Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010: MLC_8620
Help
Entry
MLC_8620 CDS
T01478
Symbol
topA
Name
(GenBank) DNA topoisomerase I
KO
K03168
DNA topoisomerase I [EC:
5.6.2.1
]
Organism
mml
Mycoplasma mycoides subsp. capri LC 95010
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mml00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mml03032
]
MLC_8620 (topA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mml03400
]
MLC_8620 (topA)
Enzymes [BR:
mml01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.1 DNA topoisomerase
MLC_8620 (topA)
DNA replication proteins [BR:
mml03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
MLC_8620 (topA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mml03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
MLC_8620 (topA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Topoisom_bac
Toprim
zf-C4_Topoisom
Toprim_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CBW54592
UniProt:
F4MR58
LinkDB
All DBs
Position
1073256..1075217
Genome browser
AA seq
653 aa
AA seq
DB search
MKVLVLLESPSKIEKIKHYLEESYPENQFVVLASGGHINSIADKGAWGLGIDLETMQPDF
VIDSSRKKIISQIKKEGKTADLIILASDPDREGEAIAYHLANLFKDHTNIKRITFNEITS
EAITNAFNNLRDIDMNLVNAQISRQILDKIIGYLVSKSLQKSTGLMSAGRVQTPALNILT
TRDTLIKNFKEVLYKKIFVIESKRAINLSLVKDKNNVLVNTEKTYYIDEKQAKAIVDELG
EVYRCTDYKSTAYETRSFKPYSTAGLLQDGFTKLKLSTSQITLAAQKLYELGYITYIRTD
SVKYSSQFISEVKDYISKNYSSDLFKAPVVGKKDQNSQEAHESIRPTNIWLTPEKASLEI
EDNLLKRVYNLIWWNSIKSLMKGPSGFNHRWTFNNNGYEFKQSWQEVKDLGYQAIKHSSS
DENIELTDDGEEIVQSKNDKPEYQFNDDFEINVSKKYIKIEDAKTNPPKMFNQASLIKEL
KNLGIGRPSTYNPILTKLKDREYVEFPKSKPIVVTNKGYSANQYLYDHYLDFFNLNYTAE
MEEKLDEITKGSFDYVNWLKEIYNALNIKVKKEIGEAKTEAICPRCGANLVYIKSRFNRG
RGCSNFTKTKCGYREYEQPDGTWKEYVKEEKPQEESSTETKSTKKSKTKKDNK
NT seq
1962 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaagttttagtattattagagtcaccatcaaaaatagaaaaaattaaacattattta
gaagagagttatccagagaatcaatttgttgttttagctagtggtggtcatattaatagt
attgctgataagggagcttgaggacttggtattgatttagaaactatgcaacctgacttt
gtgattgatagttctagaaaaaaaataattagtcaaattaaaaaagaaggtaaaactgct
gatttaattattttagcttcagatccagatagagaaggagaagctattgcttatcattta
gctaatttatttaaagatcatactaatattaaaagaattacatttaatgaaattactagt
gaagctataactaatgcatttaataatttaagagatattgatatgaacttagtaaatgca
caaatttcaagacaaattctagataaaattattggttatttagtttctaaatcacttcaa
aaatctactggattaatgagtgctggaagagtacaaactcctgctttaaatattctaaca
acaagagatactttaattaaaaactttaaagaagtgctttataaaaagatttttgtaatt
gaatcaaaaagagcaattaatttaagtttagttaaagataaaaataatgttttagttaat
actgaaaaaacttattatattgatgaaaaacaagcaaaagctattgttgatgaattaggt
gaagtttataggtgtactgattataaatcaactgcttatgaaacaagaagttttaaacct
tattcaacagctggtttattacaagatggatttactaaactaaaattaagtactagtcaa
ataactttagcagctcaaaagctatatgaattaggttatattacatatattcgtacagat
tcagttaaatattcttctcaatttataagtgaagtaaaagattatatttcaaaaaattat
tcttctgatttatttaaagctccagttgttggtaaaaaagatcaaaatagtcaagaagct
catgaatcaattagaccaacaaatatttgattaacacctgaaaaagctagtttagaaatt
gaagataatttattaaaaagagtttataacttaatttgatgaaactcaattaaatctttg
atgaaaggtccttctggatttaatcatagatgaacttttaataataatggatatgaattt
aaacaatcatgacaagaagttaaagatttaggttatcaagcaattaaacactcatcaagt
gatgaaaatattgagctaactgatgatggtgaagaaattgttcaatctaaaaatgataaa
ccagaatatcaatttaatgatgattttgaaattaatgtttctaaaaaatatattaaaatt
gaagacgctaaaactaatccacctaaaatgtttaatcaagctagtttaattaaagagtta
aaaaatttaggtattggtagaccatcaacttataacccaattctaactaaattaaaagat
cgtgagtatgttgaatttcctaaatcaaaaccaattgttgtaacaaataaaggatattca
gctaatcaatatttatatgatcactacttagacttttttaatttaaattacactgctgaa
atggaagaaaaactagatgaaattactaaaggtagttttgattatgttaactgattaaaa
gaaatttataatgctttaaatattaaagttaaaaaagaaatcggtgaagctaaaactgaa
gcaatttgtcctagatgtggtgctaatttagtatatattaaatcaagatttaatagaggt
agaggatgttcaaactttactaaaacaaaatgtggttatagagaatatgaacaacctgat
ggaacttgaaaagaatatgttaaagaagaaaaaccacaagaagaaagttcaactgaaaca
aaatctactaaaaagtcaaaaactaaaaaagataataaataa
DBGET
integrated database retrieval system
