Polaribacter vadi: LPB03_08670
Help
Entry
LPB03_08670 CDS
T04504
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pob
Polaribacter vadi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin
Cadherin_5
Cadherin_4
CshA_repeat
Bact_surface_Ig-like
Cadherin_3
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AOW17534
LinkDB
All DBs
Position
1937885..1945882
Genome browser
AA seq
2665 aa
AA seq
DB search
MKRQLLFILVCLFVLNYTSAEIPFNDFNFAPTDIILSSEAINENKSSGTTVGTLSSTDAD
FGDTFTYTLVAGIGDADNASFSISGSDLLSAASFNHEMKDSYSIRVRTTDANGLWYEEEF
TITVNDINEIPTDSALTSTNINENESSGTTVGALSTTDVDDGDTFTYTLVAGTGDTNNAS
FSILGSDLLSGASFNHEIKDSYSIRIQTTDANGLSYAQGFIITVNDVNEIPTDIALSSTD
INENESSGTTVGTLSTTDVDDGDTSTYTLVAGAGDTNNGSFSISGSSLLSGASFDYEIKD
SYSIRIRTTDANGLSYDETFTINVNDVNDTPTDMVLSLTNIDENEASGTTIGALSTTDAD
AVDSFTYTLVTGTGDTDNGSFSISGSDLLSAAIFDYETQDSYSIRVRTTDDNGLFYEETF
TITVNDINEIPTDSALSSTNIDENESSGTTVGALSTTDVDDGDTFTYTLVAGTGGTDNAS
FSISGADLLSIPIFDHETKDSYAIRVRTTDNNGLFYEKTFTITVNDINETPTDSALSSTD
IDENEASGTTVGALSTTDIDDGDTFTYTLVAGTGDTNNGSFSISGSNLLSGASFNHETKD
SYSVRVQTTDSNGLSYAQSFIIIINDINETSTDIALSSSDIDENEASGTTVGDLSTTDED
DGDTFTYTLVAGTGDTNNGSFSISGSNLLSGASFNHETKDSYSIRVRSTDVNGLWYEEAF
TITVNNVNETPADMVLSSTDINENESSGTTVGALSTTDIDNGDTFTYTLVAGTGDTDNAS
FSISSSNLLSDAIFDHEIQDSYSIRVRTTDTNGLSYDESFTITINDINETPTDIILSSTE
IDDDQVSGTTVGTLSTADVDDGDTFTYTLVSGTGDTDNGLFNITANGLLSATAFDYNAKS
TYSIRVRTTDSGILTFDKEFTITINDKTSPVISNVRMSTSNTNVAFAKVGDVITLSFDSD
ETINAPTVFIASEPASVSNPSGNSWIATLTVGLASIEGLAAFNISNISDDDNNAALDVAI
LSSGNAIEIDRTAPTGYGVSSVLDPVNIDNQTAFTFNITGLENTSTYNWTVTDVNNASVS
GNGSTNGANPISISTNVSSLADGALTVTVSSTDAAGNLGLNETGNSDKNTVRPVITLLGD
NPQIIDVNTVYVELGATANDDIDGDITGTININSSAINLTVVGCYPIIYTVLDSHGNSGQ
ETRIVFVLDPGKPWAKNDSYTVNENSQNNMLAIIGNDSYGTNGPNPNHPIAISGAYTDNG
AKIDLVGNQIQYTPRTNFTGVDSFSYTITDDNGNGSGDGASATVTVTVTAATVNISAVAD
TANAVQGSNDVVVIDVLANDTYGSAAAHATESLTLPSLTSTQGATLSVVNGTIGYVASAL
FAGPTDTFNYTIKDVNNVTSTATVTVTIGAADSVNGVPSAKSDSFSVVQNTMTSLAILAN
NGSGVDTYGTDGAHPTGALTFINGTTSSKSVKQIESGNVANNIIVNGTEIEYTPVTGFTG
SDSFYYMITDGSGDTSIAQVMITVTEVASPTANDDAATVAAGTLVAKTIDVLANDSFGSD
GPGVTPLAITNVNGSTSTLNIVDSKVTYIPDAALVDGDTETIEYTITDGSGDTTTAEITI
TIGAGTSTNDTPTAKDDAVTVAQNSMDNVISILLNNGNGADDYGIDLANANHPISLSAFF
TDNGGELELVGETVLYTPRTNFTGVDTFGYIITDGSGDGASATVTVTVTAATVNISAVAD
TANAVQGSNDVVVIDVLANDTYGSAAAHATESLTLPSLTSTQGATLSVVNGTIGYVASAL
FAGPTDTFNYTIKDVNNVTSTATVTVTIGAADSVNGVPSAKSDSFSVVQNTMTSLAILAN
NGSGVDTYGTDGAHPTGALTFINGTTSSKSVKQIESGNVANNIIVNGTEIEYTPVTGFTG
SDSFYYMITDGSGDTSIAQVMITVTEVASPTANDDAATVAAGTLVTTTIDVLANDSFGSD
GPGVTPLAITNVNGSTSTLNIVDSKVTYIPDATLVDGDTETIEYTITDGSGDTTTAEITI
TIGAGTSTNDTPTAKDDAVTVAQNSIDNVISILLNNGNGADDYGIDLANANHPISLSAFF
TDNGGELELVGETVLYTPRTNFTGVDTFGYIITDGSGDGASATVTVTVTAATVNISAVAD
TANAVQGSNDVVVIDVLANDTYGSAAAHATESLTLPSLTSTQGATLSVVNGTIGYVASAL
FAGPTDTFDYTIKDVNNVTSTATVTVTIGAADSVNGVPSAKSDSFSVVQNTMTSLAILAN
NGSGVDTYGTDGAHPTGALTFINGTTSSKSVKQIESGNAANNIIVNGTEIEYTPVTGFTG
SDSFYYMITDGSGDTSIAQVMITVTEVASPTANDDAATVAAGTLVAKTIDVLANDSFGSD
