Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_1308900
Help
Entry
PF3D7_1308900 CDS
T00095
Name
(RefSeq) mRNA-decapping enzyme 2, putative
KO
K12613
mRNA-decapping enzyme subunit 2 [EC:
3.6.1.62
]
Organism
pfa
Plasmodium falciparum 3D7
Pathway
pfa03018
RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pfa00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
03018 RNA degradation
PF3D7_1308900
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
pfa03019
]
PF3D7_1308900
Enzymes [BR:
pfa01000
]
3. Hydrolases
3.6 Acting on acid anhydrides
3.6.1 In phosphorus-containing anhydrides
3.6.1.62 5'-(N7-methylguanosine 5'-triphospho)-[mRNA] hydrolase
PF3D7_1308900
Messenger RNA biogenesis [BR:
pfa03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
mRNA cycle factors
P-body specific factors
PF3D7_1308900
mRNA degradation factors
5'-3' decay
Decapping complex
PF3D7_1308900
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DCP2
NUDIX
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
814027
NCBI-ProteinID:
XP_001349817
PlasmoDB:
PF3D7_1308900
UniProt:
Q8IEM5
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(408580..412101)
Genome browser
AA seq
1173 aa
AA seq
DB search
MPNNKLQKNLANKLPNSSKGTKLFSAQRIKQLAKDKKLLDDALLDCYGRFIALLPEFLLK
DHVHLYFQIQEAYWWYDDMWQDKYPDKLPKLSLKTFGYLICDDCPILKKYVPPSAHEQFS
LNWRRYCRTIPLRGAILLNHDLRKCLLVKGWSTDSWSFPRGKVDELEEDSVCACREIYEE
IGIDIFPYIDEQVYIETHIEDQPIKLFVIPGIREDTKFQPKTRKEIGDIRWFDIEKLLEY
KDSKRRKETFFDNKKERINYMFVCPFIPNLIKWINVLKLSIKGKVSKKNTYVSGSSILSY
KYQITGIDAHIIKKLQNADMETKDMYKSNYYFFKSDDDYYYDEEVDSLSNKDTYADVLNV
NSINSDMMKQYNTFDKGYVSMSNDSSNNNNNNNNNNNNNNSHMLINNSVYKNEEGSNIPY
GNIYNNFVPNVFNMDNMKKDHIMDKCNEDNMNDHMMNNNMNHNIIYDKKVMSNNNIKHNN
NNNNIKHNNNYHNNNSNNKDAKKVINNMLVKGNMNNNNNNNNYNNNYYHYNNKYYYNNKY
MYYPNYNINYGNNYNMYYNRGYHSYFNKNGDQDFYQKMYRNHIKKIGVGHLSALRLKEVG
LRSFDDQYIEKRKYFQMRVYGNNKNKLLYNAKNDIYGNHRKMMRNAYRSVDDSSVYYKSS
RNTNLDACNEKTFGENHMNGWSAEDMFKLNEQKFGIQSTYNIDNYTTPLNCNDEKKSSRY
VKETLKSVNVKGVSSNGLNGLLSASFDKSPVNKEIQYFLNNTKNMLSKGNMNSTNENVDM
VITKSSNNNNINENKNKNNNDNISEMNKLSKCVDSNPNLNVGKEEVDHIKMVKNKNILDI
TKKNNNNNNNDNVHVDNSKKVMMKKKKKSLGEMSKGIERNGSYYSLKGDIREKNKENVKN
NKMISNVMDTNTYDNNNIKLKKNDNLSNKLKNNKNNDIFINDNKKMNSQNMVVNKNVFSP
STSVSNICDDRDIVKKLSVSSKKNVKDKFDIFNFDDSYTDDDMDDKDVSCINGEDDINVN
TLTGKILMGLIKGSSSLNNEEEENTAKMNKQLDVKNGIDNNNNNNNNINEGVVINNKKKD
TVKNNSCQRKKDIHITSEIYKDNHKKKDVKKIHMEKANSRRNDQINNDDNKTVKDKMKRK
NKTTVDNKRSENFNETEIMEKLSKHLNSYNPFE
NT seq
3522 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctaataataaattgcagaagaatttagctaataaattgcccaatagttcaaagggc
acgaaactatttagtgctcaaagaattaagcagctagccaaagataagaaattattagat
gatgctttattagattgttatggaagatttattgcattattacctgagtttttattaaaa
gatcatgtacatttatattttcaaattcaagaagcgtattggtggtatgatgatatgtgg
caggataaatatccagacaaattaccaaaattgagtttaaaaacatttggttatttaata
tgtgacgattgtccaattttaaagaaatatgtacctccatcagctcatgaacaattttct
ttaaattggcgaagatactgtagaacgataccattgagaggtgctattcttttaaatcat
gatttaagaaaatgtttactagtaaagggatggagcacagatagttggtcttttccaaga
ggaaaagtggatgaattagaagaagattctgtgtgtgcttgtcgagagatttacgaagaa
ataggtatagatatatttccgtatattgatgagcaagtatatatcgaaactcatattgaa
