Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_1019300
Help
Entry
PF3D7_1019300 CDS
T00095
Name
(RefSeq) zinc finger protein, putative
Organism
pfa
Plasmodium falciparum 3D7
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
zf-CCCH
zf_CCCH_4
zf-CCCH_4
zf-CCCH_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
810344
NCBI-ProteinID:
XP_024329095
PlasmoDB:
PF3D7_1019300
LinkDB
All DBs
Position
10:complement(join(774929..779997,780164..780256,780361..780503,780719..780732))
Genome browser
AA seq
1772 aa
AA seq
DB search
MHRFKIYKIQMCKYALINKCDRGENCTFAHDINELRIKPDMRKTKLCKSYILGKCTDNNC
IYAHSVNELREVGKPAICQLHREGRCIKGNQCRFAHSINDINTKLVKFYGSKVDIDVDEE
IVQGKIHSKNISNINNSCINILNKSKSQMMNKIKGYENEEIEKNEFINIQNMKNNNSNKK
DIYNFQMHVNNININDNEYTSSVNIPNDILIKHKNNNNDDIINRANLVLHKNITGGDIYH
NNNCKLNICKIYNNNNNAGNEKNEENILNISHVKKNTKLCSLNIKNEPIQQVNDFLLYNN
NILEYKKEQKNYFISPQNIINNEYDGCNFNDMLNNNCKSLNVHKSICLDKSNMNIDEEYF
DMKEKTMENEELINNSYVKNKDNMNKINNMETRLRKNIIIQPKKKKDLTYVNTINSDNNM
KHMYDMKCPKINVSNMVRFNVENELRKIQDCNKRRPQLSSLENIITERGYLCKQNDDKYL
LNVVGAINKYEDICEDICEDICEDICEDICEDICEDICEDICEDICEDICEDICEDMCED
ICEDNNLSRKNMFITILENENKNTDDYRVNDDSNTCVINFVECINKENQNVITEKGKTNT
RDDDNSKGNNNDEIINNNTTTTKNNDNNNDNNNNNNNNNFMHSNDYIYCNNVVKNVTHLN
TNDSFVYSKEEYNISSDEDNLMNQQNVNKKKNINNEKEFSNEFNINYGSHSKVQQDIYNI
NCVNQTNGVNNIKHTNNIYSDHGYNIEFIKNNDKQYYDENNRNSSNLVQMINKQKEKDRG
DEESNRDINLKENNNDDGNLIIYYDDDGDQCYDNNGCTTNLHDESIKEKNLSDVPFEKIN
ENLNYKNHNDDMMNPLNFCNKKTDNGFEYIENLYFQKINDYTTNGITKDMKNNKKRNTNK
LFTCKELFPKNKEYFILNKNESKHLVGYNISNDDNKIKVNMYPYKDTKLNALHNYICVIS
PKNDNNNINCGEKICNHNNMLLNNSKTSNNNEGCPFSYMNIKSLSTHNDNRNYDKNINPE
DLSNLTDVKEPLQHALWMNNNANTNININSNHNPNHNSNNNNYYYHSFYNNDHVDYNYNI
NNVNKFDNFKTYNMYPNENNPIEVESNSEMILVHTNNNDSTNVFNQALIKNKKNENVVQV
DAHQMVLNNVTELADNVSRDMCRGEIIQDETTYQEDNKKVDDNNIYNNDIYNNDIYNDDI
YNNDIYNNDLYDNNMYDNNLYDNNLYDNKLYDDDLYTSSINNPGELIKNGENNSVNLKNN
KVINSYEEFKKYDHMNNNMTDIYQSNYPLYSTNQEKETTDSNPEKINYRLLEERKKKIYL
NNYYNMIKSVDRDNYIYNVPFVSTIINDNNVRYNNEFVNMKERKSNNVSTSTITNTNTNT
NTNTNTKTNIYTNIEKCNSFNSMELLIEKEHTLQNTMNKMNNLKNDQNNFCHMKDTQSWI
NNKYFNEEKDNYKILGQEEKNISTNEDNEIVYIDTYNNNYNNNNNMNRFYDNNTLWKKQQ
RNMMNEKKTTMYNFNYKNMSLDNIEREDQSVCENDNYQKHISSYLINKQNDIIYKNHPKN
NNNNNNINNNNNNNNNNSSNNLSWNTFHKNNTFDTHTNSFNILNHHSNNNDFDNIENIIT
SNMMNNLENANLQNNVTNKCFQSNEEKKKFQSHGYKNDNMLLNNTYFNNKNCFSYDSIKK
NDYNLLETSSNHTSTFLNYDLYRTDSIYIGPNSCENNNPSPNVINKKKNTDFYKTTLAQK
KKFLNYDDENIEQDNFMDIPNNLNFSFLNKND
NT seq
5319 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatcgattcaagatatacaaaattcaaatgtgtaaatatgcactgattaataaatgt
gataggggggaaaattgtacgtttgcccatgacataaatgaattaagaataaaacctgac
atgcgaaaaacaaaattatgtaaaagctacatattaggtaaatgcacagataataattgt
atatatgcccattctgttaatgagctgagagaagttggtaaaccagcgatatgtcaattg
