Methanobrevibacter smithii: Msm_1587
Help
Entry
Msm_1587 CDS
T00539
Name
(GenBank) adhesin-like protein
Organism
msi
Methanobrevibacter smithii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
Big_3_5
MG4
CarboxypepD_reg
PDEase_I_N
Phage_tube_C
FilR1_middle
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABQ87792
UniProt:
A5UNL4
LinkDB
All DBs
Position
1639221..1644329
Genome browser
AA seq
1702 aa
AA seq
DB search
MSNFKPILILSLFVLFMVSLGAISAEDVNVTVISDSQVDNSVYVDSNIVANGNGTIDNPI
SNIKNAVDLANNDSTIYLKGGNYSGVENNGIIINKTLTITSCDGLAIINGDYKDYIFYIG
DKGCLTLKNISFANTNYLNVKTYGAIINYGNLTVENSFFDNATGLRAGIILNYGNLTVTN
SEFKNNTAKYYGGAITNFGFANIVNSLFESNTAAEGEAILNSYDMFISNSRFVNNNISSS
KYQDAESLIDISSSYFMENSGIFVKDSGIHIKESYLTLINTTNSIVDISYSFINTYDFIN
SKINVDDNLWCSNENIPKQANRWLIMTFTDKNTGSSIIPSKTVTDVLVSFKTCNGKSTYS
LPSSVNLPHVYIQLEADNGKFKENGGFLVNNVFSTTYYGNSKDTLLFAMIDDYFATLTVG
SGVNNGKIYVSNSGSDEKGDGSINNPYKSLVKAVNVALNGDTILIAKGSYYGWNNSGLLI
NKTLTFSSYNGEVILYRDNFHTMFTVTLRGNLNLMKLTLTAEDKSKFFPLVNNSGKTIID
NCIIKNIDGGDKYKYKSYQALSYQYYSNQSVIYTSNDLFINNSLFTDLEDIVIRSYFYTG
DNYFKHFDVNIENSVFTNCKGYAWETVWDSQTYADKLDVVSPSFIINVGAENVLINNCTF
KNNLASVMRVNASKSFLVNASKFINNRGSIYSLTNGVMNNTLISEDNGPVLRFVTGHTLS
IIRNMQNVINSNFTKNNDVIINTWYSYSDNVYLYNCSFWNNSNNHAQGYGNTSGKGLILN
GGNMTVDYCTFENNSVFYGGVFYNDGTAMGAGGIYYSTLNITRSVFYKNNAVLGKDIFHR
GGNLVVSDCWWGSNRGPNDANIYNAAGSVEVKNWVILTFDIQDNTLIASLNKVTDNKSNI
YNISGNLPSRIAIFNSSMVKINPNVIPLINNQAKVNISFNGEDISATVSIDNQTISLIFY
NKNTIIDLKDIIVYGKGTAYSFVLKSVNGYVISNKTVNLLILNGTDVYQNHTLITNSFGV
ASLILNCSMGNYTFKASYKGDDYFKPVQNSANLVVMPYYTSVFVKSNQTFYGNGNFLYMY
LYDNLGDAVVNQIVLFTITSSNGIVYKKYALTNWEGQAGFYLNLSGGNYNVNVSYSGDNW
HYGSSSTGLFNILSIGTNVIIEQSLFNGRGNTLTVLLRDNNYRVLFNETLSITLSDGKIA
QTFDVTTNENGRAGIIVNLLPGKYNVYVKYGGDKLNFASSSEGDLIINPVGTQISADSVV
IFNRTVNNYLVKLTDIYGRLLVNETVVITSISQSTGVKQIFKVKTNDEGIANLTCKLDIG
YYLLKVNFEDNEWYGGSNYASTLIVADTVSDFNPYATILVANDFNKYYKNATQYVVRLQD
IYGNPISDMDVVICVNGVNYNRITNSSGEAKLNINLYPGMYYVSTSFGGCGNWTKSFVNS
SVTVLSQIISHDLTKILRNGSQFIVKFVDNAGNPIGGKTIDISINGIVYSRITNSSGEAK
LNINLNPGKYEVITSCGDFVNHNMVNVLSNIESDDLSMYYKDGSKFKVVIYDSEGKVKPN
ATVKFTINGVSYVKTTDNDGIAALSINLNSNIYTITTEYNGVVNTNQIWIYNMAVNIGAV
NETVERGNSFCVKLSDVNGNVLSGGQVTFKVNGVSYIKQVNETGYAKLNINLNPGVYKII
TAFSIRNYEDKLVYNTLNVTSH
NT seq
5109 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcaattttaaaccaattttaattttgtctttatttgtattatttatggtttcatta
ggagctatatctgctgaagatgtaaatgttacagttataagtgattctcaagtagataat
tcagtatatgttgattcaaatatagttgctaatggaaatgggactattgataatcctata
agtaatattaaaaatgctgttgatttagcaaataatgattctacaatttatcttaaaggt
