattggtgggatttcatgggagacaacggaggag
aagctccaggactacttttctcaatatggcgacgttttacaggctgtggtaatgcgagac
aagaccactggcagacccagaggctttggttttgtcgttttcgcagatccttccaccctc
gatagggttcttcaggagaagcatacaatcgatggtagaacggttgaggcgaagaaggcc
ttgtcaagagaggagcagcaaaccagtgccagagctggaaacgtgaatccatctagaaac
actggtaatggtggaaatatcaggaccaaaaagatttttgttggagggttacctcccact
atgactgaggatggattccgtcagtattttgaagattatggccatgttactgatgtagta
ataatgtatgaccagaacacccaacggcctcgtggatttggctttatttcctttgatagt
gaggatgctgttgatcgggtcttgcataaaactttccatgatttgaatggaaagcaagtt
gaagtaaagcgggctcttcctaaagatgctaatcctggtgggggaagccgctccatgagt
ggtggtgccaatggtggtgctggtggttatcagggctatggtgcttccgggggcaatgca
aattcatatgatggtcgaatggattcaaataggtatatgcagcctcagagcacaggaggt
ggctttcctccttatggttcatcaggctttaatgcacctggttatggatatggtcctgcc
aataatggtgttggatatggtggttatggtagttatggcggtgccagtgctggctatggt
ggacctgctggtgctgcgtatgggaatcctaacgtcccaagtgctgggtatgcaagtggt
ccacctggtgcccctagaagctcatggagcagtcaagctccatctggctatggtgccatg
ggctacggacatgctccatcttggggcacaccaaatgctggtgctgggagcactggtcct
ggtccaactcctgctggtcaatctcctggtgggactgctgggtatgggaatcaaggttat
ggatatggtagttatgttggaaatgatggatcctatgggaatccagctggatatggagct
gttggggggcgttctgggggtactccaaacagtaatattgggggttcaccacctgaacta
caggggagtggcagtggctacatgggaggtggttatggggatgcaaatggaaatccaggg
tatggaaatgcaggttggagatccgagtcacaactttctggaaattatgggactcagggc
aatggacttcatggtgggcaacttggttatggtgggggatacagtggttctcagaatcgg
caaggccaacaacaatga
DBGET
integrated database retrieval system