cacagagaaggacgttgtattaaaggaaatcagtgcagattcgctcactcaatcaacgac
ataaacacaaagcttgttaagttttatggatctaaagtagacatagatgttgacgaagaa
atagttcaaggtaagattcatagtaaaaatatatctaatataaataatagttgtataaat
atattaaataaaagtaaatcccaaatgatgaataaaataaagggttatgaaaatgaagaa
attgagaagaatgaatttataaatatacagaatatgaagaataacaatagtaataaaaag
gatatatataatttccagatgcatgtgaacaacataaatataaatgataatgaatatact
tcctctgttaatatacctaatgatatcttaattaaacataaaaataataacaatgatgat
attataaatagggctaatttagttcttcacaagaatatcacgggtggtgatatatatcat
aataataattgtaaacttaatatatgtaagatatataacaataataataatgctggtaat
gaaaagaatgaagaaaatatattaaacatatcacatgtaaaaaagaatacaaaactatgc
tctttaaatattaaaaatgaacccattcaacaggttaatgattttcttttgtataataat
aacatattagaatataagaaagaacagaaaaattatttcatatccccacaaaatattata
aataatgaatatgatggatgtaacttcaacgatatgttaaataataattgtaaatcatta
aacgtacacaaatctatatgcttagataaatcaaatatgaatattgatgaggaatatttt
gacatgaaagaaaagactatggaaaatgaagaacttataaataattcatatgtaaaaaat
aaagataatatgaacaaaataaataatatggaaacacgactaagaaagaatattatcatc
caaccaaaaaaaaaaaaagatctaacatatgtaaataccattaatagtgataataatatg
aagcatatgtatgatatgaaatgtccaaaaattaatgtaagcaatatggttagatttaat
gtagaaaatgaattaaggaaaatacaggattgtaataaaagacgaccacaactatcgagt
ttggaaaacattattacagaaaggggatatctttgcaaacagaatgatgacaagtattta
ttaaatgtagtaggagctattaataaatatgaagatatatgtgaagatatatgtgaagat
atatgtgaagatatatgtgaagatatatgtgaagatatatgtgaagatatatgcgaagat
atatgcgaagacatatgtgaagatatatgtgaagatatatgcgaagatatgtgtgaagat
atatgcgaagataataatttgagcaggaaaaatatgtttataaccatattagagaatgaa
aataagaacactgatgattatagggtgaacgatgattctaacacatgtgttataaatttt
gtggaatgtataaataaggaaaaccaaaatgtaattacagagaaaggtaagaccaataca
agggatgatgataattcaaagggtaataataacgacgaaataataaataataatactaca
actactaaaaataatgataataataatgataataataataataataataataataatttt
atgcatagtaatgattatatctattgtaataatgtggtaaagaatgttacgcatctcaat
acaaatgattccttcgtttactcgaaagaggaatataatatatccagtgatgaagacaat
ttgatgaaccaacagaatgtaaataagaaaaaaaatataaataatgaaaaggaattttct
aatgaatttaacataaattatggtagtcattctaaggtccaacaagatatttacaacata
aattgtgttaaccaaacgaacggtgttaacaatataaaacatacaaataatatttatagt
gatcatggttataatatagaattcattaaaaataatgataaacaatattatgatgaaaat
aatagaaattcttcgaaccttgtacagatgattaataaacagaaagaaaaggatagagga
gatgaagaaagtaatagggatattaatttaaaagaaaataataatgacgatggtaatctt
attatttactatgatgatgatggtgatcaatgttatgataataatggatgtactacaaat
ctacatgatgaaagtattaaggaaaagaatttgtcagatgtaccgtttgaaaaaataaat
gaaaatttaaattataaaaatcataatgatgatatgatgaatccattaaatttttgtaat
aaaaaaacagataatggttttgaatatatagaaaatttgtactttcaaaagatcaatgat
tatacaactaatggtattacaaaagatatgaagaataataagaaaagaaatacaaataaa
ttgtttacatgcaaagaattatttcctaaaaataaagaatattttatattaaataaaaat
