Methanosphaera stadtmanae: Msp_0964
Help
Entry
Msp_0964 CDS
T00313
Name
(GenBank) member of asn/thr-rich large protein family
Organism
mst
Methanosphaera stadtmanae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_3_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABC57352
UniProt:
Q2NFQ1
LinkDB
All DBs
Position
1105518..1107827
Genome browser
AA seq
769 aa
AA seq
DB search
MNKNISCVFLLTTLILFLGLSVVCASDINSCAYDSVSDLEKVNNIKDNTVNKVTDNNDNN
IKEIKKNTNNKKFTVSNLDNKRKETSNSKLETNNVENNTLKTVNKKNLKSSDSYTITNDS
FSNYFSNKKLNDNIQDGSTLDFKGLFNGSKYSMTINRPVNLISSDKSAFIDLDGGEFVIE
KTSHVNVTNITFHNSQTYVRESSNITFNRLNILIENKSIGQGVGSTSIRDGSTNITIKNS
NFYTENSGGYSTLVFAGVNCSTIENNTITAVGEVGNLLYLTTYNTNDYGIGMNSYNIIRN
NRITGPSSASGICYAVCLTGHDNLILNNTIVYPGSGITIQWGYTGATVENTFINNTITGS
FQASINSTVTGNNISGGVSSKGNTTFTNNTLGSISLVGNDVVNNNIINGYVTISKSNNTV
DNNLIKGDISASGTPTYNTITNNNYTGTIDSKLTNPANNNVVSDNNQVKFTEIIVEPSSV
TVPIKTTTRLSLYVLSENNKVRSGTLIIKGENGNIIERASLDDKEIVEIDLLYDSIGVKT
LNITYEGVDNYLSSSRLFNIIVIKQDPSIEVITTKSRIDDLTTFKAKFNAENVQGRVIFK
VNGKILKDENGNIIFSTVTNNEAIVENIKVNSKWYTPHTTVTAIYSGNDMYNTSTKSVPF
EVTQRESKIELEAQQATIGKTVTLKAKITDATNESITINNGQAIFKLNGRTLKDTNGNII
YAKIVNGEAILDYTIPLTFKSGEYKLTCVFGHKIYERMDGNTTLTIVKE
NT seq
2310 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagaatatttcatgtgtattcttattaactactcttatattatttttaggattg
tcagttgtttgtgcttctgatattaatagttgtgcatatgatagtgtatctgatttagaa
aaagtaaataatattaaggataatactgtcaataaagttactgacaataatgataataat
ataaaagaaataaaaaagaatactaataataaaaaatttacagtatctaatttggacaat
aagagaaaagaaacttctaactctaaattagagactaataatgtagaaaataatacttta
aaaactgttaataagaagaatttaaaatctagtgattcatataccattactaatgattct
tttagtaattattttagtaataagaaattaaatgacaatatccaagatggttctactctt
gattttaagggtttatttaatggttctaagtatagtatgactattaacagacctgttaat
ctgatttcatctgataaatctgcatttattgatcttgatggtggtgaatttgtaattgaa
aagacaagtcatgtaaatgttactaatattacattccataattctcaaacatatgttaga
gaatctagtaatattacatttaatagacttaatatactaattgaaaataaatctataggt
caaggtgttggttcaacttctattcgtgatggttctactaatataactattaaaaatagt
aatttttatactgaaaatagtggtggatacagtactcttgtttttgctggagtaaattgt
agtactattgaaaataatactattacagctgttggtgaagttggtaatttactttattta
actacatataatactaatgattatggtattggtatgaattcatataatattataagaaat
aatcgtattactggtcctagttctgcatcaggtatttgttatgctgtttgtttaactggt
catgataatttaatactaaataatactattgtttatccaggttcaggtattactattcaa
tggggttatactggtgcaactgttgaaaatacattcattaataacactattactggtagt
tttcaagcttcaataaacagtactgttactggtaataatataagtggtggagtttcctct
aagggcaatactacgttcacaaacaacacattaggttctatatcacttgttggtaatgat
gtagttaataataatatcattaatggttatgtaactataagtaaaagtaataatacagta
gataataatcttattaaaggagatattagtgcatcaggtactcctacttataatactatt
actaacaacaattatactggaacaattgattctaaattaacaaatcctgcaaataataat
gtggtatctgataataatcaagttaaatttactgaaattattgtagaacctagttctgta
actgttcctattaaaacaacaacaaggcttagtttatatgttttatctgagaataataag
gtacgaagtggaacattaattattaagggtgaaaatggaaatattattgaaagagcttct
cttgatgataaagaaattgtggagattgatcttttatatgatagtataggagtaaaaact
cttaatataacatatgagggagtagataattatctttcttcttcaagattattcaatata
attgtaattaaacaagatccatcaatagaagtaattactactaaatcaagaattgatgat
ttaactacatttaaggcaaagtttaatgctgaaaatgtacagggacgtgttatatttaaa
gtaaatggtaaaatattaaaagatgaaaatggtaatattatatttagcactgttacaaat
aatgaagctatagtagaaaatattaaagtaaatagtaaatggtatactccacatacaaca
gtaactgctatttatagtggaaatgatatgtataatacttcaacaaaaagtgtaccattt
gaagttacacaacgtgaatctaaaattgaattagaagcacagcaagctacaataggtaaa
actgtaacattaaaagcaaaaattactgatgctactaatgagagtattacaataaataat
ggacaagccatatttaaattaaatggaagaactctaaaagatacaaatggaaacataatt
tatgcaaaaattgtaaatggagaagctatacttgattataccataccacttacatttaaa
tcaggcgagtataaacttacatgtgtatttggtcataaaatatatgaaagaatggatgga
aacactacattaacaattgtaaaagaataa
DBGET
integrated database retrieval system