Planctobacterium marinum: MACH26_39820
Help
Entry
MACH26_39820 CDS
T09721
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pmaw
Planctobacterium marinum
Motif
Pfam:
TSP3_bac
LRR_4
FG-GAP_3
FG-GAP
LRR_8
LRR_9
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDX08461
UniProt:
A0AA48KR44
LinkDB
All DBs
Position
complement(4593555..4599098)
Genome browser
AA seq
1847 aa
AA seq
DB search
MFYSAQGMAHRAILLVVLFCTSTFPIFAQVNFDYNGDEKADVVLRRPSDFSFINYRTNNQ
EILGLRGTDIPVAGDFDGDGIFDVAVRRPSNAMWYIQNSTDSSAAGIQRIKFGLQSTDIP
VTGDYDGDGITDVAVRRPSNYMWYILNSSGGANNSNDAIQRVQFGKNSADIPVPADYNGD
GITDIAVRRPSNSTWYILNSQGDRVNYNAPRNDGIQRIKFGLQSTDIPVPADYDGDGIDD
IAVRRPSNSMWYIKSSLSGEIIRIRFGLQADDIPMVADYDGDGKADPAVRRVSDNHVYIR
RSSDNRIERIEAGLEIDIPIASPMSVIMAMVEGSPVNRDSDNDGLNDYEEQVHGSDPTAA
DTDGDGLSDYEEVNTYETNPTLADTDNDGVNDGEEVQQGSNPNTVINATLAEFVVEDTII
LDWPESMVSEGFFPNYLTVLDFAEDGSLLSYVSAAHGTPEPQSLSWSADTEGDITVTGFE
AEQQYFTSWHPYNEVRETWGDEAADNLLIAYDQGYIDYYFSTYIETQVAQQHYQAIGSTE
GGYGLLKTTYTLQTLLVPDSVKEQFGEEAFVLSSNTQESHVMRHLQEHHREQWSNLNQSV
TWALPLYYSLEETGTLLNTYVGPGFRHDLITFNDDVVNSEVSAMTFTWGIDSSELTLTND
QGTHSYWILKTRDNESLVAVRFVNNEDEEFWFTSTLQTYHAQDLDIEAALLTALPEIKAS
HAFGWNSERYFSDNVPRAPYLFGYQFLSDGTLQRGIYIEEGDTYIEGDTEYREEILNFGA
EWQYQIDENAGTVTMEYYHRNIIRQRVWRILGVDNQNRMSYLEYSWYSDDSNYNGELDED
ERKYFVQPRINYHKSVDLSAYGDLWGNLDLDDDGLTNAQESEAGTSFTEADSDSDGLSDY
DEVITHGTNPLVADSDNDGLTDSEELLRGTDPNTPDTGNFEEADVLNQTLLFTALEEDIQ
SGYVPLLGEVYEFQEDGAVTYHRTAQQGSSEALELTWSVDDSGYIAVSGFDSFSTAGYYN
EYYYPFDALEEQWGTELAEQLREAYFDNAIGYSIYIYHSQGTYAHFLGKQEEADADNVTE
RMIVRYEGIEIPQNIIDAVNQYGQGWQGDSKYYVFEHSSTSGGLLQDIQGIEFQPFDETM
MQSQWALAHSYTLESYFSNSDSATAALYWDLFDFTDATAQSQIAGLSYDWAISSDGALQL
SNEDVTLTYRLIMQNENEYYTLAEVEADGVSQFIVGNMVRASANAASFTDNLLTEIPEIY
TSTVNGWRKDNWDAGVYSASSLFGYQFVDAENLKRGIYIDDYNNEHTPSIHFGYDWTYSV
ASEARQVVMYRPENRGYRTWDILGVDSNGKTLVLERSIYQYDANSNGEIDDDEKGYFVLP
RISMLEKADLSQYEAWGNTDFDDDGLTLNEETQYGTDPENPDSDGDGVSDGDEVEAGYDP
NTADNFVDFELFGDDSLAFCIQEVAGQAFATVESVTELDCFDYSNISTLAGIEQLINLQR
LVLLQATADDFSVLAQLSHLTELLILDSEIGDLSFLSEMTQLQRLSLQYSRVDDFAAIAD
LSSLQWLSLSNTSFIDLQTLEGLQSLTTLHLRFTAIEDFQPLGNLTSIQYLNLSGTSFSD
GEVLSPLTQLETLLLVDVSTVTDFAPILALPALTGLDLSGTSIDNFAVFGTRDNWKLIGA
GGIALTTDDLSFLAQQTALETLWLNDSGLSSVADVSALISHLPIIALDLSDNDITDLTGI
EALSTLERLYLYFNNIQDITPLYSLPALQRVILSYNYGLYCWDLEQLHLTTGADVIYHNC
RFESSALKPQSAASKTAITSDWTEFLQQRDEALQKGQASYRTLLDHW
NT seq
5544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttttattccgcacagggaatggcacatcgagcaattttattagttgttctgttctgc
acctccacattcccaatattcgcccaggtaaattttgactacaatggtgacgaaaaagcg
gatgttgttctgcggcgtccttcagattttagtttcataaattaccgtaccaataatcaa
gagatacttggcttgagaggaaccgatatccccgtagccggtgattttgatggtgacggg
atctttgatgtggcggttcgcaggccctccaatgccatgtggtacatccagaattctact
gacagcagtgctgctggcattcaacgtattaaatttggtttgcaaagcactgatatcccg
