Nostoc sphaeroides: GXM_06111
Help
Entry
GXM_06111 CDS
T06325
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
nsh
Nostoc sphaeroides
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_16
Pkinase
GAF_2
GAF
HATPase_c
PK_Tyr_Ser-Thr
Response_reg
GAF_3
PAS_3
HisKA
PAS
PdeA_PAS
nSTAND1
PAS_9
KAP_NTPase
PAS_4
Zeta_toxin
DUF815
HATPase_c_2
NB-ARC
Sigma54_activat
AAA_22
ABC1
Kdo
RsgA_GTPase
MKRN1_C
APH
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFS48617
UniProt:
A0A5P8W779
LinkDB
All DBs
Position
Gxm1:5600578..5607729
Genome browser
AA seq
2383 aa
AA seq
DB search
MMIALPGFQIVTLLKAGVKAVIYRGIRVKDQCPVIIKGLRKEQCTPNNIEQLKHEYAIAQ
RLNTAAVVKAYALEMHQGIPYLIMEDFEARSLDQLLDQFQQPVPFLKIAIEITSKLAQIH
THHIVHKDIKPQNILINLETNQVKIADFGIATFIPYQQQMVSSSSQIEGSLPYLSPEQTG
RMNRGIDHRSDLYSLGITFYEMLTGQLPFQGKDPLEWVHCHIAKSPPSPKKLNSDIPQIL
CDIIIKLLSKVAEQRYQSALGLQFDLERCLKELETTGEIQSFILGEQDISERFQIPQKLY
GREPEIIKLLQAFERIISQGKPELVLVSGYAGVGKSSLVKEIHKPIVRERGVFISGKFDQ
YKRDIPYSTIVQAFQTLVRQILTQSEARLATWKKRIQAALGNNGRLIADVIPEVELIVGE
QPPIPELGPAESQNRFNLVFQNFISVFAQKEHPLTVFLDDMQWADSATLNLIQTVITGSS
IQYLCFILAYRDNEVDVVHPFSLMMEKVYQYGARITEIILTPLNLVYVNQLIADTLHSSV
EQVEPLAQLILQKTDGNPFFVNEFLKTLHQENLLIFNPLQSPTAKGGQRGIKGEWQWNLT
QIEAQGITDNIVSLMIGRLQKLPAATQQVLKLASCIGNRFDLEVLAIVGEQSIEETANAL
VDAILRGLIIPIESDETAHKSYRFYHDRVQQAAYSLIADESKSAVHLKIGRLLLENASHE
QVNEQIFDLVNQLNFAVVLIIEQTEKDELLRLNLIAAKKAKASTAYTPAKKFFSVAMNLL
AENCWIEQYEQTFTLFRELAECEFLTGNLVQAEELFKILFIKAASSMDKSNIYMLQIRLY
QVAGRYEEALTLGLEALKLFGVTFPNTNEEVQGAIAIEKNQVLTNLGNRQVSDLINAIVI
EDPNIKTVISLLTTLGPPTYLGRPDLFPLVVLKAVNYSLKFGNTEDSCFAYSMYAMLLVS
IFHDIPTGYAFSEMTIQLNEKLHDLKLRGVVLHIHGSHINVWRNHIATDIPFLERGFIGC
VEVGDVTMANYNGYQGSWQIIQLGFPLAETYKSLEKYIAFARQSKHETVYQTIKLQQMLL
MNLRGLTHQNMTLSNDDFDELSALSIITDAGFVSGIIFYYIIKLIMFFTYEKYCEAFNSA
LELSNFPVNTLALPIETDYILYYSLTLTALYPRVSYQEQEQFLETLKSHQQQLQYWANHC
PANFLHKSQLVAAEIARIENRDLEAMRLYEQSIASAREQEFVQYEALANELGAKFYVERN
FELIAKTYLQEAKNAYVRWEASAKVKHLEESYPQLLSQQQLVSNGTFFSTGEHLDFLSVV
KASQTISSEIVFSRLLKTLMQIVIEQAGAEIGYLLLEYEQNLAIAVEAKFNPQAEKLNVY
RPVLDGEISQVIPQSMLNYVQRTQETVILQNATEQNLFSKDEYIIRKQPKSVLCLPIALQ
SKLVGILYLENNLISSAFTQDKLSVLEILTVQIAISLENARLYQGLENSQEKLNLALKSA
QIGVWSWDIANDRFNWDEQIYQLFGLTPETFTGTAEAILARLHPDDRALLAQSLSRAINE
GVEHDLEYRIIRDDSSIRYAACRGKAFFNEAGKATHMSGVALDITERKQSEAERIQLIQE
QTARQEAEADQQRATFLAQISTTLASSLDYESTLASVANLAVPYFADWCGVDLLQNNQSI
NRVAVAHRDPEKVKFGWELYQRYPRKLDAPEGVAKVLRTGLAELVPQISDAALAAAIQDP
EHLRIVRELGLKSCMILPLMARGRIFGAISFITAESERRYSTADLSLAEDVAHRAAIAID
NARLYQEAQQAQKTAERALERIARLQSITAALSESLTPAQVSEVIVEQSMAALGANSALV
ALVNESKTELEIVRAVGYNQELVNTWRYFTIDSPSPLAEAVRTGQPIWAESTKNRIARYP
HLAETYSKYDFEGWISIPLMVEGWAVGGISLGFAQSQQLSAEDQAFILAVAQQCAQAIAR
