KEGG   Pedobacter sp. KBS0701: FFJ24_021105
Entry
FFJ24_021105      CDS       T06361                                 
Name
(GenBank) SusC/RagA family TonB-linked outer membrane protein
Organism
pek  Pedobacter sp. KBS0701
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec CarbopepD_reg_2 Plug CarboxypepD_reg OMP_b-brl_3 CooC_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: QDW27189
LinkDB
Position
complement(5227800..5231036)
AA seq 1078 aa
MKKLLQSLFILLFVASAAMAQERTITGTVTSSDDKLPIPGVSVKVKGTQAGTITDANGKY
SIKIATGTTTLEFSYIGYIAETKAVGTSNSINVVLVSDSKVLSDVVVTANSISRDKRSLG
YSAPTLNNTELTSGGSPSAISSLAGKVAGVNVTSTSNTPGSSARVVLRGGSSISGSNQAL
IVVDGVPIDNSSVIGGASVLSSVDFGNRGNDLAADDIESVTVLKGPAAAALYGSRASNGA
LIITTKKGSKEKATITFTTSNTFSNVVKLPDLQNEYGQGYYDVVAPDGKSATFVTDLKEN
GSWGAPFTGVVQGWGQQIDGVRLTKPYSALPNNVRDFFDTGFATDNSVSISGGGKSTTFY
LGINALSSDGVFPTNKDKYNKYGVRFNGTADLADKLTAGISFNYNRIDANQVGGGQGAAS
VFNNVLQTARDIDLPALRDLNNKYYGYGYTDAAGIPHPNSYGYYGTYTQNPYWVLENFAN
YDDVSRVTGNFNLNYKPLKWLDIQERVGIDTYSDRRRTISPKYSFVDIDQTAEYAGNNTR
TNVGAYQIDQYNVTELVHDFMVTAKHQFNEDFEGSLMVGNNIRQRGTNTLSSATNTSGGL
VVPGWYNLSNSNGPINIIADNLSKRRLIGLYADLNLSYKNFLFLEATARNDWSSTLPKSN
NSFFYPSVSGSFVFTELLKDSPVSSVLNYGKLRSSWAQVGNDTDPYQLLSTYGKTTINGS
FGSTVFPFGNVAALTPGSTLGNVNLKPEITTAFEIGADLGFLNNRITIDASYYKSNSKNQ
ILAIPIPNSTGYGFSVVNAGEVQNKGVELSLRGTVLKSADFEWGLYGSFTKNNNKVVSLM
PGIDQFVVGGFSGMSIVAAVGKPYGEFYGVTTLKDDQGRTVVDKTTGMPLSTSKAEYLGN
YNPKYQASWGTSIRYKQLSLNVLFDTKQGGKFYSRTRSTLAFVGASAETGGNRFGEIWPN
SVYQDASGAFVPNTTVGYVKQDYYGGSLPAGFGIVDGSFVKLRSASLSYAFNKAQLKRLP
FSSIAVGLYGNNLFMWTASENQFADPEINSAGAGNTQGFDFTAQPSVRNYGINLKVTF
NT seq 3237 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaaacttctacaaagtttgttcatacttttgtttgttgcatctgctgcaatggct
caagaaagaacaattactggtacggtaacttcttcagacgacaagctgccgatacctgga
gtaagtgtaaaagtaaaaggtacccaagcaggtactattacagatgctaatggaaagtat
tccattaaaattgctacaggtacaacaacattagaattctcttatataggttacattgcg
gagactaaagctgttggcacttcaaattcaattaatgtagttttggtatccgattcgaag
gtactaagtgatgttgtcgtgacggcaaactccatttcaagagataaaagaagcttaggt
tattctgctccaactttaaacaatactgaattaacttctggtggaagcccaagtgcaatt
agttctctagcgggtaaagtggctggtgttaacgttacttctacttcgaatactccagga
agttcggcgagagttgtactacgaggtgggtcgtctatttctggatctaaccaggcgtta
atagtggttgatggggttcctatcgataactcaagtgttattggtggagcttcagtattg
tcgagtgttgattttggtaaccgtggtaatgatttagctgctgatgatatcgagtctgta
acagtgctaaaaggccctgctgccgctgcactttatggttctagggcatccaatggtgct
ttgatcattacaaccaaaaaaggatcaaaagaaaaagcaaccatcacttttactacatct
aatactttttcaaacgtagttaaactacctgatcttcaaaatgagtatggtcaaggttat
