Medicago truncatula (barrel medic): 25496860
Help
Entry
25496860 CDS
T01716
Name
(RefSeq) lysine-specific histone demethylase 1 homolog 1
Organism
mtr
Medicago truncatula (barrel medic)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Amino_oxidase
SWIRM
NAD_binding_8
DAO
AlaDh_PNT_C
Pyr_redox_2
Thi4
FAD_binding_2
FAD_binding_3
FAD_oxidored
HI0933_like
GIDA
Lycopene_cycl
Pyr_redox
SAGA-Tad1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
25496860
NCBI-ProteinID:
XP_013453023
UniProt:
A0A072UC64
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(39234367..39237013)
Genome browser
AA seq
812 aa
AA seq
DB search
MHSPHKTELNSEQPMDTQMSEPSSEPPSQPPSQPPSEPPQLQNDNITISPENQPQNSSDS
SSQQQQQQQEQDPNPNPTLPRKRRRRKKFFTELTATTSLSKTRKNDVAKDCDDEALIAIS
VGFPVDSLTEEEIEANVVKTIGGSEQSNYIIVRNHILARWRSDVNVWLTYDKAVKSIRSE
HKGLVDVAYRFLIEHGYINFGVSPEIKAKKNSSFDGIERGSVIVIGAGLAGLVAARQLVF
LGFKVCILEGRDRPGGRVKTKRMFDGGGGGDGDGLVAAADLGGSVLTGVNGNPLGVLARQ
LDLPLHKVRDICPLYMPDGKCVDSEVDSRVEVLFNKLLERVCKLRQAMIDEVKSVDVPLG
TALEAFRRVYKVAEDKEERMLLNWHLANLEYANATLMSNLSMAYWDQDDPYEMGGDHCFI
PGGNETFVRALAEGLPIFYGRTVECIKYGSDGVLVCTDGQQFRADMALCTVPLGVLKKES
IKFVPDLPQSKKDAIHRLGFGLLNKVVMLFPTNFWGGNIDTFGHLTEDLSMRGEFFLFYS
YASVSGGPLLVALVAGEAALRFEMMSPLESVKRVLEVLKDIFHPKGIVVPEPVQAVCTRW
GKDEFAYGSYSYVAVGSSGDDYDILSESIGDGRVFFAGEATSKQYPATMHGAFMSGMREA
ANILRVTKRKSQSSVPFNATTNIDEENDDLDNLFVKPDLSFGSFSALFNPNPNDLDSSSI
LRVKIGGAVSNSPSLYLYALLSKKQVIQLSQIEGDENRMRMLNHDFGVSLVGKKGLSSTA
ESLIANIKLLRPQLNEAENGLVHGKDSCIMEE
NT seq
2439 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcactcacctcacaagactgagctaaactcagaacaacccatggatacacaaatgtca
gaaccctcatcggagccaccgtcacaaccaccttcacaaccaccgtcagaaccaccacaa
ctccaaaacgacaacataacaatctcccctgaaaaccaacctcaaaactcctctgattca
tcctcccaacaacagcaacaacaacaagaacaagatccaaaccctaaccctaccctacca
cgaaaacgacgtcgtcggaagaaattcttcacagaattaaccgcaacaacttccctctcc
aaaacccgcaaaaacgacgtcgctaaagactgtgacgacgaagccctaattgcaatttca
gtagggtttcctgtagattctttaacggaggaagaaattgaagcgaatgtggtgaaaaca
attggtgggtcggagcaatcgaattacattattgttaggaatcatattcttgcacgttgg
cgatcggatgtgaatgtttggttgacttatgataaggcggtgaagtcgattcgatccgaa
cataagggtttggttgatgttgcttataggtttttgattgagcatggttatattaatttc
ggtgtttcaccggagattaaagcgaagaaaaatagttcttttgatggaattgagagaggg
agtgtgattgttattggtgccgggttggcggggttggttgccgcgcgacaattagtgttt
ttagggtttaaagtttgtattttggaaggtagggatcgaccgggtgggagggttaagacg
aagaggatgtttgatggtggtggtggtggggatggggatggtcttgtggctgcggcggat
ttgggtggtagtgttcttaccggtgttaatgggaatccacttggtgttcttgctagacag
ttagatttgccgcttcacaaggttagggatatttgtccactttatatgccggatggaaaa
tgtgttgattctgaggttgattctagggttgaggttttgtttaataagttgttagagagg
gtatgtaagcttaggcaagctatgattgatgaggttaagagtgttgatgttcctttaggg
acagcgttggaggcgtttcgtagggtttataaggttgccgaggataaagaagagaggatg
ttgttgaattggcatcttgctaatttggagtatgcaaatgctactcttatgtcgaatttg
tctatggcttattgggatcaggatgatccttatgagatgggtggtgatcattgtttcatt
ccgggagggaatgagacgttcgtgcgtgctttggctgagggtcttccaattttctatggg
aggactgtggagtgtattaagtatggaagtgatggtgtgttggtgtgtaccgatgggcag
cagtttcgtgcggacatggcgctttgtactgtgcctttaggggttcttaagaaagaatcg
attaagtttgtccctgatcttcctcagagtaagaaggatgcaattcataggttaggattt
gggttgctgaataaggttgtgatgctgtttccgactaatttttggggtgggaatatcgat
acgtttggtcatttgaccgaggacttgagcatgaggggtgagttttttctgttctatagc
tacgcttctgtgtctggaggaccgcttctcgtggctcttgttgccggagaagctgctctt
agatttgagatgatgtcgccgttggagtctgtcaaaagggtgttggaagttttgaaggat
atttttcatccgaaggggattgttgttccggagcccgttcaggcagtctgtactcgatgg
gggaaagatgaattcgcttatggatcttattcttatgttgctgttggatcttccggagat
gattacgatatactttcagaaagtattggagatgggagggtgttctttgctggagaggca
actagcaaacagtaccctgcaacaatgcatggagcattcatgagtggaatgagagaagct
gcaaacattttaagagttacaaagaggaagtctcaaagttcagtgccattcaacgcaaca
acaaacattgatgaggagaatgacgatttagacaacctatttgtgaaacctgacctgagt
tttgggagcttctctgcattgtttaatccaaacccgaatgatcttgattctagttcaata
cttagggttaaaattggaggagctgtatcaaattcccctagtctttatctttatgcattg
ctttcgaagaagcaggtcattcagttgagtcagatcgaaggagacgaaaatcggatgaga
atgttaaatcatgattttggggtcagtttagttgggaagaaaggtttaagtagcactgct
gaatctcttattgccaacataaagttgttgagacctcagcttaatgaagcagaaaatggt
cttgtccatgggaaggatagttgtatcatggaagaatag
DBGET
integrated database retrieval system
