Plasmodium berghei: PBANKA_1335400
Help
Entry
PBANKA_1335400 CDS
T01111
Name
(RefSeq) histone deacetylase, putative
Organism
pbe
Plasmodium berghei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Hist_deacetyl
Ank_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55151700
NCBI-ProteinID:
XP_034423510
LinkDB
All DBs
Position
13:1410051..1415243
Genome browser
AA seq
1630 aa
AA seq
DB search
MMKISKDKRNIRYEYELDKLKKKKKDNILILNIINNKINYICYILKSDYRNILNDINYEN
KNSIETCFYYSKSYITFLLLYYPYIHNYIKCLRNNNLRIYKNFYKHILKLPNNFYTLIFK
LKILDIIKENKCSLNSSNDINYINKNIQEFSSNNISNTFFENTNKTYSSNSYIDNNAGGV
AAFHKNYSSSSQLVLNTPNFYDNFSKNNFIKILFSRIYKKKYHKSIIKILELVLFYHSLP
SFSFSQNFFQKYHNNKRNSGLDRKQCKSNKNKHFKKLYFKTPFFKHVIVPTIYLNEDCKN
VEVLAKKKLVKIKKKKIKNKKIKNKIKKNVAAKVEEENADYSLSENTGSDITEKSLSCLS
NSEDEREVNEFLKKEFNYDINLNKNNESHDNIYFNNYNDQSEEIIPNDKNINDGQMNTSS
VLSSTLNNENICTNKINIQNEYYKNENNNELNFSEHVVNNGENISSTREINNLQVNDISD
NFLKFIYNYNKNNKSLKNAELIYGKYILDDIQSFILYRKNKEFNSNTKDNNNEKKKIYIH
EIWKDLINFDDADDNKNTLIHKACLVSNINIIFILLNLNVNLIAYNDKSELPLHCTIYGT
NKYIFLLLLHNTIEYIFFYYIQLFKDKNNEKKKKSINSQNIKKEAKTYTLNNYNSIININ
NEKKENHQNTIKNINEISDSSIPHHTCDKTDIISDDVENDKSVIRNSHIKNKQKYIYYIK
NNFFYCKKINHKFICTVVKLYLSLFVKIIELGNYEFLKIMFNYNKQIFCYILQNQEMLYF
LCSFARMYNSLNLFIKFCNDIFSFDIVKENKKNPKKRSNTEAAFIEKEINNNIKKIKSNI
TVDIDNIETENIVNHEEEALSKNESNELDSVSVKINEEENKNSIIKISQNSEKKKNDFIN
NYVIKKKTDKKNRIEIFYSHECAKHIFVPEPTDYPYMRNRIKNSIPENSTRLDVLISNKH
GILKLNTFVNFKIKKIQRKATALDVLRVHDVSYIKMLLQKMKKLNYYNTNDKFDNFLEPS
KKNIKNYLVLPEYYSESPNNDNIPDHIKMLKNNNIISSMYEGNPNSSTQHGDNNNPQFDS
VGEDCENKKSGYNGGYGRELDSGINSSNNITEGKISSYNSSNVTTIQSPEKKMISKKYSS
NNSIFKEKYDKLVLIDNDTFVNKHSFNCALNASGVVLNAVDYISSKNSKKNKKKIFCVVR
PPGHHLGTFGAAQFNLSDEDKAAGSQGFCLLNNIAIGISYAKYKYEKYERIAIIDFDVHH
GNGTEQIIRNIGLKKIKINDYIDIYSWKGWKDKNDKKNVFFSSIHAFDGYFYPGTGYDTV
ELEPYIINVTLKKNMDENDFLQLFHNNILIHLYHFKPDILFLSAGFDGHKLDYVNNGFVK
KNTSTYFYLTNLIVSLQNKLHFPIISVLEGGYNTSNDMASVFSLSVLEHALSFYYNDISF
LSRKKNKSITNTISKKCARKERKKNVLKFPYICLGKTKMEEMFKNYFAVFKEKTKETANL
NLTNKVVEYHKYIKEYDRKENEMKKKMSKFLNKNKLYFQNILNDTNLLSTSINIKLPFES
YFYQVLFLLKIKLKKKKCLKKKKQLFSQDVNQYFSILNNPSDIQNLKSVYIQQHPDTKFE
LNNLWNHLKN
NT seq
4893 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaattagcaaagataaacgaaatatacgatatgaatatgaattagacaaatta
aaaaaaaaaaaaaaagataatattttaattttaaatataataaataacaagataaattat
atttgctatatattaaaaagtgattatcgaaatatattaaatgacataaattatgagaat
aaaaattcaatagaaacatgtttttattattcaaaatcttatataacatttttactttta
