Malacoplasma penetrans: MYPE9170
Help
Entry
MYPE9170 CDS
T00107
Symbol
MYPE9170
Name
(GenBank) DNA polymerase III subunit alpha
KO
K03763
DNA polymerase III subunit alpha, Gram-positive type [EC:
2.7.7.7
]
Organism
mpe
Malacoplasma penetrans
Pathway
mpe03030
DNA replication
mpe03430
Mismatch repair
mpe03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
mpe00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03030 DNA replication
MYPE9170 (MYPE9170)
03430 Mismatch repair
MYPE9170 (MYPE9170)
03440 Homologous recombination
MYPE9170 (MYPE9170)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
mpe03032
]
MYPE9170 (MYPE9170)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
mpe03400
]
MYPE9170 (MYPE9170)
Enzymes [BR:
mpe01000
]
2. Transferases
2.7 Transferring phosphorus-containing groups
2.7.7 Nucleotidyltransferases
2.7.7.7 DNA-directed DNA polymerase
MYPE9170 (MYPE9170)
DNA replication proteins [BR:
mpe03032
]
Prokaryotic type
DNA Replication Elongation Factors
Elongation factors (bacterial)
DNA polymerase III holoenzyme
MYPE9170 (MYPE9170)
DNA repair and recombination proteins [BR:
mpe03400
]
Prokaryotic type
SSBR (single strand breaks repair)
MMR (mismatch excision repair)
DNA polymerase III holoenzyme
MYPE9170 (MYPE9170)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol3_alpha
RNase_T
DNA_pol3_finger
PHP
RNase_H_2
HHH_6
HHH_3
Zn-ribbon_8
T2SSK
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAC44707
NIH_Japan:
9170
UniProt:
Q8EUK5
LinkDB
All DBs
Position
complement(1227840..1232216)
Genome browser
AA seq
1458 aa
AA seq
DB search
MADKNSIYNFLSKLNLVSLENWKNHFETNCDFTITRNKQNDSINIKISFNKVLPADILIP
FVDSLNLVDDSVLFNLVFNYDTYNQEDILNYLIYFVNHNIEQKQKGTSEKKELLYVLKYN
MGIKKPIISENAIFLHYLENDQEKCIKKYLEHFRKFLNDYGFSKHHLSYILDEKTIDIIS
DHKNKIQEKIKNEITEVKRSSNAKKTDSSFTYKFRKSVTGDVTKLSDLFFEMKTATIEGE
IFKIDKVVTKTGYEIYKYFVTDYSDSIVIKALFGKKINKDVLSELKEGVWVKAKISIQID
MYENNDITGLIEEISIISKPKEFIRHDNALIKRTELVNHTNMTAFEGLVNIKELFKFSSE
MGYSSVAITDKFNCQNFPDFYNEAKKYSKLKAIYGVQFNIIDKNIPIVLNANDTKISDAT
YVIFDIETTGLSPYYDKIIEFGAIKYHKGVQVESIQMFINPEEKISDKIFAITKISNEDV
KDALKIKEALVKIKDFIGDSVLIAHNGIKFDLPFLNCKLEENKMDIIKNPLIDTLQISRA
INEQIHGHSLGVIARKYKIDYDETQAHRADKDAEYLLNIWKRMLENQKLQDIKTLNEINS
NLQNDFLRERNRGSLITVYCKNEGEIRNLYKLISTSLTSNFDGGPKVYWENFNEFNNSFI
VSNSATEGEIFEAAMSNTQQVLEDIIKDKYDFITIGSPECFLHDIHREIYKRGWIEDAIK
RIIKIANKYNKKVVATSDTYYLNESDEVYFRVYVNAKVLGGKRNRLFKYNELNTVLPKYY
FRTTDELKDEFSFLNDPVLVNDIVVTNSNYIASLIDANIKPIKETLHSPHIEGASDKLKQ
LIYQKSYSIFGDAMNNDVKARIDREISSVIDNGYAMIYWFSHLLVKQSVDDGYVVGSRGS
VGSSVAAWLVDITEVNPLEPHYICTNCKYFNFEKNVDSGFDLPESNCPKCKSKLKGDGHN