gatcagccgataaaattatttgtaattccaggtataagagaagatacaaaatttcagcca
aagacgagaaaagaaattggagacattcggtggttcgatatcgagaaactattagaatat
aaagattccaaaagaagaaaagaaaccttttttgacaataaaaaagagcgtataaattat
atgtttgtatgtccgtttatcccgaatttgattaaatggattaacgttttaaaattatcc
ataaaaggaaaagtttccaaaaaaaatacgtacgtttcaggaagtagtatattatcttac
aaatatcaaataactggtattgacgctcatattataaagaagttacaaaatgcggatatg
gaaacgaaggatatgtataaatcgaattattatttttttaaaagtgatgatgattattat
tatgatgaagaagttgattctttatctaacaaagacacgtatgcggatgttttaaatgtg
aacagtattaatagtgacatgatgaagcagtataatacatttgataagggatatgtgagt
atgagtaatgatagtagtaataataataataataataataataataataataataataat
agccatatgttaataaataatagtgtgtataaaaatgaggagggttcaaatataccttat
gggaacatttataataattttgtacctaatgtgtttaatatggacaacatgaaaaaggat
catataatggataagtgtaatgaggataatatgaatgatcatatgatgaataataatatg
aatcataatataatatatgacaaaaaggttatgagtaataataatattaaacataataat
aataataataatattaagcataataataattatcataataacaatagtaataataaggat
gccaagaaagttataaataatatgcttgtgaaaggaaatatgaacaataataataataat
aataattataataataactattaccattataataacaaatattattataacaataaatat
atgtattacccaaattataatataaattacggtaataactataatatgtattataataga
ggatatcatagctacttcaataaaaatggtgatcaagacttttatcagaagatgtatagg
aatcatattaaaaaaataggcgtgggtcatctctcagccttacgattgaaggaggtaggt
ttaagaagttttgatgatcaatatattgagaagaggaaatattttcagatgagagtatat
ggaaataataagaataaattattatataatgcaaaaaatgatatatatggaaatcataga
aagatgatgagaaatgcttatcgttcagtagacgactcttcggtgtattacaagtcctca
agaaatacgaacctagacgcatgtaatgagaaaacgtttggagaaaatcacatgaatggt
tggagtgccgaggatatgtttaaattgaatgaacagaagtttggaatacaatcaacatat
aatatagataattatacaactcccttaaattgtaatgatgagaagaagagtagtagatat
gtaaaagagactttaaaaagtgtaaatgtaaaaggcgtgtcttctaatggtttgaatggt
cttctttctgcatcgtttgataaaagtcccgtaaataaagagattcaatattttttaaat
aacacaaaaaatatgttatcaaagggaaatatgaatagcacgaatgagaatgttgatatg
gttataactaaaagttcaaataataataatattaatgaaaataaaaataaaaataataat
gataatattagtgagatgaacaagttgtccaagtgtgtggatagcaatccaaatttaaat
gtcggaaaagaagaggttgatcatataaagatggtaaagaacaaaaatattttggatatc
actaaaaagaacaacaacaataataataatgataatgttcatgtggataatagcaaaaaa
gtaatgatgaagaaaaaaaaaaaaagcctaggagaaatgtcaaaagggatagaaagaaat
ggttcatattattcgcttaagggtgatataagggagaagaataaggaaaatgtaaagaat
aataaaatgatatcaaatgttatggatacaaatacttatgataataataatatcaagttg
aagaagaatgataatttatcgaataaattaaaaaataataaaaataacgatatattcata
aatgataataaaaaaatgaatagtcaaaatatggtagttaataaaaatgtatttagtcct
agtactagtgtatcaaatatttgtgatgatagagatattgtgaaaaaattaagtgtaagt
agtaaaaaaaatgttaaggacaaattcgatatattcaattttgatgattcatatactgac
gacgatatggatgataaagatgtgtcttgcataaatggggaagatgatataaatgtgaat
accttgaccgggaagatattgatgggattaattaaaggaagtagtagtttaaataatgaa
gaggaagaaaatacagcaaagatgaataaacaactagatgtaaaaaatggtatagataat
aataataataataataataatattaatgagggtgttgttataaataataaaaaaaaagat
actgtgaagaataattcttgtcaaagaaaaaaagatatacatattacaagtgaaatatat
aaggataatcataaaaaaaaagacgtaaaaaaaatacatatggaaaaagcgaatagcaga
aggaatgatcaaattaataatgatgataataaaactgtcaaggataaaatgaagagaaaa
aataaaacaactgttgataataaaaggtctgaaaattttaatgaaacggaaattatggaa
aaattatccaagcatttgaatagttataaccccttcgaatga
DBGET
integrated database retrieval system
