Manihot esculenta (cassava): 110610949
Help
Entry
110610949 CDS
T05761
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
Pathway
mesc03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mesc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
110610949
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
mesc03019
]
110610949
Messenger RNA biogenesis [BR:
mesc03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
110610949
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110610949
NCBI-ProteinID:
XP_021606724
LinkDB
All DBs
Position
3:28750332..28754594
Genome browser
AA seq
463 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWETTEEKLNDYFSQYGDVLQTVVMRDKTTGRPRGFGFVVFADPSIL
DRVLQDKHTIDGRTVEAKKALSREEQQTTVRAGNLNSARNTGNGGNIRTKKIFVGGLPPT
LTEEGFRQYFEAYGHVTDVVIMYDQNTQRPRGFGFISFDSEDAVDQVLHKTFHDLNGKQV
EVKRALPKDANPGAGSRSMGGGASGAGGYQGYGASGGNSSSYDGRMDSNRYMQPQSTGGG
FPPYGSSGYNAPGYGYGPANNGVGYGGYGGYGGASAGYGGPAGAAYGNPNVPNTGYASGP
PGAPRSTWSSQAPSGYGAMGYGNAASWGQPNAGAGGPGTTPAGQSPSGTAGYGNQGYGYG
NYGGNDGSYGNPAGYGAVGGRAGGTPNSNVGGAGGELQGNGSGYMGSGYGDANGNPGYGN
AGWRSEPLASGNYGTPQANGPHGGQVGYGGGYGGGQSRQGQQQ
NT seq
1392 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcagatcagggaaagctatttatcggcgggatttcatgggagacaaccgaggag
aagctcaatgactacttttctcaatatggcgacgttttacagactgtggtaatgcgagac
aagaccactggcagacctagaggctttggctttgtcgtttttgcagatccttccatcctt
gatagggttctccaggataagcataccattgatggtagaacggttgaggctaagaaggcc
ttgtcaagagaggagcaacagactactgtcagggctggaaatctgaattctgctagaaac
actggcaatggtggaaatatcaggaccaaaaagatttttgttggtgggttacctcctact
cttacggaggaaggattccgtcagtattttgaagcttatggccatgtcactgatgtagta
ataatgtatgaccagaacacccaacggcctcgtggatttggatttatttcctttgatagt
gaagatgctgttgatcaggttttgcacaaaacatttcatgatttgaatggtaagcaagtt
gaagtaaagcgggctcttcctaaagatgctaatcctggtgctggaagccgctctatgggt
ggtggtgctagtggtgctggtggttatcagggctatggtgcttctgggggcaattcaagt
tcatatgatggtcgcatggattcaaataggtatatgcagcctcaaagcactggaggtggc
tttcctccttatggttcatctggctataatgcacctggttatggatatggtcctgccaat
aatggtgttggatatggtggttacggtggttatggtggtgccagtgctggctatggtgga
cctgctggtgctgcatatgggaatcccaatgtcccaaatactggctatgcaagcggccca
cctggtgcccctagaagcacatggagcagtcaagctccttctggctatggtgctatgggc
tatggaaatgctgcttcttggggtcagccaaatgctggtgctggtggtcctggtacaact
cctgcaggtcaatctcctagtgggactgctgggtatgggaatcaaggttatgggtatggt
aattatggtggaaatgatgggtcttacgggaatccagctggttatggggctgttgggggg
cgtgctgggggtacccctaacagtaatgttggcggtgcaggtggagaactacaggggaat
ggcagtggctacatggggagtggctatggtgatgcgaatggaaatccaggatatggaaat
gcagggtggagatctgagccactggcatctggaaattatgggactcctcaagcaaatgga
cctcatggcgggcaagttggttatggtggggggtatggtggtggtcagtctcggcaaggc
caacaacagtga
DBGET
integrated database retrieval system
