Plasmodium chabaudi: PCHAS_0603400
Help
Entry
PCHAS_0603400 CDS
T01108
Name
(RefSeq) conserved protein, unknown function
KO
K24971
nuclear export mediator factor NEMF
Organism
pcb
Plasmodium chabaudi
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pcb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pcb03009
]
PCHAS_0603400
Ribosome biogenesis [BR:
pcb03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Ribosome quality control proteins
PCHAS_0603400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NFACT-R_1
NFACT-C
NFACT_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3497200
NCBI-ProteinID:
XP_016653388
UniProt:
A0A4V0K3Y8
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(140234..146207)
Genome browser
AA seq
1739 aa
AA seq
DB search
MGKQRLTALDIRAIITSCKKTIIGSVVTNIYNISNKIYVLKCSKKEQKYFLLLEAEKRMH
ITEWMREKDVMPSGFTMKLRKHLRSRKITNISQLGGDRVVDIQFGYDDNVYHLIVELYIA
GNIVLTNNEYKIIFILKSNDDNKKKLKINEIYNVEEHNAVMLYKYLDIINNENIKKSINE
ILMIHNQPEIGDSNKVSTTNETTTINGKMVEKNMTKSGNLSLLNSEKNDNVKLKKKSGSQ
NIKNSSNSRKGRGGTTFGDSNNILNDKNKNDDTQNDNKKNKKTKKIKTLNELGSKLILFA
HNDLIIHSLIEWNYNPHDPVEKYDIDTLTEIFFKVINECMKIFNMMSNEESVIYGYGFAP
IDEKLSILNKNKNMENVGKNENSILGTEINKDNNLGGENKLENDRLFVEFSPILLKNHIN
KIDEKKIELIKFNDFNMCVDTYFSKMELTKYDKHQEMNKRKNALTKIDKIKLDHERRIEA
LEKEVNILKKKILLIQANDEFVGEAIKLMRAAISTSANWEKIWDHVKLFKKRNHPVALKI
MSVNFNNCEIELLLNEGDTEESSSEDSSKEKGMEEKNKACTVTINLNNSVYGNIEDYEKL
RKKAEEKIRKIKMSTNVAIKKVEKKKKDKDTKQKGKHKSVFQIQKLRKIFWFEKFNWFLS
SENYLVISGRDSLQNEILFRRYFQNNDIYVHADIHGAASCIIKNPYKDIPIPEKTLAEAG
QLAMCRSSAWNNKVITSAWWVYYHQVSKTAPTGEYIKTGSFVIRGKKNYLPYAKLEMGLS
IIFQVNKNVDDNNKEDALNDDKENDETVHTGSDNDCLDKENGGSAGKVAATGNADKMTAT
SNTADCVNHMNDSSNCKETRIVNKNNCVVGKGIDLRGTCKYYLGRKQNKKYAKNKYIRLI
LKCLNRIDLLNVYKKNMISKLVISDKYRKEIISMLCKLCFSNLCINMKNDEIKSFFEFLY
KIKNHDNIQCYICQTFKKNYKIALSGIFKLFRHLFLYFDSSNKFSGTCIGGIFFNKCLKS
FDRAIKKLMKDSISFYFVHKMVLLKSCDKKIREWGKDEFNTFFDINKNNNFIKNEKYLFY
NNNVDTLVCAMKNQIDEEIKLDMMNEKDYVFDNKTMKLCFTPCEVYGLPPVAFKDDDIND
DESKNSKKGGSSNKVAFNSGDNDKEDGQKKHISFANVENSIKIERPTRTRKPTGFVKMDI
KKLLEEIDNEEEEEEGDTHNELKREDMKVTFDEQKKVPVEKKGVAFNLENNSVDNKSSTL
NIPRPTRTRKPTGFVKADLSKLLEEIDNEEEGEEKSEADGSSQKGTLNSNSSTTNVRKKS
VSFSSEDDRIYIERPITSGIPPRPVRTRKPTGFIKMDISKLLEEIDNEEENGENEKDEDE
KSDDTKKVKFSEGVEKNTNDENIKNFSRPVRTRKPTGFVKMDVKKLLEEIDNEEEEDDEN
SSTGKGAYVENSGNSEEEENSENSEEEEEEEEESENSEEEDESENSEEEEESENSEDEEE
SENSEDEGSGQNSGYGKTDYKGNMERVNESDSNKKSPNETNKEGRFNDKLVKNENKSTVH
LLRGARTKKKRMKKKYREQDDDDEERQLYMKIIGSRKMKHETEKQKKEKEENKVEKEENK
YNKRPNELKANYEEINEDEMNMKLSELNKLTFTPKEGDVITCAIPMCAPYSAIQNHKYKV
KLVPGNAKKGTIAKSCISHFLKCSTSEIEKKFINGISMDDLGNCIITNSTTDLLSSKFR
NT seq
5220 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaagcaaaggttaaccgctctagacatccgagcaataataacatcatgtaagaaa
