KEGG   Populus trichocarpa (black cottonwood): 112326567
Entry
112326567         CDS       T01077                                 
Name
(RefSeq) extensin-2 isoform X1
Organism
pop  Populus trichocarpa (black cottonwood)
SSDB
Motif
Pfam: Extensin_2 Pollen_Ole_e_1
Other DBs
NCBI-GeneID: 112326567
NCBI-ProteinID: XP_052306878
LinkDB
Position
2:complement(22285619..22289970)
AA seq 1033 aa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NT seq 3102 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgacaggttctagtggcggccccctaaggggtcgtctttggcctcaattggcagtggca
ttgactattctctttgttgcgagcaatgtaggttcagtctcaggagatgcttatgtttac
agttctccacctccaccaccgtatctatacaagtctccaccacctccttctccatctcca
ccacctccttatgagtacaagtcaccacctcctccatcaccatccccaccaccaccatac
atgtataagtctccaccacctccatccccatccccaccaccaccatacatgtataagtct
ccaccacctccatccccatccccaccaccaccatacatgtataagtctccaccacctcca
tccccatcaccccctccaccatacatgtataaatccccacccccaccatccccatcccca
ccaccaccatacatgtacaagtctccaccccctccatccccatcaccccctccaccatac
atgtacaagtcaccaccaccaccctctccatccccaccaccaccatacatgtacaagtca
ccaccaccaccttcaccatcaccacctccaccttatatatataaatctcctccaccccct
tctccatcaccaccacctccctactactataaatcacctccacccccagtacattctcct
cctccaccatattactacaagtcaccaccaccaccttctccctcaccacccccaccatat
tattacaagtctccaccaccacccaaaaaatcaccacctccaccatattactataagtca
ccacctcctccctcaccatcaccacccccaccatactactacaagtccccacctccacct
aaacattcaccacctccaccttattactacaagtcaccaccaccaccctcaccatcacca
cccccaccatactactacaagtccccacctccacctaaacattcaccacctccaccatac
tactacaagtcaccacctccaccctcaccatctcctcctcctccatactactacaagtct
ccacctcctccttcaccgtctcctccaccaccatactattataaatctcctccaccacct
tctaaatctcctccacctccttattactacaagtctcccccacctccaactaagtctcca
cctcctccaacaccatactactataaatccccaccaccaccttcacatcctttaccacca
ccctattattacaaatctccaccaccacctaaagctttacctcctccataccactacact
tctccacctccacctgtcatttaccctcacccccaccaccatgatttaatggtcaaagtg
gtaggaaaggtttactgctacaaatgttatgactggggatatccagtgaagtcacatgat
aaaaagcatctaaaaggtgccgtggtggaggtaacatgtaaagaaggtgcaaaaaagatc
aaggcctatggtaaaaccaaaatcaatggaaaatacagcatcacactgaaaggtttcaat
tatagcaaatatggaggcaaggcatgcaaagccaaacttcacatggcaccaaagggttca
ccatgcagcatcccaactaaactacactggggtaacaagggtgcctctctaaaggtgaag
tccaagacaaagtatgaagttgtgctctcagctaaaccgtttgcttatgctcctaagacc
ccttacaaggagtgtgagaagtccaagcccactcctgctccatactactacaagtcacct
ccacctcctcctccaacttacatttataagtcaccaccacctccaccttatctttacaag
tcaccccctccaccaccatatatttataaatcaccaccaccaccaactcattccccacca
ccaccatattactataaatcaccaccacctccttcaccatccccaccacctccatactat
tataaatctccaccaccaccatctccatcaccaccaccaccctactactacaaatcgcct
ccaccacctgtacactctcctccgccaccatactactacaaatcacctccacctccagtt
cactctcctcccccaccatactactacaagtctccacctccaccatctccaccaccacca
tactactacaaatcacccccaccaccagttcattctcctccaccaccatactattacaag
tcaccacctccaccggttcattctcctcctccaccatactactacaagtcacctccacca
ccggttcactctcctcccccaccatactactacaagtcaccgcctccaccatctccatca
ccaccaccaccatactactacaagtcaccacctccaccggttcattctcctcctccacca
tactactacaagtcacctccaccaccggttcactctcctcccccaccctactattacaag
tcaccgcctccaccatcaccatcacctcccccaccatactactacaagtcaccacccccg
ccggttcactctcctcccccaccctactactacaagtcaccacctccaccgtcaccatca
ccaccaccaccatactattacaaatcacctcctccaccgtcgccatctcctccaccacct
tattattacaaatccccaccacctccatccccatcccctccacccccgtactattacaag
tcaccaccaccaccatcaccatcaccaccaccaccgtactactacaagtcaccccctcca
ccatcgccatctcctcctccaccctaccactacaagtctcccccaccaccctctccttca
ccaccacctccatactattacaagtctcccccacctccctcaccatctcctccaccaccc
tactactacaaatccccacctcccccctcaccatctcctccacccccatactactacaaa
tcccctcctccaccatctccatcacctccaccaccttactactacaagtctcctccacca
ccatcttcatctccccctcctccatatgtctacaagtccccacctcccccttcaccatca
ccacctcctccctactactaccattcacctcccccaccagtgaaatcacctccacccccg
gtttacatttatgcttctccaccaccaccaacacactactag

DBGET integrated database retrieval system