gaaagtaaacatttggtaggatataatatatccaatgatgataataagataaaggttaat
atgtatccttataaagatactaaattgaatgcacttcataattatatatgcgtcatctcc
ccaaaaaatgataacaataatattaattgtggcgaaaaaatatgtaatcataataatatg
ctgcttaataatagtaaaacatcaaataataatgagggctgtccttttagttatatgaat
ataaaatcgttgagtacacataatgataatagaaactatgataaaaatataaaccctgaa
gatttgagcaatctgacagatgtaaaagaaccattacaacatgccctttggatgaacaat
aatgcaaatacaaacataaacataaatagtaaccataaccctaaccataacagtaataat
aataattattattatcatagtttttataataatgatcatgttgattacaattataatata
aacaatgttaataaattcgacaattttaaaacgtataatatgtatccgaatgaaaataat
cccatagaagtagaatccaattcagaaatgattcttgttcatacaaataataatgattcc
accaatgtgttcaaccaagctcttattaaaaataaaaaaaatgaaaatgttgttcaggta
gatgcacaccaaatggttctaaataatgtgactgagctagctgataacgtttctagagat
atgtgtaggggggaaataattcaagatgaaaccacataccaggaagataataaaaaagtg
gatgataataatatatataataatgatatatataataatgatatatataatgatgatata
tataataatgatatatataataatgatttgtatgataacaatatgtatgataacaatttg
tatgataacaatttgtatgataacaaattatatgatgacgacttatatacatctagtata
aataacccaggtgaattgataaaaaatggggagaacaattctgtgaatttaaaaaataat
aaggttataaattcatatgaagaatttaaaaagtatgaccatatgaacaataatatgacg
gatatatatcaaagtaattatccattatattctaccaatcaagaaaaggaaactaccgac
agtaaccctgaaaaaattaattatagattattagaagaaaggaaaaaaaaaatttatttg
aataattattataatatgataaaaagtgtagatagggataattatatttataatgtgcct
tttgtgtcaaccattatcaatgataataatgttagatataataatgaatttgttaatatg
aaagaaaggaaaagcaacaatgtaagtacatctacaattacaaacacaaacacaaataca
aacacaaatacaaacacaaaaacaaacatttatacaaacatagaaaaatgtaattccttt
aatagtatggagttgctcatagaaaaggaacatactttacaaaacacgatgaataaaatg
aataatctaaaaaatgatcaaaataatttttgtcatatgaaggatacacaaagctggata
aataataaatattttaacgaagaaaaagacaactataaaattcttggacaagaggaaaaa
aatatctcaacaaatgaagataatgaaattgtatatatagatacatataataataattat
aataataataataatatgaatagattttatgataataataccttatggaagaagcaacaa
agaaatatgatgaacgaaaagaaaacaaccatgtataattttaactataaaaatatgtcc
ttagataatatagaaagagaagatcaatctgtttgtgaaaatgataattatcagaagcat
atatctagttatttaataaacaagcaaaatgacataatatataagaaccatccaaagaac
aacaataataataataatattaataataataataataataataataataatagtagtaat
aacctttcttggaacacctttcataagaacaatacatttgatacacatacaaattccttt
aatattttaaatcatcattctaataacaacgattttgataatatagaaaatattattaca
tccaatatgatgaataatttagaaaatgcaaatcttcaaaataacgttacaaataaatgt
tttcaatctaatgaagaaaaaaaaaaatttcaatcacatggttataaaaatgataatatg
ttattaaataatacatatttcaataataaaaattgtttctcttatgattctataaaaaaa
aatgattataatttattagaaacatcttctaaccatacatctacttttttaaattatgat
ttgtatagaacagattctatatatattggtccaaactcttgtgaaaataataatccatca
cctaatgttattaataaaaaaaaaaatacagatttttataaaaccacacttgctcaaaaa
aagaaatttcttaactatgatgatgaaaatatagagcaagataattttatggatattccc
aataatttaaattttagttttttaaataaaaatgattga
DBGET
integrated database retrieval system