GPGVTPLAITNVNGSTSTLNIVDSKVTYIPDAALVDGDTETIEYTITDGSGDTTTAEITI
TIGAGTNTNDTPTAKDDAVTVLRNSTNNDIFILLDNGNGADDYGADLANPNHPISPLPGA
TDIGGTLVLDGNKVVYTPKLNFTGVDTFNYTITDGNGDSDTATVTITVAVAKNSTDDFNS
SQIKELQVSPNPTSGNINVRLYCAKAAQATIVLFDLTGKVVYKSKQDLTEGNNTLNFDVI
SKSGILLLKVYTDKTNFGTKKIIFK
NT seq
7998 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagacaattactatttattttagtatgcttatttgtattaaactacacttcagct
gaaattccatttaacgattttaactttgcaccaacagatataatattatcttcagaagct
ataaatgagaacaaatcctcaggaacaacagtaggtacgttatcatctacagatgcggat
tttggagatacatttacctatactttagttgctggaataggagatgcagacaatgcatct
ttttccatttcaggttcagacttattaagtgctgcaagttttaatcatgaaatgaaagat
tcttattctataagagttagaactacagatgctaatggcttatggtacgaagaagagttt
accattacagtaaatgatattaatgaaatacctacagacagtgcgttgacatcaacaaat
ataaatgagaatgaatcttcaggaactacagtgggtgctttatcaactacagatgtagat
gatggagatacgtttacctatactttggttgctggaacaggcgatacaaacaatgcatct
ttttccattttaggttctgacttattaagtggagcaagttttaatcatgaaattaaggat
tcttattccataagaatacaaactacagatgcaaatggtttatcttatgctcaaggcttt
atcattacagtaaatgatgttaacgaaataccaacagatatcgcattatcatcaacggat
ataaatgagaatgaatcttcaggaacaacagtaggtacattatcaactacagatgtagat
gatggagatacatctacctatacgttagttgctggagcaggagatacaaataatggatct
ttctctatttcaggttcaagcttattaagtggggcaagttttgattatgaaattaaagat
tcttattccataagaataagaactacagatgctaatggcttatcgtatgatgaaaccttt
accattaatgtaaatgatgttaatgatacaccaacagatatggtattatcattaacaaat
attgatgaaaatgaagcatcaggaacaacaataggtgctttatcgactacagatgcagac
gctgtggattcttttacatatactttggtgactggaacaggagatacagataatggatcc
ttttctatttcaggttcagatttattaagtgctgctatttttgattatgaaactcaagat
tcttattctataagagtgagaactacagatgataatggtttattttatgaggaaaccttt
accattacagtaaatgacataaatgaaatacctacagacagtgcattatcatcaacaaat
atagatgagaatgaatcttcaggaacaacagtgggtgctttatcaactacagatgtggat
gatggagatacatttacctataccttggttgctggaacaggaggtacagacaatgcatct
ttttccatttcaggtgcagatttattgagtattcctatttttgatcatgaaacgaaagat
tcttacgctataagagtgagaactacagataataatggtttattttatgagaaaaccttt
actattacagtaaatgatattaatgaaacaccaacagatagtgctttgtcatcaacagat
attgatgagaatgaagcatcaggaacaacagtaggtgctttatcaacaacggatatagat
gatggagatacatttacctatactttagttgctggaacaggagatacaaataatggatct
ttctctatttcaggttcaaacttattaagtggagcaagttttaatcatgaaacgaaagat
tcctattcagtaagagtacaaactacagattcaaatggtttatcatatgcccaaagcttt
atcattataataaatgatattaatgaaacatcaacagatattgcattatcatcatcagat
atagatgagaatgaagcatcaggaacaacagtaggcgatctatcaactacagatgaagat
gatggagatacatttacctatactttagttgctggaacaggagatacaaataatggatct
ttctctatttcaggttcaaacttattaagtggagcaagttttaatcatgaaacgaaagat
tcttattccataagagtaagatctacagatgttaatggcttatggtatgaagaagcattt
accattacagtaaataatgttaatgaaacaccagcagatatggtattatcatcaacagat
ataaatgagaatgaatcttcaggaactacagtaggtgctttatcaactacagatatagat
aatggagatacatttacctatactttggttgctgggacaggagatacagacaatgcatct
ttttctatttcaagttcaaatttattgagtgatgctatttttgatcatgaaattcaagat
tcttattctataagagtgagaactacagatactaatggtttatcatatgatgaaagcttt
