Nocardia farcinica NCTC11134: ERS450000_03406
Help
Entry
ERS450000_03406 CDS
T04524
Symbol
tycC_3
Name
(GenBank) Tyrocidine synthase III
Organism
nfr
Nocardia farcinica NCTC11134
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AMP-binding
Condensation
PP-binding
AMP-binding_C
Thioesterase
Abhydrolase_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CRY79255
UniProt:
A0A0H5NTY8
LinkDB
All DBs
Position
1:complement(3562199..3571270)
Genome browser
AA seq
3023 aa
AA seq
DB search
MTRPTRVRPARTRRPRLTALPQLMAKAVEANPAGVAVLCADATDTLGQLTYAELDERSTR
LARALIARGIGPEDLVALGIPRSVDSVLACWAVAKTGAGFVPVDPNYPADRVAHMLGDSG
AVVGITVADVRDDLPGDVEWLVLDDPATVDLLAAQSGEPVTGVDRVRPLLAEHPAYVIYT
SGSTGLPKGVVVTQAGLASFCEEQRERYRVTEESRTLHFASPSFDASVLELLLALGGAAT
MVVVSPTVYGGAELAGLLRRTGVTHAFITPAALASIDPTGLDDLRVVVAGGEACPPELVR
RWAVPLAGGSVREFYNGYGPTETTIMTNISEPLRPGELVTIGAPIRNVAAYVLDSRLRLV
PTGVVGELYLSGAQLARGYGNRPGMTAGRFVANPFTGDGARMYRTGDLVRRTASGALEYL
GRNDFQVKIRGFRIELGEIDAVLASHENVDFAVTVGHRLDNGSTILAAYVHAADGSPLDT
AELTALAEQQLPAHMVPTSITVLDQIPLTPVGKLDRRALPAPALHTKEFRAPAGRFEEMV
AQVFDDVVGDGSPIGAADDFFELGGNSLIATQVAARLGALLETKVPTRLIFEAPTVARLA
ERIAELSGQGGRTELRSGPRPERIPLSLAQQRMWFLNRFEPESAAYNIPIAIRLSGALDV
PALGQAIADLVARHEVLRTVYPETAHGPVQVILPSGDASPELEVRDVAPEQVRAAVAELL
GAGFDVTREVPLRVVLFRVTAEDFVLAMSVHHISGDGSSGGPLTRDLMTAYAARAAGRAP
EWAPLPVQYADYSIWQREVLGSEDDPESPAAKQIAYWRDQLAGLPDQLDLPTDRPRPAVQ
SFQGSVVDIRIDAELHRGLVELARAEGATLFMVVHTALAVLLARLSGGDDVAVGTPIAGR
GEAVLDDLIGMFVNTLVFRSRVDGAEPFTELLARQRETDLQAFAHADVPFERLVEVLNPV
RSTARHPLFQVGLSFQNLAEASLELPGLRVSGLDVDVHVSQFDLHWIVGDRYDESGAPAG
MGGALTYATALFDRATAEVFVERFVRLLRAVVAAPRTAVGDLDLLEPAERQRLLVDVNAT
DHPLTPGTLADLLDASAAAASGHAVALVGPDGGRVSWPELDARVNSVARVLISRGVGPED
RVALALRRGVDLVVAMYAVARAGGAYVPVDPDQAAERTDYILRTAAPVLVLTDRATGFTS
DIAPVLAVDGAVADSAAPITDADRRAPLRPDHTAYVIFTSGSTGRPKGVAVPHAAVVNQL
RWKISEFELTADDAVLLKTAATFDLSVWEFWSAAACGGRLVIASPDGHRDPAYLTELMAR
EGVTTLHLVPSMLDALLTASGDALPGSLRRVLAIGEALPAASAQRALRTGTALFNLYGPT
EAAVSITNHLVTEADRSTVPIGAPEWNSRVYVLDGRLRPVPVGVSGELYLAGAQLARGYF
GRPELTAERFVANPFTPGARMYRTGDVVAWNAAGELDYRGRTDFQVKIRGFRIELGEIEA
VLQAQPGVAAAAVAAHSDPHTGDRLVGYVVPADPAAEVDTAAIKTALATELPSYMVPSAF
VVLDALPLNVNGKLDRKALPEPVFEPREFRAPTTPVEEIVAEIFTDVLGVERVGADDDFF
