Prunus dulcis (almond): 117619211
Help
Entry
117619211 CDS
T07328
Name
(RefSeq) disease resistance protein RGA2-like
Organism
pdul
Prunus dulcis (almond)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NB-ARC
Rx_N
LRR_4
LRR_8
LRR_1
NACHT
AAA_16
VirD1
LRR_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
117619211
NCBI-ProteinID:
XP_034204998
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1287147..1291553)
Genome browser
AA seq
1060 aa
AA seq
DB search
MAEGVLFNIAEGIIGRLGSLVLQEIALPWGVKDELRQLKDKVDSLRAVLLDAEQKQAKEN
EVKVWLESVEDAVYEADDVLDEFEARWRQMVPGNNKVSKQVCIFFSSSNQLVFGLKMGHK
IKDLNKRLHEIASNRTFLQLERNREDVEFVRRERVTHSFVPEGKIIGRDVEKGEIIQLLL
DLDPISTKNTENVSTISIVGFGGMGKTALAQFVFNDEKVQKHFEPKMWTCVSNSFQLDTL
VKKILIKTDMSYMDQLQNELRKKIDGKRYLLVLDDVWNENREKWLALKDLLMGGGKGSKI
LITTRSEKVAKITDTSQPYNLRGLSEEQSWFLFKKMAFQEGKEPESSTIKAIGEEIARKC
QGVPLAIRTIGRMLYTRDPETEWLAFKNNKLSTIRQEENDILPTLQLSYDVLPSHLKHCF
AYCSLSPPDYEIPVENLIRLWVAQGFVKSSNPNECLEDVGYEYYKELVWRSFFQEEEKDE
FGIIKSCKMHDLMNELAVKVAGEGSTRIDRNKTDFDAKRLLHVSFDFNVDSSEWKIPTSL
LESNKLRTFLFLSQNGWEMSFHKSFCATIASNFKSLRMLSLNELSVTKLPKCLRKMIHLR
YLDLSGNPIKRLPNWIVKLQNLETLDLSRCEYLVELPRDIKKLINLRHLILANCDNLAWI
PRGLGELTHVRTLNTFVLSENKSMLRDSAGLSELGKLKDLRGKLKIRNLWCEQDMVSELN
YDCAVLKEKRHLYSLALYWMDIERENNDAEESDVIIKSMEALQPHSSLKKLVVKGYPGVR
FASWFHSLTNIVNLKLSDCDRCQHLPPLDHLPFLKSLHLNELWNLEHISAEDMVKDFASD
ETMMMSAASPSTTFFPSLERLSLIDCPNLKGWWRNETASTSVSSFPCLSTLSICDCPNLT
FMPLYPNLDQLRLERSSWKVLLPSSFVLSKLKSLEITGVEDIEEGIGNLTLLEKLQINYC
PNLASLPDQGMGRLISLQELDIWDCPKLGSLPEGMGNLKSLQWLRIGYCPNLASLPEGLR
CLLSLKRLIIDGCPILKQRCQKETGEDWSKIAHIPDISID
NT seq
3183 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcagaaggagtcctcttcaacattgcagaaggaatcattggaaggttaggctccctg
gttttgcaagagattgcattgccttggggtgtcaaagatgagctccgacagcttaaggat
aaagttgactcactccgagctgttcttcttgatgctgagcaaaagcaagccaaggaaaat
gaagtcaaagtgtggctcgaaagcgtagaagatgcagtttatgaagctgatgacgtgctc
gatgagtttgaagctcggtggagacaaatggtgcctggaaataataaagtgtcaaagcag
gtatgcatcttcttctctagctcaaatcagcttgtttttgggctgaaaatgggtcataag
ataaaagatcttaacaagagacttcatgagattgcctcgaatagaacatttcttcagtta
gaaaggaatcgtgaagatgtagaatttgtaagaagagagagggtcactcactcgtttgtc
ccggagggtaaaataatagggagagatgtagaaaaaggagaaattattcaacttttgttg
gatttggatcccatctctacaaagaacacagagaatgtgtccaccatttccattgtggga
tttggaggaatgggaaaaactgcacttgcccaattcgtattcaacgatgaaaaggttcaa
aagcattttgagccgaaaatgtggacatgtgtctctaattcatttcagttggatacactt
gttaagaaaatcctaataaaaactgacatgtcctacatggatcagttgcaaaatgagctt
aggaagaagatcgatgggaagagatacctccttgtgttagacgatgtgtggaatgagaat
