Oryza brachyantha (malo sina): 102722083
Help
Entry
102722083 CDS
T02995
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At2g17140
Organism
obr
Oryza brachyantha (malo sina)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_1
PPR_2
PPR
PPR_3
PPR_long
MRP-S27
ECSIT_N
COX5A
RPM2
Mtf2
RabGAP-TBC
Coatomer_E
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
102722083
NCBI-ProteinID:
XP_006646837
UniProt:
J3L9C5
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1250346..1256363)
Genome browser
AA seq
706 aa
AA seq
DB search
MELARRVFDAMPARNEFSFGILARGYCRAGRSMDALGVLNSMPRVNLVVCNTVIAGFCRE
GLVDEAERLVERMRYQGLDPNVVTFNARISALCKAGRVLDAYRIFNDMQENWEKGLPRPD
QVTFDVMLSGFCDAGMVDEARVLVDIMRCGGFLRRVESYNRWLTGLVRNGMVGEAQELLR
EMTHEGVQPNSYTYNIIVDGLCKEGKAFDVRKVEDFVKSGVMTPDVVTYTSLLHAYCLEG
NAAAANRILDEMAQKGCAPNSFTYNVLLQSLWKDGRITEGERLLERMSEKGYSLDTASCN
IIIDGLCRNNKLDMAMDIVDGMWNEGCLALGRLGYSFLSLLTDSSSSKRCHPDRVTYSTL
MSALCKEGRFDEAKNKLLEMIGKDISPDSVIYDTFIHGYCKHGKTSHAVKVLRDMEKKGC
KPSVRTYNLLIWGFREKHNSDEIIKLMSEMKEKGICPNVMTYNSLIKSFCERGMANKALP
LLDEMLQNEIVPNVTSFDLLIKAFCKTTDFSAAQRVFDASLSTCGQKEVLYSIMCTQLST
YGRWIEAMNALEMALESRISIHRFPYKQIIEGLCEVEEADHAYRLLKLLMVKGYSFDPAA
FMPVIDALSEKGKKQDVDVLSEKMMEMAERDDGLAVPSGKFKPRSQRHGQDKYAESDWHA
LLHRDDSARTILKITKRVKTGWGQRGNVYENKQQQNDDIYVLENTG
NT seq
2121 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagctcgcccgcagggtgttcgacgcaatgccggccaggaacgagttcagcttcggg
atcctggcgcgtgggtactgccgtgcagggaggagtatggacgcgcttggagtgctcaat
tcaatgccaagggtgaatttggtggtatgcaatacagtgatcgcggggttctgccgggag
ggcctggtggatgaggctgagaggctggttgagcgcatgagatatcagggtcttgatcca
aatgtggtcacattcaacgcgaggatctctgcgctctgcaaggctgggcgggtgctagat
gcatacaggatattcaatgacatgcaggaaaattgggagaaaggtctgccaaggcctgac
caagtgacatttgatgtgatgctgagtgggttctgtgatgctggtatggtggacgaggca
agagtgctggtggatattatgaggtgtggtgggttcttgaggcgggttgagagttacaac
cgctggttgacagggctggtgaggaatggaatggttggggaagcacaggagctgttgagg
gaaatgacgcatgagggtgtccaacctaatagttacacctacaatattattgttgatggg
ttgtgcaaggagggaaaagcatttgatgtgaggaaagtggaggattttgtgaagagtggt
gtgatgacaccagatgttgtgacctatactagtttgctccatgcttattgcttggaggga
aatgcagctgcagccaataggattcttgatgagatggcacagaaggggtgtgccccaaat
tcatttacttacaatgttctgctacaaagtttgtggaaagatggtaggattaccgagggg
gaacgattgttagagaggatgagtgagaaaggatacagcttggatacagcgagctgcaat
atcattatcgacggattatgtagaaacaacaaattggatatggctatggacattgtcgat
ggcatgtggaatgaaggttgcttggctcttggaagattaggttattcattcctaagctta
ctcactgattcttccagcagcaaaagatgtcatcctgaccgagtcacgtactctactctg
atgagtgcattgtgcaaagagggcaggtttgatgaagcaaagaataaattgcttgagatg
atagggaaagatatctctcctgattcagttatatatgatacctttattcatggttattgc
aagcatgggaagacttctcacgctgttaaggttctgagggacatggaaaagaaaggttgc
aagccaagcgtaagaacatacaacttgttgatatggggatttcgagaaaaacacaattca
gatgaaatcattaaattgatgagtgaaatgaaggagaaggggatttgtcccaatgtcatg
acgtataatagcttgataaagtccttttgtgaacggggaatggcaaacaaggccctgcct
ctgctggatgaaatgttacagaatgaaattgttcctaacgtaacttcttttgacctgttg
attaaggctttctgcaaaactacagatttctctgcagcccagagagtatttgatgcttct
ctgagtacatgtggtcagaaggaagtgctctatagcataatgtgcactcagctctccact
tatggtagatggattgaagccatgaatgctctagaaatggcgcttgaatcgaggatctct
atccatagattcccatataagcagattattgagggactctgtgaagttgaagaggcggat
catgcatataggttactcaagctgttaatggttaagggctattcatttgatccagcagca
ttcatgccagtgatagatgcattaagtgaaaagggaaagaagcaagatgttgatgtgctc
tcagagaaaatgatggaaatggcagagcgtgatgatggtcttgcagttccttctggcaag
tttaagcctagaagccagcggcatggacaggacaagtatgctgaaagtgattggcatgct
cttttgcacagagatgatagtgctcgcacaatcttgaaaatcaccaagagagtgaagaca
ggatggggtcaaagaggcaatgtttatgagaacaagcagcagcagaatgatgacatttat
gttctagagaacactggctga
DBGET
integrated database retrieval system