ALGGNSLIATQAAARIGAALDTEVPVRLLFEAATVAALAVRVEAQAGAGRRPALTPRPRP
ERIPLSPAQQRMWLLNGIDGGAAVYNIPAAVRLTGTLSVPALQQAVADVLARHEVLRTVY
PAHDGTAHQVVLPVDHVVPDLTPRVVPAAALREHIAAELGTGFDVTREVPVRAVLFRVAE
DPAEHVLVLVVHHIAADGWSMAPFTRDLMVAYAAREIGEAPSWQPLPVQYADFSLWQREL
LGDENDPASPAARQLAYWRTALAGLPDALSLPFDRPRPAIQETAARAVAVHIDARTHRAL
LELARAQHATLFMVVHTALAVLLARWSRADDIAIGTPVAGRGDAALDDLVGMFVNTLVLR
TRVDSATPFTELLARQRDTDLAAYANADVPFEHLVDVLNPVRSTARHPVFQVMLAFQNQA
RAGLELPGLSVSAMEFESEQTEYDLQLMVADGYDEHGEPTGIAGKVVYPTSLFDAATIEG
FARRFERVLAALAEEPGRPVGDVDWLTDAERTEVLTTRNATAHPLDESATLVSLVATGTR
IDPDAVALVDGALTDQRSEVSYAEFDARANRLARHLISLGVGPGSRVVVALHRSVDLLVA
IHAVLRTGAAYVPVDPDHPAERTAYVLDLSEPSCVLTHAAADFRTERAPVLHVDALDLSG
YPADPVTDADRRAPLRPADTAYILFTSGSTGRPKGVAVPHRAVANHVRWFVAEYGIGAAD
VSLFKTTITFDMSVWDVFVPFVTGGRVVIAGRDGHRDPRYLAEVIAAERVTVIPFVPSML
RAIVDTLDGAALDTLRVIWLAGEALSAETAAAARRVSRARLDNLYGPTETAVVTMTARVP
ADAAGIVPIGAPIWNVRAYVLDDRLRPVPVGVAGELYHAGIQLSHGYFGRPDLTAARFVA
SPFGDGERLYRTGDLVRWTTDGQVEYLGRTDFQVKVRGLRIELGEIETALLGHDAVRQAV
VVVHTDAQLGDQLVGYVVPEPGSGELDAEALRAHLAALVPSYMVPAAFVLLAELPLNANG
KLDRKMLPEPEFAARSQRQARTPVERTITGVFAEVLGLDSVGMDDSFFELGGNSLVATRA
AARLGEELGLRVPVVWLFTTPTPAGIAGQVLGAGAAERADGAPAFDAGAAFDVLLPLRAG
TGAPLFCIHPFGGIAWSFAGLAAHLGGDRPIYGLQSPALGSDETLPDSTEKWALRYLEEI
RSVQPRGPYHLLGWSLGGVLAHAIAVQLQAEGEQVELLAMMDSYLRSEIAESAIPAGEAP
LAELLGGLLGDDAPGVDLAVGDGVDGADPAGLARRLAELPEPFASFGADRIARVLDAAVR
SATVTERYRPRRFAGELVYFAAAEDDPTGSVGAATWATAVDGPIRTIAVPTTHWRMTTAA
GLAVIGRTLDELNAAHEAATDRT
NT seq
9072 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacccgccccacccgcgtgcgccccgcacggacccgccgcccccgcctcaccgccctc
ccgcagctgatggccaaggccgtggaggccaatccggccggcgtcgccgtgctgtgcgcg
gacgccaccgacaccctcggtcagctgacctacgccgaactggacgagcggtccacccgc
ctggcgcgggcgctcatcgcgcgcggcatcggcccggaggatctcgtcgcgctcggcatc
ccgcgctccgtcgactcggtgctggcctgctgggcggtggccaagaccggcgcgggtttc
gtgccggtcgatccgaactatcccgccgaccgggtcgcgcacatgctcggcgactccggc
gccgtcgtcggcatcaccgtcgccgacgtgcgcgacgacctgcccggcgacgtggaatgg
ctggtgctcgacgacccggccaccgtcgacctgctcgccgcgcagtccggcgagccggtc
accggcgtggatcgggtgcgtccgctgctggccgagcatccggcctatgtcatctacacc
tccggctcgaccggtctgcccaagggcgtggtcgtcacccaggccgggctggcgagcttc
tgcgaggaacagcgcgagcggtaccgggtcaccgaggagtcgcgcacgctgcacttcgcc
