Clostridioides difficile 630: CDIF630_03565
Help
Entry
CDIF630_03565 CDS
T03885
Name
(GenBank) two-component sensor histidine kinase
Organism
pdc
Clostridioides difficile 630
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HisKA
DUF948
HATPase_c_5
HATPase_c_2
7TMR-DISM_7TM
HATPase_c_3
NRBF2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJP13039
LinkDB
All DBs
Position
complement(3807794..3809770)
Genome browser
AA seq
658 aa
AA seq
DB search
MIVSLLAITGLNLLYKYDNKYTYKSIRASNGILTIDNDTFTKGKLVFLIDDWEFYNHKIF
KPNDFTEQDIKPEYVFIGQYPDFSMRKGNQSPYGNATYRMRIKNEGKDKLLSLELPEIFS
ASEVWINGEMVSKLGDVGTEKYRPKIKNSVVSFIAKKNTEIIINVSNFSHYYSGLYYPPA
LGETKDISNMMFYRLLFYSIICFTTFAIAIFSLSVWFLSNKSKIYLYFGCMCVFFAIHVS
YPFVHLLGLPLVSFTYAVEDLSYFMVVLCIICINGSISKIEENKVYRFLILPLGITMSII
SIVIPIILLPYDMYFVNIYGKLIDIYKYIVFIYILMSSLVSIYKKTCSEHISSYILVSVN
TVFGISILFDAVTSNRFEPIFTGWQTEYCGFVIVILFSVMMINRNRIIIKENEKLTRNLE
HEVEVRTNELTTLLNERKRFLADVAHDLKAPVSAIQAFIDLIKVGNIHVDEETRTYLYAI
NQKSNEVQNRVRSLQEFTSQDKSIGISEKICLNNFIKEIYENNLPDTQACGVNFETYVLE
KKIYAKINKEMLTRAFENLIYNALTFTPFDGKIILSMDKEDGFAIIKISDNGKGIPPENI
PKVFDRFFTERDNNEPKGQGLGLYIVKSIIREHGGEIFVDSELGKGTVFTIKLSLCFL
NT seq
1977 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatagtctctctgttggcaataacaggattaaatcttctgtataaatatgataataaa
tatacatataagtctattagagcaagtaatggaattttaactatagataatgatactttc
actaaaggtaaacttgtctttttgatagatgactgggagttttataatcataaaatattt
aaaccgaatgattttacagagcaagatataaaaccagaatatgtttttataggtcaatat
ccagatttttctatgagaaaggggaatcagtcaccatatgggaatgctacttatcgtatg
agaataaaaaatgaaggcaaggataagctactaagtttagagcttcctgagattttttcc
gcaagtgaagtatggataaatggagaaatggtttctaaattaggagatgtaggaacagaa
aaatatagacccaaaattaaaaattcagtagtaagttttattgcaaagaaaaatacagaa
attataatcaatgtatcgaatttttcacattattatagtggtttgtattatccgcctgca
ttaggagaaacaaaggacataagtaatatgatgttttatcgattacttttttatagtata
atttgcttcacaacttttgcaatagctatattttcattgtctgtatggtttctttcaaac
aaaagtaaaatttacttatattttggatgtatgtgtgttttctttgccatccatgtatcc
tatccctttgtacatttgttaggactgcctttggtaagctttacatatgcggttgaagat
ttgtcatattttatggtagttttatgtattatttgtataaatggaagtatatccaaaata
gaagaaaataaagtgtatagatttttaattttaccattaggaattacaatgagtatcata
tctatagtgataccaattattcttcttccatatgatatgtactttgtcaacatatatggg
aagttaatagacatatataaatatattgtatttatatatatattaatgtcttcgctggtt
tcaatatataaaaagacatgctctgagcatataagttcttatattttagtttcagtaaac
actgtttttggaattagcatattatttgatgcagttacgagtaatagatttgagcctata
tttacagggtggcaaacagaatattgtgggtttgtaattgttattttattttctgttatg
atgataaacaggaatagaataataataaaagagaatgaaaaacttacaaggaatcttgaa
catgaagttgaagtgagaactaatgaacttacaacattgttaaatgaacgtaaaagattc
ttggcagatgtagcacatgatttaaaggcacctgtttcggctatacaagcatttatagat
ttgataaaggttggtaatattcatgtagatgaagagacaagaacctatctttatgctata
aatcaaaagtcaaatgaagtacaaaatagagtacgtagtttgcaagaatttacatcacaa
gataaaagcattggtattagtgaaaaaatatgtctgaataattttattaaagagatatat
gaaaataatttgccagatacacaagcatgtggtgtaaactttgaaacttacgtattggag
aaaaaaatatatgcaaagataaataaagagatgcttacaagagcatttgagaatttaatt
tataatgctttgacctttactccatttgatggaaagataattttatcaatggataaagaa
gatggatttgcaattattaaaatttctgataatggaaaaggtatacctccagaaaatata
ccaaaggtatttgacagattctttacagaaagagacaataatgagccaaaagggcaaggg
ttagggctatatattgtcaaatccattataagagagcatggtggagaaatctttgtagat
tcagaactaggaaaaggaactgtttttacaataaaattaagtctatgttttttataa
DBGET
integrated database retrieval system