Myroides odoratimimus: AS202_18055
Help
Entry
AS202_18055 CDS
T04190
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
KO
K21573
TonB-dependent starch-binding outer membrane protein SusC
Organism
mod
Myroides odoratimimus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mod00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
mod02000
]
AS202_18055
Transporters [BR:
mod02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
AS202_18055
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Plug
CarbopepD_reg_2
STN
CarboxypepD_reg
FecR_C
T3S_SPI-1_N0
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALU27934
UniProt:
A0A0U3FJJ5
LinkDB
All DBs
Position
4000312..4003581
Genome browser
AA seq
1089 aa
AA seq
DB search
MYLKLFKGGKKLYTPLATALLFLQLLSMEGIYAQQKAVSPISIQINQASITDVFNSIKKQ
SNYTVIYSDQVTALSKKVDLNINAKDIQTVLDYLSKQYGITYQITGNTISVKLTEVKAQK
IRGNVKDRQGLGVPGASIILKGTNHGVSTDLDGNFELDAVIGKDRLETSFIGYKTVETLV
HSFMKIVMDEDQTSLDEIVVIGYGTQKRSDLTGAVSTVKSKDLTSYTVTDPIQALQGKVA
GVSVSQNTGEPSGDFSIRIRGINSIMGGNSPLIIVDGIPQSSSTIGSYDIESMEILKDAS
ATAIYGSRGANGVVLITTKRGKEGSAIVDYNYDYGSQRQIKKLDLMNEREWASFYNEYLV
NSKILEKAPFSEEDLQKMGKGTDWQNLMFKPAPIQSHSLSISGSMNKLRYYVSGTMLNRS
GIVPNSSFDKKNVRSSLDIPVKEWLDMSLQVGYTTLIGFNQSQGGGAAGSSLMSAIYAAS
PHFYPYEEDGSYKELRTWFPWSSHELRNPLNIVNESWYKTDNRLTNVNTSFLLKPLEGLT
FKSIFGFENSDSRYESYLTENYLYSNNAAVLNARRGETYINENILNYNFNLNDLHRFDLM
VAYTNQRYQSKLLEASGNTFLSDIAEVYDLGAAEIMNSPKSGFTKWVLQSYLARLNYSYN
DKYYLTASIRADGSSRYSKGNQWGYFPSVALAWRVSNEEFLSEFLKRIAINDLKIRTSYG
LTGSTAINPYATQNILQTGKTATGNGNYSYYAPGTVFPGDLKWETTKQWDFGLDVGLLNN
RFTLTVDIYKKMTEDMLNRVFLPSSSGYKNTIRNIGSMSNKGVEITLGGSVVSTKDFEFS
TQVNFSRNVNKIEKLANGDDLFGSTHTGYAAGTITILREGEALGSFYLYKDAGLDQDGKL
SYVDINGDGAYTDKEDRYLAGSPFPDFTYGITTNFRYKDFELDMFWQGSKGNKVFNLSEM
RNYSYSQGMNIEKSVYYNSWREGQDNSNALYPRIERVGTLRYSDRFLEDGSYFRLKNIAL
TYNLPVHKMAKKLFTKLSFYVSAQNILTFTKYSGVDPEVNSKKSDIDNAIDHFTYPNTKT
ISFGIKAQF
NT seq
3270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatctcaaattatttaaaggaggtaagaaattatatactcccttagctactgctttg
ctttttttacagttattaagcatggaaggtatctacgcacaacagaaggctgtatctcct
atttcgatacagataaatcaggcatctattactgatgtatttaattcgataaaaaaacaa
tctaattatactgtgatctatagtgatcaagtaacagcactttctaaaaaagtagatctg
aatatcaatgcaaaagatattcaaactgttttagattatttgtctaagcagtatggaata
acttatcaaatcacaggtaatactatctctgtcaagctaacagaagtgaaagcacaaaag
ataagaggtaatgtaaaagatagacaaggattaggtgtacctggagcatcaatcattcta
aagggaactaatcatggggttagtactgatctggatggtaattttgagctagatgcagtc
attggtaaagataggttggagacctcatttattggatataaaacagttgaaactcttgtt
cacagctttatgaaaatagttatggatgaagatcagactagtttagatgagattgtagtg
attggttacggaactcaaaaaagatcagatttaactggtgctgtttcgactgtgaaatca
aaagatttaacaagttatacagttacagatccaatccaagctttacaaggtaaagttgct