tcgccctcgttcgacgcctcggtgctggaactgttgctggcgctcggtggcgcggcgacg
atggtcgtggtctcgcccacggtgtacggcggcgccgagctggcggggctgctgcgtcgc
accggggtgacgcacgcgttcatcaccccggccgcgctggcctccatcgaccccaccgga
ctcgacgatctgcgcgtggtggtggccggcggcgaggcctgcccgccggagctggtgcgc
cgctgggcggtgccgctggccggtggctcggtgcgcgagttctacaacggctacggcccc
accgagaccaccatcatgaccaacatcagcgaaccgttgcggccgggggagctggtgacg
atcggcgcgccgatccgcaatgtggccgcctacgtgctcgattcgcggctgcggctggtg
cccaccggtgtggtgggtgagctgtatctgtccggcgcgcagctcgcccgcggctacggg
aaccgcccggggatgacggcggggcggttcgtggccaacccgttcaccggggacggcgcg
cgcatgtaccgcaccggcgacctggtccgccggaccgcatccggtgcgctggagtacctg
ggccgcaacgacttccaggtgaagatccgcggcttccggatcgaactgggcgagatcgac
gcggtgctggcatcgcacgagaacgtggatttcgcggtgaccgtcgggcaccggctcgac
aacggcagcaccatcctcgccgcgtacgtgcacgccgccgacggcagcccgctcgacacc
gccgaactcaccgcgctggccgagcagcagctgcccgcgcacatggtgcccacctcgatc
accgtgctcgaccagatcccgctgaccccggtcgggaagctggaccgccgcgcgctgcct
gctccggccttgcacaccaaggagttccgcgcgcccgcaggccggttcgaggagatggtg
gcgcaggtcttcgacgacgtggtgggcgacggttccccgatcggcgccgccgacgacttc
ttcgagctgggcggcaactcgctgatcgccacccaggtggcggcccggctgggtgcgctg
ctggagaccaaggtgcccacccggctcatcttcgaagcgccgacggtggccaggctggcc
gagcggatcgccgaactgtccgggcaggggggacgcaccgaactgcgctcgggcccgcgc
cccgagcggatcccgctgtcgctggcacagcagcggatgtggttcctcaaccggttcgag
cccgagtcggccgcctacaacatcccgatcgcgatccggttgtccggcgcgctggacgtg
cccgcgctcgggcaggcgatcgcggatctggtggcgcggcacgaggtgctgcgcaccgtc
taccccgaaaccgcgcacggtccggtgcaggtgatcctcccgtccggggacgcctcgccg
gagctggaggtgcgcgatgtcgcgcccgagcaggtgcgcgccgcggtggcggaactgctc
ggtgccgggttcgacgtcacccgggaggtgccgctgcgggtggtgctgttccgggtgacg
gccgaggacttcgtgctcgcgatgtcggtgcaccacatttcgggtgacggctcgtcgggt
gggccgttgacgcgggatctgatgacggcctacgcggcgcgggcggccgggcgcgccccg
gagtgggcgccgttgccggtgcagtacgccgactacagcatctggcagcgcgaggtgctg
ggcagcgaggacgatccggaatcgcccgccgccaagcagatcgcctactggcgtgaccag
ctggccggtctgcccgatcagctggatctgccgaccgatcggccgcgcccggccgtgcag
tcgttccagggcagcgtggtcgacattcgcatcgatgccgagttgcaccgtgggctggtg
gagttggcgcgggctgagggtgcgacgttgttcatggtcgtgcacacggcgttggcggtg
ttgctggcccggttgtcgggtggtgacgacgtggcggtggggacgccgatcgccggtcgt
ggtgaggcggtgctggacgacctgatcggcatgttcgtcaacacgctggtcttccgcagc