ggaaattattctggtgtagaaaataatgggataatcattaataaaacattaactattact
tcttgtgatggactggctattattaatggtgattataaagattatatattttacattgga
gataaaggttgtttaactttaaaaaacattagctttgctaatacaaattatttaaatgtt
aaaacatatggagctattataaattatggtaatcttactgtggaaaatagtttctttgat
aatgcaactggtttaagagcaggtattatattaaattatggaaatttaactgttactaat
tctgaatttaagaataatactgcaaaatattatggtggagctataaccaactttggtttt
gcaaatattgttaattcattatttgaatccaacactgctgctgaaggtgaggctatttta
aacagttatgacatgtttatttcaaattcaagatttgttaataataatatttcatcaagt
aaatatcaggatgctgaaagtttaatagatatttcatcttcatactttatggaaaattca
ggtatctttgttaaagatagtggtatacatattaaagaatcttatttgactttaattaat
acaacaaactctattgttgatattagctattcatttatcaatacttatgattttattaac
tcaaaaatcaatgttgatgataatttatggtgttctaatgaaaacattcctaaacaagct
aatagatggttaataatgacttttactgataaaaatactggaagttccataattccatct
aaaaccgttactgatgttttagttagttttaaaacatgtaatggaaaatctacatatagt
ttgccttctagtgttaatttacctcatgtttatattcaacttgaagcagataatggtaaa
tttaaagaaaatggtggatttttagtaaataatgtattttcaactacttattatggtaat
tctaaagacacattattatttgcaatgattgatgattattttgctactttaacagtggga
tctggtgttaataatgggaaaatatatgtttcaaattcaggttctgatgaaaaaggagat
ggatctattaataatccatataagtcattagttaaagcagttaatgtagctttaaatggt
gacactattttgattgcaaaaggaagttattatggttggaataattctggacttttaatt
aataaaactttaacattttccagttataatggtgaggttatattatacagagataatttt
catacaatgtttacagttacactaagaggaaatttaaatttaatgaaattgaccttaaca
gctgaagacaaatcaaaattcttcccacttgtaaataactctggaaaaacaattatagat
aattgtattattaaaaatattgatgggggagataaatataaatataaatcatatcaagca
ttatcttatcagtattattctaatcaaagtgtaatttacactagtaatgatttatttatt
aataattcattattcacggatttagaagatattgttattagatcatacttttatactgga
gataattattttaaacattttgacgtgaatattgaaaattcagtatttactaattgtaaa
ggttatgcttgggaaactgtatgggatagccaaacatatgctgataaattggatgttgta
tctccatcatttataattaatgtaggtgcagaaaatgttttaattaataattgtactttt
aaaaacaatttagcatctgttatgcgtgttaatgcctctaaatcatttttagtaaatgct
tctaaatttataaataatagaggttctatttattctttaacaaatggtgtgatgaataat
acattgataagtgaagataatggtccagttttaagatttgtaactggccatactctttca
ataattagaaatatgcaaaatgttattaattcaaatttcactaaaaataatgatgttatt
ataaatacatggtattcttattcagataatgtctatttgtataattgttctttttggaat
aatagtaataaccatgctcaaggttatggaaatactagtggaaaaggattaatattaaat
ggtggaaatatgactgtagattactgtacttttgaaaacaattcagtattctatggtgga
gtgttttataatgatggaacagctatgggtgcaggtggaatttattattctacattaaac
attactcgttcagtattttataaaaataatgctgttttaggtaaagatatatttcataga
ggtggtaatttagttgtttctgattgttggtggggatctaacagaggaccaaatgatgcg
aatatttataatgctgcaggtagtgttgaagttaaaaattgggttatattgacatttgat
attcaggataatacattaattgctagtttaaataaagtaacggacaataaaagtaatatt
