Nanorana parkeri (Xizang Plateau frog): 108790225
Help
Entry
108790225 CDS
T04897
Symbol
NOTCH1
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1
KO
K02599
Notch 1
Organism
npr
Nanorana parkeri (Xizang Plateau frog)
Pathway
npr04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
npr00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
108790225 (NOTCH1)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
NOD
Notch
NODP
Ank_4
Ank_3
Ank_5
EGF_3
DL-JAG_EGF-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108790225
NCBI-ProteinID:
XP_018415946
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2526 aa
AA seq
DB search
MGHLVLSLLLLSLIVRAQGLRCTQPGETCFNNGKCDSSGTNCRCPSSFIGDRCQFSNPCS
RNPCLNGGTCNAEVRGSDVQFTCSCPLGYQDARCLTRKDNACLSSPCRNGGTCELVINEK
NYRCRCPPGWTGDTCQQADPCASNPCGNGGTCVPFDSQYVCKCLEGFHGETCKQDINECK
QNPCKNGGTCVNSFGSFSCLCKSRYTGNYCENPYVPCNPSPCQNGGTCRQTDDTSYECTC
LPGFAGQNCEDNIDDCPGHNCKNGGTCVDGVNTYNCQCLPDWTGQYCTEDVDECQLMPNA
CQNGGTCHNTHGGYNCVCVNGWTGEDCSENIDDCANAACNNGATCHDRVASFFCECPHGR
TGLLCHLEDACISNPCNEGSNCDTNPVNGKAICTCPSGYSGPACNHDVDECSLGANPCEH
AGKCINTQGSFQCNCLPGYAGPRCEIDVNECLSNPCQNDATCLDQIGGFQCICMPGYEGT
YCEINTNECSSNPCLHNGKCIDKINEFHCECPTGFNGPQCQYDIDECASTPCKNGAKCID
GPNAYTCKCAEGFTGVHCETDINDCYPDPCHYGTCIDGIATFSCLCRPGFTGRLCDTNLN
ECQSMPCQNRGECIDQINSYMCQCPKGTSGTNCEINLDDCASNPCDSGKCIDKIDGYECA
CEPGYTGKMCNINIDECASNPCSHGGTCEDLVSGFKCTCPEGFQGHTCMSEVDECRSNPC
IHGTCRDGVNGYKCDCDSGWSGTNCDVNNNECDSNPCMNFGTCKDMTSGYICSCREGFTG
VNCQTNINECASNPCLNQGTCIDGVAGYKCICPLPYTGETCEDVLAPCGNNPCKNGGRCQ
ESEDYESFSCLCPVGWQGQTCEIDINECVKNPCRNGALCQNTNGNYKCNCKPGYTGRNCE
TDINDCLPNPCHNGGSCTDGVNEFFCNCLPGFRGPNCNEDINECASNPCKNGANCTDCVN
SYTCTCPSGFSGIHCEINTPDCTESSCFNGGTCVDGINTFTCLCPPGFTGSYCQHDINEC
DSKPCMNGGTCQDSYGTYKCTCPQGYTGLNCQNLVHWCDSSPCKNGGKCWQRNNLYRCEC
NSSWTGLYCDVPNVSCEVAALQRNVDVNNLCRNSGSCRDTGNTHYCLCQPGYTGSYCEAQ
VDECSPSPCQNGATCTDYLGGYSCECVAGYHGVNCSEEINECHSHPCQNGGICIDLINTY
KCSCPRGTQGVHCEINIDDCNPSYEGPNQEPKCFNSGKCVDRVGGYHCNCLPGFVGERCE
GDVNECLSSPCDARGTQNCVQLINDYQCECRQGFTGRRCESLLDGCKTKPCRNGGTCAIA
SNTERGFICKCPPGFDGATCEYDTRMCGNLQCLNGGTCISTLKSPKCLCADGFTGLECQH
AVSSSCNPNSCYNGGTCKSLPQEPFYQCICPRHFNGLFCHILDYEFEGGSGQDIIPPKIS
EKCESDWCAAQAGNKICNAQCNSNACGWDGGDCSLDFNDPWKNCSQALQCWKYFNDDKCD
SQCNNAGCLYDGFDCQTIEVQCNPLYDQYCKDHFQDGHCDQGCNNAECEWDGLDCANNMP
EKLADGTLVVVVLMTPEELKNNSFNFLRELSRILHTNVVFKKNENNDYMIIPYYGNKEEL
KKHHIKRSVPEWSEASSAIFSSLRDSLIPGRYRRELDQLEVKMSIVYLEIDNRQCFQASS
QCFNSATDVAAFLGALASLGNLDIPYKIEAVKSETAPPPPSSPLYPGLVVGAISLLLIFL
VAGVIVNKKRRREHGHLWFPEGYTVKESNKSKKRREPLGEDSVGLKPLKNGADGSLMDDN
QNEWGDEETLDSKRFRFEDQVMLPDLGDQTDHRQWTQQHLDAADLRAPSIAPTPPQGEID
ADCMDVNVRGPDGFTPLMIAACSGGGLETGNSEEDEDASGQMISDFIGQGANLHSQTDRT
GETPLHLAARYARADAAKRLLESSADANVQDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATD
LDARMHDGTTPLILAARLAVEGMVEELINSHADVNTIDELGKSALHWAAAVNNVDAAMVL
LKNGANKDMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKMLLDHFANRDITDHMDRLPRDIAQERMHH
DIVRLLDEYNLVRSPQLHNGPLGAPTLSPPICSPNGYIGNMKPAVQGKKARKPGAKGPGC
KDSKDMKARRKKSQDGKNGLLDSGSSGVLSPVDSLESPHGYLSDVSSPPLMTSPFQQSPS
MPLNHLTNMPDSHIGLNHLNMNAKQEMAAGSNRMCFETMAPRLTHLSVSSPSAVLNTGSL
QFTVGGAPVINGQCDWLARLQNGMVANQYNPMRSNLQQGGNQQASALQHGLMTSLHNGLP
TGLTQMMTYQAMPNTRMTNQSQILQAQQIQQIQQSLQLQQQSMQQQQQQQQHNPSSGSGS
HIVAPFCGSDMAQSEMQQMTGNGLHAILPQDTQILTGSLPAPLTQSMTTTQFLTPPSQHS
YSSPMDNTPNHQLQVPDHPFLTPSPESPDQWSSSSPHSNMSDWSEGISSPPTNIQSQHNH
IPEAFK
NT seq
7581 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtcaccttgtgctatcactgctgctgctgtcattgattgtccgcgcacaaggttta
aggtgtacgcagcctggcgagacttgctttaataatggaaagtgtgattccagcggaaca
aattgcagatgtcccagttccttcattggagatcgatgtcaattctccaacccatgctcc
agaaatccctgcctgaatggagggacctgcaatgctgaagtccgaggtagtgatgtacag
ttcacttgcagctgcccactaggataccaagatgcacgctgccttacccgcaaggacaac
gcttgcctcagcagcccatgtcgcaatggaggaacgtgtgagctggtcataaatgagaag
aattataggtgtagatgccctccagggtggacaggagacacttgccagcaggctgaccca
tgcgcctccaacccttgcggcaatggtggaacttgtgtcccattcgactcccagtatgtg
tgcaaatgcctggaaggttttcatggagagacctgcaagcaggacatcaacgaatgcaaa
cagaatccgtgcaaaaatggtggaacctgtgttaacagctttggatctttctcctgtctg
tgcaagagtcgttatactggcaattactgtgagaacccatatgtgccatgcaacccatca
ccttgccaaaacgggggcacctgccggcagaccgacgacacttcctatgaatgcacctgc
ttgccaggatttgcaggtcagaactgtgaagacaacattgacgactgtcctggacacaac
tgcaagaatggagggacctgtgtggatggcgtaaacacctataactgccagtgtctccct
gactggactggccaatactgtacggaagatgttgatgaatgtcagttgatgccaaatgct
tgccagaatggtggtacgtgccacaacacccatggtggctataactgcgtctgtgtcaac
ggctggacgggagaggattgcagtgaaaacattgacgattgtgccaatgctgcttgcaac
aatggagcaacctgtcatgacagagttgcatctttcttctgcgaatgtccacatggacgc
acaggtcttctctgtcaccttgaagatgcttgtattagcaacccatgtaatgagggctcc
aactgtgataccaaccctgtcaatggcaaagcgatctgtacttgtccatctggctacagc
ggtcctgcctgcaatcacgatgtggatgaatgctcgctaggtgccaatccatgtgaacat
gcaggaaaatgtatcaacactcagggttctttccaatgcaactgtctcccaggctatgcc
gggccacgatgtgaaattgatgtcaatgaatgtctttcgaacccttgccagaatgatgct
acgtgccttgaccagattggtggattccagtgtatctgtatgccaggctatgaaggcaca
tactgtgaaatcaatacaaacgaatgctccagcaacccctgcttacacaatggcaaatgc
atcgataaaataaacgagtttcactgcgaatgccctacaggtttcaatgggccccagtgt
cagtatgacattgacgaatgtgccagtacaccatgcaagaatggcgctaagtgtatagat
ggaccgaatgcctacacctgcaaatgtgcagaaggttttacgggggtgcactgtgagacg
gacataaacgactgctacccagacccctgccactatggtacctgcattgatggcatcgcc
actttctcctgcctatgtagacctgggtttactgggcggctatgtgacactaaccttaac
gaatgccaaagcatgccgtgtcagaacagaggagaatgtattgaccagatcaacagctac
atgtgccagtgcccaaagggaacctcgggtacaaactgtgagatcaatttggatgactgc
gccagtaacccatgcgactctggcaaatgcattgataagattgatggctatgagtgcgcc
tgcgaaccaggctacacaggaaaaatgtgtaatatcaacattgatgaatgtgccagcaac
ccgtgcagtcacggagggacctgtgaagaccttgtcagtggttttaagtgcacctgtcca
gagggcttccagggacacacgtgtatgtccgaagtggatgagtgccgcagcaacccttgt