ggagtttctgtctctcaaaacacaggagaaccttcaggagacttctctattagaataaga
gggattaactctattatgggagggaattcacctttgattattgttgatggtataccacaa
agtagctctactatagggagttatgatattgagagtatggagattttgaaagatgcttca
gcaacagctatttatggatcaaggggagctaatggggtagttctgattactactaaaaga
ggaaaagaaggaagtgcaatagttgactataattatgattatggtagccaaagacaaatc
aaaaaattagacttgatgaatgaaagagaatgggctagtttttataatgaatatttagtt
aattcaaaaatattagaaaaagctcctttctcagaagaagatttgcaaaaaatgggaaaa
ggaacagattggcagaatttaatgtttaaacctgctcctattcaaagtcatagtttgagc
atatcaggatcaatgaataagctgcgatattatgttagtggaactatgttaaatagaagt
ggtattgtacctaatagttcttttgataaaaagaatgttcgttctagtttagatattcca
gtaaaggaatggttagatatgtctttacaagtaggttatactacattgataggatttaat
caatcgcaaggtggaggagcagcaggttcttctttaatgtctgctatttatgcagcatca
ccacacttctatccttatgaagaagatggaagctataaagagttgagaacatggtttcct
tggtcttcacatgagttaagaaatcccctgaatatagttaatgaatcatggtataaaacg
gataatagattaacaaatgtaaatactagttttctattaaaaccgctagaagggcttaca
tttaaatctatttttggatttgaaaattcagatagtcgttatgaatcttacttgacggag
aattatttatattctaacaatgcagctgtattaaatgcacgtagaggagagacatatatc
aatgagaatatcttaaattataattttaatttaaatgatttacatcgttttgatttaatg
gtagcttatacgaatcaaagatatcaatctaagttattagaagcttcaggtaatactttt
ttatcagatatagctgaggtatatgatttaggagctgcagaaataatgaattcgcctaag
agtggttttactaagtgggtcttacagtcgtatttagcaaggttaaattattcatataat
gataaatactatttaactgctagtatacgtgctgatggatcaagtagatattcaaaaggt
aatcaatgggggtattttccttctgttgcattagcttggcgtgtatcaaatgaagagttt
ttaagtgaatttttaaaaagaattgctatcaatgacttgaaaattaggacaagttatggg
ttgacaggttctacagctattaatccttatgcaactcaaaatattttacagacaggaaaa
acagcaacaggaaacggtaattattcatactatgctccaggtactgtatttcctggagat
ttaaaatgggaaactacaaaacaatgggattttggacttgatgtagggcttcttaataat
agatttactttaactgtagatatatataagaaaatgactgaagatatgctgaatagagtg
tttttaccatcttcatcagggtataaaaatactattcgaaatataggtagtatgagtaat
aaaggtgtggaaataactttaggaggaagtgtagtttctactaaagactttgagtttagt
acacaagttaatttttctaggaatgtaaataaaattgaaaaattagcaaatggagatgat
ttgtttggtagtacacatactggatatgcagcaggaacaattacaatattacgtgaaggt
gaagctttaggttctttttatttatataaggatgctggtttagatcaagatgggaagtta
tcttatgtagatattaatggagatggagcatatacagataaagaagatcgatatttagca
ggctctccttttccagattttacttatggaataactactaatttcagatataaagatttt
gaattagatatgttttggcaaggctcaaaagggaataaagtttttaacttaagtgagatg
agaaattatagttatagccaaggaatgaatattgagaaaagcgtttattataatagttgg
agagaaggacaagataatagtaatgctttatatccacgtattgaacgagttggaacattg
cgttattcagatagattcttagaagatggttcatattttagattaaaaaatattgccctt
acttataatttacctgttcataaaatggctaaaaaactatttacgaagttaagtttttat
gtaagtgcacagaatattttgacctttactaaatattcaggagttgatccagaagttaat
tctaaaaagagtgatatagataatgcaatagatcactttacttatccgaatacaaaaaca
atctcttttggaataaaagcccaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