AHLYEAERTARSAAESANRIKDEFLAVLSHELRTPLNPILGWTKLMRTRKLDQATSDRAL
ETIERNAKLQTQLIEDLLDVSRILQGKLNLNFCPINLISVIEAAIETVRLSAQAKSIEIQ
TIIECSLSPVLGDANRLQQVFWNILSNAIKFTPTGGQVKIKLQQVSSQVQICVTDTGKGI
APEFLPYVFDYFRQADGATTRKFGGLGLGLAIVRHLVELHGGTVQAQSLGEEQGATFTVR
IPCLQDESKKIKDAKDNSSLVGQSLPLSGLDILVVDDDADMREFLPFMLEQYGATVTAVA
SAIEALTALSQSQPNLLISDIGMPEMDGYMLMRQVRSLQPEQGGTIPAIALTAYAAEIDY
QQAIAAGFQQHISKPVDPEELVKAIALLDLLKQNKGVSRQNSA
NT seq
7152 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgattgcattacccggatttcaaattgtcactttgttaaaagcaggggtaaaagca
gtcatataccgtggaattagagttaaagatcagtgtccggtaattatcaaagggctacgg
aaagaacagtgtacacccaataatattgaacaactaaaacatgagtatgcgatcgcacaa
aggttaaacaccgcagccgtagttaaagcctacgccttagagatgcatcagggaatccct
tatttaattatggaggattttgaggcgcgatcgctcgatcagttgctagaccaatttcaa
cagcctgtgccgtttctgaaaattgctattgaaatcactagtaaacttgcacaaattcac
actcatcatattgtccacaaggatattaagccgcaaaatatcttaattaacctcgaaact
aatcaggtcaaaattgctgattttggaattgctacgttcattccatatcagcagcaaatg
gttagcagttccagtcaaattgaaggcagtctaccatatctgtcacctgagcaaaccggg
cggatgaatcgaggaattgatcatcgcagcgatttatattctctgggaatcaccttttat
gagatgctgacaggtcaactaccatttcaaggcaaagatcccttagagtgggtacattgt
catattgccaaatctccgccatccccgaaaaagttaaactctgatattccgcaaatactc
tgtgatatcatcatcaaattgctgtcgaaggttgcagaacagaggtatcagagcgcttta
ggtttgcaatttgatctggaacggtgcttaaaagaattggagacaactggagaaatccaa
tcttttattttgggtgagcaagatatctcagagcggtttcaaattcctcaaaaattgtac
gggcgagaaccagagattatcaaacttttacaagcatttgagcgaattattagccaagga
aaaccagaactcgttttagtttctggttatgctggggttggtaaatcttctttagtaaaa
gagattcacaagcctattgtgcgagaacgcggagtttttatctctggtaagtttgatcaa
tacaaacgagatattccttactctactattgttcaagcttttcaaacacttgttagacaa
attttaacgcagtctgaagctcgacttgctacttggaaaaagcgaatacaagcagcatta
gggaacaatggtagattaatcgcagatgtaattccagaagttgaattaatcgttggagaa
cagcctcctataccagagttggggcctgccgaatctcaaaatcgattcaatttggtgttt
cagaattttatcagcgtctttgctcaaaaagagcatccgctcactgtttttttagatgat
atgcagtgggcagacagtgcgactttaaatttaattcaaaccgtcattactggctctagt
atccaatatctctgcttcattttggcctatcgagataacgaagtagatgttgtgcatccc
tttagtttgatgatggagaaggtttaccagtatggagcaagaataactgaaattatcctt
acccctttgaatcttgtttatgtcaatcagttgattgctgataccttgcatagttcagta
gaacaagtagaacctcttgctcaattgattctccaaaaaactgacggtaatccttttttt
gtcaatgaatttctgaaaacattgcatcaagaaaatctgttgatttttaacccccttcaa
tcacccaccgcaaagggaggacagaggggaataaaaggggagtggcaatggaatttaact
cagattgaagcccaagggattacagataatattgtcagtttgatgattgggcggctgcaa
aaactgccagccgcaactcaacaggtacttaagttagcctcttgtattggtaatcgcttt
gatttagaagttttagcgatcgttggtgaacaatctattgaagaaacagcgaatgcactt
gttgatgcaattttaagaggattaattatccccatagagtcagatgaaactgcccataaa
agctatcgtttctatcatgatcgagttcaacaagctgcatactccttaattgctgatgaa