tattacccatatattcataattatataaaatgtttaagaaataataatttaagaatatat
aaaaatttttataagcatatattaaaattgccaaataatttctacacattaatattcaaa
ttaaaaatacttgatataataaaagaaaataaatgttcattaaattcgagtaatgatata
aattatataaataaaaatatacaagaatttagtagtaataatattagtaacacttttttt
gaaaatacgaacaaaacttatagtagcaatagttatatcgataacaatgcaggaggggta
gctgcttttcacaaaaattattcatcatcttcccaacttgtattaaatactccaaatttt
tatgacaatttttcaaaaaataattttataaaaatattattttccagaatttataaaaaa
aaatatcataaatcaataataaaaatacttgaacttgtcttattttaccattctttgccg
tccttttcattctcacaaaatttttttcaaaagtatcacaacaataaaagaaatagtgga
ttggatcgcaagcaatgtaaatccaataaaaataaacattttaaaaaattatatttcaaa
acaccgttttttaagcatgttattgtaccgactatatatttaaatgaggattgtaaaaat
gtggaagtgttagctaaaaaaaaacttgttaaaataaaaaaaaaaaaaataaaaaataaa
aaaataaaaaataaaataaaaaaaaatgtggcagcaaaagtagaagaagaaaatgctgat
tattcattatcagaaaatactggaagtgatattactgaaaaaagtttaagttgtttaagt
aattcagaagacgaaagagaagtaaatgaatttttaaaaaaagaatttaactatgatatt
aatctaaataaaaacaatgaatctcatgataacatatattttaacaattataatgatcaa
tctgaagaaataataccaaatgataaaaatattaacgatggtcaaatgaatacttcatcg
gttttatcttctacacttaacaacgagaatatatgtacgaataaaataaacattcaaaac
gaatattataaaaatgaaaataataatgaattgaatttttcagagcatgttgtaaataat
ggggaaaatatttcatcaacgagagaaataaataatttgcaagtaaatgatatatctgat
aattttttaaaatttatatataattataataaaaacaataaatcattaaaaaatgcagaa
ttaatatatgggaaatatatacttgatgatatacaaagttttatattatatagaaaaaac
aaagaatttaatagtaatactaaagataataataatgaaaaaaaaaaaatatatattcat
gaaatttggaaagatttaataaattttgatgatgctgatgataataaaaatactttaata
cataaagcttgtttagtttcaaatataaacataatatttattttgttgaatttaaatgtc
aatctaattgcttataatgataaatcagaactccctttacactgcactatttatggaaca
aataagtacatttttttattacttcttcacaatactattgaatatatatttttttattac
atccaattatttaaggataaaaacaacgaaaaaaaaaaaaaatctataaatagccaaaat
atcaaaaaagaggccaaaacatacacacttaataattataatagcataataaatatcaat
aatgagaaaaaagaaaatcatcaaaatacaataaaaaatataaacgaaattagtgatagt
agtattcctcatcatacatgtgataaaacggatataataagtgatgatgtagaaaatgat
aaaagtgttattcgaaattctcatataaaaaataaacaaaaatatatatattatataaaa
aataattttttctattgcaaaaagataaatcataaatttatttgtacagttgtaaagcta
tatttaagtttatttgtaaaaattattgaactaggaaattatgaatttttaaagattatg
tttaattataataaacagatattttgttatatattacaaaatcaagaaatgttatatttc
ctttgttcatttgctcgtatgtacaattcgctaaatttgtttataaaattttgtaatgat
attttttcttttgatattgttaaagagaataaaaaaaatccaaaaaaaagatctaatact
gaagcagcatttatagaaaaggaaatcaataacaatattaaaaaaattaagtctaacata
actgttgatattgataatattgaaacagaaaatattgtaaatcacgaagaagaagcgctt
