Nostoc sphaeroides: GXM_05657
Help
Entry
GXM_05657 CDS
T06325
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
nsh
Nostoc sphaeroides
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_16
Pkinase
HATPase_c
PK_Tyr_Ser-Thr
GAF
PAS_4
GAF_2
PAS_3
GAF_3
PAS
HisKA
PAS_9
HATPase_c_5
ABC1
Pkinase_fungal
Choline_kinase
AAA_22
HATPase_c_3
Sigma54_activat
CREPT
Zeta_toxin
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFS48165
UniProt:
A0A5P8W5Z2
LinkDB
All DBs
Position
Gxm1:5151473..5157292
Genome browser
AA seq
1939 aa
AA seq
DB search
MDSTLVSIPGYRISEELYNGSRTIVYRGYRDDSLPVVIKLLKNPYPSFSELVQFRNQYTI
AKNLNSPLIIQTYSLEPYQNGYALVMEDFGGISLKEWGTGENLRNITEFLQIAIALSNAL
HILYRSRIIHKDIKPANILINPETKQIKLIDFSIASLLPRETQTLMNPNVLEGTLGYISP
EQTGRMNRGIDYRADFYSLGVTFYELLTGELPFQSNDPMELVHCHLAKLPPNMNKPHPIG
KERVLDAGEEHFPIPQVLCDMVMKLMAKNAQDRYQSALGLKFDLENCLSQLQETGEIKSF
LIAQRDVCDRFIIPDKLYGRETEVSTLLQAFERVSLGATEMMLVAGFSGIGKTVVINEVH
KPIVRQRGYFIKGKFDQFQRNIPLSALVQAFRDFMEQLLTESDSQIQQWKSKILAAVGEN
GQVIIEVIPELERIIGQQPSPPELSGNAAQIRFNLIFQKFTQVFTTAEHPLVMFLDDLQW
ADSASLKLMQLLMADTGHLLLIGAYRDNEVEKAHPLMLTLSEIEKTLVTINTITLAPLSQ
KQVNQLIADTLKCSEDLAFPLSLLVSQKTQGNPFFATQFIKALHQDGLIQFNFESGFWEC
DIAQVTTQAVIDDVVAFMAFQLQRLPQSTQNILQLAACIGNQFDLSTLAIVSESSEIETA
SDLWKALEEGLLLTTGDVYKFFQHSEQDSDSKPFNFNVQVPTYKFLHDRVQQAAYSLIPE
AQKQTTHLKLGQLLLNNISQSEQEEKIFQIVSQLNLGLELITQQTQRDQLAQLNLLAGRK
AITATAYTAAIEYLTLGMELLTADSWQSQYDLTLALYENAAKAEYLNTNFEEAIKLTDLI
LQQTTQMLDRVKAYELKVQIYIAQDQQVKAIETGLKALEQLNISLSSPDVEPENRLAQLP
SLTNLANIPEMTNLESLAALRLLISITPPVHHVKPDMFPSVALTKLHLCLEQGHSSLAAF
AYGSYSVFLCAVIGDVDTAYYSSQIALKLLEQYQSKEISSKIYMLFGVFICAYKEHGRNT
LTAIRESIQCGLEVGDIEHASYSMMAECTHLFLIGETLDAVEERQTKYINLLLKLKQKHC
VDYAQVWRQVTLNLLGRSSHQYYLTGVDFDETEMLSHLHNTHNHQSLFAIYLAKIAILYT
FDQYEQAATNAEKATEYMDGAFGLLLIVGHNFYYSLCLLAKYSSCDRQQDQQECWLNQVV
SNQKLMHYWAGYAPVNFQHKYDLVEAEIARVMGDKLKAMEYYDRAITLAKANGYIQEEAL
SNELAAKFYLGWDKEKVAQAYMQEAYYCYARWGAKAKVEDLEKRYPQLLQSILQQQRINF
KHDETISFRGTSSSTRTSSTGSTSISDALDFTSVLKAAQAISSSLELDQLVASLTRIILE
NSGAKKAALILPYEDTWQVRAITSNSQIHIQTILESQSLDNCQDIPVNIINYVKNTKQTV
VIDNCTTHIIGLIGEYMHSSQPQSVLCTPIINQGRLVGILYLENRLTQGVFTSDRLSIIN
FLCTQAAISLENAQLYNHLQERGKFLNSIYEGVGCLIFVVDIRDNGRFEYTGWSKSCELA
LGIPASQVLGKTPQEVMAPGEGAAVEQKYLDCFQSGIALTHEECLTFNEQKIWWLTTLSP
LKDETGKVYRVVGTTINISDRKQAEEAVTEKSQALGTALGDLQQAQLKIVQSEKMSALGN
LVAGVAHEMNNPLGFIAASLKQAKPTIADIVKHLKLYQTNLSNPNDEIKVHAEEIDLDYT
LEDLPKIIDSMVMACDRLKNISTSLRTFSRADKDYKVPFNIHEGIDSTILILKHRLKENE
QRPAIEVITDYENLPKIECFSGQLNQVFMNILANAIDALDESNVGRSFEEIKSNANRITI
KTSLVNEGVKIAIADNGKGMNEEVKQKIFDYLFTTKGVGKGTGLGLAIARQIVVEKHGGA
IEVDSRPGEGTEFVIYLPI
NT seq
5820 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatagcactcttgtcagtattcccggatatcgcatcagtgaagaactatacaatggt
tccagaaccatagtttatcgcggttatcgagatgactctttacctgtggtgattaaactg
ctgaaaaatccttatcccagttttagcgaattggtgcagtttcgcaatcaatacaccatt
gccaaaaatcttaactcacctctaatcatccaaacttatagcctggaaccttatcaaaat