tcaaagtcggccgttcacctgaaaattggacggcttttgctagaaaatgctagtcatgaa
caagtaaacgagcaaatatttgatttagtcaatcaactcaatttcgctgtggttctaatt
attgaacagacagaaaaagatgaattgctacggttgaatttaatcgctgctaagaaagca
aaagcctctacagcctacactcctgctaaaaagttttttagcgttgccatgaatctttta
gctgaaaattgctggattgaacaatatgaacaaacatttacgctattcagagaactagct
gagtgtgaattcttaacagggaatttagtacaagcggaagagttatttaaaatactattt
attaaagcagcatcctctatggataaatctaatatttatatgctgcaaatcagactctat
caagttgcagggaggtatgaagaagcgctgacattgggattagaagctttaaaacttttt
ggggtgacattccctaatacaaatgaggaagtgcaaggtgcgatcgcaattgaaaaaaac
caagtattaaccaatctaggtaatagacaagtctctgatttaattaatgctatagtaatc
gaagatccaaatattaaaacagtgattagtctgttgacgactttggggccacctacttat
ctcggtagacccgatctctttcccttagtcgtacttaaagcagttaactactcactcaag
tttggtaatacagaagattcctgttttgcctacagcatgtatgccatgttgttggtttct
atcttccatgatattcctacagggtacgcattttctgagatgacaattcaattaaatgaa
aagttgcatgacttgaaacttagaggagttgttctgcacattcatggaagtcatattaac
gtttggcgtaaccatattgctaccgatattccatttttagaacggggatttatcggctgc
gtggaagtcggtgacgtgacgatggcgaattacaatggttatcaaggctcgtggcaaatt
atccagttaggttttccacttgcagaaacatacaaatctctagaaaaatatattgcattc
gcccgccagtctaaacatgagactgtctatcagacaatcaaactacagcagatgctattg
atgaatctgcgcggactgactcaccaaaatatgactctaagtaatgatgactttgatgaa
ttatccgctttatctatcattacagatgcaggctttgtcagtggaattattttttattat
attattaaattaattatgttttttacttatgagaaatattgcgaggcatttaattctgcc
ttggaattgtctaattttccagttaatacactggcattaccaattgaaacagattacatt
ttatattattccctgaccctcacggctctttatccgagagtatcttatcaagagcaagaa
cagtttttagaaaccttaaaatcccatcaacagcaattgcaatactgggctaatcactgc
cctgcaaacttcttacacaagtctcaattagtagctgctgaaatagctcgaattgaaaat
cgagacttggaagcaatgcgcctatatgagcaatcaattgcttcagcccgtgagcaagaa
tttgtgcaatatgaagctttagctaatgagttaggcgctaaattttatgtagaacgaaac
tttgaattaattgccaaaacctacttgcaagaagctaaaaatgcttatgtacgctgggag
gcatctgctaaagttaagcacctcgaagaatcctatcctcagctattgtcacaacaacag
cttgtctctaacggaacatttttcagcacaggtgaacacctagactttttatcggtcgtg
aaagcgtctcaaactatatctagtgaaattgtgttttcgcggttgttgaaaactttaatg
caaattgttattgagcaagcgggagcagaaattggttatttattgcttgaatatgagcaa
aatttggcgatcgcagtagaagctaaatttaatccccaagcagaaaagctcaatgtttat
cgacctgtattagatggtgaaatttcacaggttattccgcaatcaatgctgaattatgtt
cagcgaactcaagaaacagtgattttacagaatgccactgagcaaaatctgttttcaaaa
gacgagtatataatccgaaagcaacctaaatctgtactttgtttaccgatcgcgcttcag
tcgaaattagttggtattttatatttagaaaataatctaatctccagcgcctttacgcag
gacaaactttccgtactggagattttgacagttcaaattgctatttctctagaaaatgct
cgtctttatcaaggtctagaaaatagccaagaaaaacttaatctggcgttgaaatctgcc
caaatcggtgtttggagttgggatattgccaacgatcgctttaactgggatgagcagatt
tatcaattatttgggttaacacctgaaacctttactggcactgctgaagcaattttagct