tataatataagtggaaatttaccttctagaatagctatctttaactcttcaatggttaaa
ataaatccaaatgttattccattaatcaataatcaagctaaagtaaatatttcatttaat
ggtgaagatatttcagctacagttagtatagataatcaaacaatcagtttaatattttat
aataaaaacactataattgatttaaaagatattattgtttatggtaaaggaactgcatat
tcatttgttttaaaaagtgtaaatggttatgttatatctaataaaacagttaatttatta
attttaaacggaactgatgtttatcaaaatcatacattaataactaatagttttggtgta
gctagtttaattcttaattgtagtatgggtaattatacttttaaagctagttataagggt
gatgattactttaaacctgttcagaatagtgctaatttggttgtaatgccttattatact
tctgtatttgttaaaagtaatcaaacattttatggtaatggtaatttcttatatatgtat
ctttatgataatttaggtgatgctgttgttaatcaaatagttttatttactataactagt
tcaaatggtattgtttataagaagtatgctcttactaattgggaaggtcaagcaggattc
taccttaatttatctggtggaaattataatgttaatgtaagttattctggtgataattgg
cattatgggtcttcaagtactggtttatttaatatattatctattggaactaatgtaatc
attgaacagtctttatttaatggtaggggtaatactttaacagtattacttagagataat
aactatagggttttatttaatgaaactttatctattactttatctgatggtaaaattgca
caaacatttgatgttactactaatgaaaatggacgtgcagggattattgttaatttactt
ccgggtaaatacaatgtttatgtgaaatatggtggagataagttaaactttgcatcttct
agtgaaggtgatttaattattaatcctgttggcactcaaatttctgcagattccgttgtt
atttttaatagaacggttaataattatcttgttaaattaactgatatttatggacgtttg
cttgttaatgagactgttgttattacatcaattagtcaaagtactggggttaaacagata
tttaaagttaaaacaaatgatgaaggaatagctaatttaacatgtaagttagatattggt
tattatttattgaaagttaactttgaggataatgaatggtatggtggcagtaattatgca
agtactttaattgtagctgatactgttagtgattttaatccatatgctactattttagtt
gctaatgactttaataagtattataagaatgctactcaatatgttgttcgtttgcaggat
atttatggtaatcctatttcagatatggatgttgttatttgtgttaatggtgtaaattat
aatagaataaccaacagttctggtgaggctaaattaaatattaatttgtatcctggaatg
tattatgtaagtacaagttttggaggttgtggaaattggactaaatcatttgttaatagt
tcagttacagttttgtctcaaattatttcacatgatttaactaaaattttaagaaatgga
agtcaatttattgttaaatttgttgataatgctggaaatcctattggaggcaaaacaata
gatatttctattaatggaattgtttattcccgtattactaatagttctggtgaggctaaa
ttaaatattaatcttaatcctggtaaatatgaggttataacttcttgtggtgattttgtt
aatcataatatggttaatgttttatctaacatagaaagtgatgatctttcaatgtactat
aaagatgggtctaaatttaaagtagttatctatgatagtgaaggtaaagttaaacctaat
gcaactgttaaatttaccattaatggtgtttcttatgttaaaactactgataatgatggt
atagcggctttaagcattaatttaaattctaatatttatacaataacgactgaatataat
ggtgttgttaatactaatcaaatttggatttataatatggcagttaatataggtgctgtt
aatgaaacagttgaaaggggcaattctttttgtgtaaaattaagtgatgttaatggaaat
gtattgtctggtggacaagtgacatttaaagttaacggagtttcatatattaaacaggtt
aatgaaacaggttatgcaaaattaaatattaatcttaaccctggagtatataaaattatc
acagcattttctattagaaactatgaagataaactagtttataataccttaaatgtgaca
agtcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
