Populus trichocarpa (black cottonwood): 112326567
Help
Entry
112326567 CDS
T01077
Name
(RefSeq) extensin-2 isoform X1
Organism
pop
Populus trichocarpa (black cottonwood)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112326567
NCBI-ProteinID:
XP_052306878
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(22285619..22289970)
Genome browser
AA seq
1033 aa
AA seq
DB search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NT seq
3102 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaggttctagtggcggccccctaaggggtcgtctttggcctcaattggcagtggca
ttgactattctctttgttgcgagcaatgtaggttcagtctcaggagatgcttatgtttac
agttctccacctccaccaccgtatctatacaagtctccaccacctccttctccatctcca
ccacctccttatgagtacaagtcaccacctcctccatcaccatccccaccaccaccatac
atgtataagtctccaccacctccatccccatccccaccaccaccatacatgtataagtct
ccaccacctccatccccatccccaccaccaccatacatgtataagtctccaccacctcca
tccccatcaccccctccaccatacatgtataaatccccacccccaccatccccatcccca
ccaccaccatacatgtacaagtctccaccccctccatccccatcaccccctccaccatac
atgtacaagtcaccaccaccaccctctccatccccaccaccaccatacatgtacaagtca
ccaccaccaccttcaccatcaccacctccaccttatatatataaatctcctccaccccct
tctccatcaccaccacctccctactactataaatcacctccacccccagtacattctcct
cctccaccatattactacaagtcaccaccaccaccttctccctcaccacccccaccatat
tattacaagtctccaccaccacccaaaaaatcaccacctccaccatattactataagtca
ccacctcctccctcaccatcaccacccccaccatactactacaagtccccacctccacct
aaacattcaccacctccaccttattactacaagtcaccaccaccaccctcaccatcacca
cccccaccatactactacaagtccccacctccacctaaacattcaccacctccaccatac
tactacaagtcaccacctccaccctcaccatctcctcctcctccatactactacaagtct
ccacctcctccttcaccgtctcctccaccaccatactattataaatctcctccaccacct
tctaaatctcctccacctccttattactacaagtctcccccacctccaactaagtctcca
cctcctccaacaccatactactataaatccccaccaccaccttcacatcctttaccacca
ccctattattacaaatctccaccaccacctaaagctttacctcctccataccactacact
tctccacctccacctgtcatttaccctcacccccaccaccatgatttaatggtcaaagtg
gtaggaaaggtttactgctacaaatgttatgactggggatatccagtgaagtcacatgat
aaaaagcatctaaaaggtgccgtggtggaggtaacatgtaaagaaggtgcaaaaaagatc
aaggcctatggtaaaaccaaaatcaatggaaaatacagcatcacactgaaaggtttcaat
tatagcaaatatggaggcaaggcatgcaaagccaaacttcacatggcaccaaagggttca
ccatgcagcatcccaactaaactacactggggtaacaagggtgcctctctaaaggtgaag
tccaagacaaagtatgaagttgtgctctcagctaaaccgtttgcttatgctcctaagacc
ccttacaaggagtgtgagaagtccaagcccactcctgctccatactactacaagtcacct
ccacctcctcctccaacttacatttataagtcaccaccacctccaccttatctttacaag
tcaccccctccaccaccatatatttataaatcaccaccaccaccaactcattccccacca
ccaccatattactataaatcaccaccacctccttcaccatccccaccacctccatactat
tataaatctccaccaccaccatctccatcaccaccaccaccctactactacaaatcgcct
ccaccacctgtacactctcctccgccaccatactactacaaatcacctccacctccagtt
cactctcctcccccaccatactactacaagtctccacctccaccatctccaccaccacca
tactactacaaatcacccccaccaccagttcattctcctccaccaccatactattacaag
tcaccacctccaccggttcattctcctcctccaccatactactacaagtcacctccacca
ccggttcactctcctcccccaccatactactacaagtcaccgcctccaccatctccatca
ccaccaccaccatactactacaagtcaccacctccaccggttcattctcctcctccacca
tactactacaagtcacctccaccaccggttcactctcctcccccaccctactattacaag
tcaccgcctccaccatcaccatcacctcccccaccatactactacaagtcaccacccccg
ccggttcactctcctcccccaccctactactacaagtcaccacctccaccgtcaccatca
ccaccaccaccatactattacaaatcacctcctccaccgtcgccatctcctccaccacct
tattattacaaatccccaccacctccatccccatcccctccacccccgtactattacaag
tcaccaccaccaccatcaccatcaccaccaccaccgtactactacaagtcaccccctcca
ccatcgccatctcctcctccaccctaccactacaagtctcccccaccaccctctccttca
ccaccacctccatactattacaagtctcccccacctccctcaccatctcctccaccaccc
tactactacaaatccccacctcccccctcaccatctcctccacccccatactactacaaa
tcccctcctccaccatctccatcacctccaccaccttactactacaagtctcctccacca
ccatcttcatctccccctcctccatatgtctacaagtccccacctcccccttcaccatca
ccacctcctccctactactaccattcacctcccccaccagtgaaatcacctccacccccg
gtttacatttatgcttctccaccaccaccaacacactactag
DBGET
integrated database retrieval system