cgtctgcatccagacgatcgagcattgctagctcaatcgttgagccgagcgattaacgaa
ggcgtggagcatgatttagaatatcgaattattcgagatgacagcagtattcgctacgca
gcctgccgaggaaaagccttttttaatgaagcaggtaaagccacacacatgagtggtgtt
gcgcttgatattacagagcgcaaacaatctgaagccgaacgtatccaactgattcaagag
caaaccgcccgacaggaagcagaagccgatcagcaacgggcaacatttttggctcaaatc
agcacaacactcgcctcttccctcgattatgaaagcacattagcaagtgtggcaaacctt
gctgtgccctactttgccgattggtgcggcgttgatctgctgcaaaacaaccaatcaatc
aatcgggtagcagttgctcaccgagatccagagaaagtgaaattcggttgggaactctat
cagcgttatcccagaaagttggatgcacctgaaggtgtggctaaagttctgcggactgga
cttgcagaattggtacctcaaatttcagatgcagccctagcagcagctatccaagatcca
gaacatctaaggattgtgcgtgaacttggtttaaagtcctgtatgattttgccattgatg
gcacgcggacggatttttggtgcaatttcctttattactgctgaatcagaacgtcgttac
agcactgctgacttgtcactagctgaagatgttgcccatcgagctgcgatcgccatcgat
aatgcccgcctttaccaagaagcgcagcaagcacaaaaaacagcagaacgagcattagag
cgcattgcccgtcttcaatccatcacggctgccctttcagaatccttgacaccagcccaa
gtatctgaagtcattgtagagcaaagcatggctgccttgggagccaattctgccctcgtc
gccttggtgaatgaaagtaaaactgaactggaaattgtgcgtgcagttggctataaccaa
gagttggtaaacacttggcggtattttactattgattcaccctctcctttagcagaagct
gtgcggactgggcaacctatttgggctgaatcaacaaaaaatcggattgctcgttaccct
catttagctgaaacttactccaaatatgactttgaaggctggatttctattccattgatg
gtagaaggttgggcagttggcggtataagtttgggatttgcccagtctcaacaactgagt
gcagaagatcaagcgtttatcttggctgttgctcaacaatgcgcccaagcgatcgctcgt
gcccatctttacgaagccgaacgaacggcacgaagcgctgctgaatcagcaaaccggatc
aaagatgaatttctcgctgtgctgtctcatgaattgagaacaccgcttaacccgatttta
ggttggacaaaactgatgcgaacccgcaaacttgatcaagcaacaagcgatcgcgccctc
gaaaccattgagcgcaacgctaagttacaaacccaattgattgaagatttgcttgatgtc
tcccgcatccttcagggtaaacttaacctcaacttctgccccattaatttaatatcagtc
attgaagctgcgatcgagacagtgcgtttatcagcacaggctaagtccatcgagattcag
acaattattgaatgtagcctaagtccagttttaggcgatgccaatcgattgcaacaagtt
ttttggaatatcctttctaatgccattaagtttactcccactgggggacaagtaaaaatt
aaattacagcaagttagctcacaggtacaaatctgcgtcactgatacaggaaagggaatt
gcacctgagtttttaccttatgtctttgattatttccgtcaagcagatggtgccacaact
cgaaaatttggtggtttaggtttaggattagcgatcgtccggcatcttgtagaacttcac
gggggaactgttcaagcccaaagcctgggcgaagaacaaggagcaacttttaccgtcaga
attccatgcttacaggatgaaagcaaaaaaatcaaagatgcaaaagataactcctcactt
gtgggacagtccttacctttgtctggtttagatattctcgtggtggatgatgacgcagat
atgcgagagtttttgcctttcatgctggaacaatatggtgcaactgtgactgctgtagcc
tcagccattgaagctttaactgcactgagtcaatcccagccaaatttactcattagcgat
attgggatgccagaaatggatggttacatgctgatgcgacaggtgaggagtttgcaacca
gagcaaggcgggacaattccagcgatcgccttaactgcttatgctgctgagatagattat
cagcaagcgatcgcagccggatttcaacagcatatttccaagcctgtagatccagaagaa
ttggtgaaggcgatcgcattattagacttattgaaacagaataaaggcgtcagtcgtcag
aattcagcatga
DBGET
integrated database retrieval system