Pelosinus fermentans: JBW_01495
Help
Entry
JBW_01495 CDS
T03813
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat-containing protein
Organism
pft
Pelosinus fermentans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJQ26845
UniProt:
A0A0C5Q4W0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1776038..1778581)
Genome browser
AA seq
847 aa
AA seq
DB search
MDTIGLQLRRLLPGSINANDIVLFEAVLSSFGPVSYNPATGVVILNKTGRYLVNWSVATQ
SSPGSSSISFSIVTTQADEVLVSSPLIMGPLAGSALIQVDVAPIGLGLVNRTPNSVTFSP
LVPVKATLVIAEVPEDVGVTGPTGATGAPGAPGTPGAPGAPGAPGAPGATGATGATGAAS
ATGSTGATGATGATGAASATGSTGVTGATGATGDVGATGATGATGATGATGATGATGATG
VTGATGATGATGTTGATGVTGATGATGATGTTGATGVTGATGDVGATGATGVTGATGATG
DVGATGATGATGTTGATGATGATGATGVTGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVG
ATGATGATGDVGATGATGVTGATGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGATG
DAGATGATGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGVTGATGATG
ATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATG
ATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGATGDVGATGATGATGDVG
ATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVG
ATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGATGDVGATGATGATG
DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATG
DVGATGATGATGDVGATGATGATGDVGATGATGATGDAGATGATGETGATGATGATGETG
ATGATGP
NT seq
2544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggatacaataggtcttcaacttagacggctgttgcccggttcaatcaatgcaaatgat
attgttctatttgaagcagttcttagcagctttgggcccgtaagttataacccggcaaca
ggagtcgtcatcctaaacaaaaccggacgatatcttgtcaattggtcggtagcaactcaa
tcatctccaggttcaagtagtataagtttttcaatcgtaacaacacaagctgatgaagtg
ctagtaagttcgcccctaataatgggtccgcttgctggatctgcacttatacaagttgat
gttgcaccaatcggactaggtttagtgaatcgaacacctaatagtgtaacattttctcct
ttagtcccagttaaagcaactttagtgatcgctgaggtgccagaagatgttggcgttact
ggtcctactggcgctactggtgctcctggcgctcctggcactcctggcgctcctggcgct
cctggcgctcctggcgctcctggcgctactggtgctactggcgctaccggtgctgctagt
gctactgggtcgacgggcgctactggcgctactggtgctaccggtgctgctagtgctact
ggatcgacgggcgttactggtgctactggtgctactggtgatgttggtgctactggtgct
actggtgctactggtgctactggtgctactggtgctactggtgctactggtgctactggt
gtaactggtgctactggtgctactggagctactggtactactggagctactggtgtaact
ggtgctactggtgctactggtgctactggtactactggagctactggtgtaactggagct
actggcgatgttggtgctactggagctactggtgtaactggtgctactggcgcaactggc
gatgttggtgctacgggtgctactggagctactggtactactggagctactggtgcaact
ggtgcaactggagctactggtgtaactggtgctactggtgatgttggagctactggagcc
accggcgctactggtgatgttggagctactggagccaccggcgcaactggtgatgttgga
gctactggtgctacgggcgctacgggtgatgttggtgctactggcgctaccggtgtaact
ggtgctactggtgcaactggagctactggtgctactggtgatgttggagctactggtgca
accggcgcaactggtgatgttggagctactggagctactggtgcaactggcgctactggc
gatgctggagctactggtgctactggtgctactggagctactggcgctacgggtgatgtt
ggagctactggagccaccggcgcaactggtgatgttggagctactggtgctacgggcgct
acgggtgatgttggtgctactggcgctaccggtgtaactggtgctactggtgctactgga
gctactggcgccactggtgatgttggtgctactggtgcaactggcgcaactggtgatgtt
ggagctactggtgcaactggcgcaactggtgatgttggagctactggtgcaactggcgca
actggtgatgttggagctactggagccaccggcgcaactggtgatgttggtgctactgga
gccaccggcgccactggtgatgttggagctactggtgcaactggcgccactggtgatgtt
ggtgctactggagccaccggcgctacgggtgatgttggagctactggtgcaaccggtgca
actggtgctactggtgatgttggagctactggagccaccggcgctacgggtgatgttgga
gctactggagccaccggcgccactggtgatgttggagctactggtgcaaccggtgcaact
ggtgatgttggagctactggagcgaccggcgctacgggtgatgttggagctactggagcc
accggcgccactggtgatgttggtgctactggagccaccggcgccactggtgatgttggt
gctactggtgcaactggcgccactggtgatgttggagctactggagccaccggcgccact
ggtgatgttggagctactggagccaccggcgccactggtgatgttggagctactggtgct
actggagctactggcgctacgggtgatgttggagctactggagccaccggcgctactggt
gatgttggtgctactggagccaccggcgccactggtgatgttggtgctactggagccacc
ggcgccactggtgatgttggagctactggtgcaactggcgcaactggtgatgttggagct
actggtgcaactggcgcaactggtgatgttggagctactggtgcaactggcgcaactggt
gatgttggagctactggagccaccggcgctacgggtgatgttggagctactggagccacc
ggcgctacgggtgatgttggagctactggtgcaactggcgctactggcgatgctggagcg
actggtgctactggtgaaactggcgctactggtgctactggtgctactggtgaaactggc
gctaccggtgccacaggcccctaa
DBGET
integrated database retrieval system