atccatgggacgtgccgcgatggagtcaacgggtacaagtgcgattgtgactctggctgg
agcggcaccaactgtgatgttaataacaatgagtgtgactccaatccctgtatgaacttc
ggaacctgcaaggacatgaccagcggctacatctgctcctgtagagaaggattcactgga
gtaaactgtcagaccaacattaacgagtgtgcgtcaaatccttgtctgaaccaaggcaca
tgcatagacggggttgccggatacaagtgcatttgtccactcccctatacaggggagaca
tgtgaagatgtgctggcaccgtgtggtaacaacccatgtaagaacggaggcagatgtcag
gagtctgaagactatgaaagcttctcctgcctttgtcctgtgggatggcaaggccaaacc
tgtgaaattgacatcaatgaatgcgtgaagaacccttgccgaaatggtgctttgtgccag
aacactaacggaaactacaagtgtaattgtaaacccgggtacaccggcaggaactgtgag
acggatatcaacgattgtctgccaaatccctgccacaacggaggctcctgcactgatggt
gttaacgaatttttctgcaactgtttgccgggcttccgtggtccaaattgtaatgaggac
ataaatgaatgtgcgagcaacccgtgtaaaaatggtgccaactgcactgactgcgtcaac
agctacacttgtacttgtccatctggatttagcggcatccattgtgaaattaatacacct
gattgcacagaaagctcttgcttcaatggtggcacttgtgtcgacggcatcaacacattc
acctgcctctgtccacctggctttaccgggagctactgccagcatgacatcaatgagtgt
gactccaaaccctgcatgaatgggggaacatgccaggacagctatggcacgtacaagtgc
acctgccctcaggggtacactgggttaaactgccagaatttggttcattggtgtgactcc
tctccttgcaaaaatggaggaaaatgctggcagaggaataatctgtatcgatgtgaatgc
aacagtagctggaccggattgtactgtgatgtgcccaatgtttcgtgtgaggttgctgcc
ctacagcgaaatgtggatgttaacaatctgtgccgcaattccgggtcatgtagggacact
gggaatactcactattgtttgtgccagcccggttacactggtagttactgcgaggcgcag
gtggatgaatgctctcccagtccatgccagaatggagctacatgcacggactacctagga
ggctactcctgtgagtgcgtagctggatatcatggtgttaactgctcagaggagatcaat
gaatgccactctcacccttgtcagaatggaggaatttgtattgatcttatcaacacttac
aaatgctcctgtcccagaggaacgcagggcgttcattgcgaaattaacattgatgactgc
aatccatcttatgaaggacccaaccaagagcctaaatgttttaatagcggcaaatgtgtt
gaccgtgtaggtggctaccactgtaactgcctgccaggttttgttggcgagcgctgtgaa
ggagatgtaaatgaatgcctgtctagcccttgtgatgcccgcggaacgcagaactgcgtg
cagctcattaatgattaccaatgtgaatgcaggcaggggttcacagggaggcgctgtgaa
tcgttgcttgatggctgcaaaacgaaaccctgcaggaatggaggaacctgcgctatcgcc
agcaatacggaacgtggtttcatctgcaagtgtccaccgggatttgatggcgctacttgt
gaatatgacactcgtatgtgtggaaacctgcaatgtctgaatgggggcacctgtatatct
acattaaagagccccaaatgcttgtgtgccgatgggtttactggtctagagtgccaacat
gcagtcagcagttcttgtaatccaaactcttgctataacggtggcacatgcaagtctctt
ccccaggagccattttatcagtgtatctgtcccaggcattttaacggtctcttttgccac
attctggactatgagtttgaaggtggttcaggccaggacatcattccacccaaaatcagc
gaaaagtgcgagagtgattggtgtgccgcacaagccgggaacaagatctgcaatgctcag
tgcaacagtaatgcctgcggttgggacggaggagactgttcgcttgacttcaatgaccca
tggaagaactgctcgcaggcactgcagtgctggaagtacttcaatgatgacaaatgcgac
tcacagtgcaacaacgcaggctgcctctatgatggctttgactgccaaacaattgaagtc
cagtgcaaccctctttacgaccagtactgtaaagaccatttccaggatggacactgtgat
caaggctgcaacaatgctgagtgtgaatgggacggtctggattgcgccaataacatgcct
gagaaactggcagatggcaccttggtggtggtggtccttatgactccagaggagctgaag
aacaattcctttaatttcctcagagagctgagtcgaattctgcacaccaatgttgtcttc
aagaagaatgaaaacaatgactatatgatcatcccgtactatggaaacaaggaggagctt
aagaagcatcacattaaacgatctgtaccagaatggtctgaggcctccagtgccatattc
