Pseudoalteromonas translucida TAC125: PSHAa2294
Help
Entry
PSHAa2294 CDS
T00282
Name
(GenBank) putative orphan protein; putative EAL domain
KO
K20964
c-di-GMP phosphodiesterase [EC:
3.1.4.52
]
Organism
pha
Pseudoalteromonas translucida TAC125
Brite
Enzymes [BR:
pha01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.4 Phosphoric-diester hydrolases
3.1.4.52 cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase
PSHAa2294
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
DUF3819
DUF3139
Herpes_UL20
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CAI87350
UniProt:
Q3IHV7
LinkDB
All DBs
Position
I:2438617..2440482
Genome browser
AA seq
621 aa
AA seq
DB search
MLQGKLRINGLISAFMLFLISLIICVYYTYSTIRSDVINTLDNRLINAATSVKYILGDDY
HSKINKTQTISFATYESKSKQLSELAQALDIAYVYSMVLINGKVHFSASSYTQEDQNSGK
VTQFLDLYPEATKANIGAFLSTEPVFEISSDQWGDFKTIFIPHIDKNGITYLTAADISLK
TINNKLAQSASTSAVLGGFFLVIIILLLIMYNYATKRAAMRDSGSGFANHIALEKYFLNT
PVHHMQMAIIWVNEIENINRFYGTKVGDKVMKKLLIHFKKHSNVNYRIYRVATNKLVLLT
PKETPYEELSNLIQSYNFNTPFLTNPFIYITLCAGIARGNKSLLLKNAHIAALQAKQGNL
SVVNYSEAINDSKSLYLYNLEIAKEVREAFEQKRVVPYFQAVIDIESKQTLHYECTPRIV
TSQGEILKPDAFSNTVIRLRMDGLLTRTLFSQCLSRFRKTQISWSLNITIEDILDPSINE
YIAYELQRYPYPANITLVLFEPQVIANYSSVRAFITMVKSKGIKVMINSFGNDFANTLNI
LKLEIDAIKLDGMLIKQIVNDENTALFVDYTANFAKQQNIQLIASMVENKAIATALKKVN
VTLMQGNFIAHPAPHVNPLFE
NT seq
1866 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctacaaggaaaactaagaataaatggattaataagcgcttttatgctgtttttaatc
agtttaattatctgtgtttattatacttatagcaccattcgcagtgatgtaattaacact
ctcgataatcgtcttattaatgcagccaccagcgttaaatatattttgggcgatgactat
cacagtaaaataaataaaacccaaactattagctttgcaacttacgaaagtaaaagtaag
cagctttctgagcttgcacaagcactcgatattgcttacgtgtattctatggtgttaatt
aatggcaaggttcattttagcgcctctagctacacccaagaggatcaaaatagtggcaag
gtaacccagtttttagatttatacccagaggcaactaaagctaatattggtgccttttta
tctactgagcctgtttttgaaatatcgagtgatcaatggggcgactttaaaactattttt
atcccgcatattgataaaaatggcattacatatttaactgctgccgatataagccttaaa
actattaataataagttagcgcaaagcgcctcaacatcggctgttttaggcggctttttt
ttagttattattatattgttgctgattatgtataactacgcgactaaacgcgctgccatg
agagactctggtagtggttttgctaatcatattgcgcttgaaaaatattttttaaatacc
cctgttcaccatatgcaaatggccataatttgggtgaacgaaattgaaaatataaaccgc
ttttacggtactaaagtgggtgacaaagtaatgaaaaaattactaatacactttaaaaag
cacagcaatgtaaattatcgtatttatcgtgtagcaaccaataaactggtgttactaacc
cctaaagaaaccccatacgaagagctaagtaatttaatccaatcatataattttaatacg
ccatttttaaccaacccctttatttacattacgttatgtgcaggtattgcccgaggaaac
aagtcgttactgctaaaaaatgcccatattgcggctttacaggcaaaacaaggtaacctt
agtgttgttaattactctgaggctataaatgactcaaagtcgctgtatttatataattta
gaaatagcaaaagaagtacgtgaagcgtttgagcaaaaacgcgttgtgccctattttcag
gctgttattgatatagagtctaaacaaacactacactacgagtgcacaccacgaatagtg
acttcacagggcgaaattttaaaacccgatgcattttcaaataccgtaatacgcttgcgt
atggatggcttattaacccgtacattattttcacagtgtcttagccgctttcgtaaaaca
caaattagctggagtttaaatattactattgaagatatattagaccctagcataaatgaa
tacattgcttacgagttacagcgctatccgtaccctgcaaatatcactttagttttattt
gaaccacaagttatcgccaattattcaagcgtaagggcatttataactatggttaaaagt
aaggggatcaaggtgatgattaacagttttggcaatgactttgcaaatacactcaatatt
ttaaaattggaaattgacgcaataaagttagatggcatgctaataaagcaaatagttaat
gacgagaacacggcactttttgttgattacacagccaattttgcaaagcagcaaaatatt
caactaattgcctctatggtagaaaacaaagctattgctacggcactcaaaaaagtaaat
gtgacgctaatgcagggtaatttcattgcccacccagcgccacatgttaatccattattt
gagtag
DBGET
integrated database retrieval system