cgcgtcgacggcgcggaacccttcaccgagctgctggcccgccagcgcgaaacggatctg
caagcgttcgcgcacgcggatgtgccgttcgagcggctggtcgaggtgctcaacccggtg
cgctccacggccaggcatccgctgttccaggtgggcctgtcgttccagaatctggccgag
gcgagcctggagttgccggggctgcgcgtgtcgggtctggatgtggatgtgcatgtctcg
cagttcgatctgcactggatcgtgggcgaccgttacgacgagagcggcgcgcccgcgggc
atgggcggtgccctgacctacgccaccgcgctgttcgaccgggcgaccgccgaggtgttc
gtggagcgtttcgtgcgattgctgcgcgcggtcgtggccgcgccgcgcaccgccgtgggc
gacctggacctgctcgagcccgccgagcggcagcgcctgctcgtggacgtcaacgccacc
gaccatccgctcaccccgggcacgctcgccgatctgctggacgcctcggcggccgccgcc
tccgggcacgcggtcgcgctggtcggcccggacggcggccgggtgtcctggcccgaactc
gacgcccgggtcaacagtgttgcgcgcgtgttgatctcgcgcggcgtcggcccggaggat
cgggtggcgttggcactgcggcgcggtgtcgatctggtggtggcgatgtacgcggtcgcc
cgtgcgggtggtgcgtacgtgccggtggacccggatcaggcggccgagcgcaccgactac
atcctgcgcacggccgcaccggtgctggtcctcaccgaccgcgcgacgggtttcacctcc
gacatcgccccggtgctggcggtcgacggcgcggttgcggactcggccgcgccgatcacc
gacgccgaccgtcgtgcgccgctgcgcccggaccacaccgcctacgtcatcttcacgtcc
ggttccaccggacggcccaagggtgtggcggtgccgcacgccgccgtggtgaaccagttg
cggtggaagatcagcgaattcgagctcaccgccgacgacgcggtgctgctcaagacggcc
gccaccttcgacctgtcggtgtgggagttctggtcggccgcggcgtgcggcgggcggttg
gtgatcgcgagccccgacgggcaccgcgaccccgcctatctcaccgagctgatggcgcgc
gagggcgtgaccaccctgcacctggtgccgtccatgctggacgcgctgctcaccgcctcc
ggcgacgcactgcccggttcgctgcggcgggtgctcgcgatcggtgaggcgctgcccgcg
gcgtcggcgcaacgcgcgctgcgcaccggcaccgcgctgttcaacctgtacggtcccacc
gaggcggccgtctccatcaccaaccacctcgtcaccgaggccgaccggtcgacggtgccg
atcggcgcgccggagtggaacagccgcgtctacgtgctcgacggcaggctgcggccggtg
ccggtcggcgtgtccggtgagttgtacctggcgggtgcgcaattggcgcgcggctacttc
gggcggcccgagctgaccgccgagcggttcgtcgcgaacccgttcacgcccggtgcgcgg
atgtaccgcaccggcgacgtggtggcgtggaacgccgcgggggagctggactaccggggg
cgcaccgacttccaggtgaagatccgcggtttccgcatcgaactcggcgagatcgaggcc
gtgttgcaggcgcagccgggcgtggcggcggccgcggtggccgcgcactcggacccgcac
accggtgatcggctcgtcgggtacgtggtgcccgccgatcccgcggccgaggtcgacacc
gcggcgatcaagaccgcgctggccaccgagctgccgtcgtacatggtgccgagcgcgttc
gtggtgctcgacgcgctgccgctcaacgtcaacggcaaactcgaccggaaggcgttgccg
gagccggtgttcgagccccgtgagttccgcgcgcccaccactccggtggaggagatcgtc
gccgagatcttcaccgatgtgctcggggtcgagcgcgtcggcgccgacgacgacttcttc
