Prunus mume (Japanese apricot): 103329016
Help
Entry
103329016 CDS
T03196
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At4g02750-like
Organism
pmum
Prunus mume (Japanese apricot)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
PPR_3
E_motif
TPR_19
PPR_long
SPOB_a
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103329016
NCBI-ProteinID:
XP_016649495
LinkDB
All DBs
Position
LG4:15961666..15964079
Genome browser
AA seq
739 aa
AA seq
DB search
MKLRSIGERGSQVFNQNLKITRLGKSGRIDEAIKIFSQMAQRNTVTYNSMISAYAKNGRV
SNARHLFDQMRHRNLVSWNSMIAGYLHNDRVEEAYMLFVDMPERDLYSWTLMITCYTRNG
ELEKAKELFNLLPDKRDAICWNAMIAGYAKKGKFDDAKRLFDEMPAKNLVSWNSILTGYT
KNGEMRLGVKFFEEMPERNVVSWNLMLDGFVEVGDLDSAWLFFKQIPNPNVVSWVTMLCG
FAQNGNIARAEDLFKQMPSRNVVSWNAMLAAYVRDHQIDKAIKIFRDMPEMDSVSWTTMI
NGYVRVGKLDEARQLLNRMPYRNIAAQTAMMSGYVQNGRMDEASQIFNQIAIYDVVCWNT
MIAGYAQCGKMVEAQSLFRKMINKDIVSWNTMITGYAQVGQMDKALKIFEEMGERSIVSW
NSLITGFVQNGLYLDALKSIVMMGQEGKRPDESTFACCLSACANLAALQVGKQLHHLVVK
GGYVNDLFVCNALITMYAKCGRVTNAELVFEDINHGDIVSWNSLISGYSLNGHGREAVEL
FKQMLIEGVNPDQVTFVGVLSACSHSGLVEWGLEIFKSMTEVYLIEPLAEHYACMVDLLG
RAGRLEEAFEMVSNMKIKATARIWGALLGASRIHRNLKFGKYASEKLLEVEPDKASNYVL
LSNMHAEAGRWDEVERVRVLMKESSMEKQPGCSWIEVRNQVHAFLFEDPVQPRTAELCSV
LKSLTTEMRNTSYFLTPYD
NT seq
2220 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagctcagatcaataggtgaaagggggagccaagtctttaatcaaaatctgaagatt
acccggttggggaagtcagggcggatcgatgaagcaattaaaattttctcacaaatggct
cagaggaacactgtaacatacaattctatgatctctgcttatgctaagaatggtagagtt
agcaatgcacgccatctgtttgatcaaatgcgtcatagaaacttggtttcttggaactct
atgattgcggggtacctgcacaatgatagggttgaggaagcttatatgctttttgttgac
atgccagaaagagacctttactcatggaccttaatgataacttgctatactcgtaatggt
gagcttgagaaagccaaagagctattcaatttgcttcctgataagcgagatgcaatttgt
tggaatgctatgatcgcagggtatgccaagaaggggaagtttgatgatgctaagagatta
tttgatgaaatgccagccaaaaatttagtttcatggaattcaattctaacagggtatacc
aagaatggggaaatgcgtctgggagtgaagttttttgaggagatgcctgagaggaatgtg
gtttcatggaatttgatgttggatggatttgttgaggttggtgatttggattctgcttgg
ctgttctttaagcagattcccaacccgaatgttgtttcatgggtcacaatgttatgtggg
tttgcacaaaatgggaatattgcaagggcagaggatctctttaagcagatgccaagtaga
aatgtggtgtcttggaatgcaatgcttgcagcgtatgttcgagaccaccaaattgataag
gctatcaaaatattcagggatatgcctgagatggactctgtgtcatggactacaatgatc
aatgggtatgtccgtgttggcaagcttgatgaagcaaggcaattgcttaaccggatgcca
tacaggaacattgcagcacaaactgcaatgatgtctggatatgtacaaaatggaaggatg
gatgaagcaagtcaaatcttcaaccagattgccatctatgacgttgtttgttggaacaca
atgattgcgggctatgctcagtgtggaaaaatggttgaagctcaatctcttttcagaaaa
atgattaacaaggacatcgtttcttggaatactatgattactggttatgctcaagtaggg
cagatggataaagcacttaagatctttgaggagatgggcgagaggagcatagtttcttgg
aattctctgattactggttttgtgcaaaacgggctatatctggatgcactaaagagtatt
gtgatgatgggacaggaaggaaagaggcctgatgaatcaacttttgcatgttgtctaagt
gcatgtgccaatcttgcagctttacaagttggaaagcaacttcaccatttggttgtgaag
ggtggttatgtaaatgacttgtttgtctgcaatgccctgattaccatgtatgctaaatgt
ggaagggtcacgaatgctgagcttgtgtttgaagatatcaatcatggtgatattgtttct
tggaactctttgatatctgggtattctctaaatggacatggtagagaggcagtagagctc
ttcaaacagatgctaatagaaggggtgaatccagatcaggtcacctttgttggggtgtta
tctgcatgcagtcacagtgggctggttgagtggggtttagaaatttttaagagcatgacg
gaagtttaccttattgaacctctggccgaacactatgcttgcatggttgacttgcttggt
cgtgcagggaggctagaggaagcctttgaaatggtgagtaatatgaagatcaaggcaact
gccagaatatggggtgcattgcttggagcttccaggatacaccggaatctaaaatttggc
aaatatgcttccgagaagcttttagaagttgaacctgataaagcttcaaattatgtgctc
ttgtcaaacatgcatgctgaggcaggcagatgggatgaggttgaaagagtcagggtgtta
atgaaagaaagtagcatggagaagcaaccaggctgcagttggattgaagtcagaaatcaa
gtacacgcttttctctttgaagatccagtgcagcctagaacagcagagctttgcagtgta
ttgaagagtctaaccactgagatgagaaacacaagttacttcttgacaccttatgattga
DBGET
integrated database retrieval system
