Planktothrix agardhii: NIES204_29110
Help
Entry
NIES204_29110 CDS
T05658
Name
(GenBank) filamentous haemagglutinin outer membrane protein
Organism
pagh
Planktothrix agardhii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHAT
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BBD55600
UniProt:
A0A2Z6CH07
LinkDB
All DBs
Position
complement(3290631..3296900)
Genome browser
AA seq
2089 aa
AA seq
DB search
MGGNITLDGIAVNNQPFNHGILLTNSSLNSGNGNVNLTGTSGLQTETNIGVWLEQSTINS
EAGNISIVGNSKGSQTNNIGVLLNNNSTLQSRTGNITLTGSSENGLNSFGVNLNQSNIST
VDGTIKITGTPAGINNSVAVYISDSNIASTGTGNIDLNGNNNATGNNNDGISILNNSLIS
STGTGNITLSGVSGQGNISEGIFIANGKIQTLNSDIKINGLGQGLTSSIGIFIGDGGEIV
STGIGNINLDGLSIATGNSSHGIALFGGANITATATGNINLVGSSSQTPDSHGILILDNP
IIGVINGNLNLTGVSSSSLGGQGILLGNSLIQSSGTGSINLTGTGNSTGSESNGIILINT
AEINSLASGNINIQGRSAAVANSQAVGIFGESKIQSNTGSILIDGVNNGENGENTNSVII
GENTPITTTGSGSITISGNRDLLINSVTNTGGEINLQSSEGNINSSFGIIDSSSIQGSGG
NIAINAAGNIRVAGINARGNTQGGSVSLTSANNIITVTDNINTSATTGQGNTITVSATNG
EINTQAGILDSSSSDNDGGNQTLNASGTITLGGINTSTASNSTNSQAGTLDISSGNNTIN
LTGDINTSATKGQGSDVNFNANVILPKPNITINTTGNNSGGNVTFNGTINGGINPTPTLP
LLMGGRNSLTLETGTGDATFSQAIGDSLPLQNLIINSGNVVTQSAVTVENGGINVNATQN
INLGDTITANNSPIDVSATGDITTADIISNGSRISLTSNTGNINTASGILNSSSTTENGG
EINLNAAENLTIGAVITRTESNLGTSQAGTLTLSGNTINLTNNIDTSATIGSGNNIIFNS
PVILDADIVTLNTSGTARSGNVTFNNTVDSNTPGTANLTLEAGTGTVNINQAIGATNPLN
TLNLTSGDVNSNGGINLEGEGININSSGTVNLTQPITATNTATININAENNITTANLTTQ
GQAIILNSNTGNIDSSGGIINSSSPNSNGGDITMTTPANITLGEINTSTQNNQAGNVTLN
TGNNPIILNGDINTSSNNGVGSQQQYNSPLQLASPNITLTSSGTNNSGDIIFNNSINGNS
NLTLNAGSGNITFSTVGDSNPLSSLQVNTTGLTTLKGNLTTNNNIDFSNASGGTQLENPI
IINTTGNNGNILFNNSPITGSQTLTLNAGNGTISLNTVGNNNNPINGLIFQQASALNLFG
DIYTSAGLNFSSVNTVNVSGNSVTLDTSIGNGAIDFIGSTLGGQGKLTLNAGNNDVNLDT
FTTESTLNGLGITAGTVQANAPITLGSGGLNINASNIVNLNANILSNGTVAVTANNDITT
RDITASPGITLNSRNGNITVNSLNSSSPNANGGGISLSTPQGNITTNTLNSSSPGNAGGN
ISLEANTGNVTTGNILTSGSTGGNVTVKAQTSITTGQIDTQGQTQGGNVFLDPINDVQVE
FINAESPNGLGGNVFAESTQGYFRATNSFPTQFSPTGTASISTAGRLGGGSITIRQAGGP
LNPPVAPFEIGGNLAMNGTASVITTGDFNILPLQSFEGSFTSGNIVISTDDAPNIPPNVN
QPLIDTEVILQEDVLIRPDQEQKIEETSPEIIINDNNTTGDFNILPPQSFEGSFTSGNIV
ISTDDAPNIPPNVNQPLIDTGVILQQDALIPPDQEQKIEETSPEIIINDNNNFLPKKILS
TVDIAFGFDNLDSTFLALEQSRNQEFKQHLGVQGTQLNRSEVQQLLKELEIKTKQVYAIV
YIVSREEQLEIIVVPSFGEPIRHSVPEATKEKLFPVVRQLQSEITNPRKRDKVSYQAPAK
QLYQWMIQPIEDNLKRLGISTILFSLDAGLRSLPMAVLWDGQQFLTEKYGISLIPSTSLI
DFRYQPIGQAQVLAMGASQFQQQNPLPAVPIELQNITEIWPGEKFLNERFTLENLKSQRR
ISDFQVIHLATHADFKTGSPSNSFIQLWNEKLPLTELPNLGWDNPIVELLTLSACRTALG
DRRSELGFAGLAVQAGVKSALASLWYVSDQGTLGLMSEFYESLKQAPIKAIALQEAQIDM
IQGKTRIENDQLITTFGAIPLPENLTEFNITSLSHPYYWSGFTMIGSPW
NT seq
6270 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggggggaaacatcaccctagatggcattgcggttaataaccaaccctttaatcatggg
attctattaacgaatagtagcttaaattctggcaatggaaatgttaatttaactggaacc
agtggtctacaaaccgagactaatataggagtttggttagaacaatctactattaattca
gaggcaggaaatattagtattgttggcaatagtaaaggcagtcaaaccaataatattggt
gttttactcaataataattctaccttacaaagcagaacagggaatattaccttaactgga
agtagtgagaatggattaaatagttttggtgtgaatttgaaccaaagtaatatttcaacc
gttgatggtacaattaaaatcacaggaactcccgccggaatcaataatagcgtggcagtt