cgtgaaaaatggcttgccttaaaagacttgttgatgggcggtggaaaaggtagtaaaata
ctaataactactcgtagtgaaaaagttgcaaaaataaccgacacatctcaaccatataac
ttaaggggtttaagtgaagagcagtcttggtttttgtttaagaaaatggcattccaagaa
ggaaaagagccagagagttcaaccattaaggcgattggggaggagattgctagaaaatgt
cagggggttcctcttgctataaggaccataggacggatgttgtacactagagatccagaa
actgagtggttggctttcaagaataacaagctttcaacaataaggcaagaagaaaatgat
attttaccaacacttcagctgagttatgatgttctcccatcacatttgaaacattgtttt
gcttattgtagtttgtccccgcctgattatgagattcccgtagagaatttaattaggttg
tgggtggcacaagggttcgttaagtcttcaaatcctaatgagtgcttggaagatgttggt
tatgaatattataaagaactagtttggagatcttttttccaagaagaagaaaaagatgag
tttggtataataaaaagctgtaaaatgcatgatctcatgaatgaacttgctgttaaagtg
gcaggggagggaagcacaagaatagatcgcaataagactgattttgatgcaaaacgtctt
cttcatgtatctttcgatttcaatgttgattcatcggaatggaaaataccaacatccttg
ctggaatcaaataagctaaggacttttcttttcctaagccaaaatgggtgggagatgtca
ttccataagtcattttgtgctacaattgcttcaaattttaagtcattgcgtatgttgagt
ttgaatgaattgagtgttacgaaattgccaaaatgtcttaggaaaatgatacatttaaga
tatcttgatcttagtggaaatcccattaagagacttccaaattggatagtgaaacttcaa
aatttggaaacactagatctctcaagatgtgagtatcttgtggaattgcctagagatatt
aagaaattgatcaacttgaggcatctcattttggcaaattgtgacaacttggcttggatt
cctcgtggattgggtgaattgactcatgttcgtactttgaatacatttgttttgagtgaa
aacaaatccatgttgagggacagtgcagggctcagtgagttgggaaagctgaaggattta
agaggaaagttgaagatcagaaatttgtggtgcgagcaagatatggtgtcagaattgaat
tatgattgtgcagttttgaaggagaaacgacatctctattcgttggctttatattggatg
gacattgaaagagaaaataatgatgcggaggagagtgatgtaattataaagtcaatggaa
gcgctgcagccccattcgagtctaaaaaagttagtcgtgaaaggatacccgggtgtgagg
tttgcgagttggtttcattctctcacaaatattgttaatctcaaattgtctgactgtgat
agatgccaacatcttccaccgttggatcatttaccttttcttaagagtcttcatcttaac
gagttatggaatttggagcacatatctgcagaagacatggttaaagactttgccagtgat
gagacgatgatgatgtcagctgcttctccatcgacgaccttctttccctccttagagagg
ctttctctaattgattgccctaatctcaagggatggtggaggaatgaaacagcttcaact
tcagtttcttcatttccttgtctttctactttatccatatgtgattgtcctaacttgact
ttcatgccgctgtacccaaatcttgatcaactgcggttagagagaagcagctggaaggtc
ctccttccctcctcctttgttctctccaaattaaaatctctggagattacgggcgttgag
gatatagaagaagggattggaaacctcacattacttgagaagcttcaaattaattattgt
cctaatttggcatcactaccagatcaagggatgggtcgcctcatctccttacaggaactg
gacatttgggattgcccgaaattggggtcactaccagaagggatgggcaacctcaaatca
cttcagtggcttaggatagggtattgccctaatttggcatcactcccggaagggcttcgt
tgcctcctctcattaaaaaggttgataattgatggttgccccatcttaaagcaaagatgc
cagaaagaaacaggggaggactggtccaagattgctcacatcccagacattagcattgat
tga
DBGET
integrated database retrieval system
