KEGG   Malurus melanocephalus (red-backed fairy wren): 130576190
Entry
130576190         CDS       T09178                                 
Symbol
COL1A2
Name
(RefSeq) collagen alpha-2(I) chain isoform X1
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
mmea  Malurus melanocephalus (red-backed fairy wren)
Pathway
mmea04510  Focal adhesion
mmea04512  ECM-receptor interaction
mmea04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:mmea00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    130576190 (COL1A2)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    130576190 (COL1A2)
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    130576190 (COL1A2)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:mmea00536]
    130576190 (COL1A2)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:mmea00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   130576190 (COL1A2)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI Frataxin_Cyay
Other DBs
NCBI-GeneID: 130576190
NCBI-ProteinID: XP_057226632
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1367 aa
MSLSLCIILVSNTGRNFNHFLKNYLLYFFQAPAGRKGPRGDKGPQGERGPPGPPGRDGED
GLPGPPGPPGPPGLGGNFAAQYDPSKAADFGPGPMGLMGPRGPPGASGPPGPPGFQGLPG
EPGEPGQTGPQGPRGPPGPPGKAGEDGHPGKPGRPGERGVAGPQGARGFPGTPGLPGFKG
IRGHNGLDGQKGQPGTPGTKGEPGAPGENGTPGQPGARGLPGERGRVGAPGPAGARGSDG
SAGPTGPAGPIGAAGPPGFPGAPGAKGEIGPAGNVGPTGPAGPRGEIGLPGSSGPVGPPG
NPGANGLPGAKGAAGLPGVAGAPGLPGPRGILGPPGPAGPSGARGLVGEPGPAGAKGESG
MKGEPGAAGPAGPPGPSGEEGKRGSPGEPGSAGPPGPAGLRGVPGSRGLPGADGRAGVMG
PAGNRGASGPVGAKGPNGDAGRPGEPGLMGPRGLPGQPGSPGPAGKEGPVGFPGADGRVG
PIGPAGNRGEPGNIGFPGPKGPTGDPGKPGEKGNVGLAGPRGAPGPEGNNGAQGPPGVTG
NQGGKGETGPAGPPGFQGLPGPSGPAGEAGKPGERGLHGEFGVPGPAGPRGERGPPGESG
AVGPAGPIGSRGPSGPPGPDGNKGEPGNVGAAGAPGPAGSGGIPGERGVAGVPGGKGEKG
APGLRGDTGATGRDGARGLPGAIGAPGPAGGAGDRGEGGPAGPAGPAGARGIPGERGEPG
PVGPSGFAGPPGAAGQPGAKGERGPKGPKGEVGPAGAIGPVGASGPPGPAGAAGPAGPRG
DAGPPGMTGFPGAAGRVGPPGPAGISGPPGPPGPAGKDGPRGLRGDVGPVGRTGEQGIAG
PPGFAGEKGPSGEAGAAGPPGTPGPQGILGAPGILGLPGSRGERGLPGISGASGEPGPLG
VSGPPGARGPSGPVGSPGPNGAPGEAGRDGNPGNDGPPGRDGAPGFKGERGAPGSPGPSG
ALGAPGPHGQVGPSGKPGNRGDPGPAGVVGPAGAFGPRGLAGPQGPRGEKGQPGDKGPRG
LPGLKGHNGLQGLPGLAGQHGDQGPPGNNGPAGPRGPPGPSGPPGKDGRNGLPGPIGPAG
VRGSHGSQGPAGPPGPPGPPGPPGPNGGGYEVGFDAEYYRADQPSLRPKDYEVDATLKTL
NNQIETLLTPEGSKKNPARTCRDLRLSHPEWSSGFYWIDPNQGCTADAIKAYCDFATGET
CIYANPGHIPAKTWYINKNPNSKKQHIWFGETINGGSQFEYNSEGITSKDMATQLAFMRL
LANHASQNITYHCKNSIAYMDAETGNLKKAVVLQGSNDVELRAEGNSRFTFSVLEDGCSK
KTNEWGKTIIEYRTNKPSRLPILDIAPLDIGGADQEIGLDIGPVCFK
NT seq 4104 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagtctaagtttatgcattattttagtttcaaatactggaagaaattttaaccatttt
ttaaaaaattatcttctttatttttttcaggcacctgcagggcggaagggccctagagga
gacaaagggccacagggagaaaggggtccaccaggtccaccaggcagagatggtgaagat
ggtctaccaggtcctccagggccccctggtcctccaggtcttggcggaaacttcgctgct
caatatgatccatcgaaagcagcagattttggmccgggacccatgggtttaatgggaccc
agaggcccacctggagcatctggaccccctggtcctcctggtttccaaggccttcctggt
gagccyggtgaacctggtcaaacaggtccccagggtcctcgtggtccccctggtcctcca
ggaaaggctggtgaagatggtcaccctggcaaacctggaagacctggtgagaggggtgtt
gctggccctcagggtgctcgtggtttccctggaactcctggtctgcctggctttaaggga
attaggggacacaatggtctggatggtcaaaagggacaacctggtactcctggcaccaag
ggagaacctggtgcycctggtgaaaatggtaccccaggacaacctggtgcccgtggtctc
cctggtgagagaggaagagtaggtgcccctggaccagctggtgctcgtggaagtgatggc
agtgctggccccactggacctgctggccccattggtgctgctggtcctccaggattccca
ggtgctcctggtgctaagggtgaaatcggacctgctggtaatgttggtcctactggtcct