accattacaataaatgacattaatgaaacaccaacagatattatattatcctcaacagaa
atagatgatgatcaagtttcaggaacaacagtaggtactttatcaactgcagatgtagat
gatggtgatacttttacatatactttagtatctggaactggagatacagataatggatta
tttaacattacagctaacggtttattaagtgcaactgcttttgactataatgcgaaatct
acttattcaattcgagtaagaaccacagacagtggtattttaacttttgataaagaattt
acgattacaataaacgataaaacttctcctgttatttcaaatgtcagaatgtctacaagt
aatactaatgtagcatttgccaaagttggagacgtaattaccttaagttttgattcggat
gaaacaataaatgcaccaacagtatttattgctagtgagcctgcaagcgtttcaaatcct
tcaggaaatagttggatagctacattaacggttgggctggcttcaatagaagggcttgct
gcttttaatatttcaaatatatcagatgatgataacaatgcagctttagatgttgctata
ttatcttctggtaatgctattgaaatagatagaacagcaccaacaggatatggagtttca
agtgttttagatcctgtaaatatagataaccaaacagcatttacttttaatattacaggt
ttagaaaatacatctacttataattggacagttacagatgttaacaacgcttcagtatca
ggtaatggctcaacaaatggagctaatccaatttctattagcacaaatgtttcaagttta
gctgatggtgcacttacagttacagtatcttcaacagatgctgctgggaatttaggattg
aatgagacaggaaattcagataaaaatacagtaaggccagtaatcactttattaggtgat
aatccacagataatagatgtaaatacagtttatgtagaattaggagctacagcaaatgat
gatatagatggtgatataactggaacaataaatattaattcaagtgctataaacttaacg
gttgtgggttgttatccaataatatatactgtactagattctcatggtaattcaggacaa
gaaacaagaattgtatttgtattagatcctggaaaaccctgggcaaaaaatgattcatat
actgtaaatgaaaacagtcaaaacaatatgcttgctattatagggaatgatagttatgga
acaaatggtccaaatccaaatcacccaatagcaatatcaggagcttatactgataatgga
gctaagattgatttagtaggtaatcaaattcagtatactccaagaacaaactttacagga
gttgattcatttagttatacaattacagatgataatggaaatggtagtggagatggagct
tcagcgacagtaactgtaacagtaacagcagccactgtaaatatttcagcagtagcagat
acagcaaatgcagttcaaggaagtaatgatgtagttgttatcgatgttttagctaatgat
acttatggttcagcagcagcacatgcaactgagtcattaacattaccttcattaacaagt
acacaaggcgcaactttatcagtagtaaatggaactattggttatgtagcgtcagcactt
tttgcaggaccaacagacacctttaattatacaattaaagatgtaaacaatgtaacgtca
acggctacagtaacagtaacaataggcgcagcagattcagtaaatggagttccttcagct
aaatcagattcattctcagtagttcaaaatacgatgacatccttagctattttggcaaac
aatggatcaggagtagatacttatggtacagatggagcccatccaacaggagcattaact
tttatcaatggaacaacttcatctaagagtgttaagcaaatagaaagtggaaatgttgca
aacaatattattgttaatggaactgagatagaatatacaccagtaacaggatttacagga
tcagatagtttttattacatgattactgatggtagtggagatacttcaatagctcaagtt
atgatcacagtaacagaggtagcatcaccaaccgcaaatgatgatgcagcaactgtagct
gcaggaactttagtagcaaaaacgattgatgtattagcaaatgatagttttggatcagat
ggtccaggagttacaccattagcaattaccaatgtaaatggaagtacatctacactaaat
atagttgatagtaaagtaacttatattccagatgcagcattagtagatggagacacagag
actattgaatacaccataactgatggtagtggagatactacaacagcagaaatcacaatc
actataggagctggaacaagcacaaacgatacaccaactgcaaaagatgatgcagtaaca
gtagcacagaatagtatggataatgtgattagtattttattaaataatggaaatggagca
gatgattatggaatagatttagcaaatgcaaatcatccaatatcattatcagcatttttc
acggataatggaggtgaattagaattagttggagaaactgtattgtatacgccaagaaca
aactttacaggagtagatacctttggctatataattactgatggcagtggagatggagct
tcagcgacagtaactgtaacagtaacagcagccactgtaaatatttcagcagtagcagat
acagcaaatgcagttcaaggaagtaatgatgtagttgttatcgatgttttagctaatgat
