Pasteurella multocida subsp. multocida Pm70: PM1000
Help
Entry
PM1000 CDS
T00046
Name
(GenBank) unknown
KO
K01186
sialidase-1 [EC:
3.2.1.18
]
Organism
pmu
Pasteurella multocida subsp. multocida Pm70
Pathway
pmu00511
Other glycan degradation
pmu00600
Sphingolipid metabolism
pmu01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmu00001
]
09100 Metabolism
09103 Lipid metabolism
00600 Sphingolipid metabolism
PM1000
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00511 Other glycan degradation
PM1000
Enzymes [BR:
pmu01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.18 exo-alpha-sialidase
PM1000
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BNR_3
BNR_2
Autotransporter
BNR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AAK03084
UniProt:
Q9CM43
LinkDB
All DBs
Position
complement(1176085..1179327)
Genome browser
AA seq
1080 aa
AA seq
DB search
MKKFNPSVLALSISSLLLTSTLTFGQIQQQDKALFGVKEHQESLLFHQSLVKQGSDNVPI
WRIPSLLRTKDGVLIAAADKRWQHRGDWGDIDTAIRISHDDGKTWGNITTILDLPSQNTE
HSPVMNTSTNPWGDKDNVIRQRIRDPNYSSQYMNSAFLIDAQMVQDKRNGRVFLAVDMFP
ESAGFFHLNGAFNNPGKDGSGRLTIDGKQYLKLIYQDKQWTLREDGSVFDELNRKTQYKV
IVKGDPNKNFKDLGDVYNENNENIGNIYLTNRKGSKNEKAPFYIPTTSYLWMTYSDDNGK
TWSSPIDISAQIKKDWMRFLGTGPGVGIQTKNGNLIFPVYYTNQNNVQSTALIISKDGGK
SWELGQSPNDKRIELNGMNSHNLRWDSWYANTAKQKGFELTEAQLVELENGELKLFMRNQ
TGKVMMSTSKDGGYTWVNTEKINELDHGYSQLSVIKYSKRINGKEYIVFSGQSRSGQGGD
NLRRDGKLFLGEVQESGEIKWDTTNLVREIVSQGKAAGQPNGYVYSSMAELGDGSIGLAY
ENTTDYTTIMYLPIEMQEFFWKAGKIFSDVRQKEPLVFTYDGTETLEKIGDGIAIKRGEG
ESQSGINVSEGLLVLDQQTKDGKNKAFTQLTLNNSGVAQVNSTQNIDRFVVNNGATGYLQ
FTVTDTHSPRLKINQDVTAHGQIVAVQVNLQKKLKPNDKGYYHAQGEELIAFKDNGQVKW
RLVNDELKDGMYVYTLASVAKPSVLRTTSQPHSLYLTNKLITADGKAVSTVSPLKAPLTV
NARPQVNPVLASYLTANLALNKMSEQLQQSFMHETRLLQEKDRSIFVKYLNGKQKYGSNL
SFIDYGYDFNASYSGVMLGGKVWQSERGNHALYTALNKTSYKVTPKAVDGETKAKYHSWG
GSINWHSNLPHNLIVDLSAGYQKHKGDIEHAGHVKGYTFNIGADLGYRYQWMKNAFITPM
VGLHYLYASLSDVNDQANKALLKYNNFNALKTNLGVDVNYRIGKFEVKGLLSYDMYQQKT
RQLYVDDVAYKQGKLADTLHLNTQFVAHLTPRFAFSTEVGFQHARNKGQSSFAVGAHYQF
NT seq
3243 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatttaatcctagtgtattggcgttgtccatatcaagtctgctactcacatcc
acattgacctttggtcaaatccagcaacaagataaagcactctttggtgtgaaagaacat
caagaaagcctactctttcatcagagcttagtaaaacaaggtagtgataatgtgccaatt
tggcgcattccgtctttattaagaacaaaagacggtgtattaattgccgccgcagataag
cgttggcaacaccgtggcgactggggcgatattgataccgcaatccgaattagtcatgat
gatgggaaaacatggggaaatattacaacgattttggatttgccatcacaaaatacagag
cactctccagtaatgaatacatctacaaatccttggggagataaagataatgtgattaga
caaagaatacgtgatccgaattattctagccaatatatgaattctgcgtttctgattgat
gcacaaatggtacaagataagcgtaacgggcgagtctttcttgctgtagatatgtttcct
gaaagtgctggtttttttcatttaaatggtgcttttaataatcctggtaaagatggaagt
gggcgattaactattgatggaaagcaatatttaaagttaatttatcaagataaacaatgg
