Manihot esculenta (cassava): 110603837
Help
Entry
110603837 CDS
T05761
Name
(RefSeq) beta-galactosidase isoform X1
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_35
BetaGal_gal-bd
Gal_Lectin
GHD
Glyco_hydro_42
BetaGal_ABD2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110603837
NCBI-ProteinID:
XP_021597470
LinkDB
All DBs
Position
16:complement(30780338..30785827)
Genome browser
AA seq
868 aa
AA seq
DB search
MRNMSKSSLFLFLLLFFVSWVSSVTASVSYDHKAITINGQRRILISGSIHYPRSTPEMWP
DLIQKAKEGGLDVIETYVFWNGHEPSPGNYYFEDRYDLVKFIKLIQQAGLYAHLRIGPYV
CAEWNFGGFPVWLKYVPGIEFRTDNGPFKAAMQKFTEKIVSMMKSEKLYETQGGPIILSQ
IENEFGPVEWEIGAPGKAYTKWAAEMAVGLGTGVPWVMCKQDDAPDPVINTCNGFYCENF
KPNKDYKPKIWTENWTGWYTEFGGAVPYRPAEDLAFSVARFIQNGGSFVNYYMYHGGTNF
GRTAGGPFIATSYDYDAPIDEYGLTRDPKWGHLRDLHKAIKLCEPALVSVDPTVTSLGSN
QEAHVFKSKSSCAAFLANYDTKYSVKVTFGSGQYDLPPWSISILPDCKTAVFNTARLGAQ
STQMKMTPVGSAFSWQSYIEEAASGYTDDTTTLDGLWEQINVTRDATDYLWYMTNVKIDP
SEGFLKSGQDPLLTVYSAGHSLHVFINGQLSGGLNGVLLVVKFLLDFLYSVVLTQQFILI
AGTVYGSLNSPKLTFSQNVKLNAGVNKISLLSVAVGLQNVGVHFERWNVGVLGPVTLKGL
NEGTTDLSGWKWSYKIGLKGEALNLHTVTGSSSVDWTEGKLLAKKQPLTWYKTTFDAPDG
NDPLALDMGSMGKGQIWVNGQSIGRHWPAYIARGSCGSCNYAGTYNDKKCGSNCGEPSQR
WYHVPRSWLKPSGNLLVVFEEWGGDASGISLVKRTIGSVCADIFEGQPALKNWQMIALGK
LDRLQPKAHLWCPPGQKISKIKFASYGMPQGTCGSFREGSCHAHKSYDAFEKKCVGKQSC
SVTVAAEVFGGNPCPDSEKKLSVEAVCS
NT seq
2607 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggaatatgtctaagagcagcttgtttctgtttctgctgttgttttttgtttcttgg
gtttcttctgttactgcttctgtgtcttatgaccataaagctattaccatcaatggacag
agaaggattcttatttcaggctctattcattacccaagaagtactcctgagatgtggccg
gatcttatacagaaggccaaagagggaggtctggatgtcatagaaacttacgttttctgg
aacggacatgagccttcacctgggaattactattttgaggataggtatgatctggtcaag
tttatcaagctgatacaacaagcaggactttatgctcatcttcgaattggaccctacgtt
tgcgctgagtggaactttgggggatttcctgtctggctaaaatatgtccctggtattgaa
tttagaactgacaacggtcctttcaaggcggcaatgcaaaagttcacagagaagattgtc
agcatgatgaagtcagaaaaattgtatgaaactcagggaggtccaataattctttctcag
atagaaaatgaatttggaccagttgaatgggagattggtgcaccaggcaaagcttataca
aaatgggcagctgagatggcagtgggtcttggtactggtgttccatgggtcatgtgcaag
caagacgatgcccctgatcctgttatcaacacctgtaatggattctattgtgagaatttc
aaaccaaacaaggattacaaacccaagatatggactgaaaactggactggctggtacaca
gaatttggcggtgcagttccttatagaccagcagaagatttagcattttcagttgctaga
tttatacagaacggtggttcatttgtaaactattatatgtaccatggaggaactaacttt
ggccggactgctggtggtccatttattgctactagctatgattatgatgcccctattgat
gaatatggattaacaagggatccgaagtggggacacttgagagatttgcataaagctatc
aagttatgtgaacctgctttagtctctgtagatcccacagtaacatcacttgggagtaat
caagaggctcatgtgttcaagtcaaagtcatcctgtgcagccttcctggcaaactatgac
accaaatactctgttaaagtaacgtttggcagtgggcaatatgaccttccaccttggtct
atcagcattcttcctgattgcaagactgcagtttttaacactgcaaggcttggtgcgcaa
agcacgcaaatgaagatgacgcctgttggcagtgcattttcttggcaatcatacattgaa
gaagctgcctctggttatactgatgatacaactacactagatggattgtgggagcaaatc
aatgtcacaagggatgctacagattatctttggtacatgacaaatgtgaagatagatcct
agtgaaggatttttgaaaagtggacaagatcctcttctcactgtatattcagctgggcat
tctttgcatgttttcatcaatggtcaactatcaggtggattgaatggagtattgctggtt
gtcaagtttctacttgactttttatattctgttgtattaactcaacagtttattcttatt
gcaggaactgtttatggatcattaaacagtcctaagttaacatttagccagaatgtgaag
ttgaatgctggtgttaacaagatttctttgttaagtgttgcagtgggtctacagaatgtg
ggtgtgcacttcgaaagatggaatgttggagttcttggcccagtcacactgaagggtttg
aatgaggggacaacagacctgtcaggatggaaatggtcttacaagattggtctaaaaggt
gaagcattaaaccttcacactgtcactgggagttcatctgttgattggacagaaggaaaa
ctgttggctaaaaaacaaccactaacatggtacaagacgacttttgatgcaccagacggc
aatgacccattagctttagatatgggtagtatgggaaaaggtcaaatatgggtaaatggt
cagagcataggacgccattggcctgcatatatagctcgtggtagttgtggcagttgcaac
tatgctggaacttacaatgataagaaatgcggaagtaattgtggagaaccctcccaaaga
tggtaccatgttccacgctcctggctgaaaccgagtggtaatctattagttgtttttgaa
gaatggggtggtgatgcaagtggaatttctttggtcaaaagaactataggaagtgtttgt
gctgatatatttgaagggcaaccagcattgaaaaactggcagatgattgcactggggaaa
cttgaccgtctccaaccaaaagcccatttatggtgtcctccagggcagaagatctctaag
atcaagtttgctagctatggaatgccccagggaacttgtggaagcttcagagaaggaagt
tgtcatgctcacaagtcatatgatgcttttgaaaagaagtgtgtcggaaagcaatcttgt
tcagtaactgtggctgctgaagttttcggaggaaatccctgtcctgattctgaaaagaag
ctttcagttgaggctgtctgcagctga
DBGET
integrated database retrieval system
