Prosopis cineraria: 129318005
Help
Entry
129318005 CDS
T09047
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: putative disease resistance RPP13-like protein 1
Organism
pcin
Prosopis cineraria
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
NB-ARC
Rx_N
LRR_4
LRR_8
AAA_22
AAA_16
DUF3420
nSTAND3
AAA_14
PTPA
RuvB_N
AAA_18
DUF863
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
129318005
NCBI-ProteinID:
XP_054818467
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1262 aa
AA seq
DB search
MEFAAKVGEALLSASVQTLLDRINSSEFRDFMKNRKLNVSLLDEIKTTLLMLDAVLNDAE
QKHITNHAVKKWLEELKDAVYDAEDLLDEINTESLICKVEQDSQNVANKVRSFFSSSFGE
FNRRMNSKLVATSQRLKHFAKQKDILGLQSVSLRVHKTPSTSLVNESDVVGREDDKDKLM
TMLLFDEDVKGNDIGVITIWGMGGLGKTTLAQLIYNDEKVQEHFDLKAWACVSDDFNVLE
VTKNLLESVTSRVYDSKNLEFLRVELRNSLSNKKFLIVLDDLWNEKYSHWDDLVTPFHSG
RRGSRIVVTTRQKRVAEITHTFPVHELSPFSDDNCWCLISNHALRNEDLNKHLELEVVGK
KIARKCDGLPIAAKTIAGLLRSKVDAKEWNKILNSNQWDIPNDDVLPALHLSYVYLPSHL
KKCFAYCSIFPKDLLLKTKKLVLLWMAEGFIXQNSHGEKALETEANDNFNELLSRSLIQQ
VKGNPRKFIMHDLINDLAKFVSGKSCLQFEGNEISKTTRHLSYPQKSYNGSKNFESFFYL
NCLRTLLSQSEFSGSPSCYLAKKVPQDLLAKLRCLRVLSFSRYKNIIEVPNIIGTLQHLR
YLNLSYTSIGRLPNAVFTLYNLQTLLLSNCMCFNEIPGKIEKLINLRHLDISGTALKGMP
AQISKLQNLHNLSNFMVGKQPNGLGIKELNMLPHLQGKLSLSRLENVVDSMDALAANKDK
IEELELEWNCDAQDSETVKNVLSMLQPSTNIQRLTINNCGGTNFSDWVADSSFMNITFLL
VSDCKYCLSLPSFGQLPLLKELLIIRMALIQIVGQEFYCSGGEASSFHPFPSLEILEFRD
MPIWEEWTLFDGEGAKFPFRYLRHLGLYDCPMLKGDMPDNLPSLTKVFISNCKRLEAKST
DLQWIASIEKLYIKQGEHGLRDLDNCSLDSLKYLRIEKCDSLRSLPKMIMGSYFLVKLSL
IDIPLTLSFPIDGLPTSLQQLKIENCEKLEFLSQESRQTFTSLKDLNIHNSCHSLTSFSL
GCFPKLKRLGISNCHNLETFIYVGGSALPLESFQVKDCKKLRSMSEVHIDSLTNLQSFYL
IRLPNLESLPHYGLPSNLRFLEVSGCEGLSSIPIEDWGFQQLTSLSTLHIEGDGSETMLH
NLLNNQLLPKSLVHIYIYDFSNLKRLDRKGLRHLISLEELTVWNCSNLESLPEDVLPPSL
LLLDIIGCPKLEERYNFEGGKHLSKISRIPTIRINGEFYDPCDSVLLQMVSEDEEAVKKR
HT
NT seq
3789 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggagttcgctgccaaggtgggagaagctttgctatctgcttcggtgcagaccttacta
gatcggatcaactcaagcgagtttcgagatttcatgaagaatagaaagctgaatgtctct
ctcttggatgagataaagacaactctgctgatgcttgatgctgttcttaacgatgcagag
cagaagcatatcaccaatcatgcagtcaagaagtggcttgaagagttgaaagatgctgtc
tatgatgctgaggatttactggatgagatcaacactgagtctctcatatgcaaggttgag
caagattctcaaaacgtcgctaacaaggtgcgatccttcttctcttcttcttttggtgaa
tttaacaggaggatgaactccaagctggtagcaacatcccaaaggcttaaacactttgca
aaacagaaggatatccttggtttgcaaagtgttagcttgagagtgcataaaacaccttca
acttcattggtaaatgaatccgatgtggttggtagagaggatgataaggacaaactaatg
acaatgcttttgtttgacgaagatgtaaagggtaatgacataggagtgatcactatctgg
ggtatgggagggttggggaaaaccacccttgctcaactcatttacaatgatgagaaggtg
caggagcatttcgatttgaaggcttgggcatgtgtttcagatgattttaatgttttggag
gtgacaaagaatcttcttgagtccgtcacttcaagagtctatgacagtaaaaatctagaa
ttccttcgtgttgaattaagaaatagcttgagcaataaaaagtttttgattgtgttggat
gacctatggaatgagaaatatagccattgggatgaccttgtaaccccatttcatagtgga
agaaggggaagcagaatcgtcgtaacaactcgccaaaaaagagttgctgaaatcacacat
acctttcctgtacatgaattgagtcccttctcagatgataattgttggtgtttaatatcc