gtaacgggagattatgatggagatggtattacggatgttgctgtgcgcagaccttcaaat
tatatgtggtatatcctcaattcttcgggtggcgcaaacaacagcaatgacgctattcag
cgcgtacaatttggtaagaattcggcggatattcctgtaccggcagactataacggcgac
ggaatcaccgatattgcggtacgcagaccctccaactcaacttggtatatcctgaattct
cagggtgacagagtgaattataacgcacctcgtaacgatggtatccagcgtattaaattt
ggtttgcaaagcacggatataccagttccggcggattacgacggggatggaatagatgat
attgctgttcgtcggccatccaattctatgtggtacatcaagagttctcttagcggtgaa
atcatccgtatccgatttggtctgcaagcagatgatattcctatggtggccgactacgat
ggtgatggcaaggccgaccctgccgtgcgtcgggtcagcgataatcacgtatatatccgc
cgcagctcagataaccgcatcgaacgcatcgaagccgggcttgaaattgatattccaata
gcttctcccatgtcggtaattatggcgatggttgagggtagtccggttaatcgcgatagt
gataacgatggattaaatgactatgaagaacaagtgcatggtagcgacccaacggctgca
gacaccgatggcgatggcttgtctgactacgaagaagtaaacacttatgaaaccaatcca
actcttgctgatactgataatgatggcgtaaatgacggtgaagaagtgcagcaagggagc
aatccaaacactgttatcaacgccacgctcgctgagtttgttgtcgaagacaccattatt
ttggattggccggaatcaatggttagcgaaggctttttccccaattacctgacggtttta
gattttgcagaggatggcagtctgctgtcttatgttagcgctgctcatggaactccagag
cctcaatccttaagctggtccgctgatacagagggagacattacggttaccggatttgaa
gccgagcaacaatactttaccagctggcatccttacaacgaggtccgggaaacttggggt
gatgaggcggcagataacctgcttattgcttatgatcaaggctatatcgattactacttc
tcaacttacatcgagacccaagtggcacagcagcattatcaggctattggcagtactgag
ggaggctatggcttattaaaaacgacctacacgctgcagactttattggtccccgacagt
gttaaggagcaatttggcgaagaggcgtttgtgctgagcagcaatacccaagaatcccat
gtaatgcgtcacttgcaggagcatcaccgcgaacaatggagcaatctaaaccaatctgtt
acctgggctttgccactgtactactcgttggaagagacgggaaccttgctaaacacctat
gttggaccgggctttcgtcatgacctgatcacctttaatgatgacgttgttaacagtgaa
gtgtcggcaatgaccttcacctggggtattgattcaagtgagctaaccctgaccaacgat
cagggaacccattcctattggattttaaaaaccagagacaatgaaagtctggtagcggtg
cgttttgttaataacgaagacgaagagttttggtttaccagtaccctgcaaacctatcac
gctcaagatctggatatcgaagccgcgctactcacagcacttccggaaataaaagcgtcc
catgcgtttggctggaatagcgaacgttacttttctgacaatgtaccacgtgcaccctat
ttatttggttatcagtttttatctgacggtacgttgcagcgcggtatttacatcgaagag
ggtgatacctacatcgagggtgacactgaatatcgggaggagatacttaactttggcgct
gaatggcaataccagatagatgaaaatgccggcacggtgactatggagtattaccaccgc
aatattattcgacaaagggtgtggcgaattttaggtgttgataaccagaatcgaatgtct
tacctggaatactcctggtattcagatgatagcaactacaatggtgagctggatgaagat
gaacgcaaatactttgtgcagccccgtattaattaccacaaatcggtagacctttcggcc
tacggtgacctttggggcaacttggatctcgatgacgacggcctgactaatgcgcaagaa
tctgaggcaggaacaagcttcactgaggctgactctgacagtgatggtttaagtgattac
gatgaggtgatcacccatggtactaatccgctggtggccgattcggataatgatgggctg
accgacagtgaagagttgttgcgcggtaccgacccaaataccccagatacaggtaacttc
gaagaggccgatgtcctcaatcaaaccttgctgttcaccgcgttggaagaagatattcag
tcgggttacgtgcctctattaggtgaagtttacgaatttcaggaggatggcgcggtaact
