Medicago truncatula (barrel medic): 11428130
Help
Entry
11428130 CDS
T01716
Name
(RefSeq) extensin-3
Organism
mtr
Medicago truncatula (barrel medic)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
11428130
NCBI-ProteinID:
XP_024630880
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(48371432..48374193)
Genome browser
AA seq
550 aa
AA seq
DB search
MRSPMASATLTLLLAIIVSLSIPSQISANSYLYSSPPPPSKVYPPVSPPYHYPSPPPPKV
YPPHSPPPKVYPPVSPPYHYSSPPPPKKYPPHSPPPKVYPPVSPPYHYSSPPPPKVYPPH
SPPPKVYPPVKPPYHYSSPPPPKKYPPHSPPPKVYPPVSPPYHYSSPPPPKVYPPHSPPP
KVYPPVKPPYHYSSPPPPVYSPPKKPYYYHSPPPPVYSPPPPYHYSSPPPPPKKPYKYSS
PPPPYVHPKPYYHSPPPPKKPYKYSSPPPPVHVSPKPYYHSPPPPKKPYKYSSPPPPVHH
YSPKPYYHSPPPPYYPHPHPHPHPKPYPHPHPVYHSPPPPKKPYKYSSPPPPVHHYSPKP
YYHSPPPPYYPHPHPHPHPKPYPHPHPVYHSPPPPKKPYKYSSPPPPYHPYPHPHPHPHP
HPHPYPVHHSPPPSPKKPYKYPSPPPPTHHHYPHPHPVYHSPPPPKYKYSSPPPPVHHVS
PKPYYHSPPPPKKPYKYSSPPPPVHPPYTPKPVYHSPPVHPPYTPHPVYHSPPPPVHSYI
YASPPPPYHS
NT seq
1653 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaggtctccaatggcctctgccactttgactcttctattagccataatagtgtctctc
tccataccatctcaaatttcagcaaacagctacttgtattcttcacctcctccaccttct
aaggtctaccctccagtttccccaccttaccactacccttcaccaccaccacctaaggtg
taccctccacattcaccaccacctaaggtgtaccctccagtttcaccaccttaccattac
tcttcaccaccaccacctaagaagtatcctcctcattcaccaccacctaaggtgtatcct
ccagtttcaccaccataccactactcttcaccaccacctcctaaggtgtaccctccacat
tcaccaccacccaaggtgtacccaccagttaaaccaccttaccattactcttccccacca
ccacccaagaaataccctccacattcaccaccacctaaggtgtatccaccagtctcacca
ccttaccactacagttctccaccaccacctaaggtgtaccctccacattccccaccaccc
aaggtgtaccctccagttaaaccaccttaccattactcttcaccaccaccaccagtgtac
tcaccacctaagaaaccatactactaccactctccacccccaccggtttactcacctcct
cctccctaccattacagttcaccaccaccaccaccaaagaaaccttacaagtattcttct
cctcctccaccatatgtccaccctaaaccttactaccattctccaccacccccaaagaaa
ccatacaaatattcttctcctccaccaccagtgcatgtaagccctaaaccttactaccat
tccccaccaccaccaaagaagccatacaaatattcctctcctcctccaccagtgcatcat
tacagccctaaaccttactaccactctccaccacctccatactatccacacccccatccc
cacccccacccaaaaccttacccacacccccatccagtttaccattcacctcctccccca
aagaaaccatacaaatattcttctcctccaccaccagtgcatcattacagccctaaacct
tactaccactctccaccacctccatactacccacacccccatccccacccccacccaaaa
ccttacccacacccccatccagtataccattcacctcctcccccaaagaagccatacaag
tattcatctcctccacctccatatcacccttatccacacccccacccccatccacaccca
cacccccacccctacccagttcaccactcacctcccccatcacctaaaaaaccatacaag
tatccatctccaccaccaccaacccaccaccattaccctcacccccacccagtttaccac
tcaccaccaccaccaaaatacaagtattcctcaccaccaccaccagtgcatcacgtcagc
cctaagccctactaccactctccaccaccaccaaagaagccatacaaatactcatcccct
ccaccaccagttcaccctccttacactccaaaaccagtttaccactctccaccagttcat
cctccctacactccacacccagtttatcactctcctccaccaccagttcacagttacatc
tatgcatctccaccccctccttaccactcttag
DBGET
integrated database retrieval system