tatattagtgatagtaatattgcttcaaccggaactggaaatattgatttaaacggaaat
aataacgccacaggaaataataatgacggaatttctatattaaataactccctaatttct
tccacaggaaccggaaatattaccttatcgggggttagtggtcagggtaatattagcgag
ggaatttttatcgcgaatggaaaaatacaaaccctaaatagtgatattaaaattaacggt
ttgggacagggtttaacctcaagtataggaatttttattggggatggaggtgaaattgtt
tctactggaattgggaatattaatttagatggacttagtattgctacggggaatagtagt
catggaattgccctatttggaggtgcaaatattaccgcgacagcaacgggaaatattaat
ttagtgggaagtagtagtcaaactcccgatagtcatgggattttgattttagataaccct
attattggggttattaatggaaatctgaatttaactggagtgagttcatcttctttaggt
ggacagggtattttattgggaaatagtctaattcaatcgtcaggaacagggagcattaat
ttaactggaactggcaatagtacggggagtgagagtaatgggattattttaattaatacc
gcagaaattaatagtttagcgagtgggaatattaatattcaaggtcgtagtgcggcagtt
gctaatagtcaggcggtgggaatatttggagagagtaaaattcaaagtaatacggggtca
attttaatcgatggtgtgaataatggtgagaatggcgagaatacaaatagtgtaattatt
ggagaaaatacccccattactaccacaggttcaggaagtatcaccatatcaggaaatcga
gatttattaattaattccgtgactaataccgggggtgaaattaatctccaaagtagtgaa
ggaaatatcaatagtagttttggaattattgatagtagttctattcagggaagtggggga
aatattgcgattaatgcggcgggtaatattagggttgccggaattaatgcccgtggaaac
acccaaggaggaagtgttagtttaacttctgctaataatattattacggtaactgataat
attaatacttccgccaccacaggtcagggtaatacaattacggtttctgctaccaatggg
gaaattaatacccaagctggcattttagatagtagttcttctgataatgatggcggcaac
caaaccctcaacgcttcgggaacgattactttaggaggaattaataccagtaccgcctct
aattctaccaatagtcaggcaggaaccctagatatttcttcaggaaataatactattaat
ttaactggagatattaatacctcagccaccaaaggtcagggaagtgatgttaattttaat
gctaatgttattctacctaaacccaatattactatcaatacaacgggaaataatagcggg
gggaatgttacctttaatggaacaattaacgggggtattaaccccacccctaccctcccc
ttgctaatgggaggacgtaatagtttaaccctagaaactggaacgggagatgcaactttt
agtcaagcaataggggatagtctgccgctacaaaacttaatcattaatagcggaaatgtg
gttactcagtctgcggtaacggtagagaatgggggaattaatgttaatgcaactcaaaat
attaatttaggtgataccataacagctaataatagtcctattgatgttagtgctactgga
gatattacaacggcggatattattagtaatgggtcaagaatttctctcaccagtaatacc
ggaaatattaataccgcatcgggtattcttaatagtagttcaaccaccgaaaacggagga
gaaatcaacctaaatgcggctgaaaatttaactataggcgcagtaattacccgcacagaa
tctaatttaggaaccagtcaagccggaaccctaactctctctggaaatacaattaattta
actaataatattgatacttctgctactattggttcagggaataatattatctttaattct
ccggtgattttagatgcagatatcgttactttaaacacatcgggaaccgccagaagtgga
aatgttacctttaataataccgttgatagtaatactccagggactgctaatttaaccctg
gaagcggggacgggaacggttaatattaatcaagcaataggagcaacaaatcccttaaat
actttaaatctaaccagtggagatgtcaatagtaatgggggaattaatcttgagggagaa
ggaattaatatcaatagcagtggtacggttaatttaacccaacccatcaccgccacgaat
accgccactattaatattaatgccgaaaataatatcactaccgccaacctaactacccaa
ggtcaagctattatattaaatagcaatacgggaaatattgatagtagtggcggaattatt
aatagcagttctcctaatagcaatggcggtgatattacgatgacaactcctgctaatatt
accctgggggaaatcaataccagcacccaaaacaaccaagcgggaaatgttactttaaac
actggaaataatccaattattttaaatggtgatattaatacctctagcaataatggggtc
ggaagtcaacaacaatataatagtcccctacaactcgcatcccctaatattaccctaact
tcatcgggaactaataatagtggtgatattattttcaataattctatcaatggaaatagt
aacttaaccctgaatgcgggtagcggtaatattactttttctactgtgggtgatagtaac
cccctgtctagtttgcaagttaataccaccggactcacgaccctaaaaggcaatttaact
