Prunus mume (Japanese apricot): 103329944
Help
Entry
103329944 CDS
T03196
Name
(RefSeq) inactive LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase BIR2
Organism
pmum
Prunus mume (Japanese apricot)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
LRR_1
LRRNT_2
LRR_4
LRR_8
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
103329944
NCBI-ProteinID:
XP_008230695
LinkDB
All DBs
Position
LG4:21519643..21522316
Genome browser
AA seq
604 aa
AA seq
DB search
MIGSISSMTVRIWIAILFLSCACYCSYGAVVEDDVKCLQSLKQSLKDPLGKLASWDFRNT
SVVSMCKFVGVTCWNDRENRILNLELRDMELSGAIAKDIEYCSSLQNLDLGGNKLSGSIP
PDICTWLPFLVTLDFSNNDFSGSIPTDLQHCKYLNNLILSDNKLSGTIPYEFSSLVRLKR
FSVANNKLTGTIPAFLDRFDKADFAGNSGLCGGPLGSKCGGLSKKNLAIIIAAGVFGAAA
SLLLALGLWWWYHLRLSKKRKGGYGVGREDWAERLRAHKLTQVSLFQKPLVKVKLADLMA
ATNNFSPENVIISSRTGTTYKALLPDGSALAIKRLSTCKLGEKQFRLEMNRLGQLRHPDL
VPLLGFCVVEEEKLLVYKYLSSGTLYSLLHGGGSGLDWPARFRIGLGAARGLAWLHHGCQ
PPIMHQNICSNVILLDEDFDARIMDFGLATLTASDSNESSFVTGDLGELGYVAPEYPSTM
VASLKGNVYGLGIVLLELATGQKPLEVTTVEEGFKGNVVDWVNHLTSSGRTKDAIDKALC
GKGHDEEILQFLKVASNCVVSRPKDRWSMYQVYHSLKSMSKDNSFTEQDDEFPLIFRKPD
KDSA
NT seq
1815 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattggctcaatctctagcatgactgttaggatatggattgccatattgttcttgagc
tgtgcttgttattgttcttatggggctgtggttgaggacgatgtgaagtgccttcagagc
cttaagcaatctctgaaagacccacttggaaagctggcctcttgggatttcaggaacacg
tctgtggtttccatgtgcaagtttgtgggagttacctgctggaacgatcgagagaaccgc
atattaaaccttgagctcagagacatggagctttctggtgctattgcgaaggacatagag
tactgttccagccttcagaatctggatcttggaggcaacaagctttctgggtcgatccct
cctgatatttgtacttggttgccatttttggtgaccttggacttttccaacaatgatttc
tcaggctcaatcccaactgatctgcaacactgtaagtacctgaacaatctgatcctttcg
gataataagctttctgggactataccttatgaattttctagcttggttaggctcaagagg
ttttcagtggccaacaacaagttgactggtactatacctgcttttttagaccgttttgat
aaggctgattttgctgggaatagtgggctttgtggagggcctcttgggtcaaagtgtggt
gggttgagtaagaagaatcttgctattataattgctgctggggtgtttggtgccgcggct
tctttgttgttggctttggggctatggtggtggtaccatttgaggttgagcaagaagagg
aagggaggttatggggttggaagagaagattgggctgagaggttgagggctcacaagctt
actcaagtttccttgtttcagaaaccccttgtgaaggttaagttggctgatttgatggcg
gctacgaataatttcagccccgaaaatgtgatcatttcatctagaacagggactacttat
aaggctctacttcctgatgggtcggctctggcaattaagcggcttagtacttgtaagctt
ggtgagaagcaatttcggttggagatgaaccgtttaggacagcttaggcatccggatttg
gtaccccttttggggttttgtgtcgtggaggaggagaagcttctggtttataagtacttg
tcaagtgggactttgtattctttgttgcatggaggtggttctggattggattggccagct
agatttaggattggtttaggtgctgcaaggggacttgcttggcttcaccacggttgtcag
cctccaattatgcaccagaacatatgctcaaatgtgatcctccttgacgaggattttgat
gctaggataatggattttggcttggcaacgcttacggcttctgattctaatgaaagcagt
tttgttactggagacttgggagagcttggctatgtagctccagaatatccaagtactatg
gttgcttcactgaaagggaacgtttatggattgggaatagtgcttctggaactggcaact
gggcaaaagccactagaagtcaccactgttgaggagggatttaagggtaacgtggtggat
tgggtaaatcatctaacaagttctggtcgaaccaaggatgccattgataaagctctctgt
ggaaaagggcacgatgaggaaattttgcaatttctgaaagttgctagtaattgtgtggtt
tctcggcccaaggacaggtggtctatgtaccaggtttaccattcattgaagagtatgagc
aaagacaacagtttcactgaacaagatgatgagtttcctttgatttttcgcaagccggat
aaagattcagcttag
DBGET
integrated database retrieval system