actttacgtgaagatggtagtgtatttgatgaattgaatagaaaaacacaatataaagtg
attgtaaaaggagatccaaataagaactttaaagatcttggggatgtttataatgaaaat
aatgaaaacatcggcaatatttacttaactaatagaaagggatctaaaaatgagaaggca
cctttttatattccaactacatcatatttatggatgacatactcggatgataatggaaag
acatggtcttcacctatagatatttcggcacaaattaaaaaagattggatgcgattttta
gggaccggaccaggagttggtattcaaactaaaaatgggaatttaattttccctgtttac
tatacaaatcagaataatgttcaatcaacagctttaattattagtaaggatggcggaaaa
agctgggagttaggacaaagtcctaatgataaaagaatagagttaaatggtatgaactca
cataatttaagatgggatagttggtatgctaatacagctaaacaaaaaggttttgaatta
acagaagcacagcttgttgagttagagaatggtgagcttaagctatttatgagaaatcag
acaggtaaagttatgatgtctacttctaaagatggaggctacacttgggttaatactgaa
aaaattaatgaattagatcacgggtattctcagctttcagtaattaaatactctaaacga
attaatggtaaagagtatattgtattttctggtcaatctcgtagtgggcaagggggagat
aatctccgtagagatgggaaacttttcttaggagaagtgcaagaaagtggtgaaataaaa
tgggatacaactaatttagttagggaaatcgttagtcaaggtaaagcagcaggacagcca
aacggctatgtctatagctcgatggcagagttgggtgatggcagtattggtttagcttat
gaaaatacgacagactacaccacaatcatgtatctccctattgaaatgcaagaatttttt
tggaaagccggaaaaatctttagtgatgtgcgtcagaaagaaccattagtgtttacttat
gatggaacggagacattggaaaaaattggcgatgggattgcgattaaacgtggtgaaggg
gaaagtcaaagtggaattaatgtgagtgaaggcttgcttgtgttggatcagcaaacgaaa
gacggtaaaaacaaagcctttactcaacttacccttaataactcgggagtagctcaagtt
aattccacacaaaatattgatcggttcgttgtgaacaacggtgctacggggtatttgcaa
tttacggtcacagatactcactctccacgacttaagattaatcaagacgtgactgcacat
gggcagattgtggctgtacaagtcaacctacagaaaaaactcaaaccaaatgataaaggt
tattaccatgcccaaggagaagaactaatcgcatttaaggataatggacaagtcaaatgg
cgtttagttaacgatgaactaaaagatggcatgtatgtttatactttggcttcagtggct
aaaccaagtgttttacgtacaacaagtcagccacattcactctatttaacaaataagtta
attacagcagatggtaaagccgtatccacagtttctccattgaaagcaccattaaccgta
aatgctcgcccacaagtgaatccggtattagcttcttatttaaccgccaatcttgcgctt
aataaaatgagcgagcaacttcagcaaagttttatgcatgaaacgcgtttattgcaagaa
aaagatcgcagtatttttgttaagtatcttaatggtaaacaaaaatatggctcaaactta
agctttattgactatgggtatgattttaatgcgagttatagcggtgtgatgttgggaggc
aaagtatggcagtctgaacgtggtaaccatgccctgtatacagcattgaataaaacgtcc
tataaagtgacgccgaaagctgtagatggtgagacgaaagcgaaataccacagctgggga
ggaagtataaattggcatagtaacttgcctcacaatctgatagtagatttatcagctggc
tatcaaaaacataagggcgacattgaacatgcaggtcatgtgaaaggttatacttttaat
attggtgcggatttaggttatcgctatcaatggatgaaaaatgcgtttattacaccaatg
gtcggtttgcattatttatatgcctcgctttcagatgtcaatgaccaagcgaataaagcg
ttattgaaatataataatttcaatgcgttaaaaacgaatttaggtgttgatgtgaactat
cgaatcgggaagtttgaagtaaaaggtttactttcttatgatatgtatcaacaaaaaaca
cgtcaattgtatgttgatgatgtagcttataagcaaggtaaactggctgatacacttcat
ttaaatacacaattcgttgcccatttaacgccacgttttgcattttcaacggaagttggt
ttccagcatgcgcggaataaaggacagtcttcctttgctgttggagcacattatcagttc
taa
DBGET
integrated database retrieval system