acttatggttcagcagcagcacatgcaactgagtcattaacattaccttcattaacaagt
acacaaggcgcaactttatcagtagtaaatggaactattggttatgtagcgtcagcactt
tttgcaggaccaacagacacctttaattatacaattaaagatgtaaacaatgtaacgtca
acggctacagtaacagtaacaataggcgcagcagattcagtaaatggagttccttcagct
aaatcagattcattctcagtagttcaaaatacgatgacatccttagctattttggcaaac
aatggatcaggagtagatacttatggtacagatggagcccatccaacaggagcattaact
tttatcaatggaacaacttcatctaagagtgttaagcaaatagaaagtggaaatgttgca
aacaatattattgttaatggaactgagatagaatatacaccagtaacaggatttacagga
tcagatagtttttattacatgattactgatggtagtggagatacttcaatagctcaagtt
atgattacagtaacagaggtagcatctccaaccgcaaatgatgatgcagcaactgtagct
gcaggaactttagttacaacaacaattgatgtactggcaaatgatagtttcggatcagat
ggtccaggagttactcctttagcaattacgaatgtaaacggaagtacctctacactaaat
atagttgatagtaaagtaacttatattccagatgcaacattagtagatggagacacagag
actattgaatataccataactgatggaagtggagatactacaacagcagaaatcacaatc
actataggagctggaacaagcacaaacgatacaccaactgcaaaagatgatgcagtaaca
gtagcacagaatagtatcgataatgtgattagtattttattaaataatggaaatggagct
gatgattatggaatagatttagcaaatgcaaatcatccaatatcattatcagcatttttc
acggataatggaggtgaattagaattagttggagaaactgtattgtatacgccaagaaca
aactttacaggagtagatacctttggttatataattactgatggcagtggagatggagct
tcagcgacagtaactgtaacagtaacagcagccactgtaaatatttcagcagtagcagat
acagcaaatgcagttcaaggaagtaatgatgtcgttgttatcgatgttttagctaatgat
acttatggttcagcagcagcacatgcaactgagtcgttaacattgccttcattaacaagt
acacaaggcgcaactttatcagtagtaaatggaactattggttatgtagcgtcagcactt
tttgcaggaccaacagacacctttgattatacaattaaagatgtaaacaatgtaacgtca
acggctacagtaacagtaacaataggcgcagcagattcagtaaatggagttccttcagct
aaatcagattcattctcagtagttcaaaatacgatgacatccttagctattttggcaaac
aatggatctggggtagatacttatggtacagatggagcgcatccaacaggagcattaact
tttatcaatggaacaacttcatctaagagtgttaagcaaatagaaagtggaaatgctgca
aacaatattattgttaatggaactgagatagaatatacaccagtaacaggatttacagga
tcagatagtttttattacatgattactgatggtagtggagacacttcaatagctcaagtt
atgatcacagtaacagaggtagcatcaccaaccgcaaatgatgatgcagcaactgtagct
gcaggaactttagtagcaaaaacgattgatgtattggctaatgatagttttggatcagat
ggtcctggagttacaccattagcaattacgaatgtaaatggaagtacatctacactaaat
atagttgatagtaaagtaacttatattccagatgctgcattagtagatggagacacagag
actattgaatataccataactgatggtagtggagatactacaacagcagaaatcacaatc
accataggagctggaacaaatactaacgatacgccaactgcaaaagatgatgcagtaaca
gttcttagaaacagtacaaacaatgatatctttatcttattggataatggaaatggagca
gatgattatggagcagatttagcaaatccaaatcatccaatatcaccattacctggagca
acagatataggaggaacattagtattagatggtaacaaagtagtttatacaccaaaatta
aactttacaggagtagatacttttaactatacgattacagatggaaatggagattcagat
acagcaactgtaactataactgttgcagtagctaaaaactcaacagatgactttaatagt
tctcaaattaaagaattacaagtatcaccaaatccaacaagtgggaacataaatgtaaga
ctatattgtgctaaagcagcacaagcaactatagtactatttgatttaacaggtaaagta
gtttataaaagtaaacaagatcttacagaaggaaataatacattgaacttcgatgtaatt
tctaaatcaggtattttattattaaaagtatacactgataaaacaaattttggaactaaa
aagataatttttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