IPFETFMGFKGDKIPDIDLNFSAVYQGKAHDFIKNMFGEERVFRAGTISTTAEKTAYGYV
KSYFEESKKMNARNAEITRIAKKCENVKRTTGQHPGGIVVVPHGKDVYDFTPFNYPADDK
TQDWFTTHLAFESLHDSLLKFDILGHDNPTILKMLTEQTNVNADTIPNFDNDVMDLFNST
DSLKIKNPMINKILKTGSSGIPEFGTNFVKEMLLVTKPQKFSDLIRISGLSHGTNVWNDN
AKYLIEEKGLTISDVISCRDDIMVYLIDKGITPIIAFKIMEDVRKGKGLNEEYQKVLNDN
NIPTWYIESCNKISYLFPKAHATAYVIMAWKIAWFKIYYPLHFYASYFSIRIKVFDIKSI
LNGESEITNKINEIKEKMANPKTKALVKNKELDLIPIYELALELLGRGYKFANIDLKKSL
ATDFLVEGDYLIPPFSAIDGLGDSVATSIVKAREEKMFSSKEDFKKRTKVTTTHMKIMEE
LGITSSLNEDDQISLFNF
NT seq
4377 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagataaaaatagtatttataactttttgtcaaaattgaatttagtgtctttggaa
aattgaaaaaatcattttgaaactaattgtgattttaccattacaagaaataaacaaaat
gattctataaatataaaaatttcatttaataaagttttacctgctgacattttgattcct
tttgttgattcattaaacttagtagatgatagtgttttatttaatttagtttttaattat
gacacttacaaccaagaagacattttaaattacttaatttattttgttaaccacaacata
gaacaaaagcaaaaagggacaagtgaaaaaaaagaattattgtatgttcttaaatataat
atgggaattaaaaaaccaataatttctgagaatgctatttttttacattatttagaaaat
gatcaagaaaaatgtataaaaaaatatttagaacattttagaaaatttttgaatgattat
ggattttctaagcatcacttatcttacatattagatgaaaaaacaatagatataatttct
gaccataaaaataaaattcaagaaaaaataaaaaatgaaataactgaagtcaaaagatca
agtaatgctaaaaaaactgactcatctttcacttataaatttagaaaaagtgttactggt
gatgttacaaaattatcagatttattctttgaaatgaagactgccactattgagggtgaa
atttttaaaatagataaagtagtaacaaaaacaggatatgaaatttataaatattttgta
acagactatagtgattcaattgttataaaagcattatttgggaaaaaaattaataaagat
gttttatcagagttgaaagaaggtgtttgggtaaaagctaaaattagtatccaaatcgat
atgtatgaaaacaatgatataacaggattaattgaagaaattagtatcattagcaaacca
aaagaatttataagacatgataatgcattaatcaaaagaacagagttggtaaatcacacc
aatatgactgcttttgaaggtttagttaacataaaagaattattcaagttttcaagtgaa
atgggctatagttcagttgcaattacagataaatttaattgtcaaaacttccctgatttt
tataatgaggcaaaaaaatattcaaaactgaaagcaatttatggtgttcaatttaatatt
attgacaagaatataccaatagttttaaatgcaaatgacactaaaatatcagatgccact
tatgttatttttgatattgaaactacaggattgtcaccatattatgacaagataatagaa
tttggtgcaattaaatatcataagggtgttcaggtagaaagcattcaaatgtttataaat
cctgaagaaaaaattagtgacaagatttttgctattactaagatttctaatgaagatgta
aaagatgctttaaaaatcaaagaggcattagtaaagattaaagattttataggtgatagt
gttttaatagcacataatgggattaaatttgacttaccttttcttaactgtaaattagaa
gaaaataagatggatattattaaaaatccattaattgatacacttcaaatttcacgtgca
ataaatgaacaaattcatggtcactcacttggagtaatagctagaaaatataaaatagat
tatgatgaaactcaagcccatagagcagataaggatgctgagtacttgttaaacatttga
aaaagaatgttagaaaaccaaaaattacaagacatcaaaactctaaatgaaattaattct
aatctacaaaatgatttcttaagagaaagaaatagaggttcattaattacagtttattgt
aagaatgaaggtgaaattaggaatctttataagttaatatcaacatcattaactagtaat