ggctatgcgttggtgatggaagactttggggggatttctctgaaagaatggggaacaggg
gaaaacctccgaaatattacggagtttttacagatagcgatcgcactgtccaacgcctta
catatactataccgctcgcgcattattcataaagatattaaacccgccaatattctaatt
aatcccgaaaccaaacaaattaaattaattgactttagtattgcatccctactaccacgg
gaaactcaaacactgatgaatcctaatgtgttggaagggacactaggttatatttctcct
gaacaaacaggaagaatgaatcgaggaattgactaccgggctgacttttattctttaggt
gtgactttttacgaattattgacaggagaattaccgtttcaatcaaacgatccgatggaa
ttggtacattgtcatttagcaaagcttccaccaaatatgaataaacctcaccctattggt
aaggagagggtgcttgatgcgggtgaggaacattttcctattcctcaagttctctgtgac
atggtgatgaaattgatggcgaaaaatgcccaagatcgctatcaaagcgcattgggactg
aaatttgatttagaaaattgtttatctcaactccaagaaactggtgaaattaagagtttt
ttaattgcacaacgggatgtgtgcgatcgcttcattattcctgataaactctatggacgg
gaaacagaagtatcaacattactccaagcatttgagcgagttagccttggtgcaacagaa
atgatgctggtagctggtttttccggtattggtaaaaccgttgtcattaatgaagttcat
aaaccgattgttagacaacgcggttattttattaaaggtaaatttgaccaatttcaacgg
aatattcccttaagtgcattggtgcaagcatttcgagatttcatggagcaactattaaca
gaaagcgatagccaaatccagcaatggaaaagcaaaatattagcggctgtgggtgaaaat
ggacaagtaattattgaagtcatcccggaattagaaagaattattggtcaacaaccatcg
cctccagaattatcaggaaatgcagcacaaattagatttaatttaatattccaaaagttt
acccaagtctttaccactgccgaacatccattagtaatgtttttagatgatttacaatgg
gcagattcagcatcgctgaagttaatgcagttattaatggctgatacaggacatctttta
ttaattggtgcatatcgtgataacgaagtcgaaaaagcacatccgttaatgttgactttg
agtgaaattgaaaaaacactcgtcacgattaatacaatcacattagcaccactaagtcaa
aaacaagtgaatcagttaattgctgacacacttaaatgttctgaggatttagcgtttcct
ctttcgctacttgtatctcaaaaaactcaaggtaatccattttttgctacacagtttatc
aaagcattacatcaagatgggctgattcaatttaactttgagtcaggcttttgggaatgt
gacattgcacaagttacgactcaagcggttatagatgatgttgttgcctttatggcattt
caactacaaagactaccacaatcaactcaaaacatcttgcagttagctgcttgtattggc
aatcaatttgatttatcaactttggcaattgtttccgaatcatcggaaattgaaacggcc
tctgatttgtggaaagctttggaagaagggttacttttaactactggtgatgtttataaa
ttctttcaacacagtgaacaggattctgattcaaagccttttaattttaatgtacaagtc
cccacctataaatttttacacgatcgggttcaacaagctgcttattctttaattccagaa
gctcagaagcagactactcacttaaaactaggtcagctactgttaaataatatttctcaa
agcgaacaagaagagaaaatatttcaaattgttagtcaattgaacctggggttagagtta
attactcaacagacacaacgagatcaactcgctcagttaaatctgttagctggacggaaa
gctataactgccactgcctacactgctgcgattgaatatctaacgctaggaatggaactg
ctaacagcagatagctggcaaagtcagtacgatctcaccctagcgctgtatgaaaatgca
gcaaaagcagaatacttaaatactaactttgaagaggctatcaaactgacagacctgatc
ttacagcaaactacgcagatgttggatagagttaaagcttatgaactgaaagtccagatt
tatattgcccaagatcagcaagttaaagccattgaaacagggttaaaagcactggagcag
ttaaacatttcgttgagttcacctgatgtagaaccggagaatcgtttagctcaactacca
agtttaacaaacttagctaatattccagaaatgactaatctggaatctctggctgcactg
cggttgctgattagtattacacctcctgttcatcatgtaaaaccggatatgtttccgtca
gtagcactaacaaagcttcatctttgtcttgaacagggacattcatctttggctgctttt
gcctatggaagttatagtgtatttctttgtgctgtaatcggagatgtagataccgcttat
tactcaagtcagatagctttaaagctactagaacaataccaaagtaaagaaataagttca
aaaatttatatgctttttggtgtttttatctgtgcttacaaagagcatggtcgaaataca
