Prochlorococcus marinus MIT 9301: P9301_07831
Help
Entry
P9301_07831 CDS
T00488
Name
(GenBank) possible ATP-dependent DNA ligase
Organism
pmg
Prochlorococcus marinus MIT 9301
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_ligase_A_M
DNA_ligase_A_N
DNA_ligase_A_C
mRNA_cap_enzyme
RNA_ligase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABO17406
UniProt:
A3PCD1
LinkDB
All DBs
Position
complement(680210..681850)
Genome browser
AA seq
546 aa
AA seq
DB search
MSLKKFSELFGDLDSINSTNNKIEVLKNYFLSNDPIDNSWAIYLLTGKSNKRFISGRYLK
NLFSHIYEYPQWLIDTCYLKVGDSAEVITLLLKNKTNSRKKKLSNISLTELLSETIPELS
KLNDEQKNLEIKNLWEKLPEDNHLIFNKILTGTFRVGVSIGLITKSISKLTHIEEEIISH
RLMGDFKPSIDSYEFLINKNINLQELNSKPFPFLLANTIEDKIFKNSINDFQFEWKYDGI
RMQLIKRSGNVSLWTRGQELVNESFPELVEKMSNIKDDFVLDGELLVWNFKEQIAFDFSL
LQKRINRKSPTKSIQIKYPIIFIAYDLLEINGRDIREIKLENRRIELEKYFSKWQIKTEN
NISDIFKICDLIFPKDWPDALAYKEKSRENNTEGLIIKKKTSIYSSGRKKGIWWKYKVDP
MQLDAVLIYAKGGSGRRAGLYTDYSFALWKDKELIKFASAYSGLTNIEIKELDKWIRKNT
IEKFGPVRSLKPEMVFEISFEKIQISNRHKSGIAVRFPRITKWRKDKKIKDADSLENAYE
LMKKIS
NT seq
1641 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcttaaaaaagttttcagaattatttggcgatctagattcaattaatagtacaaat
aataaaattgaagttttaaagaattattttttatctaatgatccaatagataactcatgg
gcaatatatttgctaactggaaaaagtaataagagatttattagtggaagatatttgaaa
aatcttttttctcacatatatgaatatcctcaatggttaattgatacatgttatttaaaa
gttggtgattctgctgaggtaataacattattacttaaaaataaaactaattctagaaaa
aagaaattgtcaaatataagtctcactgaattactaagcgaaacaatacctgaattatca
aaactgaatgacgagcagaaaaatttagaaattaaaaatctttgggaaaaattacctgaa
gataaccatctaatttttaataaaattcttacaggaacttttagagtaggagtctctatc
ggattaattacaaaatcgatatcaaaactaactcatattgaggaagagattatttctcat
aggttgatgggtgattttaaaccttcaattgattcatatgaatttttaattaacaagaat
atcaatcttcaagagttaaattccaaaccatttccatttcttctagcaaatactattgaa
gataaaatcttcaaaaattcaataaatgattttcaatttgaatggaaatacgacggtata
aggatgcaattaattaaaagatcaggcaatgtttcgttatggacaagagggcaagaatta
gtaaatgaatctttcccagaattagtagagaaaatgtcaaatataaaagatgattttgtt
cttgatggggaattattagtttggaattttaaagaacaaattgcctttgatttttcttta
cttcaaaaaagaataaatagaaagtctcctactaaatcaatccaaataaaatatccaatt
atttttattgcttatgatcttttagagattaatgggagagatataagagaaattaaatta
gaaaatagaagaattgagttagaaaaatatttttcaaaatggcaaattaaaactgagaat
aatatctctgatattttcaaaatatgtgatttaatctttccaaaagattggcctgatgct
ttagcctataaagaaaaatctcgagaaaataatactgaaggattaataattaagaaaaag
acttctatatactcctctggtagaaagaaaggtatttggtggaaatataaagttgatcct
atgcaactggatgctgttctaatttacgctaagggcggtagcggtagaagggctggtctg
tatacagattacagttttgcattatggaaagacaaagaattaattaaatttgcaagtgca
tattctgggttaacgaatattgagattaaagagctagataaatggataagaaaaaataca
atagaaaaatttggtcctgttcgatcgttaaaaccagaaatggtattcgaaatatctttt
gagaaaatacaaatttctaatcgtcataaatcaggcatagcggtacgatttccaagaata
acaaaatggagaaaagataaaaaaattaaagatgcagatagcttagagaatgcttatgaa
ctaatgaaaaaaatatcatga
DBGET
integrated database retrieval system