Plasmodium falciparum 3D7: PF3D7_1449400
Help
Entry
PF3D7_1449400 CDS
T00095
Name
(RefSeq) crossover junction endonuclease MUS81, putative
Organism
pfa
Plasmodium falciparum 3D7
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ERCC4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
812052
NCBI-ProteinID:
XP_001348644
PlasmoDB:
PF3D7_1449400
UniProt:
Q8IKY1
LinkDB
All DBs
Position
14:complement(join(2020209..2020262,2020376..2024137))
Genome browser
AA seq
1271 aa
AA seq
DB search
MDRNCNYMNKIINSKNRRHYSMHPENAIFFDYFINLKKKAIAQGYNNLVISFKKIISSIT
KYPLPIKNSLDAYKLKGVGKRFSNYFEKALSQSKVDKKIQNLKEDFISSKSEFRINIHIN
KVINSADKFLKDFDKEIYNIRVLGELSDDNILNNIREIENDNLCNVNSKNLNQCTLVSSN
KLNESYSNGKSLSLCTNNIEKVTSLNNNKKKKCIDMNDTEKSIITYLYKYGHLYNEHALS
KEEIISGVLKYYERSIVVNYKTLRRLINREFIEKTESVENRICNNIKSSKIKTKLKVINK
IRLTKKGKDFLDNEKDYILDCSLINTENIYQLNNTKEEESMLHTENVKNMISQYSFNTDN
ELKEEDNNMSSKKKIDSPSYMKKNLRCSDTEEKCFELSEKKENQERCLNVTYLSISKNNE
IISHECLFKNENEMEKNDEEEKNDEKKKNDEMNNKQNRQENISINNIQTSDAVLVQKEEK
EEFSECNQLFKNTKTLSSSSYTNYSISFGFNDDIKKKTDSSWNNKKGRIYKKYKPRIFTK
TKEIIEEDKNKILKKKKKSINNEESIDSKSVSILSDNYEERKKTDGNVNGLNLSNSYDLI
EKKIKNIKKRMNKNLKERLEKKKKNRNDSGVSSSEMFEGSSSKEENFFSSDRKKLSLEEE
DKSLKLTNYIWDEDQVEEKKGEKTETKFLIKEYEKYYNEIDESKKMKSFVTDELIYKSTV
LKNNSKNIIKEVEDSNMLLSNVQKDTNHLREEEFLSLRNENVNSINNNDDKEKGKKCKRK
RSILNNIGNNKDAEGNKRKKKKRSKPETENKVEFDTSNINNLNKEDKDLNEMNESNQRCK
ITYGTYEIIMIIDNREVTGSSYEFNEKMKKVFNDKNIKYETRNLPLGDIIWICRRSVYNK
NSSSNKKKQMKKMRRNKKMMDDEKKKKSEEINMDIKKGILERNNHSVSKENDYHQISDDD
NDDNNDDNNDDNNDDNNDDHNDDHNDDHNNDHNDDHNNDDDNIDDDNNNKKKEKVLCPDK
KIEPFIDDVEYEEFVLKWIIERKTLNDLSASIIDGRYDEQKYRMMRLRDIHHIIYLIENC
NNTYRNYMNSSKISYETLNNAQHSTQLVSGFSILGSQHMNHTLFLLCEIHQEIIKHIKLY
CHIKKEHPVIRHNEDLSMYLQKYSCSWDEWNNESKKSKNNIVKEVFGKQLRLINMCGPDA
TELILSLWPTPTKLSAALNKYTHDGILAEKMKRIYLKNHDMIGKKRIKSPIDVQLIAQLR
QLYAPDSIERW
NT seq
3816 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataggaattgtaattatatgaataaaataataaattccaaaaacagaagacactat
agtatgcatccagaaaacgccatattttttgattactttattaatttaaagaaaaaagcc
attgcccaaggttataataacttggttatttctttcaaaaaaattattagttctataaca
aaatatcccttaccaattaaaaatagtcttgatgcatataaattaaaaggtgtaggaaaa
cgcttttctaattattttgaaaaagctttatcacagagtaaagtagataagaaaatacaa
aatttaaaagaggattttatatctagtaaatccgaatttcgaattaatattcatataaat
aaagttattaatagtgccgataaatttttaaaagattttgataaagaaatatataacatt
agagttttaggtgagttatcagatgataatatattaaataatatcagagaaattgaaaat
gataatttgtgtaatgttaattcaaaaaatttaaatcaatgtactcttgtttcaagtaat
aaacttaatgaatcttattcaaatggaaagtctttatctttatgtacgaataatattgaa
aaagtaacatctttaaacaataataaaaaaaagaaatgtatagatatgaatgatacagaa
aagagtatcataacatatctttataaatatggtcatttatataatgaacacgctttaagt
aaggaagaaattatttctggtgttttaaaatattatgaaagatcaatagttgtaaattat
aaaacattaagaagattaattaatagggaatttatcgaaaaaactgaaagtgtagaaaat
agaatatgtaataatatcaagtcgtctaaaattaaaaccaaattaaaagttatcaataaa
attagattaacaaaaaagggaaaggattttttggataatgaaaaggattatatattagat
tgttctttaataaatacagagaacatataccagctaaataacacaaaggaagaggaatct