ctcacagctatacgagaaagtatccagtgtgggctagaagttggagatattgaacacgct
agctattcaatgatggctgaatgtacgcatttattcttaattggagaaactctagatgct
gttgaagaaaggcaaaccaaatatattaatctacttttaaaacttaaacaaaaacattgt
gttgattatgcccaggtttggcggcaagttaccttaaatctactcggtcgatcctctcac
caatattacctgactggtgttgattttgatgaaacagaaatgctgtcgcatcttcacaac
actcacaatcatcagtcactatttgccatctatcttgccaaaatagctatcctttatacc
tttgatcagtatgaacaggctgcaaccaatgcagaaaaagccaccgaatatatggatgga
gcctttggtctactgttaattgtaggacataacttttactactctttgtgcttacttgca
aagtattctagctgcgatcgccaacaggatcagcaagaatgttggctaaatcaggtagtt
agcaaccaaaaactcatgcattattgggctggctatgctcctgttaattttcagcacaag
tatgacttagttgaggcagaaatagcgcgggtaatgggagacaagctcaaagcgatggaa
tattacgatcgcgccataactcttgccaaagccaacggctacatccaagaagaagcactt
agcaacgaattagcagccaaattctatctcggctgggataaagaaaaagtcgcccaagca
tatatgcaagaagcatactactgctacgctcgttggggcgcaaaagccaaagtggaggat
ttagaaaaacgctatccccaactactccaatccattctgcaacagcaacgaatcaacttc
aaacacgacgaaactattagctttcgtggcacttcttcttccactcgcacttctagcact
ggcagcaccagtatttctgatgcactagattttacttcagttctcaaagcggctcaagct
atctccagttctctagaattagatcaacttgttgccagcctcacccgcattatcctcgaa
aactccggcgcgaaaaaagctgcactaattcttccctatgaagatacttggcaagttagg
gcaattacctcaaattcccagattcatatccaaaccattcttgaatcacaatcactagac
aattgtcaagatattcccgtaaatattatcaattacgtcaaaaataccaagcaaacagtt
gttatagacaattgcacaacacatattattggcttaattggggaatatatgcactcctca
caaccccagagtgtattatgtactccgattattaatcaagggcgtttagtggggattctt
tatttagaaaatcgactgacgcaaggggtatttacgagcgatcgcctttctattataaat
tttctctgcactcaagctgccatttctttggaaaatgcccaattatataatcatctccag
gagcgcggaaagttcttaaatagtatttacgaaggtgttggctgtctcatttttgtggtc
gatattcgggataatggtagatttgagtacacaggatggagtaaatcgtgcgaattagcg
cttggtatacctgcttcccaagtgctgggtaaaactccccaagaagtaatggctccaggt
gaaggtgcagcagtcgagcaaaagtatctggattgttttcaaagcggaatagccctcacc
catgaagaatgtctaacatttaatgagcagaaaatttggtggttaaccacactcagtcca
ttaaaagatgagacgggcaaagtttatcgcgtagttgggacaactattaatattagcgat
cgcaaacaagctgaagaagcggtaacagaaaaatctcaagcactcggaacagccttagga
gatttacaacaagcgcaattaaaaattgttcagagtgagaaaatgtcagcattgggtaat
ttagttgctggggtagcccatgaaatgaataatcctttaggctttattgctgctagcctc
aaacaagctaaacccacgattgctgatattgttaaacacttaaaactatatcaaacaaat
ctctcaaatcccaatgatgaaatcaaagtacatgccgaagagattgatttagattatacc
ttagaagacttaccaaaaattattgattcaatggtgatggcgtgcgatcgcctcaaaaat
atcagcactagtttaagaactttttctcgtgctgataaagattataaagtaccgtttaat
atccacgaaggtatcgacagtacaattttaattctcaaacatcgcctcaaagaaaacgaa
caacgtccagcaattgaagtgataactgattatgaaaacttgcccaaaattgaatgtttt
tctgggcaattgaatcaggtatttatgaatattttggcaaatgctattgatgcgctggat
gaatcaaatgtaggaaggagttttgaggaaattaagtccaatgccaaccgaattacaatt
aaaacctctttggtaaatgaaggcgtaaaaattgctattgctgataatggcaaagggatg
aatgaagaagtcaaacaaaagatttttgactacttgtttactacaaaaggtgtgggaaaa
gggacaggattggggttagcgatcgctcgtcaaatcgttgtagaaaaacatggaggagcg
atcgaggtagattctagaccaggtgaaggtactgaatttgtgatctacttaccaatctaa
DBGET
integrated database retrieval system
