Plasmodium berghei: PBANKA_1406400
Help
Entry
PBANKA_1406400 CDS
T01111
Name
(RefSeq) tripartite motif protein, putative
Organism
pbe
Plasmodium berghei
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
zf-B_box
HEPN_Swt1
HSP33
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
55152094
NCBI-ProteinID:
XP_034423886
LinkDB
All DBs
Position
14:complement(297270..299771)
Genome browser
AA seq
775 aa
AA seq
DB search
MDIISSSNNDINSEEENGFSDFENGNTQICKEDTISESCETQNNKIYRCAYCSRKVEDVL
ICSCKHLMCLTCASMQLQDKYDKFMKACSSAKIIEEKKVNYKINESFRNCIDIIDKINND
KIEDILKKEKIGYVTCNICNIKNKLTIDTLELLTKVGLFSSDVLNIHTFYFNLIGNNNKR
IKGLTENCVKQLSLEYDESYSNDMPNNRILKNDKLKQLAVSNNKYNYLEEYADDLDRYSY
ICNICSFSEAIIYCNDCIEYLCENCCNNIHEINTPNGMNSKITPHDYYKIDKKIINLKKL
VKPPKMFLNITKEDIEIIDNTDRDSFDGHFSEDDEKKRNNKIGNFKVEGGDDSDFDNYDE
KYFYEKQKKLMEKKNKKDNNIKLSHKLNNLVENMKNGSSYDSVHSTIDGTLGSISDLGAN
FLKKKKKKGNRRMRKKNMYGSKIKYGEHLNGETKMLQKREWTSLQKGKKNKIGNMNKEES
ICVFSNDETSSRVDISSSESSLNSCNSDDGEICIKNIKMESIKKKKKEIRNPSLNNDIIA
NKTFTSIENIRCNHHYNYPIQYFCHTCCTKCFCSECAINGIHTSQCNIENINAAFITVLN
NYLIQWNEVINELINDLEVNFYESLEDTRNDWSSILSECYYNISSKINYIINNMHKMEKD
IFNQLDTYMENFKKDNLDYVELLNSKYDDIENTISIIRANKFQKNPIDLIKFYNNNINII
DRTLILNKDFKPIEDLSKIRESKIFYMDLYTSQIISYLKHLQVFLSSNFLAPSIK
NT seq
2328 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacatcatttcctcatcaaataatgatataaattcagaggaagaaaatggattcagc
gattttgaaaatgggaacacccaaatttgtaaagaagatacaataagtgaatcatgcgaa
actcaaaataataaaatatataggtgtgcatactgtagcagaaaagtggaagatgtcctg
atatgctcatgtaaacatttaatgtgtctaacatgcgcaagtatgcaactacaagataaa
tatgataaatttatgaaagcatgctctagtgcaaaaattatagaagaaaaaaaagtaaat
tataaaataaatgagagttttagaaattgcatagatataatagacaaaattaataatgat
aaaatagaagatatattaaaaaaggaaaaaataggctatgttacatgcaatatatgtaat
attaaaaataagcttacgatagatactcttgaacttttgacaaaagttgggttattttca
tctgatgttttaaatattcatacattttattttaatttaattggaaataacaataaaaga
ataaaagggttgaccgaaaattgtgttaaacaactaagtttagaatatgatgaatcatat
agtaatgatatgccaaataacaggatattaaaaaatgataaattaaaacaattggcagtt
tcaaataataaatataattatcttgaagaatatgcagacgaccttgatagatattcatat
atatgtaatatatgctcatttagtgaagcaataatatactgtaatgattgcattgaatat
ttgtgtgaaaattgttgtaataatattcatgaaataaatacgccaaatggcatgaatagc
aaaattacaccccatgattattataaaatagataaaaaaattataaatcttaaaaaatta
gtaaaacctccaaaaatgtttttaaatataacaaaagaagatattgaaattattgataat
acagatcgagatagttttgatggacatttttcagaagacgatgaaaaaaagagaaataat
aagatagggaattttaaagtggaagggggtgacgattctgattttgataattatgatgaa
aaatatttctatgaaaaacagaaaaaactaatggaaaagaaaaacaaaaaagataataat
ataaaactttcacacaaactaaataatttagtggaaaatatgaaaaatggaagtagttat
gacagtgtgcattcaacaatagatgggacacttgggtctattagtgacttaggtgcaaat
tttttaaaaaaaaaaaaaaaaaagggaaatagacgaatgcgcaaaaaaaatatgtatgga
tctaaaataaaatatggtgaacatttaaatggagaaacaaaaatgctgcaaaagagggaa
tggacgagcttacaaaaaggaaaaaaaaataaaataggaaatatgaacaaagaagaaagt
atatgtgtattttcaaatgatgaaacttcttctcgagttgatattagttctagtgaaagt
tcattaaattcgtgtaatagtgatgatggagaaatatgtataaaaaatataaaaatggaa
tccataaaaaaaaagaaaaaagaaataagaaatccttcgttaaataatgatataattgct
aataaaacctttacaagtattgaaaatataagatgcaatcatcattataattatcctata
caatatttttgccatacttgttgtactaaatgtttttgctcagaatgtgctattaacggt
atacatacttctcaatgtaatatagaaaatataaatgcagcttttataacagttttaaat
aattatttaattcaatggaatgaagttattaatgaattaataaatgatttagaagtaaat
ttttatgaatctcttgaagatactagaaatgattggtcttcaatattaagcgaatgctat
tataatataagcagtaaaataaattacataattaataacatgcataaaatggaaaaggat
atatttaatcaacttgatacatatatggaaaatttcaaaaaagacaatttagactatgtc
gaactattaaattccaaatatgatgatattgagaatactataagcataatcagagcgaat
aaatttcaaaaaaacccaattgatttaattaaattttataataataatattaatataata
gacagaactcttattctaaataaagattttaaacctatagaagatttatcaaaaatacga
gaaagtaaaattttttacatggatttatatacttctcaaataattagttatcttaagcat
ttacaagtttttttatcctcaaactttttagccccatctattaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