atgttacatacggagaatgttaaaaatatgatatcacaatatagtttcaatacagataat
gaactgaaggaggaagataataatatgtcttccaaaaaaaaaatcgattcaccatcatat
atgaaaaagaatttacgttgtagtgatacagaagaaaaatgtttcgaattaagtgaaaag
aaagagaaccaagaacgttgcttaaatgtaacctacttgagtatatcaaaaaataatgaa
ataataagccatgaatgcttattcaaaaatgaaaatgaaatggaaaaaaatgatgaagag
gaaaaaaatgatgaaaagaaaaaaaatgatgaaatgaataacaaacaaaatagacaagaa
aacatttcaataaataatattcaaacgtcagatgccgtattagttcaaaaggaggaaaaa
gaagaattttctgaatgtaaccaactttttaaaaacacaaagacacttagttcttcatca
tatactaattatagtatctcttttggatttaatgatgacataaaaaaaaaaacagattct
tcttggaataataaaaaaggcagaatttataagaaatataaaccacgcattttcactaag
actaaagaaattattgaggaagataaaaataaaatattaaaaaaaaaaaaaaaaagtata
aataatgaagaatcgattgattctaaaagtgtaagtattttgagtgataattatgaagaa
agaaaaaaaactgatggaaatgtaaatggtttgaatttatccaattcatatgatttaata
gaaaaaaaaattaaaaacataaagaaaagaatgaataaaaatttgaaagaaagattagaa
aaaaaaaaaaaaaatagaaatgattcaggagttagttcctcagaaatgtttgaaggaagc
tcatcaaaggaagagaactttttttcaagtgatagaaaaaaattaagtttagaagaagaa
gacaagtctttgaaattaacaaattatatatgggacgaagatcaagtggaagagaaaaag
ggggagaaaacggaaactaaatttttaataaaagaatatgaaaaatattataatgagatt
gatgaaagtaaaaagatgaaaagttttgttacagatgaattgatttataaaagtaccgtt
ttgaaaaataattcgaagaatataataaaagaagtagaggattccaacatgttattaagt
aatgtacaaaaggatacaaatcatttaagagaagaagaatttttatctttgagaaatgag
aatgtaaattctattaataataatgacgataaggaaaaaggtaaaaagtgtaaacggaag
aggagcatattaaataatattggaaataataaagatgctgaaggaaataaaaggaaaaaa
aaaaaaaggagcaaacctgagacggaaaataaagtggaattcgatacatcaaatataaat
aatttaaataaagaagataaagatttaaatgaaatgaatgagagtaatcaaagatgcaaa
ataacatatggtacgtatgaaataattatgataattgacaatcgagaagttaccggatct
agttatgagtttaatgaaaaaatgaaaaaagtatttaatgataagaatattaaatatgaa
acaagaaatttgcctttgggtgatattatatggatatgtagaagaagtgtatataataaa
aacagttcaagtaacaaaaagaaacaaatgaagaaaatgaggaggaataagaaaatgatg
gatgatgaaaaaaaaaaaaaatctgaagaaataaatatggacattaaaaaaggtattttg
gaaaggaataaccattcggtaagcaaagaaaatgattatcatcaaattagtgatgatgat
aatgatgataataatgatgataataatgatgataataatgatgataataatgatgatcat
aatgatgatcataatgatgatcataataatgatcataatgatgatcataataatgatgat
gataatattgatgatgataataataataagaagaaagaaaaagtattgtgtcctgataaa
aagattgagccttttattgacgatgtagaatatgaagaatttgttttaaaatggataata
gaacgaaaaactttaaacgatttaagtgcaagtattatagatggtagatatgatgaacag
aaatatagaatgatgagattaagagatatacatcacatcatttatttaattgagaattgt
aataatacatataggaattatatgaattcatcaaaaatatcatatgaaacattgaataac
gctcagcatagtactcaattagttagtggcttttctatattgggtagtcaacatatgaat
cacacattatttttattatgtgaaattcatcaagaaataataaaacatataaaattatat
tgtcatattaaaaaagagcaccctgtgataagacataatgaggacttgtctatgtattta
cagaaatattcatgttcttgggatgaatggaataatgaatctaagaaatccaagaataat
attgtaaaagaagtttttggaaaacaactaagattaataaatatgtgtggacctgatgct
accgaactaatattgtcattatggcctactccgacaaaattaagtgcagcattaaataaa
tatacacatgatggaatattagctgaaaaaatgaagagaatatatttgaaaaatcatgat
atgataggaaagaaaagaattaagtctccaatagatgttcagcttattgcacagttgaga
caactttatgcacctgattcaatagaaagatggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