aatcatgcacttagaaatgaagatcttaataagcatctagagctagaagtagttggcaag
aaaattgcaagaaaatgtgatggcctacctattgctgccaaaacaattgcaggtcttttg
cgttcaaaagtggatgcaaaggaatggaataaaattttgaatagcaaccaatgggacata
ccaaatgatgacgttctacctgctctacatttgagttatgtttatcttccatcacatttg
aagaaatgttttgcttattgctcaatttttccgaaagatcttttgttgaagacaaagaaa
ttggtcttgctatggatggctgaaggctttatataacaaaactcccacggggagaaagcg
ctagagacagaagcaaatgacaattttaatgaattgttgtcgaggtcactcattcaacaa
gtgaaaggaaatccaagaaagttcattatgcatgatctcatcaacgatttagccaaattt
gtgtctggcaagagttgtcttcaatttgagggtaacgaaatctcaaaaacaactcgccat
ttatcatatccccaaaaatcatataatggctcaaaaaattttgagagcttcttctatcta
aattgtttgaggactcttctctcacaatctgaatttagtgggagtccatcatgttatttg
gccaaaaaggtgccacaggatttgttggcaaaattaagatgtctaagagtactatctttc
tcaaggtataaaaatatcattgaggtaccgaatataattggtactttgcaacatttgcgt
tatctcaacctttcttacacttcaattggtaggttgcctaatgcagtctttacactttac
aatttgcagactttacttttatcaaattgcatgtgttttaatgaaattccaggaaagata
gaaaagcttattaatttacgtcacctagacatcagtggcactgctttgaaagggatgcct
gcacaaattagcaagctacaaaatcttcataatttgagtaattttatggtaggcaaacaa
ccaaatggattagggattaaagagttaaacatgctccctcatttgcaaggtaagctttcc
ctctcgagactagaaaatgttgttgactcaatggatgctttggcagcaaacaaggacaaa
attgaggagctagagttggaatggaattgtgatgctcaagattcagaaactgtgaaaaat
gtactcagcatgctacaaccttcaacaaatatacaaagattgaccatcaacaattgtggt
ggcactaacttttcggattgggtggcagattcttcattcatgaatattacatttttatta
gtgagtgattgcaagtattgcttgtcactcccatcgtttggacaattacctttgctcaaa
gagctcttgattataaggatggcattaatacaaatagtcggacaagaattctattgcagt
ggaggagaggcctcttcatttcacccatttccatccctagaaattctagaatttagagat
atgcctatttgggaggaatggacattgtttgatggtgaaggtgccaaatttccttttcgt
tatcttagacatttgggtttatatgattgtccaatgttgaaaggagacatgcccgacaac
cttccatcattgacaaaggtttttatctcaaactgcaaacggttggaggcaaaatcaaca
gatttgcaatggattgcatctattgaaaaattatacattaagcaaggggaacatgggttg
agagatcttgataattgttctttggattctttaaaatatctaagaattgagaagtgtgat
agcttgcggtctttgccaaaaatgataatgggtagctattttcttgtaaagttgtctctc
atagatatcccattaaccttgtccttcccaattgatggtttgcccacttctttgcagcaa
cttaaaattgaaaattgtgagaaattagagttcctatctcaggaatctcggcaaaccttc
acctcacttaaagacttgaatattcataacagttgccattccttgacatccttttcatta
ggttgttttcccaagcttaaaaggcttggcattagcaattgtcataatttagagaccttt
atatatgttggggggtctgctcttcccttagaatcctttcaagtcaaagattgcaaaaaa
cttaggtcaatgtcagaagtacacattgattcccttaccaaccttcaatctttttattta
ataaggcttccaaatttggaatcattgcctcattatggtttgccttctaatttacgattt
ttggaagttagtggctgtgagggactctctagtataccaattgaagattggggttttcaa
cagttgacttctctctcaacattgcatattgaaggtgatggaagtgaaactatgctccat
aatttactaaacaatcaactactacccaagtctcttgtgcatatctacatatatgatttc
tctaatcttaaacggttagatagaaaagggcttcgacacctcatatctcttgaagagctc
accgtctggaactgttcaaaccttgaatccttgccagaagatgtgctaccaccctctctt
cttttgctagatatcattgggtgtcctaaattagaagaaagatataattttgaaggagga
aaacacttgtccaagatctctcgtattccaaccataagaattaatggtgaattctatgat
ccttgcgatagtgtattgcttcaaatggttagcgaagatgaggaagcagtcaaaaagaga
catacatga
DBGET
integrated database retrieval system