Medicago truncatula (barrel medic): 25485755
Help
Entry
25485755 CDS
T01716
Name
(RefSeq) extensin-2 isoform X1
Organism
mtr
Medicago truncatula (barrel medic)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
25485755
NCBI-ProteinID:
XP_013470510
UniProt:
A0A072VSY6
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(56522299..56527174)
Genome browser
AA seq
1226 aa
AA seq
DB search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NT seq
3681 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgctaggggcagtgaccccataaggggtcgttttcggccgcatatggccatggca
ttggccattgttctcatttctactacagtggtttctgttgctgctgatggttacccatac
agttctcctccaccaccaacttatgagtacaagtcaccccctccaccctctccttcaccg
ccacctccttacatttacaaatcaccccctccaccaccttatgaacataaagctccacct
tacgagtacaagtcacctccgccaccgtcaccttcaccaccaccgccttacgagtacaag
tctccacctccaccttcctcatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacctccc
ccgccgtatgagcacaaagctccaccatatgagtacaagtctccacctccaccttcccca
tcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacctcccccaccgtatgagcacaaagcg
ccaccatatgagtacaagtcacccccaccaccatctccctcacccccacctccttactac
tataaatctccaccaccaccctctccctcacctccaccaccttactactacaagtcccca
ccaccaccctctccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccctct
ccctcacctccacctccttactactacaagtcacctccaccaccttcaccttcacctcct
ccaccttactactataaatctcctcctccaccctctccctcccctcctccaccttactat
tacaagtctcccccaccaccatatgagcacaaagctccgccatactattacaagtctccc
cctccaccttctccctcacctccaccaccttactactacaagtctcctccaccaccctct
ccctcacctccacctccttactactacaagtctcccccaccaccctcaccctcccctcct
cctccatattattacaagtccccaccacctccttcaccgtcccctccaccaccatattat
tataaatctcctccaccaccttcaccatctcctccaccaccctattattacaagtctcct
cctcctccatctccggtacctcatccaccttactactacaattcaccaccacctcctgta
aaatctccacctccaccaacaccgtactactatcagtctccaccaccacccaagtacact
ccacctccatactactataattctcctcctccgccagttgtatatccccctccttaccac
cacccattgattgtgaaggtagtgggtaaagtctacagctacaagtgctataattgggag
tatcctgaaaagtctcatgacaagaaacatctcaaaggtgctgttgttgaggtcaaatgc
aaagctggaaggaacatcatcaaggcttacggtaaaactaagagtaatggaaagtatgcc
atcacaattccaaactttaactatgtaaaatatggttctgtggtgtgcaaagccaaacta
tatgctccacctaaagactctcccttcaacatacctactaagctcaatgagggaactgac
ttgaaggtaaaatctaaagacaagtatgaagttgtgctcaaggctaagccattcgcatat
gcttctaagaagcattatgaagaatgtgaaaaacctaagccttcaccaactccttactac
tacaagtcacctcctcctccttcaccggtttatatatacaagtcaccacctccaccatca
cctacttataagtacacatcaccacctccacctgtccatcaatattctcctccatattat
tacaagtcaccacccccaccatcacctgtttacaaacccccatactactacaagtcacct
cctcctccaacaccaatttacaagtacaattcaccacctccaccatcaccaacttacgtg
tacaagtctccacccccaccatcacctgtatataaacccccatactattacaagtcacct
cctccaccatcacctgtataccagcccccatactactacaagtcacctccccctccatca
ccagtttactactacaagtcaccacccccaccatcacctgtatacaaacccccgtactac
tacaagtcacctcctcctccaacaccagtttacaagtacaattcaccacctccaccatca
ccaacttacgtgtacaagtctccacccccaccatcacctgtgtataaacccccatactat
tacaagtcacctcctccaccatcacctgtatacaagcccccatactactacaagtcacct
cctcctccaacaccagtttactactacaagtcacctcctcctccaacaccagtttacaag
tataattcaccacctccaccatcaccaacttacgtgtacaagtctccacccccaccatca
cctgtgtataaacccccatactattacaagtcacctcctccaccatcaccagtttactac
tacaagtctccacctccaccttcacctgtgtacaaacccccgtactactacaattcacca
cctcctccaacaccagtttacaaatacaattcaccacctccaccgtcaccaacatatgtg
tacaagtcaccacccccaccatcacctgtatacaaaccaccctattactacaagtcacct
cctcctccaacaccagtttacaagtacaattcaccacctccgccatcacctgcttacgtg
tataagtctcctcctcctccaacaccagtttacaagtacaagtcaccacctccacctgtc
cattattattctccaccatactactataagtcaccacctccaccatccccatcacctccc
cctccatactattacaaatctcccccaccgccatcaccatccccacctccaccatactat
tatcattctcctcccccacctaaagaattaccaaaccctccatactactataagtcacca
ccaccaccatcaccatcccctcctccaccatactattataagtcaccacctccaccatca
ccatcccctccccctccatactattataaatctcctccaccaccctcaccatccccacct
ccaccgtactattaccaatcccctccaccaccatcaccatctccaccacctccttattac
tacaaatcacctccaccaccaaccccatcacctccacctccatactactacaaaagtccc
cctccaccctctccctctcctccacctccatactattacaagagtccccctccaccctct
ccctccccccctcctccatactattatcattccccaccaccaccatcgccttctccacca
cctccctactactacaaatcacctccaccaccatccccgtcacctccacctccttactat
tacaagtcacctccacctccatctccatctccaccacctccttattactatcaaagtcct
cctccaccatctcccactcctcatactccctaccactacaaatcccctccaccaccaacg
gcgtctcctccacctccttaccattatgtgagtccccccccacctacatcatctccacca
ccttaccactacacatcaccacctcctccctccccagctcccgctcccacatacatatac
aaatcacctcccccaccaatgaaatcacctcctccgccagtttacatttatgcttcccca
ccaccacctatctacaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system