Populus trichocarpa (black cottonwood): 112324129
Help
Entry
112324129 CDS
T01077
Name
(RefSeq) extensin-2-like
Organism
pop
Populus trichocarpa (black cottonwood)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112324129
NCBI-ProteinID:
XP_052303039
LinkDB
All DBs
Position
14:10501365..10506248
Genome browser
AA seq
1142 aa
AA seq
DB search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NT seq
3429 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaggttctagcggcggctccctttggggtcgtctttggcctcaattggccgtggca
ttggttattctctttgtttcaagcaatgtaggttcagtctcaggagatgcttatgtttat
agttcaccacctccaccttatgtatacaagtctccaccacctccatcaccatctcctcca
cctccttatgaatacaagtcaccacctcctccatcacctcatccaccaccaacatacgtg
tacaaatccccaccacctccatctccatctcctcctccaccatatatctacaagtcacct
cctccaccttctccttccccgccaccaccatatgagtacaagtcaccaccaccaccatcc
tcatctcccccaccaccttacatctacaaatcacctcctccaccttcaccatccccgcca
ccaccttatgtctacaagtcaccacctccaccttcaccatcaccacccccaccttacatc
tacaaatctcctccacccccttcaccatccccaccacccccctactattataagtctcca
ccacctccttcgccatctcccccgccaccttatgtctacaagtcaccgcctccaccttca
tcatcaccacccccaccttacatctacaaatctcctccacccccttcaccatccccacca
cccccctactattataagtctccaccacctccttcgccatctcccccgccaccttatgtc
tacaagtcaccgcctccaccttcatcatcaccacccccaccttacatctacaaatctcct
ccacccccttcaccatccccaccacccccctactattacaagtctccaccacctccttcg
ccatctcccccaccaccttactactacaagtctcccccaccacccgatccttcaccacca
cctccatactactacaagtcaccacctccaccttcatcatcaccacccccaccttacatc
tacaaatctcctccacccccttcaccatccccaccacctccctactattataagtctcca
ccacctccttcgccatctcccccaccaccttactactacaagtcaccaccacccccttca
ccatctccaccacccccttactactataaatccccaccaccacccaaaaaatcaccacca
ccaccatactactacaagtcaccacctcctccctcaccatcaccgcccccaccataccac
tacaattctccaccaccacccactcattcaccacctccaccttattactacaagtcacca
ccaccaccctcaccatctcctccccctccatactactacaagtctccacctcctccttca
ccatctcctccaccaccatactattacaaatctcctccaccaccttcaaaatcttctcca
cctccttattactacaagtctccaccacctccaactaagtccccaccacctccaacacca
tactactacaagtctccaccaccaccttcacatcctttaccaccaccctactattacaaa
tctccaccaccacctaaagctctaccttctccatactactacgcttccccccctcctccc
atcccttaccctcacaaccaccatcatgacttaattgtcaaggtggtaggaaaagtttat
tgttacagatgttatgactggggatatccagtgaagtcacatgataaaaagcatctaaaa
ggtgccgtggtggaggtaacatgcaaggcaggcactgagaaggtcaaggcctatggtaaa
accaagatcaatggaaaatacagtatcaccgttaaaggcttcaactataaaaagtatgga
ggaaaggaatgcaaggccaagcttcacgcggctccaaagggttcatcatgcaatatccca
actggcctacactggggtaacaaaggtgcctccctcaaggtgaagtccaagacaaagtat
gaagttgtgctttcagctaagtcattcgcttatgctcctaagaccccttataaggagtgt
gagaagcacaagcccactccagctccttactactacaagtcccctccacccccacctccc
gcttacatatacaagtcacctccaccacctccaccaacctatatttacaagtctccacca
cccccaccttatctttataaatcaccccctccaccaacatatatctataaatcaccacca
cctccttcaccatcccccccacctccatactattataaatctccaccaccaccatcttca
tcaccaccaccaccctattactataaatcaccaccacctccttcaccttcacccccacct
ccatattattataaatccccaccaccaccatctccatcaccaccaccaccctactactac
aaatcacctccaccaccggttcactctcctccccaaccttactactacaaatcaccaccc
ccaccatccccgtcacctcctccaccatactactacaaatcacctccctcaccggttcat
tcccctcccccaccttactactacaaatcaccacccccaccatctccgtcacctccccca
ccatattactacaaatcacctccaccaccatccccgtcacctcctccaccatactactac
aaatctcctcctccaccagttcattcccctcccccaccatactactacaaatcaccacca
ccaccatccccatcacctcccccaccatactattacaaatctcctcctccaccggttcat
tcccctcctccaccttactactacaaatcaccacctccgccatctccatcacctcctcca
ccttactactacaaatcacctccaccaccggttcactcccctcccccaccatactactac
aaatctcctcctccaccatcaccatctcctcctccaccctactactacaaatcacctcca
ccaccagttcactctccaccaccaccatactactacaaatcacctcctccaccatcatcg
tctcctcctccaccctactactacaaatctccaccacctccatccccatctcctccacct
ccatactactacaaatcccctccaccacccgatccttcaccaccacctccataccactac
aagtccccaccacctccttcaccatctcctccaccaccttactactacaaatccccacct
cccccctcgtcatctcctccccctccataccattacagctccccacccccaccatcatca
tctcttccccctccataccactacagctccccacccccgccatccccatcaccaccacct
ccttactactacaagtctcctccaccaccatctccatctcctcctcctccatacgtctac
aagtccccacctcccccttcaccatcaccacctcctctatactactaccattcacctccc
ccgccgatgaaatcacccccacccccggtttacatttacgcttctccaccaccaccaatt
cactactag
DBGET
integrated database retrieval system