gccctcggcggcaactcgctgatcgcgacccaggccgctgcccggatcggcgccgcactc
gacaccgaggtgccggtccggctgctgttcgaggccgccaccgtggccgcgctggcggtc
cgggtggaggcacaggcgggcgccggacggcgcccggcgctcacgccgcggccgcgcccg
gagcgcattccgctgtcgccggcccagcagcgcatgtggctgctcaacggcatcgacggc
ggcgccgccgtctacaacatcccggccgcggtccggctgaccggcaccctgtcggtgccc
gcgctccagcaggccgtcgccgacgtgctggccaggcacgaggtgctgcggacggtctac
cccgcgcacgacggcaccgcccaccaggtcgtcctgccggtcgaccacgtggtgcccgac
ctcaccccgcgcgtcgtgccggccgccgcgctgcgcgagcacatcgcggccgagctgggg
accggcttcgacgtcacccgcgaggtaccggtgcgggccgtgctgttccgcgtggccgaa
gatccggccgagcacgtgctcgtgctggtcgtgcaccacatcgccgccgacggctggtcg
atggcccccttcacccgcgacctgatggtcgcctacgccgcccgcgagatcggcgaggcg
ccgtcgtggcaaccgctgccggtgcagtacgccgacttcagcctgtggcagcgcgaactg
ctcggcgacgagaacgacccggcctccccggccgcccgtcagctggcgtactggcgcacc
gcgctggccggtctgccggacgcgttgagcctgccgttcgaccggccgcggcccgccatc
caggagaccgcggcccgcgcggtggccgtgcacatcgacgcgcggacccaccgcgcgctg
ctggagctggcgcgcgcgcagcacgcgacgctgttcatggtcgtgcacacggcgctggcg
gtgctgctcgcccgctggtcgcgcgccgacgacatcgccatcggcacgcccgtggcgggc
cggggtgacgccgcactcgacgatctggtcggcatgttcgtcaacaccctggtgctgcgc
acccgggtcgactccgccaccccgttcaccgagctgctcgcccgccagcgcgacaccgac
ctggccgcctacgccaacgccgacgtcccgttcgagcatctggtcgacgtcctcaacccg
gtgcgctccaccgcccggcacccggtgttccaggtgatgctggccttccagaaccaggcc
cgcgccggtctcgagctgcccggcctgtcggtctcggccatggagttcgagtccgagcag
accgaatacgacctgcagctgatggtcgccgacggctacgacgagcacggcgaacccacc
ggtatcgcgggcaaggtggtctacccgaccagcctgttcgacgcggccaccatcgaaggc
ttcgcgcggcggttcgaacgcgtcctggccgcgctcgccgaggaacccggccgtccggtc
ggcgacgtcgactggctcaccgacgccgaacgcaccgaggtactgaccacccgcaacgcc
accgcgcacccgctcgacgagtcggccacgctggtctcgctggtcgccaccggcacccgc
atcgaccccgacgcggtggcgctggtcgacggcgcactcaccgatcagcgcagcgaagtc
agctacgccgagttcgacgcccgggcgaatcgccttgcccggcatctgatctcgctgggt
gtcggacccggttcccgggtcgtggtcgcactgcaccggtcggtcgatctgctggtggcg
atccacgcggtgctgcgcacgggcgcggcgtacgtgccggtggatcccgaccacccggcc
gagcgcaccgcctacgtgctcgacctgtccgagccgagctgtgtgctcacccacgccgcc
gccgatttccgcaccgagcgggcaccggtgctccacgtggacgcgctggacctgtccggc
tacccggccgatccggtgaccgacgccgaccgccgcgcgccgctgcgcccggcggacacc
gcctacatcctgttcacctccggctcgaccggacggcccaagggcgtcgccgtgccgcac
cgcgcggtcgccaaccatgtgcgctggttcgtcgccgagtacgggatcggcgccgccgac