accattattggatctgttgtaacaaatatttataatatatcaaataaaatatatgtgtta
aaatgttctaaaaaggaacagaaatattttctgcttttggaagcagaaaaaagaatgcac
ataactgaatggatgagagaaaaggatgtgatgccatcagggtttactatgaaattaaga
aaacatttacgatcccgtaaaataacaaatatatctcaattaggtggagatagagtagtt
gatattcaatttggatatgatgataatgtatatcatttaattgttgaattatatattgct
gggaatattgtacttacaaataatgaatataaaataatatttattttaaaaagtaatgat
gataataaaaaaaaactaaagataaatgaaatatataatgttgaagagcataatgctgtg
atgttatataaatatttggatataattaataatgagaatataaaaaaaagcattaatgaa
atattaatgattcataatcaacctgaaattggtgattcaaacaaggttagtactactaac
gagacgaccacgataaatggcaaaatggttgaaaaaaatatgactaagtcaggaaatttg
agcttattaaatagcgaaaagaatgataatgtaaaactaaaaaaaaaatctggatcacaa
aatataaaaaattcttcaaattcgcgaaaaggtcgtggtggaacaacctttggtgattca
aacaacattttgaatgataaaaataaaaatgatgatacacaaaatgataataaaaaaaat
aaaaaaacaaaaaaaataaaaacattgaatgaattaggtagtaaattaatattatttgca
cataacgatttaataatacattcattgatcgaatggaattataatccacatgatccagtg
gagaagtatgatattgacacactgacagaaatattttttaaagtaataaatgaatgtatg
aaaatatttaatatgatgagtaatgaagaaagtgtaatttatggatatggttttgctccc
attgatgaaaagttatcgattttaaataaaaataaaaatatggaaaatgttggaaaaaat
gaaaattctattttggggaccgaaataaataaagacaataatttagggggtgaaaataag
ttagaaaatgatcgattgtttgttgaatttagtccaattcttcttaaaaatcatataaat
aaaatagatgaaaaaaaaatagagttaataaaatttaatgattttaatatgtgtgtagat
acatattttagtaaaatggaattaacaaaatatgataagcatcaagaaatgaataaacgg
aaaaatgcacttacaaaaattgataaaataaaattggatcatgaaagaagaattgaagca
ttagaaaaggaggtaaatatattaaaaaagaaaatattattaattcaggcaaatgatgaa
tttgttggagaggcaataaaattgatgcgtgctgcaatttctacaagtgctaattgggaa
aaaatatgggaccatgtcaagttatttaaaaagcgtaaccatccagtagccttaaaaata
atgtctgtgaattttaacaattgtgaaattgaattattattgaatgaaggtgatacggaa
gagagtagtagtgaggattcttcaaaagaaaagggaatggaagaaaagaataaagcatgt
acagtgacaataaacttaaacaattctgtatatggtaatattgaagattatgaaaagtta
agaaaaaaagctgaggaaaaaattcgtaaaataaaaatgtcaacaaatgtagctataaaa
aaggttgagaagaaaaaaaaagataaagatacaaaacaaaaaggtaaacataaatccgtt
tttcagattcaaaaattaagaaaaatattttggtttgaaaaatttaattggtttttatca
tccgaaaattatttagtaatatctggaagagattcattacaaaatgagatattatttaga
cgatactttcaaaataatgatatatatgtacatgctgatattcatggtgcagcatcttgt
ataataaaaaatccgtataaagatataccaattcctgaaaaaacgctagctgaagctggc
caattagctatgtgtcgaagttcggcatggaataataaagtaataacatctgcttggtgg
gtgtactatcatcaagttagtaaaacagcacctactggtgaatatataaaaacaggttct
tttgtgatcagagggaagaagaattatttaccatatgctaagctagagatgggtctatcc
atcatatttcaagttaataaaaatgtggatgataataataaagaagatgcattaaatgat
gataaagagaatgacgaaactgttcatacaggaagtgacaatgattgccttgacaaggaa
aatggcggcagtgcaggtaaagtagcagctactggcaatgcagataaaatgacagctact
agcaacactgctgattgcgtaaatcatatgaacgattcaagcaattgtaaggagactaga
atagtaaataaaaacaattgtgtagtgggaaaaggtattgatttgcgagggacatgtaag