gctggtccaagaggagagattgggcttcctggttctagtggtcctgttggccctccaggc
aaccctggtgctaatggccttccaggagctaaaggtgcagctggtcttcccggtgttgct
ggtgctcctggtctgcctggtccccgtggtattcttggtcctcctggccctgctggtcct
agtggtgctagaggacttgttggtgaaccaggccctgctggtgccaagggagaaagtggt
atgaagggtgagcctggtgctgctggacctgctggccctccyggccctagtggtgaggaa
ggcaagagaggcagccctggtgaacctggctctgctggtcccccaggccctgctggtctg
agaggtgtacctggatctcgtggtctgcctggagctgatggcagagctggtgtcatggga
cctgctggtaaccgtggtgctagtggtcctgttggtgccaagggtcctaatggtgatgct
ggccgtcctggtgagcctggtcttatgggtccaagaggtctcccaggtcagcctggaagc
ccaggtcctgctggcaaggaaggtcctgttggtttccctggagctgatggtagagttggg
ccaattggtccagctggtaacagaggtgagcctggaaacattggattccctggaccaaaa
ggtcccactggtgatcctggcaaacctggtgaaaaaggcaatgttggtcttgctggccca
cggggtgctcctggtccagagggaaacaacggtgctcaaggtcctcctggagtcactggc
aaccaaggtggaaagggtgaaacaggtcctgctggccctcctggcttccagggtctgcca
ggtccctcgggtcccgctggtgaggctggcaaaccaggagagaggggtcttcatggtgaa
tttggtgtccctggtcctgctggtccaagaggtgagcgtggtcctcctggtgagagtggt
gctgttggtcctgctggtcccattggaagccgtggtccctctggcccaccaggccccgat
ggtaacaagggtgagcctggcaatgttggtgctgctggtgctcctggtcctgctggctct
ggtggaatcccaggagagagaggtgttgctggtgttccaggaggcaagggtgaaaagggt
gctccaggtctgagaggcgatacgggtgcaacaggaagagatggtgctcgtggtctccct
ggtgctattggtgctcctggccctgctggtggtgctggtgatcggggagaaggcggtcct
gctggtcctgctggtcctgctggtgcccgtggtatccctggtgaacgtggtgagcctggt
cccgtgggtcccagtggatttgcyggacctcctggtgcagctggtcagcctggtgctaaa
ggcgagcgtgggcccaaaggacctaaaggtgaagttggcccagcaggtgctattggccca
gtcggtgcttctggaccaccaggtcccgctggtgctgctggtcccgctggccctcgtggt
gatgctggtcctcctggcatgactggyttccctggtgctgctggaagagttggtcctcct
ggccctgctggcatcagtggtccccctggtcctcctggcccagctggcaaagatggtcct
cgaggtctgcgtggtgacgttggaccagttggccgcactggtgaacaaggtattgctggc
ccacctggttttgctggtgagaagggtccatctggagaggctggtgctgctggtcctcct
ggtaccccaggtcctcagggtattcttggtgctcctggtatccttggtctgcctggctct
cggggagagcgtggtcttccaggcatctctggagcatcaggtgaacctggtcccctgggt
gtttctggtcctcctggtgcccgtggtccctctggccctgtgggttctcctggtcccaat
ggtgctcctggtgaagctggacgtgatggcaatcctggaaatgatggtcctccaggccgt
gatggtgctcctggtttcaagggtgagcgtggtgctcctggcagtcctggtcccagtggt
gctctgggtgctcctggtcctcatggccaagttggtccttctggaaagcctggaaaccgt
ggtgatcccggccctgctggtgttgtcggtcctgctggtgcttttggtccaagaggtctt
gctggcccacaaggtccacgtggtgagaaaggtcaacctggtgataaggggcctagaggt
ctgcctggcttgaagggacacaatggattgcagggtcttcctggtcttgctggccaacat
ggtgatcaaggtcctcctggtaacaacggccctgctggcccaaggggtccacctggtcct
tctggtcctcctggtaaagatggtcgcaatggtctccctggacctattggccctgctggt
gtgcgtggctctcacggtagccaaggtcctgctggtcctcctggtcctcctggtccccct
ggcccccctggtcccaatggtggtggatatgaagttggctttgatgcagaatactaccgg
gctgatcagccttctctcagacccaaggattatgaagttgatgccactctkaaaacactg
aacaaccaaattgagaccctgctgaccccagaaggctccaaaaagaacccagctcgcacc
tgtcgtgacctcagacttagccacccagaatggagcagcggcttctactggattgatccc
aaccaaggctgcactgcagatgccattaaagcwtactgcgattttgccactggtgagact
tgtatctatgccaaccctggccatattcctgctaagacctggtatatcaacaagaatccc
aacagcaagaagcagcacatatggtttggtgaaactatcaatggtggcagccagtttgaa
tacaacagtgaaggaataacctcaaaggatatggccacccaacttgccttcatgcgtctg
ctggccaaccaygcctcccagaacatcacctaccactgcaagaacagcattgcttacatg
gatgcagaaactggtaacctcaaaaaggctgttgtgctgcagggatccaacgatgttgaa
ctacgagctgaaggcaacagcagattcactttcagtgttcttgaggatggctgctctaaa
aagaccaacgaatggggcaaaacgatcattgaatacagaacaaataagccatcccgcttg
cccatccttgacattgcacctttggatattggcggcgctgaccaagaaatcggtttggac
attggcccagtctgttttaaatga

DBGET integrated database retrieval system