tatcatcgcactgctcaacaggggagttccgaggcactcgagttaacctggtctgtcgat
gacagtggttatattgctgtatctggttttgatagcttcagtactgctgggtactataac
gaatactattacccgtttgatgctctggaagagcaatggggcactgagttagcagagcaa
ttgcgtgaggcgtatttcgataatgcaataggttactctatttatatctaccactctcag
gggacttatgcacacttcctgggcaagcaagaagaagcggatgctgataacgtcactgag
cggatgattgtcagatacgagggcatcgaaataccacagaatattattgatgctgttaat
cagtacggtcagggctggcagggtgactcaaaatactacgtgtttgagcatagctccacc
tcaggtggcctgttgcaggatatccagggcatagagtttcagccgttcgatgagacgatg
atgcaaagtcaatgggcattggcacacagctatacactggagagttactttagtaatagc
gacagtgccacagcagcgctgtattgggatttgtttgattttaccgacgctactgcgcag
agccagattgcaggtttgagttatgactgggcaatcagcagcgatggcgcgttgcaactt
agtaatgaggacgtcactcttacttaccgtcttattatgcaaaatgaaaatgagtactac
acattagccgaagttgaggctgatggcgtttcacaattcattgtcggtaacatggtcaga
gcaagtgctaacgctgcgagcttcacagataatctgctcactgaaataccggaaatttac
acatccacggttaatggttggcgaaaagataattgggacgcaggtgtatacagtgcaagc
tcattgtttggatatcaatttgtagatgctgaaaaccttaaacgtggcatatatatcgat
gattacaataacgagcacacgccgtctatacattttggttatgactggacctactctgta
gcgtcagaggcgcgacaagtagttatgtatcgaccagaaaaccggggttatcgcacctgg
gatattttaggggtcgacagcaatggtaaaacactggtgctggagcgttctatctatcaa
tacgatgctaatagcaatggagagattgatgatgatgaaaagggctatttcgtgttgccc
cgcatcagtatgttagaaaaagcggatctatcccaatacgaggcctggggcaatactgat
tttgatgatgatggacttaccctgaatgaagaaacgcaatatggtacagatccggagaat
ccggattcagatggtgatggcgtctcggatggtgatgaagtcgaagccggttatgaccct
aacacggctgataactttgtagattttgaactctttggcgatgacagtcttgccttctgc
atccaggaggtcgccggacaagcgtttgctactgttgaatctgttaccgagttagactgc
tttgactatagcaatatctcgacgctagccggtatagaacagctaattaacctgcaaagg
ttggtattgttgcaagcaactgccgatgatttcagtgttttagcacaactaagtcatctc
accgagttgctgatactcgatagcgaaattggtgatttgagcttcctcagtgagatgaca
caattgcaaaggttgtcgctgcaatattcaagagtcgatgactttgctgctatcgccgat
ttaagtagtttgcagtggttaagcttgagtaataccagctttattgatctgcaaaccctc
gagggattgcagtcactcactacactgcacctcaggtttacggcaattgaagactttcag
ccactgggtaacctgaccagcatacaataccttaatctgtcgggtaccagcttcagtgat
ggtgaggttctgagtcccttgacccaactggaaacgttgctcttagttgatgtgtcgaca
gtgactgattttgccccgattctggcgttaccagcattaaccggattggatctttcgggc
accagtatcgataattttgcggtatttggcaccagagacaattggaagctgattggcgct
ggtggtatcgcattaaccacggatgacctgtcatttcttgcgcaacaaaccgcgttagag
acactttggctcaacgatagcggactgagctcggtagctgatgtgagcgcattaatcagc
catttgcccatcatagcactggatctttcagataacgatattactgacctcacaggcatc
gaagctctcagtacgctggagcgcttgtatctgtatttcaataatattcaggatattaca
cctctatatagtctgcctgcactgcaaagggtaatactcagttataactatggcctgtat
tgttgggatcttgagcaacttcatttaaccacgggcgccgatgtgatttaccacaattgt
cgatttgagagcagtgctttgaaaccgcaatctgcagcaagtaaaactgcaatcacatct
gattggactgagttcctacagcaacgggatgaagcactacaaaagggacaggcgtcttac
aggactttgctggatcattggtaa
DBGET
integrated database retrieval system