tttgatggaggtcctaaagtttattgagaaaactttaatgaatttaacaattcttttata
gtttcaaattctgcaactgaaggtgaaatatttgaagctgcaatgagtaacactcaacaa
gttttagaagatatcattaaagataaatatgatttcataacaattggatccccagagtgt
tttttacatgatatccatagagaaatttataaaagaggatgaatagaagatgctattaaa
agaattattaaaatagctaataaatataataaaaaggttgttgctacatctgacacatat
tatttaaatgagagtgatgaagtatattttagagtatatgtaaatgcaaaagtgttgggt
ggtaaaagaaatagattatttaaatataatgaattaaatacagtgttgcctaaatattac
tttagaacaactgatgaactaaaagatgaattttcatttttaaatgatccagttttagta
aatgatattgtagttacaaatagtaattacattgcaagtttaatagatgcaaacattaag
ccaattaaagaaacattgcattctccccatattgaaggcgcaagtgataaattaaaacaa
ttaatttatcaaaaatcttattctatttttggtgatgcaatgaataatgatgtaaaagcc
agaattgatagagaaataagttctgtaattgataatggttatgcaatgatttattgattc
tcacatttattagttaagcaatcagtagatgatggatatgttgttggttcaaggggttca
gttggttcttctgttgctgcatgattggttgatataactgaagtaaacccattagagcca
cattatatttgtactaattgtaagtattttaattttgaaaaaaatgtagatagtgggttt
gatttaccagaatcaaattgccctaaatgtaaaagtaaattaaaaggtgatggtcataat
attccttttgaaacattcatgggattcaaaggtgataaaattccagatattgatttaaat
ttttcagcagtatatcaaggaaaagctcatgacttcattaaaaacatgtttggtgaagaa
agagtttttagagcaggaacaattagtacaactgcagaaaaaactgcttatggatatgta
aaatcatattttgaagaaagcaaaaaaatgaatgctagaaatgctgaaattacaagaatt
gctaaaaaatgtgaaaatgtaaaaagaactacaggtcaacaccctggtggaatagttgtt
gttcctcatggtaaagatgtttatgatttcacaccttttaattatccagcagacgataaa
actcaagattgatttacaacacacttagcatttgaatctttacacgattctttattgaaa
tttgacatactgggtcatgataatcccactatattaaaaatgcttactgagcagactaat
gtaaatgctgatactattcctaattttgataatgatgtaatggatctatttaatagtaca
gatagtttaaaaattaaaaatccaatgattaataaaattttaaaaacaggatctagtgga
attcctgaatttggaacaaactttgtaaaagaaatgttactagttactaagcctcaaaaa
ttctctgatcttattagaatatcaggattgtctcatggtactaatgtgtgaaatgacaat
gcaaaatatttaattgaagaaaaaggattaactatttcagatgttatttcttgtagagat
gacattatggtttatttaattgataaaggaataactcctattattgcttttaaaatcatg
gaagatgttagaaaaggtaaaggtttaaatgaagaatatcaaaaggtattaaatgataat
aatatcccaacttgatatatagaatcatgtaataaaatttcttatttatttcccaaagca
catgctactgcatatgtgattatggcttgaaaaatagcatgatttaagatttattatcca
ttgcatttttatgcatcatatttttctataagaattaaagtttttgatatcaaatccatt
ttaaatggagaatcagaaatcactaacaagattaatgaaataaaagaaaagatggctaac
cctaaaacaaaagctttggttaaaaataaagaattggatttaatccctatttatgaatta
gctttagaattacttggtagaggttataaatttgcaaacatagatcttaaaaaatctctt
gctacagattttttagtagaaggtgattatttaattccaccattttcagcaattgatgga
ttgggtgactctgttgctacatcaattgtaaaagctagagaagagaaaatgtttagttct
aaagaagactttaagaaaagaactaaagtcactacaactcatatgaaaattatggaagaa
ctaggaataacaagttcactaaatgaagatgaccaaatttctttatttaacttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