agcagtttaagggattccttgatccctggacggtatcggagggaactggaccagctggaa
gtaaaaatgtcaattgtatacttggaaatagataaccggcaatgtttccaggcttcatcc
cagtgctttaacagcgcaacagacgtagcggcctttcttggagcgcttgcctcccttggg
aacctagacatcccgtataagattgaagctgtaaaaagtgaaacggcacctccaccaccc
agctctccactgtatcctggcttggttgttggagcgatctccctcctgctgatcttcctc
gtggccggggtcatcgtgaacaagaagagacggagagagcacgggcacctctggttccca
gagggttacacagtgaaagagtcaaacaagtccaagaaacgaagagagccccttggggaa
gattctgtgggtttaaagccactgaagaatggtgcagatggttcgctgatggatgacaac
caaaatgagtggggtgatgaagaaacgctggacagcaagagattcagatttgaagatcag
gtgatgcttcctgaccttggagatcagactgatcacagacaatggactcaacaacatcta
gatgcagctgacctccgagctccatccatagcacccacaccgccacagggagaaatcgat
gctgactgtatggacgttaatgtacgcggaccagatggtttcacgccactcatgatcgca
gcatgcagtggaggaggcttggaaactggcaacagtgaagaagatgaagatgcttctggg
caaatgatctcggactttattgggcagggtgccaacctacatagccaaactgaccgcacc
ggagagacgccactccacctggctgcccgatatgccagagcagacgctgccaaacgtttg
ctggaatccagtgcagatgccaatgttcaggataacatggggaggactcctcttcatgct
gctgtagcagcagatgcccaaggcgtatttcagattcttatacgtaacagagcaacagac
ctagatgcccgtatgcatgatggcacaacaccactgatcctggcagctcgtctggcagtg
gaaggcatggttgaagaacttatcaactcccacgctgatgtgaatacaatcgatgagtta
ggaaaatctgctttgcattgggccgcagcagtaaataatgtggatgctgcaatggtcctg
ctgaagaatggtgccaacaaggacatgcaaaacaataaggaggagactccgttgttcctg
gcagcaagagaaggaagctatgaaactgctaagatgctgttggatcactttgcaaataga
gacattactgaccacatggataggcttccccgtgacattgcccaggaacgcatgcatcat
gacattgtccggttactggatgaatacaacctggtgaggagtcctcagctgcacaacggt
ccactgggtgctccaaccttatctcctcccatctgttccccaaatggctatattgggaat
atgaaaccagcagtacaagggaaaaaggctcgaaagcctggtgccaagggccctggttgt
aaagattccaaagatatgaaggccaggagaaaaaagtctcaagacggaaaaaacggactt
ctggattcaggaagctctggggtgttatctcctgttgactcattggagtcacctcatggg
tatttgtcagatgtctcttctcctcctctgatgacctctccatttcagcagtctccttca
atgcctctcaaccacctcaccaacatgccagattctcatattggcctgaatcacctaaat
atgaatgccaagcaagaaatggctgctggttctaatcgaatgtgctttgagacaatggcg
ccccgtcttactcatctctctgtgtctagtcccagcgctgttctaaacactggctccttg
cagtttacagtgggaggtgcacctgtcattaatgggcagtgtgactggctagcaagattg
caaaatgggatggtagcaaaccagtacaatcctatgaggagtaacctccaacaaggtggt
aaccaacaagcatcagcccttcagcatggtctgatgacatctttgcacaacggtttgcca
acaggtctgacacaaatgatgacctaccaggccatgccaaacacgaggatgaccaaccaa
tctcaaattctccaagcgcagcagatacaacaaattcaacagagtttacagctgcagcaa
caaagtatgcagcaacaacaacagcagcagcagcacaatccaagctctggatctggcagc
catattgttgctcctttttgtggaagtgatatggcccagtcagaaatgcagcagatgaca
ggtaatggcctacatgccatactcccccaggacacccaaatcctgactggctcactgcca
gcacctctcacgcagtctatgacgactactcagttcttaacgccaccatctcagcacagt
tactcctccccgatggacaacactccaaaccatcagttacaggtgcctgatcacccattt
ctgacaccatctcctgagtcaccggaccagtggtcaagttcctcccctcattccaatatg
tctgattggtcagagggtatatcaagtccgcctacaaacatacaatcccagcataatcac
attccagaagcttttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
