Parabacteroides distasonis: BDI_1146
Help
Entry
BDI_1146 CDS
T00549
Name
(GenBank) putative capsule polysaccharide export protein
Organism
pdi
Parabacteroides distasonis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SLBB
Poly_export
JmjC_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABR42909
UniProt:
A6LB45
LinkDB
All DBs
Position
complement(1324654..1327032)
Genome browser
AA seq
792 aa
AA seq
DB search
MNLSFKNVLCVCCLLLSGSVYAQVPQDLIDKAKAAGMSDTQIQQELAKRMKQEGGSVGSQ
ATATDAKVSDRVMPVIDEGQSLEAQRRNNLPASAMENTVFGHEIFSNKNLSFAPDLNIPT
PKDYVLSAGDELLINVWGDSELNLKLKISPDGTILVPNLGPVSVSGLTIAGAETRLRQEL
SQIMSTLSGSGEGNTFVSVSLSQIRSMKVNIVGEVVAPGTYTLPSFATLFNALYAAGGVN
KIGSLRSIKVYRNSKEIANLDVYDYLLNGKYTTNVRLEENDMIMVGPYDQLAVVRGKVKR
NRIFELRKGETLKQLLDMAGGFTGDAYTKDVQVKRKSDSRYQISTVSEDKFASFVMQDGD
SLQVDSVIPFYENRLVVTGAVWRPGEYELSPSVRTVKQLVKQAAGLKGDEFAGRALITRL
NPDFTTTMIAVDIRGILNGTAPDVELQAEDQLSIPSLFDLREPYTIKVGGAVNYPDTVLP
YRHNLTIEDAIMMAGGLRESASSINVEVARRVKDPSSNQNVNRIADVYNFSLSEDFKLNA
GDTIFTLEPFDEVYVRFSPGYHEQQVVKVNGEITFAGSYVLATKNARLSDIIAKAGGVTP
ESYVKGASLKRQLTEDELKRMETLLALSEANKQSRDSIGVALMNVKDYSVGIDLEKALAN
PGSIDDVVLRDGDELYIPQMQSTVKMSGAVTYPNSVTYTKGMSVMDCLSQAGGYNDIARK
YPIVIYMNGKVATTKRTAIFFKRYPKVEPGCEIVVPTKTQRERRSLAEIMSISSSATSMA
AMITSIVNMIKN
NT seq
2379 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttatcgtttaagaacgtactatgcgtatgttgcttattgctgtcgggatctgtg
tatgcgcaggttccgcaagacttgattgacaaggcgaaagccgctggaatgtcggatacg
cagatacagcaggaattagccaagcgtatgaaacaagaagggggatctgtcggatctcaa
gctaccgctaccgatgcgaaggttagcgaccgggtaatgccggtaatcgatgaaggacaa
tccttagaagcccaacgtagaaataatcttcctgcttcagccatggagaataccgtattc
gggcatgaaatcttctcaaacaagaacttatcttttgccccagatttaaacatccctaca
cctaaggattatgtgctttccgctggtgatgagttattgattaatgtatggggagattcc
gagctaaacttgaaattaaagatctctccggacggtacgatccttgtaccaaatttaggt
ccggtgtcggtcagtggattgacgatcgctggcgctgagactcgtctgcgtcaggagttg
agccagattatgtctacgctgtctggttcgggagaggggaatacctttgtttccgtcagt
ttgagccagattcgtagcatgaaggtgaatattgtcggcgaggtagtcgctcccggtacg
tatacattaccttcattcgccacattatttaatgcgttgtatgccgccggtggtgtgaat
aagattggttctttgcgtagcatcaaggtatatcgtaatagcaaggaaatcgctaatctc
gacgtatatgattatttattgaacggaaagtacacaacgaatgtccgtttggaagagaac
gatatgattatggtaggcccgtacgaccagttagcggtggttcgaggtaaggtgaaacgt
aatcgtattttcgagttgcgcaagggcgagaccttgaagcaattgctggatatggctggc
ggatttaccggcgacgcttatacgaaggacgtacaagtgaagcgtaaatcagatagtcgt
taccagatctctacggtttcggaggataagttcgcttctttcgtgatgcaggatggcgat
tctttgcaggtagattccgttattcctttttatgagaatcgtttggtcgtgacgggagct
gtatggcgtccgggagaatatgagttaagtccgtcggttcgtacggtaaagcaattggta
aaacaggccgcaggtcttaaaggagacgagttcgccggccgtgccttgattacccgtttg
aatccggatttcacgactacgatgatcgccgtggatattcgtggtatcttgaacggtacc
gctccagatgtggagttgcaagcggaagaccaattaagcattccttccctattcgatttg
cgcgaaccttatacgatcaaggttggcggagccgtgaattatccggatacggtgcttccg
tatcgtcataatttgacaatagaagacgctatcatgatggcaggtggtttaagagagtcc
gcttcttctattaatgtagaggtagcccgtcgtgtgaaggatcctagttccaatcagaat
gtcaaccggatcgccgatgtatataacttctcgttgagtgaggacttcaagttgaatgcg
ggagatacgatcttcacattggagccgttcgatgaggtttatgttcgtttctccccgggg
tatcatgagcaacaggtcgtgaaggtgaacggcgagatcacttttgccggtagctatgta
ttggctacgaagaacgctcgcttgagtgatattatcgcgaaagcgggaggagttacccca
gagtcttatgtaaaaggtgctagcttgaaacgtcagttgacagaagatgaattgaaacgc
atggagacccttctggctttaagtgaggcgaataagcaaagccgggattccatcggtgta
gcgttgatgaatgtgaaggactattccgtaggtattgatttagagaaagcgttggcaaat
ccgggtagtatcgatgacgttgtgcttcgtgacggcgatgagctttatatcccgcagatg
caaagtacggtgaagatgagcggagccgtgacttatccgaacagcgtaacttacacgaaa
ggtatgtcggttatggattgcttgtctcaagccggtggttataatgatatcgcacgtaag
tatccgatcgtaatatatatgaatggtaaggtcgctacgacgaagcgtaccgctatcttt
ttcaagcgttatccgaaagtggagccgggctgtgagatcgtagttccgacgaaaacgcaa
cgtgagcgccgaagcttggctgagatcatgagtatcagtagctccgctacctctatggct
gcgatgattacctctattgttaacatgattaaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system
