Pseudoalteromonas sp. NC201: PNC201_20755
Help
Entry
PNC201_20755 CDS
T05464
Symbol
gmr13
Name
(GenBank) Cyclic di-GMP phosphodiesterase Gmr
Organism
psen
Pseudoalteromonas sp. NC201
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_9
PAS
PAS_4
PAS_8
PAS_10
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUJ72367
UniProt:
A0A2K9K3X7
LinkDB
All DBs
Position
pNC201:696370..698595
Genome browser
AA seq
741 aa
AA seq
DB search
MRRIFLVVGILLSLTMLMADKLGLFLLSPVTFIIIIALVFLFVALLWWQAQDTKKIMVDD
DSTVPQAVLDSDGVILQANDQMQSILGVGSTVIGLKLENLIAVSGNIHSEGKSGATSMFE
ALVMQSYGNCTTKHSGKVISPVTLPIKVADTVTGYLCYFNTSNRENRLAQALEEEKELLE
VTLSSIGDGVICTDVNGVITYINPVTEAILAMLNEEVVGRRFDDVMSMYHEETKASVNKF
PELCLKQGHTICLPELTSITNHLGLTFAIQDSFSPIIAKDGSYLGTVMVFQDVTESRLMA
KKMNHLAHHDALTGLPNRLLLHDRLVQACKRAKRMSHQFALVFIDVNKFKKINDSLGHDY
GDLLLKEIASRLTQQIRGCDTVARMGGDEFVLLIDGIQDKKYVRKVVSKVLSSVNGQYCL
RQVSLKATVSAGVAIYPDDGDNTEALLKHADTAMYRAKKATQTEFQFYNARLDHESEQRL
VQESRIIQGLDNREFIPYYQPIVDAHTRKIKKLEVLARWQQDEQLLVPEDFFEAACDGDL
MVEIGQQLRTQAFKAMKTWFYEYDNLVVSFNFSLAELTNKTVIKNFMEQAAQHQLPSRQI
EIEIKEVDLIELLDKAPEVMAELEQTGMRISIDHFGVGHTSMLYLQKLTFETIKIPPAFL
ATPQSVASQNDIAKLIVQMAKSLDVECVAVGVETALQAKSLNLNGCHLIQGNHLFAPAPE
SEITPILSTHMSIERRRLGQN
NT seq
2226 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagacggatattcttagttgttggtattttactctccttaaccatgcttatggccgat
aaattgggcttattcttactgtcaccagtgacttttatcatcatcatcgctttagttttt
ttgtttgtagcactgctttggtggcaagctcaagatactaaaaaaattatggttgatgat
gactctaccgtgccacaagcggtgttagacagcgatggcgttattctacaagccaatgac
caaatgcaatccatactgggtgttggcagcacagtaatagggttaaaacttgaaaattta
atcgctgtgagcggtaacatccatagtgaggggaagagtggtgcaacaagcatgttcgaa
gcgcttgttatgcaaagttatggtaattgcacgactaaacacagtggcaaagttattagt
cctgttactttaccaattaaagtcgcggataccgttacagggtatctctgttattttaat
actagcaacagagaaaaccgcctcgctcaagcactagaagaagaaaaggaattgctcgaa
gtgacgctgagctctattggtgatggcgtgatctgtacagacgtaaatggcgtgatcact
tatattaaccctgtcacagaagccattctcgcgatgttaaatgaagaagtggtcgggcgg
cgatttgatgatgtgatgtctatgtatcacgaagaaaccaaagcttcagtcaataaattc
cctgaactttgcctaaagcaaggccataccatttgtttacctgaactcacttccatcacc
aatcatcttggtcttacctttgctatccaagattccttctctcctattatagctaaagat
ggcagctaccttggcactgtaatggtctttcaagatgtgacagagtcgagattgatggcg
aaaaaaatgaatcaccttgctcatcacgatgcattaactgggctacccaatcgcttattg
ctgcatgaccgtttagtgcaggcttgtaaacgagccaagcgcatgagtcaccaatttgct
ttggtatttattgacgtcaacaaattcaaaaaaatcaacgactcactggggcatgattat
ggcgacttattactcaaagaaattgcgagccgattaactcagcaaattcgaggatgtgac
accgttgccagaatggggggcgatgaatttgtgttactcattgacgggatccaagataaa
aaatatgtacgtaaggtggtgagtaaagtattgagtagcgttaatggacaatattgtttg
cgccaagttagtctaaaagccacggtgagtgctggcgttgcaatttaccctgatgatggt
gacaacacggaagctttgttaaagcatgctgataccgcaatgtatcgagctaaaaaagcc
acacaaacggagtttcaattttataacgcacgcctagatcacgagtcggagcagcgctta
gtgcaagaaagtcggatcattcaggggttagataatcgagagtttattccttattaccag
cctattgtcgatgcgcatacccgcaagattaaaaaacttgaagtgctcgcaaggtggcag
caagatgaacaattgttggtacctgaagacttttttgaagcggcatgtgatggcgatctg
atggtagaaattgggcaacagctcagaacacaagctttcaaggcgatgaaaacatggttt
tacgagtacgataatctcgtggttagctttaatttttcgcttgctgaactcaccaataaa
actgtaataaaaaactttatggagcaggctgcgcaacatcagttgccatctcggcaaatt
gaaatagaaatcaaagaagttgacctgatagagctacttgataaagcaccggaagtgatg
gcggaattagagcaaactggtatgcggatctcaattgatcattttggtgttgggcatacc
agcatgctgtacttgcaaaaacttacgtttgaaaccattaaaattccaccggctttcctt
gcgacccctcaatcggttgcctcacaaaatgatattgcaaaattgattgtacagatggca
aagagcttggatgtagaatgtgtagcggtaggtgttgagaccgcgttgcaagctaagtct
cttaatctcaatggctgtcaccttattcaaggcaaccacctttttgctcctgccccagag
tcagagatcaccccgattctcagtacccatatgagtatagaacggcgcagattaggtcaa
aactaa
DBGET
integrated database retrieval system