gtgtcactgttcaagaccaccatcaccttcgacatgtcggtgtgggacgtgttcgtgccc
ttcgtcaccggcggccgggtggtgatcgccggccgcgacgggcaccgcgatccgcgctac
ctcgccgaggtgatcgccgccgagcgggtgaccgtcatcccgttcgtgccgtcgatgctg
cgcgccatcgtcgacaccctcgacggtgccgcgttggacacgctgcgggtgatctggctg
gccggtgaggcgctgtccgccgagacggccgcggccgcgcgccgggtctcgcgggcccgg
ctggacaacctctacggcccgaccgaaaccgcggtcgtcaccatgaccgcgcgggtgccc
gccgacgccgcaggcatcgtgcccatcggcgcccccatctggaacgtgcgcgcctacgtg
ctcgacgaccggctgcggccggtcccggtcggtgtcgccggcgagctctaccacgccggt
atccagctctcgcacggctatttcggtcgcccggacctcaccgccgcccggttcgtggcc
agccccttcggcgacggggagcggctctaccgcaccggcgacctggtgcgctggaccacc
gacggacaggtggaatacttgggccgcaccgacttccaggtcaaggtgcgcggtctgcgg
atcgagctcggcgagatcgagacggcgctgctcggccacgacgcggtccgccaggccgtc
gtcgtggtgcacaccgacgcgcagctgggcgaccagctcgtgggctatgtcgtgcccgag
ccgggaagcggcgagctcgacgccgaagcgttgcgcgcacacctggccgcgctggtgccc
tcctacatggtgcccgccgccttcgtgctgctcgccgagctgccgctcaacgccaacggc
aagctcgaccggaagatgttgcccgagccggaattcgccgcccgctcgcagcggcaggcc
cgaacgccggtggaacgcaccatcaccggggtcttcgccgaggtgctcggtctcgactcg
gtcggcatggacgacagcttcttcgaactcggcggcaattcgctggtcgccactcgggcg
gcggcccggctgggcgaggaactcgggctgcgggtgccggtggtgtggctgttcaccacg
ccgaccccggccgggatcgccgggcaggtgctcggtgctggtgccgcggaacgtgccgat
ggagcgccggcgttcgatgccggtgcggcgttcgacgtgctgttgccgctgcgggcgggg
acgggcgcgccgctgttctgcatccacccgttcggcggcatcgcctggtccttcgccggg
ctcgccgcgcatctgggcggcgaccggccgatctacggcctgcagtccccggccctcggg
tcggacgagacgttgcccgactccaccgagaagtgggcgctgcgctacctggaggagatc
cggtcggtgcagccgcgcggaccgtatcacctgctgggctggtcgctgggcggtgtgctc
gcgcacgccatcgcggtgcaactgcaagccgagggcgagcaggtcgaactgctggcgatg
atggacagctacctgcgttcggagatcgccgagtccgcgatcccggccggggaggcgccg
ctggccgaactgctcggcggcctgctcggcgacgacgcccccggcgtggacctggccgtc
ggcgacggtgtggacggggccgatcccgccggcctcgcgcgccggttggccgagttgccc
gaaccgttcgcctccttcggtgccgaccgcatcgcccgggtcctcgacgccgccgttcga
tcggcgactgtcaccgagcggtaccgaccccgtcggttcgccggtgaactggtctatttc
gccgccgccgaggacgatccgaccggcagcgtgggcgcggccacctgggccacggcggtc
gacggacccatccgcaccatcgcggtgcccaccacgcactggcggatgaccacggcggcc
ggtctcgcggtgatcggacggacgctcgacgagctgaacgcggcgcacgaggcggcgaca
gaccgaacctga
DBGET
integrated database retrieval system