tattacttgggcagaaagcaaaataaaaaatatgcgaaaaataaatatattaggttaatt
ttaaaatgcttaaataggatagatttgttaaatgtttataaaaaaaatatgattagtaaa
ttagtaataagtgataagtacagaaaggaaattatttctatgttatgcaaactttgtttt
tccaacctatgtataaatatgaaaaatgatgagataaaatcattttttgaatttttatat
aaaattaaaaatcatgacaatatacaatgttatatatgtcaaacatttaagaagaattat
aagatagctttatcaggaatattcaaattgtttaggcatttatttttatatttcgatagc
tcaaataaatttagcggtacatgtatagggggtattttttttaataaatgtttaaagagt
tttgatagagcaattaaaaaattaatgaaagatagtatttctttttattttgttcataaa
atggttttattaaaaagttgtgataaaaaaataagagaatggggcaaggatgagtttaat
acattttttgacataaataaaaataataattttataaaaaatgaaaaatatttattttat
aataataatgtggatacattagtatgtgccatgaaaaatcagattgatgaggaaataaaa
ctcgatatgatgaatgaaaaagattatgtatttgataataaaacaatgaaattatgtttt
acgccttgtgaagtatatggcttacctcctgtagcttttaaggacgatgatataaatgat
gatgaatcaaagaattcaaaaaaaggtggatcatcaaataaagtagcattcaattctggg
gataatgataaggaggatggacaaaagaaacatatttcatttgcaaatgtcgaaaattcg
ataaaaatagagcgacccacaagaactaggaaaccaactggctttgtaaaaatggatata
aaaaaacttcttgaagaaattgacaatgaagaagaggaggaagaaggtgatactcataat
gaattgaaacgagaagatatgaaggttacctttgacgaacaaaaaaaagtgcctgtcgaa
aaaaaaggtgtagcgtttaatcttgagaataacagtgttgataataaaagttctacactg
aatattccaaggcctacaagaactcgaaaaccaactggttttgtaaaagcagatctctca
aaattgcttgaagagatagataatgaagaggaaggtgaagaaaaaagcgaagctgatggt
agtagccaaaaaggaacattaaattcgaatagttctacaacaaatgttagaaaaaagagt
gtttcatttagttcagaagatgatcgtatttatattgagaggccaataacatcaggtatt
cccccaagacccgttaggactagaaagccaactggttttataaaaatggatattagtaag
ttgcttgaagaaatagataacgaagaggaaaatggtgagaatgagaaggatgaggatgaa
aaaagtgatgacacaaaaaaggtaaaattcagtgaaggtgtcgaaaaaaatacgaatgat
gaaaatataaagaacttttcaaggccagttaggactagaaaaccaactggttttgtaaaa
atggatgtaaaaaaacttcttgaagaaattgataatgaagaggaggaggatgatgaaaat
agtagcacaggaaagggggcttatgttgaaaatagcggtaattcagaagaggaagaaaat
agcgaaaattcagaagaagaagaagaagaagaagaagaaagtgaaaattcagaagaggag
gatgaaagtgaaaattcggaagaggaggaagaaagtgaaaactcggaggatgaggaggaa
agcgaaaattcagaggatgaaggaagtggacaaaatagtggatatggaaaaactgattat
aaaggaaatatggagagagttaatgaaagtgattcaaataaaaaaagcccaaatgaaaca
aacaaagaaggaagatttaatgataaattagttaaaaatgaaaataaaagtacggttcat
ttactaagaggggctcgaacaaaaaaaaagcgaatgaaaaaaaagtatcgagagcaagat
gatgatgatgaggaaaggcaattatatatgaaaataattggatctcgaaagatgaagcat
gaaactgaaaagcaaaaaaaagaaaaggaagaaaacaaagtagagaaggaagaaaataaa
tacaataagcgcccaaacgaacttaaagcgaattatgaggaaataaatgaagatgaaatg
aatatgaagttaagcgaattaaataaattgacatttacaccaaaagaaggggatgttata
acatgcgcaattccgatgtgtgcaccttattctgctatacagaaccataagtataaagta
aaattggtcccaggaaatgcaaaaaagggaacaattgccaaatcatgcatttcgcatttc
ttaaaatgttcaactagtgagatagagaaaaagttcattaatgggatatcaatggacgat
ttgggaaactgcataataacaaattcaacaaccgacctattgagttcaaagtttcgttaa
DBGET
integrated database retrieval system