tcaaaaaatgaatcaaatgaattagattcagtttctgtaaaaataaacgaagaggaaaat
aaaaatagtataataaaaatatcccaaaatagtgaaaaaaaaaaaaatgattttataaat
aattatgtgataaaaaaaaaaacagataaaaaaaataggatagaaatattttactcacat
gaatgtgctaaacatatatttgtccctgaaccaactgattatccatatatgcgaaataga
attaaaaatagcatacctgaaaattcaacaagattagatgttttaatatctaataaacat
ggaatattaaaattaaatacttttgtaaattttaaaattaaaaaaattcaaagaaaagct
acagcattagatgttttaagagtgcatgatgtgtcatatataaagatgctgttacaaaaa
atgaaaaaattaaattattacaatactaatgataaatttgataattttttagaaccttcg
aaaaaaaacattaaaaattatttagtattacctgaatattatagcgaatcaccaaacaat
gacaatattcctgatcatatcaaaatgttaaaaaataataatattataagtagtatgtac
gaaggaaatccaaattcttctactcaacatggagataataataatccccaatttgatagc
gttggtgaagattgtgaaaataaaaaaagtggatataatggagggtatggaagggaatta
gatagtggtataaacagtagtaataatataactgagggaaaaatatcgagctataatagt
agcaacgtaactacaatacaaagcccagaaaaaaaaatgatcagtaaaaaatatagcagc
aataatagtatttttaaagagaaatatgataaactagttttaatagataacgacacattt
gttaataagcattcatttaattgtgcattaaatgcaagcggggtcgttttaaatgcagtt
gattatatatcttcaaaaaattcgaaaaaaaacaaaaaaaaaatattttgtgtagtaaga
ccaccaggacatcatcttggcacatttggcgcagctcaattcaatttatcagatgaagat
aaagcagcaggtagccaagggttttgtttattaaataatattgctattggtatatcatat
gcaaaatataaatatgaaaagtatgaaagaatagcaataatagattttgatgtacatcat
ggtaatggaacagaacaaattataagaaatatcggattaaaaaaaataaaaattaatgac
tatattgatatttatagttggaaagggtggaaagataaaaatgataagaaaaatgttttt
tttagttctatacatgcatttgatggttatttttatcctggaacgggttatgatactgtt
gaattagaaccatatataataaatgtaacattaaaaaaaaatatggatgaaaatgatttt
ttacagttattccataataatatattaatacatttatatcattttaagcctgatatatta
tttttatcagctggttttgatgggcataaattagattatgtaaataatggatttgttaag
aaaaatacgtcaacatatttttatctaactaatcttattgtttcattacaaaataaatta
catttccctattattagcgttttagaaggtgggtataacacatcaaatgatatggcatct
gtttttagtttgtcagtccttgaacatgctttatctttttattacaatgatatatcattt
ttatcacgaaaaaaaaacaaatcgataactaatactatctcaaaaaaatgcgcacgaaaa
gagagaaaaaaaaatgtattaaaatttccatatatatgtttaggaaaaacaaaaatggaa
gaaatgtttaaaaattattttgccgtttttaaagaaaaaaccaaagaaactgcaaattta
aatttaacaaataaagtagttgaatatcataagtatattaaagagtatgatcgaaaagaa
aatgaaatgaaaaaaaaaatgtcaaaatttttaaacaaaaataaattatatttccaaaac
atactaaatgatactaatttactttctacaagtataaatataaaactaccattcgaatca
tatttttatcaagttttatttcttttaaaaataaaattaaaaaaaaaaaaatgtttaaaa
aaaaaaaaacagctattttcgcaggacgttaatcaatacttctccattttgaacaaccct
tccgatattcaaaatttaaaatctgtctatattcaacagcatcccgatacaaaatttgag
ttaaataatttatggaatcacctaaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system