acaaataataatattgattttagtaatgcttctgggggaactcaactcgaaaatcctatt
attattaataccaccggaaataatggtaatatcctatttaataatagtccgataacaggt
tcccaaaccctaacactcaacgccggaaatggaacaatttccctgaataccgttggtaat
aataataaccccataaacggattaatttttcaacaagcgagcgcccttaacctgtttgga
gatatctacaccagcgccggacttaacttttcctccgtaaataccgttaatgtttctgga
aattcagttacattagacaccagtattggaaatggagcaattgactttattggttcaacc
cttggtggacaaggaaagttaactcttaacgcggggaataatgatgtaaatttagatact
tttaccacagaatctaccctaaacggtttagggattaccgccggaaccgtccaagctaac
gcccctattaccctagggtcagggggactgaatattaatgccagtaatattgttaacctc
aatgctaatattctcagtaatggtacggttgcagtcaccgccaataatgatattaccacc
cgtgatattaccgcatcccctggtattaccctcaatagccgtaacgggaatattacggtt
aactccctgaatagttcatcccctaatgctaacggtgggggtatttccctaagtaccccc
cagggaaatattactactaacaccctgaatagctcatccccaggtaatgcgggcggaaat
atctccctagaagcgaataccggaaatgttacaaccggaaatatactgacatccggttcg
acaggcggtaatgttacggttaaagcccaaaccagcattaccaccggacaaattgatacc
caaggtcaaacccagggcggtaacgtcttcctcgacccgattaatgatgttcaggtcgaa
tttattaacgctgaatcccccaatggtctcgggggtaacgtttttgcggaatcaactcaa
ggctacttccgtgctaccaactccttccccacccaattttcccccacgggaaccgccagt
atctccaccgcaggacgtctgggcgggggttcgattacgattcgtcaggccggagggcca
ctgaatccccctgttgctccctttgaaatcggaggtaacttagcaatgaatggaacagcc
tccgtcattactacaggagactttaatattctgccactccaaagttttgaaggttcattc
acatcaggaaatattgttatttccaccgatgacgcgcctaatattccccccaatgtaaat
caacccttaattgataccgaagttatcctacaagaagatgtattaattcgtcctgaccaa
gaacaaaaaatagaagaaacttctcctgaaattattattaatgataacaatactacagga
gactttaatattctgccaccccaaagttttgaaggttcattcacatcaggaaatattgtt
atttccaccgatgacgcgcctaatattccccccaatgtaaatcaacccttaattgatacc
ggagttatcctacaacaagatgccttaattcctcctgaccaagaacaaaaaatagaagaa
acttctcctgaaattattattaatgataacaataattttctgcccaagaaaattttatca
acggtagatattgcttttggttttgataacttagattcgacatttttagcattagaacag
tcaagaaatcaagaatttaaacaacatttaggagtccaaggaacccaattaaatcgttca
gaagttcaacaattgttaaaagaattagagataaaaactaaacaggtttatgcgattgtt
tatattgtttccagggaagagcaattagaaatcattgtggttccttccttcggtgaaccc
ataagacatagcgttcctgaagccactaaagaaaaattattccccgttgttcgacaatta
caaagtgaaattaccaacccccgaaaacgggataaagtcagttatcaagctccggcgaaa
caactttatcaatggatgattcaaccgatagaagataatttgaaaagattaggaatttct
acaattctattctccctggatgcaggtttacggagtttaccgatggcagttttatgggat
ggtcaacaatttttaaccgaaaaatatgggattagtttaattccgagtaccagcttaatt
gactttcgatatcaacccattggtcaagcgcaagtcctagccatgggagccagtcaattt
caacaacaaaatccacttccggcggttccaattgaactccaaaatattactgaaatttgg
cctggggaaaaattcttaaacgaacgatttaccctggaaaatctgaaatcccaacggcgt
atatctgattttcaagtgattcatttagccacccacgctgattttaaaaccggatctccg
agtaattcttttattcaattatggaatgaaaaattacccttaacagaacttcctaatttg
ggttgggataatcccatagtggaattattaactttaagtgcttgtcgaacagcattagga
gatcgacggtcagaattaggatttgctgggttagcggtgcaggcgggagttaaatccgct
ttagcgagtttatggtatgttagtgatcaaggaaccttgggattaatgagtgaattttat
gaatctttaaagcaagctccgattaaagcgatcgctttacaagaggcacaaattgacatg
attcaaggaaaaactcggatcgaaaatgatcaattgataaccacctttggcgctattcct
ctccctgagaatctgacagaatttaatattaccagcctatcccatccctattactggtca
ggatttacaatgattggaagcccttggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
