Manihot esculenta (cassava): 110630181
Help
Entry
110630181 CDS
T05761
Name
(RefSeq) pre-mRNA-processing factor 39 isoform X1
KO
K13217
pre-mRNA-processing factor 39
Organism
mesc
Manihot esculenta (cassava)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mesc00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
mesc03041
]
110630181
Spliceosome [BR:
mesc03041
]
Other splicing related proteins
Spliceosome associated proteins (SAPs)
Other SAPs
110630181
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_14
Suf
TPR_19
NRDE-2
TPR_12
TPR_MalT
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110630181
NCBI-ProteinID:
XP_021633228
LinkDB
All DBs
Position
13:4688006..4698249
Genome browser
AA seq
834 aa
AA seq
DB search
MGDSEMVVAEASAVTEYDSAGYAATGYGDTSSNVVTDSSVYPTDGTGVYAASADGAYTVP
PAPSFADGNMYGTDANSVIQEAHVNATYETKPDVEKGSASENLVATGTALIAASQVAAYD
SSVNGSVGGDAGSITSANGTAADIAEGATAATMDGLVPPMSGEEERLWSIVRANSLDFDA
WTALIDETEKVAGDNILKIRKVYDTFLAEFPLCYGYWKKYADHEARVGSMDKVVEVYERA
VLGVTYSVDIWLHYCIFAINTYEDPDTIRRLFERGLAYVGTDYLSYSLWDKYIEYEEMHA
QWSHVAMIYTRILEIPNKRLDDYLTRFKAFAATHPLSELTTPEEAAAAVPAPSESGDQAN
MGEVHADAAEQSSKPVSAGLTEAEELEKYIAIREEMYKKAKEFDSKISDFENAIRRPYFH
VRPINVAELENWHNYLDFIEREDDLNKVVKLYERCLIACANYPEYWMRYVLCMENCGSMD
LANNALARATQVFVKRQPEIHLFAARFREQSGDIPGARAAYQLVHTEITPGLLEAVVKHA
NMEHRLGNLKDAFSLYEQTIAIEKGKEHSQVLPMLYAQYSRFLYLVAGNVEKAREVLVEA
LENAPLSKPLLEAFIYLESFQSLPKRIDYLDSLVEKLIVPNSDSLNVASAAEREELSCIF
LEFLGMFGDAQSIKKADDRHAKLFLPHRSKSEFKKRHAEDYLASDKTKLAKSYADAPSSA
QSLMGAYPNVQNQWATGYGLQPQAWPPVTQAQTPGYGQQTAYGTYGGYGSNYTNPQAPTS
VPQTAAYGAYPPTYPVQQAYPQQGYPQAQPPAAATLAPAQQPASVPQPYYGSYY
NT seq
2505 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagatagtgagatggtagttgctgaagcatctgcagtcacggagtatgattcggct
ggatatgctgctactggctatggtgatactagttcaaatgttgttaccgattctagtgtt
tatcccacagatggtactggagtttatgcggcttctgctgatggagcttatactgtacca
cctgctcctagttttgctgatggaaatatgtatggtacagatgctaattctgtcatacaa
gaggcccatgttaatgcaacatatgagactaagccagatgttgaaaagggaagtgctagt
gagaatttagttgctacagggactgcattgatagcagcatctcaagttgctgcttatgac
tcttctgtaaatggcagcgttggaggtgatgcaggaagcattacttcagctaatggtact
gctgcggatattgcagagggagctactgctgctactatggatggtttggttccaccaatg
tcaggcgaagaagagcgattgtggagtattgtgagggctaattccctggattttgatgca
tggactgccttgattgatgagacagagaaggtggcaggggataacatattgaaaattcga
aaggtgtatgatacctttttggctgaattcccattgtgttatgggtattggaagaagtat
gcagatcatgaagcacgagttggatctatggacaaagttgtcgaggtatatgaacgagcg
gttctgggggtgacgtattcggtggatatttggttgcattattgcatatttgccataaac
acgtatgaagatccagacaccattagaaggctttttgaacggggattggcttatgttgga
acagattatctatcttactccctttgggacaagtacattgaatatgaagaaatgcatgca
cagtggagccatgttgccatgatttacacgaggatattagagattccaaataaacgcttg
gatgattatctcaccagatttaaggcttttgctgcaactcaccctttatcagaattaaca
actcctgaggaagctgctgctgcagtgcccgctccttcagagagtggtgatcaagcaaac
atgggagaagttcatgctgatgctgctgaacaatcctctaaacctgtaagtgctggctta
acagaagcagaggagttggagaagtatatcgccattagagaagagatgtataagaaagct
aaagagttcgattctaagatatctgattttgaaaatgctattaggaggccttactttcat
gtgcggcccatcaatgttgcagagcttgaaaattggcataattatctggattttatagaa
agagaagatgatttgaacaaggtggtgaagttatatgaaagatgcctaattgcttgtgcc
aattatcctgagtattggatgcgttatgtcttgtgcatggaaaactgtggaagtatggat
cttgctaataatgctcttgctcgtgccactcaagtgtttgtcaagagacaaccagagatt
cacctctttgctgcccgatttagagagcagagtggagatatacccggtgcccgagctgca
taccaacttgtacacactgaaatcacacctggccttcttgaagcagttgttaagcatgca
aacatggaacatcggctggggaacctcaaagatgccttttctttgtatgaacagaccata
gccattgaaaaaggaaaagagcattcacaggtgttgcctatgctgtatgcacaatactct
cggtttctgtatttggttgcgggaaatgtggaaaaagctagggaggttctagttgaagca
cttgagaatgccccattatcaaaaccgctgcttgaggcctttatatatctagaatcattt
cagtcactgccaaagcggattgattatttagattcattagttgagaagcttatagtgccc
aactcagatagtctcaatgtggcaagtgctgctgaaagagaggagctatcttgcattttc
ttggagtttttaggtatgtttggagatgctcaatctattaagaaggctgatgataggcat
gcaaagctctttttaccccataggagcaagtcggagttcaaaaaacgtcatgcagaggat
tatctagcttcagataagacaaaattagcaaaatcttatgctgatgccccttcatcagca
cagtcacttatgggtgcatatccaaatgtgcaaaaccagtgggcgacaggttatggcttg
cagcctcaagcttggccgcctgttacacaagcacagacccctggctatggtcaacagact
gcatatggaacatatggtggttatggaagcaactatactaaccctcaagcacccacatct
gttccacaaacagcagcatatggtgcttatcccccaacatatcctgtccagcaggcttac
cctcaacaaggttatccacaagcacagccacctgcagcagccacattggccccagctcag
cagccagcttctgttccacagccatattatggaagttactactga
DBGET
integrated database retrieval system