tacgatgttgttgctccagatggaaaatctgctacgtttgtaaccgatcttaaagaaaac
ggaagctggggtgctccatttactggagttgttcagggatggggacaacaaattgacggt
gttagattaacaaaaccttactctgctcttccaaataatgtccgggatttctttgataca
ggctttgcaacagataatagtgtcagtatctctggtggtggaaaaagcactaccttctat
ttaggcattaatgcacttagttctgatggagtatttccaaccaacaaagataaatataat
aaatacggcgttagatttaatggaacagctgatttagctgacaaacttacggctggaata
tctttcaattataatagaattgatgctaatcaagttggaggtggtcaaggcgctgcttct
gtttttaataatgtgttacaaactgccagggatattgatttacctgcattaagagattta
aataataaatattatggttacggttataccgatgcggcaggtattccacatcctaattct
tatggatattacggaacttacactcaaaatccatactgggtactagaaaattttgcaaac
tacgatgatgtgagcagggttacaggtaactttaatttaaattataaaccattaaaatgg
ttggatattcaggaaagagttggtattgatacttattcggacagaagaagaacaatatct
cctaaatatagctttgttgacatagatcaaactgcagaatatgcagggaataataccaga
accaatgttggtgcctatcaaatagatcaatataatgttaccgaattggttcatgatttt
atggttaccgctaaacatcaatttaacgaggattttgagggatcgttaatggtgggtaat
aacatcagacaaagaggaacaaatacacttagttctgctaccaacacatctggtggttta
gtagttccagggtggtacaatttgtcaaacagtaatggtccgataaatattattgcagat
aatttatcaaaaagaagactaattggtctttatgccgatttgaacttatcttataaaaat
ttcttgtttttagaggctacagcaagaaatgactggtcttcaacattaccaaaaagtaat
aattcattcttttacccaagtgtaagtggctctttcgtttttaccgaattacttaaagac
tcgcctgtatcaagtgttttaaactatgggaaattaagatcaagctgggctcaggtgggt
aatgataccgatccttatcagttgctatctacttatggaaaaacgactataaacggtagt
tttggaagcacggtctttccttttggtaacgttgccgccttaacaccaggttcaacctta
ggtaatgtaaatcttaagcctgaaattaccacagcttttgaaattggtgcagatttaggc
ttcttaaataacaggatcacgatagatgcaagttattacaaaagcaattctaaaaatcag
attttggccattccgattcctaactcaacaggttacggatttagcgtagttaacgcgggt
gaagttcaaaataaaggtgtggagttaagcttaagaggaactgtattaaaatctgctgat
tttgagtggggtttatacggatcatttactaaaaacaacaacaaagtagtttcactaatg
cctgggattgatcagtttgtagtgggtggattctctggaatgtcgatcgttgctgcggta
ggtaaaccatacggtgagttttatggtgttactacattaaaagatgatcagggaagaact
gttgttgacaaaacaacaggtatgccgttgagtacttctaaagcagaatatctgggcaat
tacaatcctaaatatcaggcttcatggggtactagtattaggtataaacaattgtctttg
aatgtcctgtttgatactaaacaaggtgggaaattctattctagaacaagatcaacgtta
gcctttgtcggtgcttccgcagaaaccggtggaaatagatttggagaaatctggcctaat
tctgtttatcaggacgcttccggggcattcgttccaaatacaactgtgggttatgttaaa
caagattattatggtggtagcttaccagcggggtttggtatagttgatggctctttcgta
aaattacgttctgctagtctttcttatgcctttaacaaagctcagcttaaacgcctgcca
ttcagttctatagccgtaggtctttatggaaacaatttatttatgtggacagctagtgag
aatcagtttgctgacccagaaattaactcagcaggtgctggaaatactcaaggatttgac
tttactgcgcagccatcggttcgtaattatggtatcaaccttaaagttacattttaa

DBGET integrated database retrieval system